MUSA公司 swMATH ID: 35518 软件作者： Nuno D.Mendes、Ana C.Casimiro、Pedro M.Santos、Isabel Sá-Coreia、Arlindo L.Oliveira、Ana T.Freitas 说明： MUSA：一种用于识别生物重要基序的无参数算法。结果：我们提出了一种新的算法，MUSA（使用无监督方法的Motif finding using an UnSupervised Approach），该算法既可以用于自主发现过度表示的复杂模体，也可以用于估计现代模体搜索器的搜索参数。该方法依赖于一种双聚类算法，该算法对小图案的共现矩阵进行操作。该方法的性能与所寻求图案的复合结构无关，对其特征几乎没有假设。MUSA算法应用于两个涉及恶臭假单胞菌KT2440的数据集。第一个数据集由70个σ54依赖的启动子序列组成，第二个数据集包括54个对苯酚反应的上调基因启动子序列，如定量蛋白质组学所示。结果表明，该方法在识别具有生物学意义的复杂基序方面非常有效。可用性：MUSA算法可根据作者的要求提供，并将通过基于Web的界面提供。 主页： https://academic.oup.com/bioinformatics/article/22/24/2996/209502 相关软件： 字谍;MotifMiner公司;网络MOTIFS;减少;垫片;ARGO公司;比较Motif;MotifVoter（MotifVoter）;PROSITE公司;模因;瓦伦 引用于： 1文件 2位作者引用 1 马特奥·科明 1 戴维·维尔佐托 连载1篇 1 算法 在1个字段中引用 1 生物学和其他自然科学（92-XX） 按年份列出的引文