概述
- 这个ND（无损检测）当被注释的基因或基因产品的分子功能、生物过程或细胞成分的信息不可用时，证据代码用于注释。
- 使用ND（无损检测）证据代码明确表明，馆长已经查找了但未能找到支持在指定注释日期对分子功能、生物过程或细胞成分中的任何术语进行注释的信息。
- 请注意ND（无损检测）证据代码对其中一个根节点进行了注释，以指示在该方面缺乏知识，从而仅就本体的特定方面声明缺乏知识。使用ND（无损检测）指示在一个特定方面缺乏知识的证据代码没有对其他GO方面的知识或证据的可用性做出任何陈述。
- 还请注意，有可能存在提及该基因的论文，但没有在与GO注释相关的水平上对其进行描述。这些类型的论文的例子包括基因克隆的描述、疾病关联研究或作为生物标记物的使用。这些数据都不提供GO注释的材料，因此在这种情况下仍然建议使用ND注释。如果你使用的策展工具允许，将论文标记为“不适合注释”（黑名单）。
- ND（无损检测）应该使用只有对于根项注释，分子功能（GO:0003674）、生物过程（GO:0008150）或细胞成分（GO:0005575），在注释中使用时，表示没有关于GO这方面的基因产物的知识。
- 注：ND（无损检测）与其他证据代码不同，证据代码应被视为指示策展状态/进展的代码，而不是用于推导注释的方法。
- 当使用NOT限定符将基因产品注释为GO术语时，这是一种声明，即不适合将该特定GO术语与该特定基因产品关联。然而，这样一个否定的注释并没有对该基因产物的作用做出任何积极的声明。因此，除了NOT注释外，还应该始终有一个肯定的注释。如果对基因产物在GO的给定方面（分子功能、生物过程或细胞成分）中的作用一无所知，则应使用ND证据代码对该方面的根节点进行积极注释。
参考
- 请注意，一些小组只检查已发表的文献，而其他小组也进行序列比较，以查看是否可以根据序列比较进行注释。GO Reference集合包括一个在检查文献和序列后可与ND一起使用的参考；要使用它，请将其放在基因关联文件的参考列中。
- 即使作者在论文中声明没有可用数据或对特定GO方面的基因产物一无所知，也应使用ND（无损检测）引用注释组内部参考或GOC关于使用ND（无损检测）证据代码，而不是特定的文件。
ND使用示例
| 数据库对象ID |
DB对象符号 |
GO标识 |
数据库：参考 |
证据代码 |
带有（或）发件人 |
| PomBase:SPBC31F10.17c |
纳 |
GO:0008150（生物处理） |
政府参考号：0000015 |
ND（无损检测） |
纳 |
| PomBase:SPBC31F10.17c |
纳 |
GO:0003674（分子功能） |
政府参考号：0000015 |
ND（无损检测） |
纳 |
| PomBase:SPCC594.01 |
纳 |
GO:0005575（细胞组件） |
政府参考号：0000015 |
ND（无损检测） |
纳 |
ND的With/From列的用法
何时不使用ND
质量控制检查
仅对根节点的ND注释
证据与结论本体
ECO:0000307未发现人工断言中使用的生物数据
基因-产品-术语关系
- 当使用ND证据代码对根节点注释应用基因-产品-术语关系时，应使用以下关系：
| GO术语标签 |
GO术语ID |
GAF 2.2的RO术语 |
RO术语ID |
| 生物过程 |
去：0008150 |
参与_参与 |
RO:0002331 |
| 分子功能 |
去：0003674 |
使能够 |
RO:0002327 |
| 细胞成分 |
GO:0005575号 |
是活动的 |
RO:0002432 |
链接
GO证据代码策展人指南
基因本体网站GO证据代码列表
审查状态
上次审查日期：2018年4月12日