反褶积Lab2

反褶积lab2:反褶积显微术的开源软件。由于光的衍射极限,荧光显微术中的图像本质上是模糊的。反褶积显微术的目的是在数值上补偿这种退化。反褶积被广泛应用于恢复三维生物样品的精细细节。不幸的是,处理反褶积工具并不简单。除此之外,终端用户必须选择合适的算法、校准和参数化,同时还可能面临高要求的计算任务。为了使反褶积变得更容易操作,我们开发了一个实用的反褶积显微镜平台,称为反褶积实验室。自由分布的反褶积实验室拥有3D显微镜反褶积的标准算法,并通过面向用户的界面驱动它们。本文利用反褶积lab2的发布,对软件包及其内置的反褶积算法进行了完整的描述。我们研究了反褶积显微术中使用的几种标准算法,特别是:正则化逆滤波、Tikhonov正则化、Landweber、Tikhonov-Miller、Richardson-Lucy和快速迭代收缩阈值法。我们使用模拟数据集和真实实验图像对这些方法进行了评估。我们在图像质量、性能、可用性和计算需求方面对这些算法进行了区分。我们的演讲结束时讨论了反褶积的最新趋势,灵感来自最近组织的反褶积显微镜大挑战的结果。

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