协同因素 swMATH编号： 35552 软件作者： 罗伊，A。；杨建毅；张，Y。 描述： COFACTOR：基于结构的蛋白质功能注释的精确比较算法。我们开发了一个新的COFACTOR网络服务器，用于基于结构的蛋白质功能自动注释。从实验测定或计算建模给出的结构模型开始，COFACTOR首先通过将目标结构穿过三个具有已知蛋白质-配体结合相互作用的代表性模板库，识别具有相似折叠和功能位点的模板蛋白，酶委员会编号或基因本体术语。然后从功能模板推导出这三个方面的生物功能见解，其置信度通过结合全局和局部结构相似性的评分函数进行评估。该算法已通过大规模基准测试进行了广泛的基准测试，与传统的基于序列的方法相比显示出显著的优势。在最近的社区CASP9实验中，COFACTOR被评为预测蛋白质-配体结合位点的最佳方法。COFACTOR服务器和模板库在http://zhangab.ccmb.med.umich.edu/COFACTOR。 主页： https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3394312/ 相关软件： DeepGO公司;字符串;DeepGOPlus（深度GOPlus）;UDSMProt公司;网络GO;I-TASSER公司;MetaGO公司;GOProFormer公司;多PredGO;ProLanGO项目;ProtVec公司;亚当;UniProt公司;反应途径;张紧器2传感器;卡塔尔科技大学;ProTranslator软件;戈尔巴勒;深度文本2GO;新GOA 引用于： 4文件 全部的 前5名11位作者引用 1 阿克谢·迪帕克 1 戈帕拉克里希南，克里希纳萨米 1 Kumari，斯维塔 1 萨吉塔·卢鲁 1 阿鲁穆甘Mohana Priya 1 阿什什·兰扬 1 亚伦·雷德利。 1 拉夫库什·夏尔马 1 穆罕默德·托奎尔 1 王生 1 徐汉文 2篇连载文章中引用 2 理论生物学杂志 1 遗传学和分子生物学中的统计应用 在3个字段中引用 4 生物学和其他自然科学（92-XX） 1 计算机科学（68至XX） 1 流体力学（76-XX） 按年份列出的引文