SMPDB（小分子通路数据库）是一个交互式可视化数据库，包含350多条人类发现的小分子通路。超过2/3的这些途径（>280）未在任何其他途径数据库中找到。SMPDB专门用于支持代谢组学、转录组学、蛋白质组学和系统生物学中的通路阐明和通路发现。它能够做到这一点，部分原因是提供了人类代谢途径、代谢疾病途径、代谢信号途径和药物作用途径的精细详细、完全可搜索的超链接图。所有SMPDB通路都包含有关相关器官、亚细胞隔室、蛋白质辅因子、蛋白质位置、代谢物位置、化学结构和蛋白质四元结构的信息。每个小分子都超链接到HMDB公司或药物数据库并且每个蛋白质或酶复合物都与UniProt公司所有SMPDB途径都附有详细的描述和参考，提供了每个图表中描述的途径、条件或过程的概述。该数据库易于浏览，支持全文、序列和化学结构搜索。用户可以使用代谢物名称、药物名称、基因/蛋白质名称、SwissProt ID、GenBank ID、Affymetrix ID或Agilent微阵列ID的列表查询SMPDB。这些查询将生成匹配路径的列表，并突出显示每个路径图上的匹配分子。基因、代谢物和蛋白质浓度数据也可以通过SMPDB的映射界面可视化。SMPDB的所有图像、图像地图、描述和表格都是可下载的.
SMPDB由支持戴维·威斯哈特，部门计算机科学&生物科学,阿尔伯塔大学.
- Wishart DS、Frolkis A、Knox C等。， SMPDB：小分子通路数据库。《核酸研究》，2010年1月；38（数据库问题）:D480-7。