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什么是高阶网络? (英语) Zbl 1519.05226号

摘要:使用图形语言对复杂系统和数据进行基于网络的建模已成为跨一系列不同学科的重要主题。可以说,这种基于图形的透视图的成功源于图形的相对简单性:图形只由一组顶点和一组边组成,描述了这些顶点对之间的关系。这种简单的组合结构使图形具有可解释性和灵活的建模工具。然而,图形作为系统模型的简单性最近在文献中被仔细研究过。具体而言,有人从各种不同的角度提出,需要高阶网络,这超出了用图封装的成对关系建模范式。在这篇调查文章中,我们对这些最新发展进行了评估。我们的目标是澄清(i)什么是高阶网络,(ii)为什么这些是有趣的研究对象,以及(iii)如何在应用中使用它们。

理学硕士:

05C82号 小世界图形、复杂网络(图形理论方面)
34B45码 常微分方程的图和网络边值问题
68兰特 计算机科学中的图论(包括图形绘制)
55单位10 代数拓扑中的单纯形集和复数
05C65号 Hypergraphs(Hypergraph)
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参考文献:

[1] P.A.Abrams,支持高阶相互作用的论点,Amer。《自然主义者》,121(1983),第887-891页,https://doi.org/10.1086/284111。
[2] J.Acebroín、L.Bonilla、C.Peírez Vicente、F.Ritort和R.Spigler,《Kuramoto模型:同步现象的简单范例》,《现代物理学评论》。,77(2005)第137-185页,https://doi.org/10.1103/RevModPhys.77.137。
[3] H.Adams、T.Emerson、M.Kirby、R.Neville、C.Peterson、P.Shipman、S.Chepushtanova、E.Hanson、F.Motta和L.Ziegelmeier,《持久图像:持久同源的稳定向量表示》,J.Mach。学习。第18号决议(2017年),第8条·Zbl 1431.68105号
[4] M.Aguiar、C.Bick和A.Dias,《高阶相互作用的网络动力学:相同细胞和同步的耦合细胞超网络》,非线性,36(2023),第4641-4673页,https://doi.org/10.1088/1361-6544/ace39f。 ·Zbl 1525.37038号
[5] M.A.D.Aguiar和A.P.S.Dias,加权网络中的同步和公平划分,混沌,28(2018),第073105条,https://doi.org/10.1063/1.4997385。 ·Zbl 1425.34069号
[6] P.Alexandroff,《拓扑的基本概念》,Courier Corporation,2012年。
[7] S.Allesina和J.M.Levine,物种多样性竞争网络理论,Proc。国家。阿卡德。科学。美国,108(2011),第5638-5642页,https://doi.org/10.1073/pnas.1014428108。
[8] U.Alvarez-Rodriguez、F.Battiston、G.F.de Arruda、Y.Moreno、M.Perc和V.Latora,《社会网络中高阶交互的进化动力学》,《自然-人类行为》,5(2021),第586-595页,https://doi.org/10.1038/s41562-020-01024-1。
[9] E.J.Ameízquita、M.Y.Quigley、T.Ophelders、E.Munch和D.H.Chitwood,《未来事物的形状:拓扑数据分析和生物学,从分子到生物,发展动力》。,249(2020),第816-833页。
[10] M.C.Angelini、F.Caltagirone、F.Krzakala和L.Zdeborovaí,稀疏超图的谱检测,2015年第53届Allerton通信、控制和计算年会(Allerton),IEEE,2015年,第66-73页。
[11] G.Ariav、A.Polsky和J.Schiller,CA\textup1锥体神经元基底树突中快速钠树突棘介导的输入-输出转换函数的亚毫秒精度,神经科学杂志。,23(2003),第7750-7758页,https://doi.org/10.1523/JNEUROSCI.23-21-07750.2003。
[12] P.Ashwin、S.Coombes和R.Nicks,神经科学中振荡网络动力学的数学框架,J.Math。神经科学。,6(2016),第2条,https://doi.org/10.1186/s13408-015-0033-6。 ·Zbl 1356.92015号
[13] P.Ashwin和A.Rodrigues,具有\(S_N\)对称性的Hopf正规型和非线性耦合相位振荡器系统的归约,Phys。D、 325(2016),第14-24页,https://doi.org/10.1016/j.physd.2016.02.009。 ·Zbl 1364.34041号
[14] P.Ashwin和J.W.Swift,n个弱耦合同振子的动力学,非线性科学杂志。,2(1992),第69-108页,https://doi.org/10.1007/BF02429852。 ·Zbl 0872.58049号
[15] A.Aukerman、M.Carrière、C.Chen、K.Gardner、R.Rabadan和R.Vanguri,《乳腺癌免疫微环境的持久同源性表征:可行性研究》,第36届国际计算几何研讨会(SoCG 2020),Schloss Dagstuhl-Leibniz-Zentrum fúR Informatik,2020年·Zbl 1518.92073号
[16] G.Ausiello和L.Laura,有向超图:导论和基本算法:综述,理论。计算。科学。,658(2017),第293-306页,https://doi.org/10.1016/j.tcs.2016.03.016。 ·Zbl 1356.68159号
[17] E.Babson、C.Hoffman和M.Kahle,《随机\(2)-络合物的基本群》,J.Amer。数学。Soc.,24(2011),第1-28页·Zbl 1270.20042号
[18] K.A.Bacik、M.T.Schaub、M.Beguerisse-Diáaz、Y.N.Billeh和M.Barahona,秀丽隐杆线虫连接体的基于流的网络分析,公共科学图书馆计算。《生物学》,第12卷(2016年),第1005055条。
[19] D.Bal、R.Berkowitz、P.Devlin和M.Schacht,随机超图中的哈密顿-伯杰圈,组合概率。计算。,30(2021年),第228-238页·Zbl 1466.05145号
[20] A.-L.Barabaási,《网络科学》,剑桥大学出版社,2016年·Zbl 1353.94001号
[21] S.Barbarossa和S.Sardellitti,《拓扑信号处理:在多路关系上建立数据的意义》,IEEE信号处理。Mag.,37(2020),第174-183页。
[22] S.Barbarossa和S.Sardellitti,简单复数上的拓扑信号处理,IEEE Trans。信号处理。,(2020). ·Zbl 07590943号
[23] S.Barbarossa、S.Sardellitti和E.Ceci,从简单复合体上定义的信号中学习,2018年IEEE数据科学研讨会(DSW),IEEE,2018年,第51-55页。
[24] S.Barbarossa和M.Tsitsvero,超图信号处理简介,2016年IEEE声学、语音和信号处理国际会议(ICASSP),IEEE,2016年,第6425-6429页。
[25] D.S.Bassett和O.Sporns,《网络神经科学》,《自然神经科学》。,20(2017),第353-364页,https://doi.org/10.1038/nn.4502。
[26] F.Battiston、G.Cencetti、I.Iacopini、V.Latora、M.Lucas、A.Patania、J.-G.Young和G.Petri,《两两交互之外的网络:结构和动力学》,《物理学》。众议员,874(2020),第1-92页·Zbl 1472.05143号
[27] M.Belkin和P.Niyogi,用于降维和数据表示的拉普拉斯特征映射,神经计算。,15(2003年),第1373-1396页·Zbl 1085.68119号
[28] P.Bendich、J.S.Marron、E.Miller、A.Pieloch和S.Skwerer,脑动脉树的持续同源性分析,Ann.Appl。统计人员。,10(2016),第198-218页。
[29] A.R.Benson、R.Abebe、M.T.Schaub、A.Jadbabaie和J.Kleinberg,单纯形闭包和高阶链接预测,Proc。国家。阿卡德。科学。美国,115(2018),第E11221-E11230页。
[30] A.R.Benson、D.F.Gleich和D.J.Higham,《高阶网络分析起飞,经典思想和新数据的推动》,预印本,https://arxiv.org/abs/2103.05031, 2021.
[31] A.R.Benson、D.F.Gleich和J.Leskovec,用于划分高阶网络结构的张量谱聚类,《2015年SIAM国际数据挖掘会议论文集》,SIAM,2015年,第118-126页,https://doi.org/10.1137/1.9781611974010.14。
[32] C.Berge,《图和超图》,北荷兰人,阿姆斯特丹,伦敦,1973年·Zbl 0254.05101号
[33] C.Bick,嵌合体间的异宿性转换,Phys。E版,(2018),第050201条,https://doi.org/10.103/PhysRevE.97.050201。
[34] C.Bick,《局域频率同步的异宿动力学:小种群的异宿循环》,《非线性科学杂志》。,29(2019),第2547-2570页,https://doi.org/10.1007/s00332-019-09552-5。 ·兹比尔1431.34045
[35] C.Bick、P.Ashwin和A.Rodrigues,具有非通气相互作用的一般耦合相位振荡器网络中的混沌,混沌,26(2016),第094814条,https://doi.org/10.1063/1.4958928。 ·Zbl 1382.34038号
[36] C.Bick、T.Boíhle和C.Kuehn,具有非局部高阶相互作用的相位振荡器网络:扭曲状态、稳定性和分岔,SIAM J.Appl。发电机。系统。,出现·Zbl 1523.35273号
[37] C.Bick、T.Boíhle和C.Kuehn,通过相位相关振幅振荡器的相位还原实现相位振荡器网络中的高阶相互作用,预印本,https://doi.org/10.48550/arXiv.2305.04277, 2023. ·Zbl 1523.35273号
[38] C.Bick和M.J.Field,《异步网络和事件驱动动态》,非线性,30(2017),第558-594页,https://doi.org/10.1088/1361-6544/aa4f62。 ·Zbl 1361.34011号
[39] C.Bick、M.Goodfellow、C.R.Laing和E.A.Martens,《通过精确平均场减少了解生物和神经振荡器网络的动力学:综述》,J.Math。神经科学。,10(2020年),第9条,https://doi.org/10.1186/s13408-020-00086-9。 ·Zbl 1448.92011年
[40] C.Bick和A.Lohse,局域频率同步的异宿动力学:异宿环和网络的稳定性,非线性科学杂志。,29(2019),第2571-2600页,https://doi.org/10.1007/s00332-019-09562-3。 ·Zbl 1431.34046号
[41] J.C.W.Billings、M.Hu、G.Lerda、A.N.Medvedev、F.Mottes、A.Onicas、A.Santoro和G.Petri,《简单复合体中社区检测的Simplex2Vec嵌入》,预印本,https://arxiv.org/abs/1906.09068,2019年。
[42] A.S.Blevins和D.S.Bassett,节点过滤有序复合物的可重排序性,物理学。修订版E,101(2020),第052311条。
[43] A.S.Blevins和D.S.Bassett,生物学中的拓扑,收录于《艺术和科学数学手册》,查姆斯普林格,2021年,第2073-2095页·1470.00002赞比亚比索
[44] O.Bobrowski和M.Kahle,《随机几何复合体的拓扑:综述》,J.Appl。计算。白杨。,1(2018),第331-364页,https://doi.org/10.1007/s41468-017-0010-0。 ·Zbl 1402.60015号
[45] O.Bobrowski、M.Kahle和P.Skraba,《随机几何复合体中的最大持续循环》,Ann.Appl。概率。,27(2017),第2032-2060页·Zbl 1377.60024号
[46] S.Boccaletti、V.Latora、Y.Moreno、M.Chavez和D.-U.Hwang,《复杂网络:结构和动力学》,物理。众议员,424(2006),第175-308页·Zbl 1371.82002号
[47] C.Bodnar、F.Frasca、Y.G.Wang、N.Otter、G.Montu-far、P.Liò和M.Bronstein、Weisfeiler和Lehman Go Topological:Message Passing Simplicial Networks,预印本,https://arxiv.org/abs/20103.03212, 2021.
[48] Á。Bodoí,G.Y.Katona和P.L.Simon,超图上的SIS流行病传播,布尔。数学。《生物学》,78(2016),第713-735页·Zbl 1339.05270号
[49] P.Bonacich、A.C.Holdren和M.Johnston,《超边缘和多维中心主义》,《社会网络》,26(2004),第189-203页。
[50] S.Bressan、J.Li、S.Ren和J.Wu,超图和应用的嵌入同调,预印本,https://arxiv.org/abs/1610.00890, 2016. ·Zbl 1432.55032号
[51] S.C.Bruíningk、F.Hensel、C.R.Jutzeler和B.Rieck,《阿尔茨海默病预测的图像分析:模型结构设计的病理特征》,预印本,https://arxiv.org/abs/2011.06531, 2020.
[52] P.Bubenik,使用持久性景观的统计拓扑数据分析。,J.马赫。学习。第16号决议(2015年),第77-102页·Zbl 1337.68221号
[53] E.Bunch、Q.You、G.Fung和V.Singh,单纯形(2)-复杂卷积神经网络,预印本,https://arxiv.org/abs/2012.06010, 2020.
[54] H.M.Byrne、H.A.Harrington、R.Muschel、G.Reinert、B.Stolz-Pretzer和U.Tillmann,《拓扑表征肿瘤血管系统》,数学。今天(南海),55(2019),第206-210页。
[55] D.Calugaru、J.F.Totz、E.A.Martens和H.Engel,大量强耦合弛豫振荡器中的一阶同步跃迁,Sci。Adv.,6(2020),第eabb2637条,https://doi.org/10.1126/sciadv.abb2637。
[56] O.Candogan,I.Menache,A.Ozdaglar和P.A.Parrilo,《游戏的流程和分解:调和和潜在游戏》,数学。操作。Res.,36(2011),第474-503页·Zbl 1239.91006号
[57] T.Carletti、F.Battiston、G.Cencetti和D.Fanelli,超图上的随机行走,物理学。E版,101(2020),第022308条。
[58] T.Carletti、D.Fanelli和S.Nicoletti,超图上的动力系统,J.Phys。复杂性,1(2020),第035006条。
[59] G.Carlsson,拓扑与数据,布尔。阿默尔。数学。Soc.,46(2009),第255-308页·Zbl 1172.62002号
[60] G.Carlsson和V.De Silva,Zigzag持久性,发现。计算。数学。,10(2010年),第367-405页·Zbl 1204.68242号
[61] G.Carlsson、V.De Silva和D.Morozov,Zigzag持久同调和实值函数,《计算几何第二十五届年会论文集》,2009年,第247-256页·Zbl 1380.68385号
[62] G.Carlsson、A.Dwaraknath和B.J.Nelson,持久和Z字形同调:矩阵分解观点,预印本,https://arxiv.org/abs/11911.10693,2019年。
[63] G.Carlsson、G.Singh和A.Zomordian,《计算多维持久性》,摘自2009年施普林格国际算法与计算研讨会,第730-739页·Zbl 1273.68416号
[64] G.Carlsson和A.Zomordian,多维持久性理论,离散计算。地理。,42(2009),第71-93页·Zbl 1187.55004号
[65] J.M.Chan、G.Carlsson和R.Rabadan,病毒进化拓扑,Proc。国家。阿卡德。科学。美国,110(2013),第18566-18571页·Zbl 1292.92014年
[66] T.-H.H.Chan和Z.Liang,通过介质扩散过程推广超图Laplacian,Theoret。计算。科学。,806(2020),第416-428页·Zbl 1442.05145号
[67] T.-H.H.Chan、A.Louis、Z.G.Tang和C.Zhang,超图的谱性质——拉普拉斯和近似算法,J.ACM,65(2018),第15条·Zbl 1426.05163号
[68] 卓别林,随机有向图的路同调的第一贝蒂数,预印本,https://arxiv.org/abs/2111.13493, 2021.
[69] F.Chazal、B.Fasy、F.Lecci、B.Michel、A.Rinaldo和L.Wasserman,《持久同源性的子抽样方法》,《国际机器学习会议》,PMLR,2015年,第2143-2151页。
[70] F.Chazal和B.Michel,《拓扑数据分析简介:数据科学家的基本和实用方面》,《前沿人工智能》。,4 (2021).
[71] J.-R.Chazottes和B.Fernandez,耦合映象格子和相关空间扩展系统的动力学,物理课堂讲稿。671,施普林格,柏林,海德堡,2005年,https://doi.org/10.1007/b103930。 ·邮编1073.70002
[72] Y.C.Chen、M.Meilă和I.G.Kevrekidis,亥姆霍兹特征映射:从点云数据中发现拓扑特征和边流学习,预印本,https://arxiv.org/abs/2013.07266, 2021.
[73] I.Chien、C.-Y.Lin和I.-H.Wang,超图中的社区检测:最佳统计极限和有效算法,人工智能与统计国际会议,2018年,第871-879页。
[74] P.Chodrow和A.Mellor,注释超图:模型和应用,应用。网络科学。,(2020年),第9条。
[75] P.S.Chodrow,随机超图的配置模型,预印本,https://arxiv.org/abs/1902.09302, 2019. ·Zbl 1467.05239号
[76] P.S.Chodrow、N.Veldt和A.R.Benson,《生成超图聚类:从块模型到模块化》,科学版。Adv.,7(2021),第eabh1303条。
[77] S.Chowdhury、S.Huntsman和M.Yutin,路径同源性和时间网络,《复杂网络及其应用国际会议》,施普林格出版社,2020年,第639-650页。
[78] S.Chowdhury和F.Meímoli,定向网络的持久路径同源性,第二十届ACM-SIAM离散算法年会论文集,SIAM,2018年,第1152-1169页,https://doi.org/10.1137/1.9781611975031.75。 ·兹比尔1403.68154
[79] F.R.Chung和F.C.Graham,谱图理论,CBMS Reg.Conf.Ser。数学。92,美国数学学会,1997年·Zbl 0867.05046号
[80] D.Clemens、J.Ehrenmuöller和Y.Person,随机超图中Berge圈的Dirac型定理,电子。《联合杂志》,27(2020),第3-39页·Zbl 1466.05194号
[81] D.Cohen-Steiner、H.Edelsbrunner和J.Harer,持久性图的稳定性,离散计算。地理。,37(2007),第103-120页·Zbl 1117.54027号
[82] R.R.Coifman和S.Lafon,扩散图,应用。计算。哈蒙。分析。,21(2006),第5-30页·Zbl 1095.68094号
[83] O.Cooley,N.D.Giudice,M.Kang和P.Spru­ssel,随机单形复数上同调群的消失,随机结构算法,56(2020),第461-500页·Zbl 1436.05095号
[84] A.Costa和M.Farber,大型随机单形复合物,I,J.Topol。分析。,8(2016),第399-429页·Zbl 1339.05440号
[85] A.Costa和M.Farber,《随机简单复合体》,《配置空间》,Springer出版社,2016年,第129-153页·Zbl 1398.55011号
[86] A.Costa和M.Farber,大型随机单形复合物,II:基本群,J.Topol。分析。,9(2017),第441-483页·Zbl 1378.55011号
[87] A.Costa和M.Farber,《大型随机单形复合物》,第三章:临界维度,《结理论分歧》,26(2017),第1740010条·Zbl 1367.55011号
[88] A.Costa、M.Farber和T.Kappeler,《随机代数拓扑学主题》,载于《计算机科学中几何和拓扑方法研讨会论文集》,电子注理论。计算。科学。283,爱思唯尔出版社,2012年,第53-70页·Zbl 1347.05225号
[89] O.T.Courtney和G.Bianconi,《广义网络结构:单形复合体的构型模型和正则系综》,Phys。修订版E,93(2016),第062311条。
[90] L.Crawford、A.Monod、A.X.Chen、S.Mukherjee和R.Rabadaán,肿瘤图像的拓扑摘要改善了多种形式胶质母细胞瘤无病生存预测,预印本,https://arxiv.org/abs/1611.06818, 2016.
[91] C.Curto,关于神经代码,拓扑能告诉我们什么?,牛市。阿默尔。数学。Soc.,54(2017),第63-78页·Zbl 1353.92027号
[92] G.F.de Arruda、G.Petri和Y.Moreno,超图上的社会传染模型,物理学。Rev.Res.,2(2020),第023032条。
[93] V.De Silva和R.Ghrist,同源传感器网络,美国通告。数学。Soc.,54(2007),第10-17页·Zbl 1142.94006号
[94] V.De Silva、D.Morozov和M.Vejdemo-Johansson,持久(共)同源性中的二重性,反问题,27(2011),第124003条·兹比尔1247.68307
[95] L.DeVille,《关于单复数的共识》,或:非线性单拉普拉斯算子,预印本,https://arxiv.org/abs/2010.07421, 2020.
[96] T.K.Dey、T.Li和Y.Wang,一种有效的一维(持久)路径同调算法,预印本,https://arxiv.org/abs/2001.09549, 2020.
[97] A.Dudek和A.Frieze,随机一致超图中的紧Hamilton圈,随机结构算法,42(2013),第374-385页·Zbl 1264.05078号
[98] D.Easley和J.Kleinberg,《网络、人群和市场》,剑桥大学出版社,英国剑桥,2010年·Zbl 1205.91007号
[99] S.Ebli、M.Defferrard和G.Spreemann,简单神经网络,预印本,https://arxiv.org/abs/2010.03633, 2020.
[100] B.埃克曼(B.Eckmann),《Hermonische Funktitonen und Randwertaufgaben》,见《einem Komplex评论》。数学。帮助。,17(1944年),第240-255页·Zbl 0061.41106号
[101] H.Edelsbrunner和J.Harer,《持久同源性:一项调查》,Contemp。数学。,453(2008),第257-282页·Zbl 1145.55007号
[102] H.Edelsbrunner和J.Harer,《计算拓扑:导论》,美国数学学会,2010年·Zbl 1193.55001号
[103] F.Effenberger和J.Spreer,simpcomp:简单复合体的GAP工具箱,ACM Commun。计算。《代数》,44(2011),第186-189页·Zbl 1308.68167号
[104] M.Eidi、A.Farzam、W.Leal、A.Samal和J.Jost,《基于边的网络分析:图和超图的曲率》,理论生物科学。,139(2020),第337-348页。
[105] E.Estrada和J.A.Rodriíguez-Velaízquez,复杂超网络中的子图中心性和聚类,Phys。A、 364(2006),第581-594页。
[106] G.Fachetti、G.Iacono和C.Altafini,《计算大规模签名社交网络中的全球结构平衡》,Proc。国家。阿卡德。科学。美国,108(2011),第20953-20958页。
[107] L.Fajstrup、E.Goubault、E.Haucourt、S.Mimram和M.Raussen,定向代数拓扑与并发,Springer,2016年·Zbl 1338.68003号
[108] M.Farber和L.Mead,中间区域中的随机单形复合体,拓扑应用。,272(2020),第107065条·Zbl 1435.57022号
[109] M.Farber、L.Mead和T.Nowik,《随机单纯形复合体,对偶性和临界维》,预印本,https://arxiv.org/abs/1901.09578, 2019. ·兹比尔1493.57020
[110] B.T.Fasy、J.Kim、F.Lecci和C.Maria,R包TDA简介,预印本,https://arxiv.org/abs/1411.1830, 2014.
[111] B.T.Fasy、F.Lecci、A.Rinaldo、L.Wasserman、S.Balakrishnan和A.Singh,持久性图的置信集,Ann.Statist。,42(2014),第2301-2339页·Zbl 1310.62059号
[112] N.Fenichel,流的不变流形的持久性和光滑性,印第安纳大学数学。J.,21(1972),第193-226页·Zbl 0246.58015号
[113] E.Ferraz和A.Vergne,《几何随机单形络合物统计》,2011年,https://hal.science/hal-00591670。
[114] S.Fortunato和D.Hric,《网络中的社区检测:用户指南》,Phys。代表,659(2016),第1-44页。
[115] B.K.Fosdick、D.B.Larremore、J.Nishimura和J.Ugander,用固定度序列配置随机图模型,SIAM Rev.,60(2018),第315-355页,https://doi.org/10.1137/16M1087175。 ·Zbl 1387.05235号
[116] C.F.Fowler,广义随机单纯形复合体,预印本,https://arxiv.org/abs/1503.01831, 2015.
[117] C.F.Fowler,多参数随机单形复形的同调,离散计算。地理。,62(2019),第87-127页·Zbl 1414.05266号
[118] N.E.Friedkin,中心性度量的理论基础,Amer。《社会学杂志》,96(1991),第1478-1504页。
[119] L.Gauvin、A.Panisson和C.Cattuto,《检测时间网络的社区结构和活动模式:非负张量因子分解方法》,《公共科学图书馆·综合》,9(2014),第86028条。
[120] E.Gawrilow和M.Joswig,《多边形:分析凸多边形的框架》,载于《多边形组合与计算》,施普林格出版社,2000年,第43-73页·兹伯利0960.68182
[121] G.Ghoshal、V.Zlaticí、G.Caldarelli和M.E.Newman,《随机超图及其应用》,Phys。E版,79(2009),第066118条。
[122] D.Ghoshdastidar和A.Dukkipati,种植分割模型下均匀超图谱分割的一致性,《神经信息处理系统进展》,2014年,第397-405页·Zbl 1360.62330号
[123] D.Ghoshdastidar和A.Dukkipati,种植分割模型下谱超图分割的一致性,Ann.Statist。,45(2017年),第289-315页·Zbl 1360.62330号
[124] R.Ghrist,《条形码:数据的持久拓扑》,Bull。阿默尔。数学。Soc.,45(2008),第61-75页·Zbl 1391.55005号
[125] R.W.Ghrist,《基本应用拓扑》,第1卷,西雅图Createspace出版社,2014年·Zbl 1427.55001号
[126] P.Giblin,图、曲面和同调:代数拓扑导论,施普林格科学与商业媒体,2013。
[127] C.Giusti、E.Pastalkova、C.Curto和V.Itskov,Clique拓扑揭示了神经相关性中的内在几何结构,Proc。国家。阿卡德。科学。美国,112(2015),第13455-13460页·Zbl 1355.92015年
[128] N.Glaze、T.M.Roddenberry和S.Segarra,用于轨迹预测的原理简单神经网络,预印本,https://arxiv.org/abs/1202.10058, 2021.
[129] D.F.Gleich,网页之外的PageRank,SIAM Rev.,57(2015),第321-363页,https://doi.org/10.1137/10976649。 ·Zbl 1336.05122号
[130] D.F.Gleich、L.-H.Lim和Y.Yu,《多线性PageRank》,SIAM J.矩阵分析。申请。,36(2015),第1507-1541页,https://doi.org/10.1137/10985160。 ·Zbl 1330.15029号
[131] G.Gonzalez、A.Ushakova、R.Sazdanovic和J.Arsuaga,《使用拓扑签名和机器学习预测癌症基因组学》,收录于《拓扑数据分析》,斯普林格出版社,2020年,第247-276页·Zbl 1448.62165号
[132] L.J.Grady和J.R.Polimeni,《离散微积分:计算科学中图形的应用分析》,Springer科学与商业媒体,2010年·Zbl 1195.68074号
[133] D.R.Grayson和M.E.Stillman,Macaulay 2,代数几何研究软件系统;可从获取http://www.math.uiuc.edu/Macaulay2/。
[134] A.Grigor’yan、Y.Lin、Y.V.Muranov和S.-T.Yau,路径复合物及其同源性,J.Math。科学。,248(2020),第564-599页·Zbl 1448.05171号
[135] J.Grilli、G.Barabaís、M.J.Michalska-Smith和s.Allesina,竞争网络模型中的高阶相互作用稳定动力学,《自然》,548(2017),第210-213页。
[136] E.Gross、V.Karwa和S.Petrovicí,代数统计、表格和网络:Fienberg Advantage,预印本,https://arxiv.org/abs/11910.01692,2019年。
[137] E.Gross、S.Petrovicí和D.Stasi,对数线性网络模型的Goodness-of-fit:使用超图的动态马尔可夫基,Ann.Inst.Statist。数学。,69(2017),第673-704页,https://doi.org/10.1007/s10463-016-0560-2。 ·Zbl 1400.62124号
[138] E.Gross、S.Petrovicí和D.Stasi,《具有节点和块效应的随机图:模型、良好匹配测试以及在生物网络中的应用》,预印本,https://arxiv.org/abs/2104.03167, 2021.
[139] C.Hacker,k-simplex2vec:节点2vec的简单扩展,预打印,https://arxiv.org/abs/2010.05636, 2020.
[140] V.Hakim和W.-J.Rappel,全球耦合复杂Ginzburg-Landau方程动力学,物理学。A版,46(1992),第R7347-R7350页,https://doi.org/10.103/PhysRevA.46.R7347。
[141] J.Harer、K.Mischaikow和S.Mukherjee,《使用Chomp数据库从拓扑推断网络控制》,技术报告,杜克大学,北卡罗来纳州达勒姆,2015年。
[142] H.A.Harrington,N.Otter,H.Schenck和U.Tillmann,分层多参数持久同源性,SIAM J.Appl。代数几何。,3(2019年),第439-471页,https://doi.org/10.1137/18M1224350。 ·Zbl 1450.55002号
[143] R.Harris-Warrick、E.Marder、A.I.Selverston和M.Moulins主编,《动态生物网络:口腔胃神经系统》,麻省理工学院出版社,1992年,https://mitpress.mit.edu/books/dynamic-biobical-networks。
[144] A.Hatcher,《代数拓扑》,剑桥大学出版社,2002年,http://www.math.cornell.edu/hatcher/AT/ATpage.html·Zbl 1044.55001号
[145] D.Heger和K.Krischer,带Kuramoto型振荡器耦合网络的鲁棒自联想记忆,物理学。E版,94(2016),第022309条,https://doi.org/10.103/PhysRevE.94.022309。
[146] M.Hein、S.Setzer、L.Jost和S.S.Rangapuram,《超图的总变异——重访超图的学习》,高级神经信息。过程。系统。,26 (2013).
[147] A.Helm、A.S.Blevins和D.S.Bassett,《秀丽线虫连接体的生长拓扑》,预印本,https://arxiv.org/abs/2101.00065, 2020.
[148] G.Henselman和R.Ghrist,拟阵过滤和计算持久同调,预印本,https://arxiv.org/abs/1606.00199, 2016.
[149] K.Hess,《神经科学中的拓扑冒险》,收录于《拓扑数据分析》,施普林格出版社,2020年,第277-305页·Zbl 1451.92071号
[150] A.Hickok、Y.Kureh、H.Z.Brooks、M.Feng和M.A.Porter,超图上意见动力学的有界置信模型,预印本,https://arxiv.org/abs/1202.06825, 2021. ·Zbl 1482.91163号
[151] D.J.Higham和H.-L.de Kergorlay,超图传染模型的平均场分析,SIAM J.Appl。数学。,82(2022),第1987-2007页,https://doi.org/10.1137/21M1440219。 ·Zbl 1503.92064号
[152] Y.Hiraoka、T.Nakamura、A.Hirata、E.G.Escolar、K.Matsue和Y.Nishiura,以持久同源性为特征的非晶固体的层次结构,Proc。国家。阿卡德。科学。美国,113(2016),第7035-7040页。
[153] C.Hoffman、M.Kahle和E.Paquette,随机图的谱间隙和应用,国际。数学。Res.不。IMRN,11(2021),第8353-8404页,https://doi.org/10.1093/imrn/rnz077。 ·Zbl 1473.05285号
[154] D.Horak和J.Jost,单形复形上组合拉普拉斯算子的谱,高等数学。,244(2013),第303-336页·Zbl 1290.05103号
[155] L.Horstmeyer和C.Kuehn,单纯复合体上的自适应选民模型,Phys。修订版E,101(2020),第022305条,https://doi.org/10.103/PhysRevE.101.022305。
[156] D.R.Hunter、M.S.Handcock、C.T.Butts、S.M.Goodreau和M.Morris,ergm:网络指数族模型拟合、模拟和诊断软件包,J.Statist。软件,24(2008),第nihpa54860条。
[157] I.Iacopini、G.Petri、A.Barrat和V.Latora,社会传染的简单模型,自然公社。,第10条(2019年),第2485条,https://doi.org/10.1038/s41467-019-10431-6。
[158] S.Jahnke、M.Timme和R.-M.Memmesheimer,学习、重放和锐波/涟漪的统一动态模型,神经科学杂志。,35(2015),第16236-16258页,https://doi.org/10.1523/JNEUROSCI.3977-14.2015。
[159] J.Jia、M.T.Schaub、S.Segarra和A.R.Benson,基于图的边缘流半监督和主动学习,《第25届ACM SIGKDD国际知识发现与数据挖掘会议论文集》,2019年,第761-771页。
[160] X.Jiang,L.-H.Lim,Y.Yao,Y.Ye,统计排名和组合霍奇理论,数学。程序。,127(2011),第203-244页·Zbl 1210.90142号
[161] T.Kaczynski、K.Mischaikow和M.Mrozek,《计算同源性》,应用。数学。科学。157,Springer科学与商业媒体,2006年。
[162] M.Kahle,随机团复形的拓扑,离散数学。,309(2009),第1658-1671页,https://doi.org/10.1016/j.disc.2008.02.037。 ·Zbl 1215.05163号
[163] M.Kahle,随机几何复数,离散计算。地理。,45(2011年),第553-573页·Zbl 1219.05175号
[164] M.Kahle,随机标志复合物上同调的锐利消失阈值,数学年鉴。(2) ,179(2014),第1085-1107页·Zbl 1294.05195号
[165] M.Kahle,《随机单形复形的拓扑:综述》,载于《代数拓扑:应用和新方向》,Contemp。数学。620,美国数学学会,2014年,第201-222页·Zbl 1294.00030号
[166] M.Kahle和E.Meckes,随机单形复形Betti数的极限定理,同伦应用。,15(2013年),第343-374页·Zbl 1268.05180号
[167] L.Kanari、P.Dłotko、M.Scolamiero、R.Levi、J.Shillock、K.Hess和H.Markram,分支神经元形态的拓扑表示,神经信息。,16(2018),第3-13页。
[168] M.Karoníski和T.Łuczak,随机超图中的相变,J.Compute。申请。数学。,142(2002),第125-135页·Zbl 0995.05131号
[169] V.Karwa,M.J.Pelsmajer,S.Petrović,D.Stasi和D.Wilburne,无向随机图的核分解的统计模型,电子。统计学杂志。,11(2017),第1949-1982页·Zbl 1386.05178号
[170] V.Karwa和S.Petrovicí,“统计学家合著和引用网络”讨论,Ann.Appl。统计人员。,10(2016),第1827-1834页·Zbl 1454.62543号
[171] 柯振堂,石方峰,夏德胜,基于正则张量幂迭代的超图网络社区检测,预印本,https://arxiv.org/abs/1909.06503,2019年。
[172] M.Kerber和A.Rolle,双粒度持久性模块的快速最小呈现,收录于2021年算法工程与实验研讨会论文集(ALENEX),SIAM,2021年,第207-220页,https://doi.org/10.1137/1.9781611976472.16。 ·Zbl 07302448号
[173] C.Kim、A.S.Bandeira和M.X.Goemans,超图、尖峰张量模型和平方和中的社区检测,2017年国际抽样理论与应用会议(SampTA),IEEE,2017年,第124-128页。
[174] W.Kim和F.Memoli,通过Zigzag持久性实现动态图和动态度量空间的稳定签名,预印本,https://arxiv.org/abs/1712.04064, 2017.
[175] W.Kim和F.Memoli,动态度量空间的时空持久同调,离散计算。地理。,66(2021),第831-875页·Zbl 1480.55007号
[176] W.Kim、F.Meímoli和Z.Smith,《通过Z字形持久性分析动态图和动态度量空间》,收录于《拓扑数据分析》,施普林格出版社,2020年,第371-389页·Zbl 1448.55008号
[177] M.Kivela¨、A.Arenas、M.Barthelemy、J.P.Gleeson、Y.Moreno和M.A.Porter,多层网络,J.Complex networks,2(2014),第203-271页。
[178] S.Klamt、U.-U.Haus和F.Theis,超图和蜂窝网络,公共科学图书馆计算。《生物学》,第5卷(2009年),第1000385条。
[179] M.A.Komarov和A.Pikovsky,非线性全局耦合振子系综中有限尺寸诱导的同步跃迁,物理学。E版,92(2015),第020901条,https://doi.org/10.1103/PhysRevE.92.020901。
[180] N.Komodakis和N.Paragios,《超越两两能量:高阶MRF的高效优化》,载于2009年IEEE计算机视觉和模式识别会议,IEEE,2009年,第2985-2992页。
[181] B.Kralemann、A.Pikovsky和M.Rosenblum,从观测重建振荡器网络的有效相位连通性,新物理学杂志。,16(2014),第085013条,https://doi.org/10.1088/1367-2630/16/8/085013。 ·Zbl 1317.34057号
[182] C.Kuehn和C.Bick,爆炸现象的通用路径,科学。Adv.,7(2021),第3824条,https://doi.org/10.1126/sciadv.abe3824。
[183] Y.Kuramoto,《化学振荡、波浪和湍流》,Springer Ser。Synergics 19,柏林施普林格,1984年,https://doi.org/10.1007/978-3-642-69689-3。 ·Zbl 0558.76051号
[184] R.Kwitt、S.Huber、M.Niethammer、W.Lin和U.Bauer,《统计拓扑数据分析:核心观点》,摘自《神经信息处理系统进展》,2015年,第3070-3078页。
[185] R.Lambiotte、M.Rosvall和I.Scholtes,从网络到复杂系统的最优高阶模型,自然物理学。,15(2019),第313-320页,https://doi.org/10.1038/s41567-019-0459-y。
[186] R.Lambiotte和M.Schaub,《复杂网络的模块化和动力学》,剑桥大学出版社,2021年·Zbl 1517.90022号
[187] C.Lee和D.J.Wilkinson,图聚类的随机块模型和扩展综述,应用。网络科学。,4(2019年),第1-50页。
[188] I.Leoín和D.Pazoí,超越一阶的相位减少:平均场复Ginzburg-Landau方程的情况,Phys。E版,100(2019),第012211条,https://doi.org/10.103/PhysRevE.100.012211。
[189] I.Leoín和D.Pazoí,扩大的Kuramoto模型:二次不稳定性和向集体混沌的过渡,Phys。E版,105(2022),第L042201条,https://doi.org/10.103/PhysRevE.105.L042201。
[190] T.Lesieur、L.Miolane、M.Lelarge、F.Krzakala和L.Zdeborovaí,尖峰张量估计中的统计和计算相变,2017年IEEE信息理论国际研讨会(ISIT),IEEE,2017年,第511-515页。
[191] M.Lesnick和M.Wright,\textup2-D持久性模块的交互式可视化,预打印,https://arxiv.org/abs/1512.00180, 2015.
[192] J.M.Levine、J.Bascompte、P.B.Adler和S.Allesina,《超越复杂群落中物种共存的成对机制》,《自然》,546(2017),第56-64页,https://doi.org/10.1038/nature22898。
[193] P.Li和O.Milenkovic,子模超图:P-Laplacians,Cheeger不等式和谱聚类,机器学习国际会议,PMLR,2018,第3014-3023页。
[194] L.-H.Lim,《图上的霍奇·拉普拉斯》,SIAM Rev.,62(2020),第685-715页,https://doi.org/10.1137/18M1223101。 ·Zbl 1453.05061号
[195] 林毅,任三生,王建华,吴建华,加权有向图的加权路径同调与持久性,预印本,https://arxiv.org/abs/1910.09891,2019年。
[196] N.Linial和R.Meshulam,随机\(2)-配合物的同调连通性,Combinatorica,26(2006),第475-487页·Zbl 1121.55013号
[197] M.Lucas、G.Cencetti和F.Battiston,用于高阶网络同步的多阶拉普拉斯,Phys。Rev.Res.,2(2020),第033410条·Zbl 1510.70065号
[198] T.Łuczak和Y.Peled,随机单形复形的积分同调,离散计算。地理。,59(2018),第131-142页·Zbl 1387.05275号
[199] R.I.Lung、N.Gaskoí和M.A.Suciu,代表科学产出的超图模型,《科学计量学》,117(2018),第1361-1379页。
[200] D.Luítgehetmann、D.Govc、J.P.Smith和R.Levi,《计算定向标志复合物的持久同源性》,《算法》,第13(2020)条,第19条。
[201] 马友友、傅友友,《流形学习理论与应用》,CRC出版社,2011年。
[202] S.A.Marvel、J.Kleinberg、R.D.Kleinberg和S.H.Strogatz,结构平衡的连续时间模型,Proc。国家。阿卡德。科学。美国,108(2011),第1771-1776页。
[203] N.Masuda、M.A.Porter和R.Lambiotte,网络上的随机行走和扩散,Phys。众议员,716(2017),第1-58页·Zbl 1377.05180号
[204] M.H.Matheny、J.Emenheiser、W.Fon、A.Chapman、A.Salova、M.Rohden、J.Li、M.Hudoba de Badyn、M.Pošsfai、L.Duenas-Osorio、M.Mesbahi、J.P.Crutchfield、M.C.Cross、R.M.D'Souza和M.L.Roukes,《纳米机电振荡器简单网络中的异国态》,《科学》,363(2019),第eaav7932条,https://doi.org/10.1126/science.aav7932。
[205] 松本,莫尔斯理论导论,翻译。数学。单声道。208,美国数学学会,2002年·Zbl 0990.57001号
[206] J.P.May,《代数拓扑简明教程》,芝加哥大学出版社,1999年·Zbl 0923.55001号
[207] M.R.McGuirl、A.Volkening和B.Sandstede,斑马鱼图案的拓扑数据分析,Proc。国家。阿卡德。科学。美国,117(2020),第5113-5124页·Zbl 1456.92004号
[208] R.-M.Memmesheimer,具有超线性树突相互作用的神经网络中间歇性高频振荡的定量预测,Proc。国家。阿卡德。科学。美国,107(2010),第11092-11097页,https://doi.org/10.1073/pnas.0909615107。
[209] R.-M.Memmesheimer和M.Timme,非加性耦合使同步尖峰活动能够在纯随机网络中传播,PLoS Compute。《生物学》,第8卷(2012年),第1002384条,https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1002384。
[210] R.Meshulam和N.Wallach,随机k维复合体的同调连接性,随机结构算法,34(2009),第408-417页·Zbl 1177.55011号
[211] A.P.Millaín、R.Ghorbanchian、n.Defenu、F.Battiston和G.Bianconi,局部拓扑运动决定双曲高阶网络的全局扩散特性,Phys。E版,104(2021),第054302条,https://doi.org/10.103/PhysRevE.104.054302。
[212] A.P.Millaín、J.J.Torres和G.Bianconi,简单复合物上的爆炸性高阶Kuramoto动力学,Phys。修订稿。,124(2020)第218301条,https://doi.org/10.103/PhysRevLett.124.218301。
[213] E.Miller,《真实多参数持久性模块的数据结构》,预印本,https://arxiv.org/abs/1709.08155, 2017.
[214] K.Mischaikow和M.Mrozek,康利指数,《动力系统手册》,Handb。发电机。系统。2,《爱思唯尔科学》,2002年,第393-460页·Zbl 1035.37010号
[215] A.Muhammad和M.Egerstedt,网络拓扑中使用高阶拉普拉斯算子的控制,第17届网络和系统数学理论国际研讨会论文集,2006年,第1024-1038页。
[216] R.Mulas、C.Kuehn和J.Jost,超图上的耦合动力学:掌握稳态和同步的稳定性,Phys。E版,101(2020),第062313条,https://doi.org/10.103/PhysRevE.101.062313。
[217] E.Munch,《持久同调在时变系统中的应用》,博士论文,杜克大学,北卡罗来纳州达勒姆,2013年。
[218] E.Munch,拓扑数据分析用户指南,J.学习分析,4(2017),第47-61页。
[219] J.R.Munkres,《代数拓扑的元素》,CRC出版社,2018·Zbl 0673.55001号
[220] H.Nakao,非线性振荡器同步的相位减少方法,康泰姆。物理。,57(2016),第188-214页,https://doi.org/10.1080/00107514.2015.1094987。
[221] J.T.Nardini、B.J.Stolz、K.B.Flores、H.A.Harrington和H.M.Byrne,拓扑数据分析区分了Anderson-Chaplain血管生成模型(PLoS Compute)中的参数状态。《生物学》,17(2021),第1009094条,https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1009094。
[222] R.Nenadov和N.Škoricá,随机图中Hamilton圈的幂和随机超图中的紧Hamilton环,随机结构算法,54(2019),第187-208页·Zbl 1405.05167号
[223] L.Neuha¨user、A.Mellor和R.Lambiotte,网络系统上的多体相互作用和非线性共识动力学,Phys。E版,101(2020),第032310条。
[224] L.Neuha¨user、M.T.Schaub、A.Mellor和R.Lambiotte,《网络游戏、控制和优化(NETGCOOP 2021)中的多体交互的意见动力学》,施普林格,查姆,2021年,https://doi.org/10.1007/978-3-030-87473-5_23。 ·Zbl 1497.91242号
[225] M.Newman,《网络》,牛津大学出版社,2018年·Zbl 1391.94006号
[226] M.Nicolau、A.J.Levine和G.Carlsson,基于拓扑的数据分析确定了具有独特突变特征和良好生存率的乳腺癌亚组,Proc。国家。阿卡德。科学。美国,108(2011),第7265-7270页。
[227] E.Nijholt和L.DeVille,定义在单形复形上的动力系统:对称、共轭和不变子空间,混沌,32(2022),第093131条,https://doi.org/10.1063/5.0093842。
[228] E.Nijholt、B.Rink和J.Sanders,耦合细胞网络的中心流形,SIAM Rev.,61(2019),第121-155页,https://doi.org/10.1137/18M1219977。 ·兹伯利1415.37034
[229] O.E.Omel’chenko,《嵌合体状态背后的数学》,非线性,31(2018),第R121-R164页,https://doi.org/10.1088/1361-6544/aaaa07。 ·Zbl 1395.34045号
[230] A.Ortega、P.Frossard、J.Kovačević、J.M.Moura和P.Vandergheynst,图形信号处理:概述、挑战和应用,Proc。IEEE,106(2018),第808-828页。
[231] N.Otter、M.A.Porter、U.Tillmann、P.Grindrod和H.A.Harrington,持久同源性计算路线图,EPJ数据科学。,第6条(2017年),第17条。
[232] L.Page、S.Brin、R.Motwani和T.Winograd,《PageRank引文排名:给网络带来秩序》,技术报告,斯坦福信息实验室,1999年。
[233] O.Parzanchevski和R.Rosenthal,《单纯形复合体:谱、同源性和随机游动》,《随机结构算法》,50(2017),第225-261页·Zbl 1359.05114号
[234] O.Parzanchevski,R.Rosenthal,and R.J.Tessler,《单纯形复数中的等周不等式》,组合数学,36(2016),第195-227页·Zbl 1389.05174号
[235] A.Patania、G.Petri和F.Vaccarino,合作的形式,EPJ数据科学。,第6条(2017年),第18条·Zbl 1440.55004号
[236] A.Patania、F.Vaccarino和G.Petri,数据拓扑分析,EPJ数据科学。,第6条(2017年),第7条·兹比尔1440.55004
[237] P.Pattison和G.Robins,《构建社交空间模型:基于Neighourhood的社交网络和关联结构模型》,数学。科学。嗯,数学。社会科学。,168(2004),第11-29页·Zbl 1127.91380号
[238] L.M.Pecora和T.L.Carroll,同步耦合系统的主稳定函数,Phys。修订稿。,80(1998),第2109-2112页,https://doi.org/10.103/PhysRevLett.80.2109。
[239] K.Pelka、V.Peano和A.Xuereb,Chimera在小型光机阵列Phys中表示。Rev.Res.,2(2020),第013201条,https://doi.org/10.103/PhysRevResearch.2.013201。
[240] J.A.Perea,拓扑时间序列分析,Notices Amer。数学。Soc.,66(2019),第686-694页·Zbl 1416.37067号
[241] B.Pietras和A.Daffertshofer,耦合振荡器的网络动力学和相位降低技术,物理学。众议员,819(2019),第1-105页,https://doi.org/10.1016/j.physrep.2019.06.001。
[242] A.Pirayre,Y.Zheng,L.Duval,and J.-C.Pesquet,HOGMep:变分贝叶斯和高阶图形模型在联合图像恢复和分割中的应用,2017年IEEE国际图像处理会议(ICIP),IEEE,2017年,第3775-3779页。
[243] R.Rabadaín和A.J.Blumberg,《基因组学和进化的拓扑数据分析:生物学中的拓扑》,剑桥大学出版社,2019年·Zbl 1462.92001
[244] J.Ray和M.Trovati,《用Python实现的拓扑数据分析(TDA)方法的调查》,《智能网络和协作系统国际会议》,施普林格出版社,2017年,第594-600页。
[245] Y.Reani和O.Bobrowski,持久同调的循环注册及其在拓扑引导中的应用,预印本,https://arxiv.org/abs/2101.00698, 2021.
[246] M.W.Reimann、M.Nolte、M.Scolamiero、K.Turner、R.Perin、G.Chindemi、P.Dłotko、R.Levi、K.Hess和H.Markram,结合到腔中的神经元团提供了结构和功能之间缺失的联系,前沿计算。神经科学。,第11条(2017年),第48条。
[247] M.Reitz和G.Bianconi,单形络合物的高阶谱:重整化群方法,J.Phys。A、 第53条(2020年),第295001条,https://doi.org/10.1088/1751-8121/ab9338。 ·Zbl 1519.82042号
[248] S.Ren,超图和计算工具的持久同源性:用户调查,J.Knot Theory Rafications,29(2020),第2043007条·Zbl 1460.55008号
[249] V.Robins、J.D.Meiss和E.Bradley,《计算连通性:计算拓扑的实践》,《非线性》,11(1998),第913-922页·Zbl 0957.54010号
[250] A.Robinson和K.Turner,拓扑数据分析的假设检验,J.Appl。计算。白杨。,1(2017年),第241-261页·Zbl 1396.62085号
[251] M.Robinson,用滑轮狩猎狐狸,通知Amer。数学。Soc.,66(2019),第661-676页·兹比尔1422.94016
[252] T.M.Roddenberry、M.T.Schaub和M.Hajij,细胞复合体上的信号处理,摘自ICASSP 2022-2022 IEEE声学、语音和信号处理国际会议(ICASSP),IEEE,2022年,第8852-8856页。
[253] T.M.Roddenberry和S.Segarra,《HodgeNet:边缘数据的图形神经网络》,2019年第53届信号、系统和计算机Asilomar会议,IEEE,2019,第220-224页。
[254] F.A.Rodrigues、T.K.D.Peron、P.Ji和J.Kurths,《复杂网络中的Kuramoto模型》,Phys。代表,610(2016),第1-98页,https://doi.org/10.1016/j.physrep.2015.10.008。 ·Zbl 1357.34089号
[255] M.Saadatfar、H.Takeuchi、V.Robins、N.Francois和Y.Hiraoka,颗粒结晶的孔隙结构景观,自然社区。,8(2017),第1-11页。
[256] A.Salova和R.M.D’Souza,分析超图完全同步以外的状态需要投影网络以外的方法,预印本,http://arxiv.org/abs/2107.13712, 2021.
[257] A.Salova和R.M.D'Souza,超图上的簇同步,预印本,http://arxiv.org/abs/2101.05464, 2021.
[258] S.Scaramuccia、F.Iuricich、L.De Floriani和C.Landi,通过基于离散Morse的方法计算多参数持久同源性,计算。地理。,第89条(2020年),第101623条·Zbl 1479.55014号
[259] S.H.Schanuel,土豆的长度是多少?,《连续介质物理学分类》,施普林格出版社,1986年,第118-126页·Zbl 0621.51023号
[260] M.T.Schaub、A.R.Benson、P.Horn、G.Lippner和A.Jadbabaie,简单复数上的随机行走和归一化Hodge(1)-Laplacian,SIAM Rev.,62(2020),第353-391页,https://doi.org/10.1137/18M1201019。 ·Zbl 1441.05205号
[261] M.T.Schaub、J.-C.Delvenne、M.Rosvall和R.Lambiotte,《复杂网络中社区检测的多方面》,应用。网络科学。,第2(2017)条第4条。
[262] M.T.Schaub、J.-B.Seby、F.Frantzen、T.M.Roddenberry、Y.Zhu和S.Segarra,简单复合体上的信号处理,收录于《高阶系统》,施普林格出版社,2022年,第301-328页·Zbl 1510.94063号
[263] M.T.Schaub和S.Segarra,《流平滑和去噪:边缘空间中的图形信号处理》,2018年IEEE信号和信息处理全球会议(GlobalSIP),IEEE,2018年,第735-739页。
[264] M.T.Schaub、Y.Zhu、J.-B.Seby、T.M.Roddenberry和S.Segarra,《高阶网络上的信号处理:边缘上的生命……》。。。信号处理。,187(2021),第108149条。
[265] H.Schenck,《数据分析的代数和拓扑》,2020年,http://webhome.auburn.edu/hks0015/AuburnTDA.html。
[266] J.Schmidt-Pruzan和E.Shamir,随机超图演化中的成分结构,组合数学,5(1985),第81-94页·Zbl 0573.05042号
[267] Y.Shemesh、Y.Sztainberg、O.Forkosh、T.Shlapobersky、A.Chen和E.Schneidman,《老鼠群体中的高阶社会互动》,电子生活,第2期(2013年),第e00759条。
[268] D.I.Shuman、S.K.Narang、P.Frossard、A.Ortega和P.Vandergheynst,图上信号处理的新兴领域:将高维数据分析扩展到网络和其他不规则领域,IEEE信号处理。Mag.,30(2013),第83-98页。
[269] J.Silva和R.Willett,基于超图的高维共现异常检测,IEEE Trans。模式分析。机器。智力。,31(2008),第563-569页。
[270] A.E.Sizemore、J.E.Phillips-Cremis、R.Ghrist和D.S.Bassett,《整体的重要性:网络神经科学家的拓扑数据分析》,《网络神经科学》。,3(2019年),第656-673页。
[271] P.S.Skardal和A.Arenas,全局耦合振子单纯形中的突然去同步和广泛多稳态,Phys。修订稿。,122(2019),第248301条,https://doi.org/10.103/PhysRevLett.122.248301。
[272] P.S.Skardal和A.Arenas,相位振荡器复杂网络中的高阶相互作用促进了突然同步切换,Commun。物理。,3(2020年),第218条,https://doi.org/10.1038/s42005-020-00485-0。
[273] J.Skvoretz和K.Faust,附属网络的Logit模型,《社会学方法论》,29(1999),第253-280页。
[274] C.Spagnuolo、G.Cordasco、P.Szufel、P.Prałat、V.Scarano、B.Kaminíski和A.Antelmi,使用SimpleHypergraphs.jl通过超图分析、探索和可视化复杂网络,互联网数学。,(2020年),第12464条。
[275] T.Stankovski、T.Pereira、P.V.E.McClintock和A.Stefanovska,《耦合函数:动力学相互作用机制的普遍见解》,现代物理学评论。,89(2017),第045001条,https://doi.org/10.103/RevModPhys.89.045001。
[276] D.Stasi、K.Sadeghi、A.Rinaldo、S.Petrovicí和S.E.Fienberg,具有给定度序列的随机超图的Beta模型,《第21届国际计算统计会议论文集》,2014年·Zbl 1436.91097号
[277] I.Stewart、M.Golubitsky和M.Pivato,耦合细胞网络中的对称群胚和同步模式,SIAM J.Appl。动态。系统。,2(2003),第609-646页,https://doi.org/10.1137/S111111103419896。 ·Zbl 1089.34032号
[278] B.Stolz,《神经科学中的计算拓扑》,牛津大学硕士论文,2014年。
[279] B.J.Stolz、H.A.Harrington和M.A.Porter,基于耦合时间序列构建的时间依赖功能网络的持久同源性,混沌,27(2017),第047410条。
[280] B.J.Stolz、J.Kaeppler、B.Markelc、F.Mech、F.Lipsmeier、R.J.Muschel、H.M.Byrne和H.A.Harrington,《多尺度拓扑表征动态肿瘤血管网络》,预印本,https://arxiv.org/abs/2008.08667, 2020.
[281] B.Stolz-Pretzer,《生物数据形状和分类的全局和局部持久同源性》,牛津大学博士论文,2019年。
[282] S.H.Strogatz,《从Kuramoto到Crawford:探索耦合振荡器种群中同步化的开始》,Phys。D、 143(2000),第1-20页,https://doi.org/10.1016/S0167-2789(00)00094-4. ·Zbl 0983.34022号
[283] S.H.Strogatz,《同步:自发秩序的新兴科学》,企鹅出版社,2004年。
[284] A.Tahbaz-Salehi和A.Jadbabaie,无位置信息传感器网络中的分布式覆盖验证,IEEE Trans。自动化。控制,55(2010),第1837-1849页·Zbl 1368.90039号
[285] Tanaka和Aoyagi,具有三体相互作用的相位振荡器网络中的多稳吸引子,物理学。修订稿。,106(2011),第224101条,https://doi.org/10.1103/PhysRevLett.1024101。
[286] D.Taylor、F.Klimm、H.A.Harrington、M.Kramaír、K.Mischaikow、M.A.Porter和P.J.Mucha,用于检查网络传播过程的传染图拓扑数据分析,自然社区。,6(2015),第1-11页。
[287] J.B.Tenenbaum、V.De Silva和J.C.Langford,《非线性降维的全球几何框架》,《科学》,290(2000),第2319-2323页。
[288] M.Timme和J.Casadiego,《从动力学中揭示网络:导论》,J.Phys。A、 第47条(2014年),第343001条,https://doi.org/10.1088/1751-8113/47/34/343001。 ·Zbl 1305.92036号
[289] C.M.Topaz、L.Ziegelmeier和T.Halverson,生物聚集模型的拓扑数据分析,公共科学图书馆,10(2015),第0126383条。
[290] L.Torres、A.S.Blevins、D.Bassett和T.Eliassi-Rad,《复杂系统表征的原因、方式和时间》,SIAM Rev.,63(2021),第435-485页,https://doi.org/10.1137/20M1355896。 ·1470.00003赞比亚比索
[291] F.Tudisco和D.J.Higham,超图的节点和边非线性特征向量中心性,Commun。物理。,4(2021),第201条,https://doi.org/10.1038/s42005-021-00704-2。
[292] S.Tymochko、E.Munch和F.A.Khasawneh,《使用之字形持久同源性检测动力系统中的Hopf分支》,《算法》(巴塞尔),第13卷(2020年),第278条。
[293] L.R.Varshney、B.L.Chen、E.Paniagua、D.H.Hall和D.B.Chklovskii,秀丽隐杆线虫神经元网络的结构特性,公共科学图书馆计算。《生物学》,第7期(2011年),第1001066条。
[294] A.Vazquez,超图上使用统计模型的人口分层,Phys。E版,77(2008),第066106条。
[295] A.Vazquez,《寻找超图社区:贝叶斯方法和变分解》,J.Statist。机械。理论实验,2009(2009),第P07006条。
[296] N.Veldt、A.R.Benson和J.Kleinberg,具有一般分裂函数的超图切割,预印本,https://arxiv.org/abs/2001.02817, 2020. ·兹比尔1494.05080
[297] O.Vipond、J.A.Bull、P.S.Macklin、U.Tillmann、C.W.Pugh、H.M.Byrne和H.A.Harrington,多参数持久同源性景观识别肿瘤中的免疫细胞空间模式,Proc。国家。阿卡德。科学。美国,118(2021),第2102166118条。
[298] S.T.Vittadello和M.P.Stumpf,通过简单复合物和持久同源性进行模型比较,Roy。Soc.开放科学。,第8条(2021年),第211361条,https://doi.org/10.1098/rsos.211361。
[299] T.R.Walsh,超映射与二分映射,J.Combin.Theory Ser。B、 18(1975),第155-163页,https://doi.org/10.1016/0095-8956(75)90042-8. ·Zbl 0302.05101号
[300] P.Wang、K.Sharpe、G.L.Robins和P.E.Pattison,附属网络的指数随机图模型,《社交网络》,31(2009),第12-25页。
[301] L.Wasserman,拓扑数据分析,美国国立大学。Rev.Stat.应用。,5(2018年),第501-532页。
[302] 夏国伟,蛋白质结构、柔韧性和折叠的持久同源性分析,国际数学家杂志。方法生物识别。工程,30(2014),第814-844页。
[303] L.Xian、H.Adams、C.M.Topaz和L.Ziegelmeier,通过拓扑捕获时间变化数据的动力学,预印本,https://arxiv.org/abs/2010.05780, 2020. ·Zbl 1501.37084号
[304] G.Yan、P.E.Veártes、E.K.Towlson、Y.L.Chew、D.S.Walker、W.R.Schafer和A.-L.Barabaási,《网络控制原理预测秀丽隐杆线虫连接体中的神经元功能》,《自然》,550(2017),第519-523页。
[305] M.Yang、E.Isufi、M.T.Schaub和G.Leus,简单复数的有限脉冲响应滤波器,2021年第29届欧洲信号处理会议(EUSIPCO),IEEE,2021,pp.2005-2009。
[306] M.Yang、E.Isufi、M.T.Schaub和G.Leus,单纯形卷积滤波器,IEEE Trans。信号处理。,70(2022),第4633-4648页,https://doi.org/10.109/TSP.2022.3207045。
[307] X.Yang,《社会网络建模与社区检测结构相似性评估》,卡内基梅隆大学博士论文,2015年。
[308] J.R.Yaros和T.Imielinski,非平衡超图划分和共识聚类改进,2013年IEEE第25届人工智能工具国际会议,IEEE,2013年,第358-365页。
[309] J.-G.Young、G.Petri、F.Vaccarino和A.Patania,简单配置模型的构造和有效采样,Phys。E版,96(2017),第032312条·Zbl 1440.55004号
[310] E.C.塞曼(E.C.Zeeman),《大脑拓扑和视觉感知》,收录于《三流形拓扑及相关主题》(topology of 3-Manifolds and Related Topics),普伦蒂斯·霍尔(Prentice-Hall),恩格伍德·克利夫斯(Englewood Cliffs),新泽西州,1962年,第240-256页·Zbl 1246.92006号
[311] 张绍,丁振中,崔绍,超图信号处理简介:理论基础与实际应用,IEEE Internet Things J.,7(2019),第639-660页。
[312] Z.-K.Zhang和C.Liu,社会标签网络的超图模型,J.Statist。机械。理论实验,2010(2010),第10005页。
[313] E.Zheleva、L.Getoor和S.Sarawagi,《社会网络和从属网络分类的高阶图形模型》,NIPS跨学科网络研讨会:理论与应用,2010年第2卷。
[314] D.Zhou、J.Huang和B.Scho¨lkopf,超图学习:聚类、分类和嵌入,高级神经信息。过程。系统。,19 (2006).
[315] A.Zomorodian和G.Carlsson,计算持久同源性,离散计算。地理。,33(2005年),第249-274页·Zbl 1069.55003号
[316] K.Zuev、O.Eisenberg和D.Krioukov,指数随机单形复合物,J.Phys。A、 第48条(2015年),第465002条·Zbl 1331.90020号
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