SNP最大值 swMATH ID: 10515 软件作者: Anne-Laure,Boulesteix;卡罗琳·斯特罗布尔(Carolin Strobl);斯特凡·韦丁格;Wichmann,H.-Erich;斯特凡·瓦根菲尔 描述: SNP-SNP相互作用的多重测试。大多数遗传病是复杂的,即与SNP的组合而非单个SNP有关。在过去的几年里,这个主题经常被用逻辑运算符链接的表达式给出的SNP-SNP交互模式来解决。当同时考虑许多SNP时,可以应用在高维环境中进行多重测试的方法。然而,当逻辑表达式被最优选择时,另一个不太知名的多重测试问题出现在SNP的固定子集中。在本文中,我们提出了一种通用的渐近方法,用于推导各种情况下最大选择的齐方统计量的分布。我们展示了该结果如何用于测试逻辑表达式,尤其是SNP-SNP交互模式,同时控制多重比较。仿真表明,当选择逻辑表达式时,我们的方法提供了多种测试调整,例如最大化统计值。通过应用于一项基于大规模人群的研究(考虑KORA中的过敏和哮喘)的真实数据集,证明了其益处。我们的方法的实现可从综合R档案网络(CRAN)获得,即R包“SNPmaxsel”。 主页: http://cran.r-project.org/web/packages/SNPmaxsel/index.html 源代码: https://github.com/cran/SNPmaxsel网站 关键词: 最大T;调整;最佳选择;最大选择统计;基因-基因;联想研究;数学软件R;软件包SNPmaxsel 相关软件: R(右);逻辑注册;卢比/夸脱;mvtnorm公司;CRAN(起重机);QSIMVN公司 引用于: 3文件 全部的 前5名12位作者引用 1 马·戈扎塔·博格丹 1 安娜·劳尔·伊萨博(Anne-Laure Isabeau),布列斯特(Boulesteix) 1 托尔斯滕·霍霍恩 1 卡加·伊克斯塔特 1 马格达莱娜·玛丽娜 1 马丁·波什 1 霍尔格·施温德 1 卡罗琳·斯特罗布尔 1 斯特凡·瓦根菲尔 1 斯特凡·威丁格 1 海因茨·埃里希 1 阿希姆·齐利埃斯 2篇连载文章中引用 2 遗传学和分子生物学中的统计应用 1 生物计量学 在2个字段中引用 2 统计学(62-XX) 2 生物学和其他自然科学(92-XX) 按年份列出的引文