Fortran和Matlab代码

tar文件gnicodes.tar码包含一个包含以下Fortran 77代码的目录（用于使用命令展开目录tar xvf gnicodes.tar码)

• GNI_IRK2，辛和对称隐式Runge-Kutta码对于二阶微分方程；
• GNI_COMP，以基本方法作为外部子程序的组合方法；
• GNI_LMM2，二阶对称线性多步方法微分方程；
• 所有三种方法的驱动程序示例；
• 开普勒问题三种八阶方法的比较外太阳系；
• 合成方法的复杂应用：刚体模拟（顶部）基于分裂或嘎嘎声；球面上的两体问题。

• GNI_IRK2，辛和对称隐式Runge-Kutta码对于二阶微分方程；
• GNI_COMP，以基本方法作为外部子程序的组合方法；
• GNI_LMM2，二阶对称线性多步方法微分方程；
• 驱动程序示例的方法，开普勒问题；
• Henon-Heiles问题的Poincare截面计算；
• 用于解决球体上的两体问题的驱动程序。

刚体积分器，如中所述E.Hairer和G.Vilmart（2006）：预处理离散Moser-Veselov刚体全动力学算法,物理学杂志。A： 数学。Gen.39（2006）13225-13235。

• DMV10型修改DMV 10阶的Fortran子程序算法（订单版本的子程序包括2、4、6、8）。
• DR_DMV10DMV10驱动器（非对称刚体）。

• DOPRI5公司5（4）阶显式Runge-Kutta方法问题y'=f（x，y）；具有4阶密集输出
• DR_DOPRI5公司DOPRI5驱动程序
• DOP853公司8（5,3）阶显式Runge-Kutta方法问题y'=f（x，y）；具有7阶密集输出
• DR_DOP853号文件DOP853驱动程序
• ODEX公司问题的外推方法（GBS）y’=f（x，y）；具有密集输出
• DR_数据交换ODEX驱动程序
• ODEX2标准外推方法（Stoermers规则）二阶微分方程y’’=f（x，y）；具有密集输出
• 索引2ODEX2驱动程序

• 有一个文件夹的.tar文件，其中包含C型DOPRI5、DOP853和RETARD。DOP853的Unix命令行版本可从凯斯·布里格斯.可从以下网址获得可处理不连续性的C版修改弗雷德里科·贝杰罗

• 有一个文件夹，由Blake Ashby编写“bmashby（at）stanford.edu”，其中包含C++版本非刚性积分器DOPRI5和刚性积分仪RADAU5。它可以用“tar xzf IntegratorT.tgz”展开。

• 有Matlab和Octave文件Matlab非刚性,八面体非刚性,由Denis Bichsel撰写“dbichsel（at）infomanik.ch”，用于非刚性积分器DOPRI5和DOP853。

• 关于Matlab接口对于非刚性积分器DOPRI5、DOP853和ODEX，请参阅慕尼黑理工大学主页。

• 有一个gzip-ped非刚性.tar.gz包含所有这些程序的文件。

• RADAU5公司5阶隐式Runge-Kutta方法（Radau IIA）表格问题My'=f（x，y）与可能奇异矩阵M；具有密集输出（配置解决方案）。关于线性代数例程用户可以选择将程序链接到DC_DECSOL和DECSOL或使用DC_LAPACK和LAPACK以及LAPACKC
  选择提示：
  a） LAPACK例程使用BLAS
  b） 编译器必须接受COMPLEX*16用于LAPACK例程；DECSOL公司例程仅使用REAL*8声明
• C-与radau/radau5代码的接口，编写人迈克尔·豪斯（Michael.Hauth（at）wsi-gris.uni-tuebingen.de）。该包允许从C调用radau/radau5代码。
• DC_DECSOL公司用于分解和线性系统的后代换；使用DECSOL的子程序
• DECSOL公司线性代数例程，由使用DC_DECSOL、SDIRK4、ROS4、SEULEX、SODEX
• DC_亚太用于分解和线性系统的后代换；使用LAPACK和LAPACKC的子程序
• LAPACK公司线性代数例程，由DC_LAPACK使用
• 拉帕克复数的线性代数例程算术，由DC_LAPACK使用
• DR1_雷达5RADAU5驱动程序（刚性范德波尔方程）
• DR2_雷达5RADAU5驱动程序（放大器问题，指数1的微分代数）
• RADAU公司变阶隐式Runge-Kutta方法（Radau IIA）（开关在订单5、9和13之间自动）对于形式问题My'=f（x，y）与可能奇异矩阵M；对于选项IWORK（11）=3和IWORK（12）=3，代码在数学上是相当于RADAU5（通常比RADAU5慢一点）。
• DR_RADAU公司RADAU驱动程序（刚性范德波尔方程）
• 罗德斯4（3）阶Rosenbrock方法，对于形式My'=f（x，y）的问题奇异矩阵M；产量密集；考虑了代数阶条件关于线性代数例程用户可以选择将代码链接到DC_DECSOL和DECSOL或使用DC_LAPACK和LAPACK以及LAPACKC（实际上，文件LAPACKC和不使用需要COMPLEX*16的DC_LAPACK）
• DR_RODAS公司RODAS驱动程序（刚性范德波尔方程）
• SEULEX公司基于线性的外推方法形式问题的隐式EulerMy'=f（x，y）与可能奇异矩阵M；产量密集；关于线性代数用户有与RODAS相同的选择
• DR_SEULEX公司SEULEX的驱动程序（刚性范德波尔方程）

  具有分布时滞的刚性问题（积分微分方程）：通过将DC_DECSOL替换为DC_SUMEXP，RADAU5可以解决此类问题。描述见：N.Guglielmi和E.Hairer，Applied stiffODE和DDE的积分器用于解决分布式延迟问题。这些代码是与尼古拉·古列尔米（Nicola.Guglielmi（at）gssi.it）。它们是免费的，但须遵守以下规定许可协议（有关详细信息，请参阅RADAR5“用户指南”的版权声明（第9节）。

• DC-SUMEXP公司必须与RADAU5应用程序一起使用的线性代数子程序
• DR-gamm-SUMEXP博士分布式延迟测试问题的驱动程序（gamma分布）
• MYELO-SUMEXP博士化疗诱导的分布式延迟模型的驱动程序骨髓抑制（γ分布）

  老年人：但是，一些其他可用代码没有相同的线性代数选项包括：

• 新加坡存托凭证44阶对角隐式Runge-Kutta方法对于形式My'=f（x，y）的问题奇异矩阵M；输出密集，采用DECSOL；A类司机也可以使用。
• 活性氧44（3）阶经典Rosenbrock方法，对于形式My'=f（x，y）的问题奇异矩阵M；无密集输出；使用DECSOL；A类司机也可以使用。
• SODEX公司基于线性的外推方法形式问题的隐式中点规则My’=f（x，y）；使用DECSOL；A类司机也可以使用。
• RADAUP公司5、9或13阶隐式Runge-Kutta方法（Radau IIA）表格问题My'=f（x，y）与可能奇异矩阵M；被RADAU取代。

• 有一个文件夹，是Blake Ashby写的“bmashby（at）stanford.edu”，其中包含C++版本非差分积分器DOPRI5和刚性积分器RADAU5的输出。它可以用“tar xzf Integrator T.tgz”展开。

• 有Matlab和Octave文件MatlabStiff公司,八面体刚度,由Denis Bichsel撰写“dbichsel（at）infomanik.ch”，用于刚性积分器RADAU。

• 关于Matlab接口对于刚性积分器RADAU5和SEULEX，请咨询慕尼黑理工大学主页。
• RADAU5的Matlab版本可以从图宾根大学（Ch.Engstler）。

• 交互式pdf文件萨拉戈萨大学由提供（路易斯·兰德斯）. 它是RADAU5的学术实现，允许积分二维微分系统。

• 有一个gzip-ped刚性.tar.gz包含所有这些程序的文件。

• tar文件摇滚巨星包含Fortran 77代码为ROCK2的目录（顺序2）和ROCK4（顺序4），以及以下三个示例的子目录。对于使用命令展开目录焦油xvf岩石焦油
• BURGER，BURGER方程的MOL离散化（维数500）；
• BRUSS-2D，反应扩散问题的MOL离散化在2个空间维度中（ODE的维度为32768）；
• FINAG，FitzHug和Nagumo神经传导方程（400维）。

• 延缓将代码DOPRI5扩展到延迟差分方程y'（t）=f（t，y（t），y（t-a），…）
• DR_预计RETARD驱动器

  有一个文件夹Matlab代码,由Denis Bichsel撰写“dbichsel（at）infomanik.ch”，用于非刚性积分器DOPRI5和DOP853用于延迟微分方程。

• tar文件radar5-v2.2.tar（2024年2月版本2.2）包含一个包含Fortran 90代码RADAR5（必要的线性代数）的目录例程和子目录。A类用户指南对于版本2.2可用。
• 抑制剂分子酶动力学，尺寸4，一个恒定延迟；
• HAYASHI是一个几乎奇异的状态相关中性问题，维数2作为微分代数问题，一个消失延迟；
• 肝炎急性乙型肝炎病毒感染，维度10，5个恒定延迟；
• OREGONATOR化学动力学，维度2，一个恒定延迟；
• ROBERTSON与稳态溶液的化学反应，尺寸3，一个恒定延迟，非常大的时间间隔（步长大于延迟）；
• SDISC，非光滑人工问题，维数1，1恒定延迟；
• WALTMAN，抗体生成阈值模型，维度6，2状态相关延迟趋于零，右侧的不连续性方程；
• 状态相关人工问题；
• ELSNOR，解决方案终止问题。

• 雷达5（2024年2月2.2版）
• DC_SUMEXPDEL公司用分布式延迟替换问题的文件DC_DECSOLDEL
• DR_PARETO公司RADAR5的驱动程序，用于解决具有Pareto-分布积分项的问题。

• 老人牌汽车55（3）阶半显式Runge-Kutta方法；使用DECSOL、LAPACK、LINSP（代码由V.Brasey编写）
• 老人牌5.PS包含HEM5用户指南的PostScript文件。
• 亚麻布包含MA28的稀疏线性代数例程哈维尔图书馆
• DR_ISO公司HEM5驱动器（绝缘子链，非解析型）
• DR_ISOSPHEM5驱动程序（绝缘子链，稀疏型）
• PHEM56型5（4）阶分块半显Runge-Kutta方法；使用DECSOL、LAPACK、LINSP（代码由A.Murua编写ander（at）si.ehu.es公司)
• PHEM56.PS型包含PHEM56用户指南的PostScript文件。
• DR_项目56PHEM56驱动器（绝缘子链，稀疏型）

• 有一个gzip-ped机械.tar.gz包含所有这些程序的文件。