生命史分析的Aster模型
明尼苏达大学，双子城 统计学院 查理·盖尔的主页
生态、进化和行为系 露丝·肖的主页
芝加哥植物园 植物保护生物学研究所 斯图亚特·瓦格纽斯的主页
紫锥菊项目页面
目录
新增！所有包含R代码的aster技术报告都已更新为运行在当前版本的R上（只需要对代码进行三次小改动）。它们位于以下位置github储存库.
新增！R包紫菀版本为1.1-3（2023-12-14）。
新增！R包aster2号版本0.3（2017-03-26）。
John Stanton-Geddes创建了一个Google Group用于aster分析讨论https://groups.google.com/forum（网址：https://groups.google.com/forum）/#!论坛/aster-analysis-user-group.虽然还不多，但我们会尽力跟上发布的问题那里。
查理·盖尔（Charlie Geyer）教授了一整学期关于aster模型的专题课程面向生物和统计学研究生的混合观众。课程网页是http://www.stat.umn.edu/geyer/8931aster网站/，它也链接在上面的“目录”部分中。所有用于演讲的幻灯片都在这些网页上。诚然，没有书那么好看，但是尽可能接近现有的aster分析教科书。
aster包的第二个版本，称为aster2号
有有装船! 这仍然是测试版，除非他们需要具有依赖组的模型aster2号实施然而紫菀没有。新包裹没有倒过来与旧的兼容，但应该更容易使用。因此，当新的包的功能已完成（尚未，但是真实的现在很快)它应该用于所有新项目。旧包裹不会添加任何新功能，但会在需要时修复错误，并将保留在CRAN上，以便重新进行旧的分析。
我们已经开始在明尼苏达大学数字保护协会.我们预计该网站不会很快消失，但保护将永久存在。
报纸统一生命史分析进行推断健身与人口增长已获得2009年总统奖美国自然主义者协会.该奖项授予发表于美国博物学家总统任期前一个日历年。美国博物学家协会主席Joel Kingsolver获得此奖项的年份。
在您拥有的R安装中安装软件（不是管理员
或根
用户），只需执行
install.packages（“aster”）
在R命令行。否则，请咨询友好的当地系统管理员来执行此操作。
报纸
Ruth G.Shaw、Stuart Wagenius和Charles J.Geyer（2015年）。
敏感性狭叶松果菊一只专业蚜虫：基因型变异与人口学的生态进化观后果。
生态学杂志 103, 809–818.
可在生态学杂志网站。数据分析的一部分需要条件aster模型，因为时变协变量的早期出版）。报纸
Daniel J.Eck、Ruth G.Shaw、Charles J.Geyer和Joel Kingsolver（2015年）。
昆虫体型表型选择的综合分析和开发时间
进化 69, 2525–2532.
现在可以在进化网站。其中引用的技术报告（698）链接如下。本文中的分析说明了多项式节点在图形模型（需要R包aster2号)，在这种情况下以模拟特定年龄的变态。它还说明了使用人口生长速度作为适应度指标。
报纸
Charles J.Geyer、Caroline E.Ridley、Robert G.Latta、Julie R.Etterson、，和Ruth G.Shaw（2013年）。
局部适应和遗传对适应性的影响：计算用于具有随机效应的指数族模型。
应用统计年鉴,7, 1778–1795.
它以前的名称是具有随机效应的Aster模型
,现在可以在应用统计年鉴网站。其中引用的技术报告（692）链接如下。
报纸
Ruth G.Shaw和Charles J.Geyer（2010年）。
推断健身景观。
进化 64, 2510–2520.
现在可以在进化网站。其中引用的五份技术报告（669、670、671、674和675）链接如下。
报纸
斯图亚特·瓦格纽斯（Stuart Wagenius）、海伦·H·汉格尔布鲁克（Helen H.Hangelbroek）、卡罗琳·雷德利（Caroline E.Ridley）、，和Ruth G.Shaw（2010年）。
多年生草原植物的双亲近交和异种交配：前八年对后代的健康影响。
进化,64, 761–771.
现在可以在进化网站。
报纸
Ruth G.Shaw、Charles J.Geyer、Stuart Wagenius、Helen H.Hangelbroek和Julie R.Etterson（2008）。
统一生命史分析进行健康推断以及人口增长。
美国人自然主义者,172，E35–E47.
现在可用，还有三份技术报告对本文中的实例进行了全面的数据分析。
报纸
Charles J.Geyer、Stuart Wagenius和Ruth G.Shaw（2007年）。
生命史分析的Aster模型。
生物特征,94, 415–426.
现在可以使用，包含完整数据的技术报告也可以使用对论文中的示例进行分析，并留下许多理论细节纸外，还有一个教程（包小插曲），它提供了更多软件的基本介绍。
| PDF文件 |
描述 |
| TR 698型
| 新增！技术报告标题为支持数据分析表型的综合分析昆虫个体大小和发育时间的选择 ,这是第一个使用aster2号包装第一个使用依赖组处理裁判打电话标记重捕获 数据，我们称之为生命史阶段（本例中为昆虫幼虫、蛹、成虫）。该分析结合了通过健身景观（如Lande-Arnold）和人口增长率（如莱斯利矩阵）得到了所有这三个一个aster分析中的方面，从而实现标题的承诺第二张aster纸统一生命史分析 .（三个文件位于大学明尼苏达州数字保护协会,技术报告和Rnw文件的PDF需要重新创建TR，其中包括所有计算的所有R代码，尽管此报告使用针织物而不是Sweave公司,以及包含原始数据的CSV文件转换为格式aster2号点赞。） |
| TR 696型
| 技术报告标题为具有随机效应和加性遗传方差的Aster模型健身,它显示了如何计算适合度的加性遗传方差，这是应用费希尔自然选择基本定理所必需的。（两个文件位于明尼苏达大学数字保护,技术报告和Rnw文件的PDF需要重新创建TR，其中包括所有计算的所有R代码。） |
| TR 692型
| 技术报告标题为基于惩罚似然的随机效应Aster模型,其中引入了具有（近似）随机效应的aster模型。（两个文件位于明尼苏达大学数字保护,技术报告和Rnw文件的PDF需要重新创建TR，其中包括所有计算的所有R代码。） |
| TR 676型
| 技术报告标题为Aster模型的哲学审视，提供了概述aster模型背后的数理统计技术性。（一个文件位于明尼苏达大学数字保护,技术报告的PDF）。 |
| TR 675修订
| 技术报告标题为Aster模型和Lande-Arnold Beta给出了有效的假设方向选择梯度的置信区间。（两个文件位于明尼苏达大学数字保护协会,技术报告和Rnw文件的PDF需要重新创建TR，其中包括所有计算的所有R代码。）本技术报告已修订2010年1月13日。如果你有早期版本，请注意这个数字是错误的。（仅供记录，早期版本可以在这里找到但除比较外，不得用于其他任何原因查看错误是什么。） |
| TR 674修订
| 技术报告标题为涉及健康状况的假设检验和置信区间Aster型号适合,如何对健身环境是否存在最大值进行假设测试（存在稳定选择），如果存在，如何为最大值的位置。（两个文件位于明尼苏达大学数字保护,技术报告和Rnw文件的PDF需要重新创建TR，其中包括所有计算的所有R代码。）本技术报告已修订2010年1月9日。如果你有早期版本，请注意保密最大值区域太大（忘记平方根）。（仅供记录，早期版本可以在这里找到但除比较外，不得用于其他任何原因查看错误是什么。） |
| TR 671修订
| 技术报告标题为适宜景观评价中的模型选择,这是对许多表型性状时该做什么的详细说明是经过测量的，尽管人们希望模型适合性是所有因素的函数为了得到良好的统计估计，必须使用较少的子模型参数。（两个文件位于明尼苏达大学数字保护,技术报告和Rnw文件的PDF需要重新创建TR，其中包括所有计算的所有R代码。）本技术报告已修订2009年7月6日。如果您有早期版本，请告知早期版本中的模型平均计算是错误的。（仅供记录，早期版本可以在这里找到但除了比较之外，不应出于任何原因使用查看错误是什么。） |
| TR 670型
| 技术报告标题为兰德·阿诺德分析述评，这是一个详细的中的理论解释兰德和阿诺德（1983）和还有一些补充图在Evolution 2008上的一次演讲中，明尼苏达大学，6月20日至24日。（两个文件位于明尼苏达大学数字保护,技术报告和Rnw文件的PDF需要重新创建TR，其中包括所有计算的所有R代码。） |
| TR 669型
| 技术报告包含所有2008年Evolution大会上演讲的计算和图表，明尼苏达大学，6月20日至24日。（两个文件位于明尼苏达大学数字保护,技术报告和Rnw文件的PDF需要重新创建TR，其中包括所有计算的所有R代码。） |
| aster2.rgs.pdf版
| 第二篇关于aster分析的论文。这篇文章回顾了生命史分析以及aster分析适合和三个例子，包括对健身景观和人口增长率估计。已修改并重新提交到美国博物学家.（仅供历史参考首次提交版本) |
| tr666.pdf格式
| 尚未提交的技术报告在线补遗实例的另一种计算在第二次（也是最后一次）重新提交Shaw、Geyer、Wagenius、Hangelbroek和Etterson的论文如上所述。重新创建TR所需的文件，其中包括所有计算的所有R代码，是在此文件夹中. |
| tr661.pdf格式
| 具有修改后的重新提交中的一个示例的计算Shaw、Geyer、Wagenius、Hangelbroek和Etterson的论文如上所述。（该TR于2007年11月24日稍作修订，再次修订，增加了一个2007年11月26日，结尾处有更多页面和情节，然后再次修订2007年12月26日，仅更改了一些绘图标签。）重新创建TR所需的文件，其中包括所有计算的所有R代码，是在此文件夹中. |
| tr658.pdf格式
| 包含以下内容的技术报告修改后的重新提交中其余示例的计算Shaw、Geyer、Wagenius、Hangelbroek的论文，和上述Etterson（加上另一个示例的计算在原始提交文件中，通过以下计算进行了改进TR 661）。文件夹需要重新创建TR，其中包括所有计算的所有R代码，是在此文件夹中. |
| aster-submit3.pdf格式
| 修改并重新提交论文，双倍行距。这篇论文发表于生物特征.这个印刷的版本可从牛津大学出版社获得。（仅供历史参考第一提交的版本和第二提交的版本) |
| tr644.pdf格式
| 具有修改后的重新提交中的一个示例的计算Geyer、Wagenius和Shaw的论文如上所述。
|
| 教程.pdf
| 教程（软件包小品） |
| 白色.pdf
| 关于参数引导的教程最后一节的扩展 |
| 多个pdf
| 允许相关子节点的技术报告（653）。仅具有历史意义，包含在Geyer、Wagenius和Shaw的论文如上所述。 |
Charlie Geyer在2013年中西部统计研究座谈会威斯康星州麦迪逊。这些是本次演讲的幻灯片.
Charlie Geyer在莱斯大学统计系发表演讲。这些是本次演讲的幻灯片.
Charlie Geyer在第七届年会应用数学和计算数学前沿（FACM’10）在新泽西州纽瓦克的新泽西理工学院（NJIT）。这些是本次演讲的幻灯片.
露丝·肖在2008年演变.这些是本次演讲的幻灯片.
斯图亚特·瓦格纽斯在2008年演变.这些是本次演讲的幻灯片.
Charlie Geyer在2008年演变.这些是本次演讲的幻灯片.
Charlie Geyer在WNAR公司.这些是本次演讲的幻灯片.
Ruth Shaw在彼得·尤兹学术讨论会.这些是本次演讲的幻灯片.
斯图亚特·瓦格纽斯（Stuart Wagenius）在年度生态/欧空局会议上发表演讲2006年8月，田纳西州孟菲斯生存与繁殖的联合分析来自七个种群的多年生紫锥菊植物的10多年
这些是本次演讲的幻灯片.
Charlie Geyer给出了一个谈话在统计学院研讨会上2006年3月30日。这些是本次演讲的幻灯片.
露丝·肖在进化研究学会上就此发表了演讲在阿拉斯加费尔班克斯举行的会议（2005年6月）。这是原件Microsoft PowerPoint陈述的形式和Adobe PDF（可移植文档格式）形式生产单位：开放式办公室.
这是全面数据分析提供了示例为了这次演讲。现在有了替换为紫菀建模技术报告.
我选择调用包的原因紫菀
是那个吗我们用于初始分析的数据的有机体是
紫锥花(狭叶松果菊)
哪个在阿斯特家族。提交的论文草稿说
我们用花来命名我们的模特，因为花的名字很短而且很多比…更好森林图指数族条件或非条件规范统计模型或任何其他我们能想到的描述性名称。
也许不是很好的理由，但是引导程序
和手提刀
和模拟退火
甚至更少与实际统计数据的连接。
你可以随便叫，LHA生命史分析
或用于平坦指数族
或者别的什么。但它会此时更改R包的名称太麻烦了，由于函数名称
紫菀summary.aster公司anova.aster公司预测主站
不应该改变。
UROP（本科生研究机会计划）机会涉及aster模型在本网页上进行了描述.
