序列总线 swMATH ID: 29583 软件作者： Pantano，L.、Estivill，X.、Marti，E。 描述： SeqBuster是一种用于处理和分析小RNA数据集的生物信息工具，它揭示了人类胚胎细胞中普遍存在的miRNA修饰。高通量测序技术使直接编目和分析活细胞总小RNA含量快照成为可能。高通量测序数据的表征需要生物信息工具提供小RNA转录组的广阔前景。在这里，我们介绍了SeqBuster，一个高度通用和可靠的基于web的工具包，用于处理和分析大规模小RNA数据集。该工具的高度灵活性体现在预分析中为绘图目的提供的多种选择以及为数据操作提供的不同分析模块中。为了克服基于web的工具的存储容量限制，SeqBuster提供了一个独立版本，允许针对任何自定义数据库进行注释。SeqBuster在一个独特的平台中集成了多个分析模块，并构成了第一个提供miRNA变体（isomiRs）深入特征描述的生物信息工具。SeqBuster应用于人类胚胎干细胞的小RNA数据集表明，大多数miRNAs呈现不同类型的isomiRs，其中一些与干细胞分化有关。SeqBuster对isomiRs的详尽描述有助于识别与生理和病理过程相关的miRNA-v变异。SeqBuster位于http://estivill_lab.crg.es/seqbuster。 主页： https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2836562/ 源代码： https://github.com/lpantano/seqbuster 相关软件： DEG序列;星形底座;BSMAP公司;烤面包;天鹅绒;阿拉伯;拼接陷阱;DWE公司;CLIPZ公司;mir工具;miR快件;TargetSpy公司;miRNA键;PatMaN公司;项目II;MiRonTop公司;MiPred公司;miR分析仪;DIANA-mirExTra公司;米尔芬德 引用于： 1文件 3位作者引用 1 Ana M.阿兰赛。 1 迈克尔·哈肯伯格 1 罗德里格斯-埃兹佩列塔，奈亚拉 0连载引用 在2个字段中引用 1 总体主题；集合（00-XX） 1 生物学和其他自然科学（92-XX） 按年份列出的引文