第41卷,第179-189页,2014年。
GeneRank问题的多项式预处理
Davod Khojasteh Salkuyeh、Vahid Edalatpour和Davod Hezari
摘要
识别与特定疾病有关的关键基因是生物医学研究中的一个非常重要的问题。GeneRank模型基于PageRank算法,并具有许多数学特性。该模型将基因表达信息与网络结构和结合基因芯片实验结果对基因进行排序例如,来自基因注释(GO)的表达信息。在本研究中,我们提出用多项式预处理共轭梯度算法求解GeneRank问题并研究其性质。通过数值实验验证了所提出的预处理方法的有效性。
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关键词
基因网络,基因本体,共轭梯度,切比雪夫多项式,预条件,M矩阵
AMS主题分类
65F10、65F50、9208、92D20
引用的ETNA文章链接
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