垫片 swMATH ID: 35520 软件作者： Arijit Chakravarty、Jonathan M.Carlson、Radhika S.Khetani、Charles E.DeZiel、Robert H.Gross 描述： 间隔物：识别具有非接触临界残留物的顺式调节元素。结果：我们给出了该算法的一个实现，命名为SPACE（基于分离模式的顺元素识别算法），并证明了其在识别“间隙”和高度退化基序方面的有效性。我们比较了SPACE在42个实验定义的调控子上的表现，这些调控子来自枯草芽孢杆菌、大肠杆菌和酿酒酵母。这些基序发现器涵盖了广泛的枚举和统计方法，包括专门为原核生物和“间隙”基序设计的程序。可用性：Java 1.4实现可以在Web上免费获得，网址为http://genie.Dartmouth.edu/SPACER/ 主页： https://academic.oup.com/bioinformatics/article/23/8/1029/198138 依赖项： Java语言 相关软件： 字谍；MotifMiner公司；网络MOTIFS；减少；ARGO公司；MUSA公司；CompariMotif公司；MotifVoter（MotifVoter）；PROSITE公司；模因；瓦伦 引用于： 1文件 2位作者引用 1 马特奥·科明 1 戴维·维尔佐托 连载1篇 1 算法 在1个字段中引用 1 生物学和其他自然科学（92-XX） 按年份列出的引文