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分数阶敏感感染模型:定义及其在新冠肺炎主要蛋白酶研究中的应用。 (英语) Zbl 1488.92024号

摘要:我们提出了一个扰动在蛋白质氨基酸间传递的模型,该模型表示为相互作用网络。动力学由基于Caputo分数阶导数的敏感感染(SI)模型组成。我们找到了这个模型的解析解的上界,它代表了扰动在蛋白质残基网络中传播的最坏情况。这个上界用氨基酸间相互作用网络的邻接矩阵的Mittag-Lefler函数表示。然后,我们将该模型应用于分析SARS-CoV-2主要蛋白酶抑制剂产生的扰动传播。我们发现,蛋白酶强抑制剂产生的扰动传播到远离结合位点的地方,证实了蛋白质内通讯的长程性质。相反,最弱的抑制剂只会在结合位点周围的封闭环境中传递它们的扰动。这些发现可能有助于设计抗这种新型冠状病毒的候选药物。

MSC公司:

92C40型 生物化学、分子生物学
26A33飞机 分数导数和积分
33E12号机组 Mittag-Lefler函数及其推广
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