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仅存在半连续数据的贝叶斯模型,用于预测巴卡塔红豆杉在意大利的两个地区。 (英语) Zbl 1306.62267号

摘要:在生态位潜在分布的研究中,通常只记录感兴趣物种的存在。为了避免有偏差的估计和预测,从研究区域对伪缺席进行采样。对于记录了连续丰度指数而不是仅仅存在的情况,我们导出了一个半连续(即带多余零点的正数据)数据的两部分模型,该模型明确考虑了采样零点的不确定性。我们的模型是G.病房等【生物统计学65,No.2,554-563(2009;Zbl 1167.62098号)]. 它适用于贝叶斯框架,与Ward等人[loc.cit.]的最大似然方法相比,该方法具有许多优点,其中最重要的是不需要提前知道物种的流行程度。我们用一项原始研究中的实际数据来说明我们的方法,该研究旨在预测巴卡塔红豆杉位于意大利中部两个地区。提供命题、表格和代码详细证明的补充材料可在线获取。

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第62页第12页 统计在环境和相关主题中的应用
92D40型 生态学
2015年1月62日 贝叶斯推断
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全文: 内政部

参考文献:

[1] Attorre,F.、Alfó,M.、De Sanctis,M.、Francesconi,F.和Bruno,F.(2007a),“绘制区域尺度气候和生物气候变量的插值方法比较”,《国际气候学杂志》,271825-1843·doi:10.1002/joc.1495
[2] Attorre,F.、Francesconi,F.,Taleb,N.、Scholte,P.、Saed,A.、Alfó,M.和Bruno,F.(2007b),“龙血能在下一个气候变化时期生存吗?朱砂龙血树的当前和未来潜在分布,“生物保护,138430-439·doi:10.1016/j.biocon.2007.05.009
[3] Berger,J.O.(1985),《统计决策理论和贝叶斯分析》,柏林:施普林格出版社·Zbl 0572.62008号
[4] Bernardo,J.M.和Smith,A.F.M.(1994),贝叶斯理论,奇切斯特:威利出版社。
[5] Chaubert-Pereira,F.、Guédon,Y.、Lavergne,C.和Trottier,C.(2010),“用于识别林木生长成分的马尔可夫和半马尔可夫切换线性混合模型”,生物计量学,66,753–762·Zbl 1203.62211号 ·文件编号:10.1111/j.1541-0420.2009.01338.x
[6] Diebolt,J.和Robert,C.(1994),“通过贝叶斯抽样估计有限混合分布”,《皇家统计学会杂志》。B系列,56、363–375·Zbl 0796.62028号
[7] Elith,J.,Graham,C.H.,Anderson,R.P.,Dudik,M.,Ferrier,S.,Guisan,A.,Hijmans,R.J.,Huettmann,F.,Leathwick,J.R.,Lehmann,A.,Li,J,Lohmann。,Soberon,J.、Williams,S.、Wisz,M.S.和Zimmermann,N.E.(2006),“从发生数据改进物种分布预测的新方法”,生态学,29129-151·doi:10.1111/j.2006.0906-7590.04596.x
[8] Engler,R.、Guisan,A.和Rechsteiner,L.(2004),“从发生和伪缺失数据预测稀有和濒危物种分布的改进方法”,《应用生态学杂志》,41,263–274·doi:10.1111/j.0021-8901.2004.00881.x
[9] Farcomeni,A.(2010),“贝叶斯约束变量选择”,《中国统计》,第20期,第1043–1062页·Zbl 1507.62227号
[10] Garthwaite,P.、Kadane,J.和O'Hagan,A.(2005),《概率分布统计方法》,《技术报告808》,卡内基梅隆大学·Zbl 1117.62340号
[11] Gelfand,A.E.(1996),“使用基于抽样方法的模型确定”,载于《马尔可夫链蒙特卡罗实践》,编辑W.Gilks、S.Richardson和D.Spiegelhalter,伦敦:Chapman&霍尔,第145-161页·Zbl 0840.62003号
[12] Gelfand,A.E.、Dey,D.K.和Chang,H.(1992),“通过基于抽样的方法实现预测分布的模型确定”,贝叶斯统计,4147-167。
[13] Gilks,W.R.,Best,N.G.,and Tan,K.K.C.(1995),“Gibbs采样中的自适应抑制都市采样(corr:97v46 p541-542 with R.M.Neal)”,《应用统计学》,第44、455–472页·Zbl 0893.62110号 ·doi:10.2307/2986138
[14] Guisan,A.和Zimmermann,N.E.(2000),“生态学中的预测栖息地分布模型”,生态建模,135,147–186·doi:10.1016/S0304-3800(00)00354-9
[15] Hastie,T.和Tibshirani,R.J.(1990),广义加法模型,伦敦:查普曼;霍尔·Zbl 0747.62061号
[16] Hastie,T.、Tibshirani,R.和Friedman,J.(2001),《统计学习的要素》,纽约:施普林格出版社·Zbl 0973.62007号
[17] Hoeting,J.A.、Madigan,D.、Raftery,A.E.和Volinsky,C.T.(1999),“贝叶斯模型平均:教程”,《统计科学》,第14382–417页·兹比尔1059.62525 ·doi:10.1214/ss/1009212519
[18] Kadane,J.,Dickey,J.、Winkler,R.、Smith,W.和Peters,S.(1980),“正态线性模型的交互式观点启发”,美国统计协会杂志,75,845–854·doi:10.1080/01621459.1980.10477562
[19] Kadane,J.B.和Wolfson,L.(1998),“启发经验”,统计学家,47,3-19。
[20] Keating,K.A.和Cherry,S.(2004),“栖息地选择研究中逻辑回归的使用和解释”,《野生动物管理杂志》,68,774-789·doi:10.2193/0022-541X(2004)068[0774:UAIOLR]2.0.CO;2
[21] Lachenbruch,P.(2002),“过零数据分析”,《医学研究中的统计方法》,第11297–302页·Zbl 1121.62626号 ·doi:10.1191/0962280202sm289ra
[22] Leathwick,J.、Moilanen,A.、Francis,M.、Elith,J.,Taylor,P.、Julian,K.、Hastie,T.和Duffy,C.(2008),“近海海洋保护区设计和评估的新方法”,《保护信函》,第1期,第91–102页·文件编号:10.1111/j.1755-263X.2008.0012.x
[23] Li,N.、Elashoff,D.A.、Robbinsons,W.A.和Xun,L.A.(2008),“倾斜反应的分层零膨胀对数正态模型”,《医学研究中的统计方法》,doi:10.1177/0962280208097372。
[24] McCullagh,P.和Nelder,J.A.(1989),广义线性模型,伦敦:查普曼;霍尔,CRC·Zbl 0744.62098号
[25] Pearce,J.L.和Boyce,M.S.(2006),“仅存在时的分布和丰度建模”,《应用生态学杂志》,43,405–412·doi:10.1111/j.1365-2664.2005.01112.x
[26] Phillips,S.、Anderson,R.和Schapire,R.(2006),“物种地理分布的最大熵建模”,《生态建模》,第190、231–259页·doi:10.1016/j.ecolmodel.2005.03.026
[27] Prasad,A.M.、Iverson,L.R.和Liaw,A.(2006),“较新的分类和回归树技术:用于生态预测的袋装和随机森林”,《生态系统》,9811-199·doi:10.1007/s10021-005-0054-1
[28] R开发核心团队(2009年),R:统计计算的语言和环境,维也纳:R统计计算基金会。
[29] Scarnati,L.、Attorre,F.、De Sanctis,M.、Farcomeni,A.、Francesconi,F.,Mancini,M.和Bruno,F.(2009a),“森林栖息地空间分布和动态评估的多重方法:亚平宁山毛榉林与红豆杉和冬青树含水层的案例”,生物多样性与保护,18,3099–3113·doi:10.1007/s10531-009-9629-z
[30] Scarnati,L.、Attorre,F.、Farcomeni,A.、Francesconi,F.和De Santis,M.(2009b),“利用丰度数据模拟具有零散种群的树种的空间分布”,《群落生态学》,第10期,第215–224页·doi:10.1556/ComEc.10.2009.2.12
[31] Tanner,M.A.(1996),《统计推断工具》,纽约:Springer出版社·Zbl 0846.62001号
[32] Ward,G.、Hastie,T.、Barry,S.、Elith,J.和Leathwick,A.(2009),“仅存在数据和EM算法”,《生物计量学》,65,554–563·Zbl 1167.62098号 ·doi:10.1111/j.1541-0420.2008.01116.x
[33] Zaniewski,A.E.、Lehmann,A.和Overton,J.(2002),“利用现有数据预测物种空间分布,新西兰本土蕨类的案例研究”,生态建模,157,261-280·doi:10.1016/S0304-3800(02)00199-0
[34] Zhou,X.和Tu,W.(1999),“当样本中包含对数正态和可能为零的观测值时,几种不同人群均值的比较”,《生物计量学》,55,645–651·Zbl 1059.62518号 ·doi:10.1111/j.0006-341X.1999.00645.x
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