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关于优化、动力学和不确定性:基因环境网络教程。 (英语) Zbl 1172.92015年

概要:计算生物学和生物技术的一个新兴研究领域致力于基因表达模式的数学建模和预测;要充分理解其基础,需要进行数学研究。本文在矩阵和区间算术的框架内,通过在遗传背景中严格引入误差和不确定性的环境和方面,综述并在数学上扩展了建模和预测的最新进展。
给定DNA微阵列实验和环境测量的数据,我们提取出包含待确定参数的非线性常微分方程。这是通过广义切比雪夫近似和广义半无限优化实现的。然后,研究了时间离散动力系统。通过构造并跟踪多面体序列的组合算法,检测参数稳定区域。最后,我们从结构稳定性的角度分析了基因-环境网络的拓扑景观。这项开创性的工作是有实际动机和理论阐述的;它旨在促进有关更好的卫生保健、医学进步、更好的教育和更健康的生活条件的应用。

MSC公司:

92C40型 生物化学、分子生物学
37N25号 生物学中的动力系统
90 C90 数学规划的应用
92D10型 遗传学和表观遗传学
41A50型 最佳逼近,切比雪夫系统
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[83] F.B.Yölmaz,H.Øktem,Weber,G.-W.,基因表达模式和基因网络的数学建模和近似,收录于:F.Fleuren,D.den Hertog,P.Kort,(编辑),《运筹学学报》,2005年,第280-287页;F.B.Yölmaz,H.Øktem,Weber,G.-W.,基因表达模式和基因网络的数学建模和近似,收录于:F.Fleuren,D.den Hertog,P.Kort,(编辑),《运筹学学报》,2005年,第280-287页
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