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标题化合物[Cu(C5H(H)N个2O(运行)2)2(H)2O) ]n个由水热合成制备,与铁同构-,公司-和镍-含有类似物。不对称单元包含两个二取代吡嗪-2-羧酸盐(pc)阴离子,它们通过一个N原子和一个O原子在赤道平面上与Cu键合。铜原子通过一个pc阴离子的第二个N原子与相邻铜原子的轴向位置结合而成链。铜周围轻微扭曲的八面体配位由水分子完成,水分子形成氢键将链连接成三维结构。所研究的晶体是反转孪晶。

支持信息

到岸价

结晶信息文件(CIF)https://doi.org/10.107/S1600536807030528/hb2444sup1.cif
包含全局数据块,I

香港特别行政区

结构系数文件(CIF格式)https://doi.org/10.107/S1600536807030528/hb244Isup2.hkl
包含数据块I

CCDC参考:1212036

关键指标

  • 单晶X射线研究
  • T型=298千
  • 平均值[西格玛](C-C)=0.006º
  • R(右)系数=0.038
  • 水风险系数=0.099
  • 数据与参数之比=13.5

检查CIF/PLATON结果

未发现语法错误
警报级别C STRVA01_警报4_CFlack测试结果不明确。来自CIF:_refine_ls_abs_structure_Flack 0.490来自CIF:_refine_ls_abs_structure_Flack_su 0.020板033_ LERT_2_CFlack参数值与零偏差2*su。0.49PLAT094_警报_2_C最大/最小残余密度比。。。。3.34铭牌222_ALERT_3_C大非溶剂H Ueq(最大)/Ueq。。。3.08比率平台710_警报4_C删除1-2-3或2-3-4线性扭转角…#51O3-CU1-O1-C1-133.60 1.60 1.555 1.555 1.5555 1.555PLAT710_警报_4_C删除1-2-3或2-3-4线性扭转角…#58O1-CU1-O3-C6-38.50 1.80 1.555 1.555 1.553 1.555
警报级别G 参考03_图纸_4_G请检查Friedel对数量的估计值是否为对的。如果不是,请在_提交的CIF的publ_section_exptl_refinement部分。来自CIF:_diffrn_reflns_theta_max 26.99来自CIF:_reflns_number_total 2460对称唯一refns计数1459完整性(_total/calc)168.61%测试3:检查Friedels的非中心结构Friedel对测量值估计1001Friedel对分数测量值为0.686是否存在重原子类型Z>Si是PLAT794_ALERT_5_G检查Cu1(2)的预测键价2.29板860_ LERT_3_G注:租赁平方限制数量。。。。。。。
0A级警报=一般情况:严重问题0B级警报=潜在的严重问题6C级警报=检查并解释G级警报=一般警报;检查0警报类型1 CIF构造/语法错误,数据不一致或缺失2警报类型2结构模型可能错误或有缺陷的指示器2警报类型3结构质量可能较低的指示器4警报类型4改进、方法、查询或建议1警报类型5信息性消息,检查

注释顶部

标题化合物(I)与其Fe同构,公司、和镍类似物[郝和刘,(2007);郝,穆和刘等。(2007)]. Cu公司(I)中的原子由两个O以双齿形式配位和来自两个独立吡嗪-2-羧酸阴离子的两个N原子。这个扭曲的八面体坐标由来自第三个原子的另一个N原子完成吡嗪-2-羧酸配体,并通过水分子的O原子(图1,表1)。一个吡嗪-2-羧酸配体与相邻的Cu配位原子通过它的第二个N原子,导致具有Z字形的聚合物结构平行于b条轴(图2)。氢键加入水分子(表2)可以稳定结构。

相关文献顶部

对于同构铁,公司、和镍类比,参见:郝和刘(2007); 等。(2007); 等。(2007).

[准备部分说明形成了红色块状晶体,但CIF数据表陈述蓝色立方体-哪个是正确的?]

实验顶部

六水合二氯化铜(0.5 mmol)、氢氧化钾(0.5 mmol/)、2-吡嗪羧酸(0.5 mmmol)、EtOH(8 ml)和H的混合物2O(8毫升)将25 ml内衬特氟隆的不锈钢高压釜在413 K温度下加热2 d,然后冷却至室温。红色块状晶体(I)以36%的收率获得。分析。C的计算10H(H)8CuN公司4O(运行)5:C 36.62,高2.44,氮17.09%;发现:C 36.59,H 2.47,N 17.01%。

精炼顶部

C原子上的所有H原子都是几何生成的(C-H=0.93Å),并且像骑马一样精致U型国际标准化组织(H) =1.2U型等式(C) ●●●●。氢原子水分子是从不同的密度图中定位出来的,并进行了细化距离限制为O-H=0.82(1)Ω和H··H=1.38(2)Ω和a固定的U型国际标准化组织(H) 0.08奥2.

结构描述顶部

标题化合物(I)与其Fe同构,公司、和镍类似物[郝和刘,(2007);郝,穆和刘等。(2007)]. Cu公司(I)中的原子由两个O以双齿形式配位和来自两个独立吡嗪-2-羧酸阴离子的两个N原子。这个扭曲的八面体坐标由来自第三个原子的另一个N原子完成吡嗪-2-羧酸配体,并通过水分子的O原子(图1,表1)。一个吡嗪-2-羧酸配体与相邻的Cu配位原子通过它的第二个N原子,导致了具有之字形的多晶结构平行于b条轴(图2)。氢键加入水分子(表2)可以稳定结构。

对于同构铁,公司、和镍类似物,参见:Hao&Liu(2007); 等。(2007); 等。(2007).

[准备部分说明形成了红色块状晶体,但CIF数据表陈述蓝色立方体-哪个是正确的?]

计算详细信息顶部

数据收集:智能(布鲁克,2001)[或4月2日?]; 单元格细化:圣普卢斯(布鲁克,2001年);数据缩减:圣普卢斯; 用于求解结构的程序:SHELXS97标准(谢尔德里克,1997);用于优化结构的程序:SHELXL97型(谢尔德里克,1997);分子图形:SHELXTL公司(布鲁克,2001年);用于准备出版材料的软件:SHELXTL公司.

数字顶部
[图1] 图1。显示30%概率位移的(I)结构碎片椭球(H原子的任意球体)。原子在对称位置(-x个+ 1,- 1/2, -z+ 3/2).
-聚[[水(吡嗪-2-羧基)铜(II)]-µ-吡嗪2-羧基]顶部
水晶数据 顶部
[铜(C5H(H)N个2O(运行)2)2(H)2O) ]F类(000) = 660
M(M)= 327.74D类x个=1.894毫克
正交各向异性,P(P)212121K(K)α辐射,λ= 0.71073 Å
大厅符号:P2ac 2ab2460次反射的细胞参数
= 7.7379 (5) Åθ=2.5–27.0°
b条= 9.9021 (5) ŵ=1.93毫米1
c(c)= 15.002 (1) ÅT型=298千
V(V)= 1149.48 (12) Å立方体,蓝色
Z轴= 40.10×0.10×0.1毫米
数据收集 顶部
Bruker APEXII CCD区域探测器
衍射仪
2219次反射> 2σ()
辐射源:精细聚焦密封管R(右)整数= 0.032
石墨单色仪θ最大值= 27.0°,θ最小值= 2.5°
φω扫描小时=89
6840次测量反射k个=1212
2460个独立反射=1519
精炼 顶部
优化于F类2二次原子位置:差分傅里叶映射
最小二乘矩阵:完整氢站点位置:从邻近站点推断
R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.038用独立和约束精化的混合物处理H原子
水风险(F类2) = 0.099 w个= 1/[σ2(F类o个2) + (0.0666P(P))2+ 0.3756P(P)]
哪里P(P)= (F类o个2+ 2F类c(c)2)/3
S公司= 1.01(Δ/σ)最大值= 0.014
2460次反射Δρ最大值=1.20埃
182个参数Δρ最小值=0.36埃
3个约束绝对结构:Flack(1983),1004对Friedel对
主原子位置定位:结构-变量直接方法绝对结构参数:0.49(2)
水晶数据 顶部
[铜(C5H(H)N个2O(运行)2)2(H)2O) ]V(V)= 1149.48 (12) Å
M(M)= 327.74Z轴= 4
正交各向异性,P(P)212121K(K)α辐射
= 7.7379 (5) ŵ=1.93毫米1
b条= 9.9021 (5) ÅT型=298千
c(c)= 15.002 (1) Å0.10×0.10×0.10毫米
数据收集 顶部
Bruker APEXII CCD区域探测器
衍射仪
2219次反射> 2σ()
6840次测量反射R(右)整数= 0.032
2460个独立反射
精炼 顶部
R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.038用独立和约束精化的混合物处理H原子
水风险(F类2) = 0.099Δρ最大值=1.20埃
S公司= 1.01Δρ最小值=0.36埃
2460次反射绝对结构:Flack(1983),1004对Friedel对
182个参数绝对结构参数:0.49(2)
3个约束
特殊细节 顶部

几何图形.所有e.s.d.(两个l.s.平面之间二面角的e.s.d.除外)使用全协方差矩阵进行估计在估计e.s.d.的距离、角度时单独考虑和扭转角;e.s.d.细胞内参数之间的相关性仅为当它们由晶体对称性定义时使用。近似(各向同性)细胞e.s.d.的处理用于估计涉及l.s.的e.s.d。飞机。

精炼.改进F类2对抗所有反射。加权R(右)-因子水风险和贴合度S公司基于F类2,常规R(右)-因素R(右)基于F类,使用F类设置为零消极的F类2。的阈值表达式F类2>σ(F类2)仅用于计算R(右)-因子(gt).并且与选择反射进行细化无关。R(右)-因素基于F类2从统计上看大约是两倍大作为那些基于F类、和R(右)-基于所有数据的系数将为甚至更大。

分数原子坐标和各向同性或等效各向同性位移参数2) 顶部
x个zU型国际标准化组织*/U型等式
铜10.42685 (6)0.63422 (4)0.59076 (3)0.01911 (14)
C1类0.1940 (5)0.8096 (4)0.6830 (3)0.0259 (5)
指挥与控制0.3720 (5)0.8540 (4)0.7110 (2)0.0174(7)
C3类0.3948 (5)0.9581 (4)0.7733 (3)0.0214 (8)
H3级0.29811.00260.79550.026*
补体第四成份0.6843 (6)0.9334 (4)0.7638 (3)0.0243 (9)
H4型0.79540.95890.78040.029*
C5级0.6628 (5)0.8307 (4)0.6996 (3)0.0226 (9)
H5型0.75940.79050.67400.027*
C6级0.6424 (6)0.4713 (4)0.4810 (3)0.0228 (9)
抄送70.4616 (5)0.4269 (4)0.4590 (3)0.0232 (9)
抄送80.4259 (6)0.3353 (4)0.3918 (3)0.0323 (10)
H8型0.51750.29880.35970.039*
C9级0.1408 (6)0.3514(4)0.4213 (3)0.0307 (9)
H9型0.02680.32690.41010.037*
C10号机组0.1755 (6)0.4432 (4)0.4894 (3)0.0271 (9)
H10型0.08470.47790.52300.033*
N1型0.5062 (4)0.7910 (3)0.6756 (2)0.0195 (7)
氮气0.5494 (4)0.9948(3)0.8012 (2)0.0191 (7)
N3号机组0.3352 (4)0.4817 (3)0.5070 (2)0.0197 (7)
4号机组0.2667 (5)0.2974 (4)0.3713 (3)0.0383 (10)
O1公司0.1945 (3)0.7028 (3)0.63112 (18)0.0201 (6)
氧气0.0686 (3)0.8697 (3)0.70894 (18)0.0259 (5)
臭氧0.6530 (4)0.5644 (3)0.54124(19)0.0218 (6)
O4号机组0.7633 (4)0.4208 (4)0.4411 (3)0.0434 (9)
O5公司0.4184 (4)0.7653 (3)0.48314 (19)0.0274 (6)
高沸点0.509(5)0.793 (6)0.462 (5)0.080*
H2W(氢气)0.335 (5)0.815 (6)0.475 (5)0.080*
原子位移参数(2) 顶部
U型11U型22U型33U型12U型13U型23
铜10.0166 (2)0.0202 (2)0.0205 (2)0.00007 (19)0.00077 (19)0.00039 (19)
C1类0.0155 (10)0.0306 (12)0.0314 (12)0.0031 (11)0.0021 (9)0.0043 (10)
指挥与控制0.0168 (17)0.0186 (17)0.0168 (17)0.0012 (14)0.0034 (13)0.0012 (15)
C3类0.021 (2)0.0237 (18)0.0189 (18)0.0014 (15)0.0012 (16)0.0043 (15)
补体第四成份0.019 (2)0.0229(19)0.031 (2)0.0010 (17)0.0004 (17)0.0052 (17)
C5级0.0156(19)0.024 (2)0.029 (2)0.0018 (16)0.0015 (16)0.0003 (16)
C6级0.0189 (19)0.024 (2)0.025 (2)0.0033 (16)0.0005 (16)0.0005 (16)
抄送70.024 (2)0.0222 (19)0.023 (2)0.0035 (16)0.0005 (16)0.0005 (16)
抄送80.023 (2)0.037(2)0.038 (3)0.003 (2)0.002(2)0.0162 (17)
C9级0.0215 (19)0.033 (2)0.038 (2)0.0013 (18)0.0046 (18)0.007 (2)
C10号机组0.022(2)0.027 (2)0.032 (2)0.0010 (17)0.0026 (18)0.0019 (17)
N1型0.0169 (15)0.0205(16)0.0211 (17)0.0013 (13)0.0001 (13)0.0009 (13)
氮气0.0184 (17)0.0182 (14)0.0206 (15)0.0002 (14)0.0006 (13)0.0037 (12)
N3号机组0.0185 (16)0.0182 (16)0.0223 (16)0.0007 (13)0.0003 (14)0.0014 (13)
4号机组0.031 (2)0.041 (2)0.043 (2)0.0074 (18)0.0033 (18)0.0200 (19)
O1公司0.0146(13)0.0238 (13)0.0219 (14)0.0003 (11)0.0022 (11)0.0039(11)
氧气0.0155 (10)0.0306 (12)0.0314 (12)0.0031 (11)0.0021 (9)0.0043 (10)
臭氧0.0135 (13)0.0233(14)0.0286 (15)0.0016 (11)0.0001 (11)0.0007 (12)
O4号机组0.0217 (17)0.054 (2)0.054 (2)0.0074 (16)0.0067 (15)0.0191 (17)
O5公司0.0234(15)0.0304 (15)0.0285 (14)0.0089 (15)0.0052 (14)0.0127 (12)
几何参数(λ,º) 顶部
Cu1-O12.015 (3)C5-H5型0.9300
Cu1-O32.023 (3)C6-O4型1.218 (5)
Cu1-O52.073 (3)C6-O3型1.293 (5)
铜-N32.089 (3)C6至C71.503 (6)
Cu1-N1型2.099(3)C7-N3号机组1.331 (5)
Cu1-N22.137 (3)C7-C8号机组1.384 (6)
C1-O2型1.203 (5)C8-N4号机组1.324 (6)
C1-O1型1.313(5)C8-H8型0.9300
C1-C2型1.506 (5)C9-N41.341 (6)
C2-N1型1.323 (5)C9-C10型1.394 (6)
C2-C3型1.402(5)C9-H90.9300
C3-N2型1.319 (5)C10-N3号机组1.320 (6)
C3-H3型0.9300C10-H10型0.9300
C4-N2型1.332 (5)N2-Cu1型ii(ii)2.137 (3)
C4-C5型1.410 (6)O5-H1W型0.82 (5)
C4-H4型0.9300O5-H2W(五氧化二氢)0.82 (5)
C5-N1型1.324 (5)
O1-Cu1-O3175.85 (12)O4-C6-O3型126.0 (4)
O1-Cu1-O589.69 (12)O4-C6-C7119.1 (4)
O3-Cu1-O5型87.45 (12)臭氧-C6-C7114.9 (3)
O1-Cu1-N396.98 (12)编号3-C7-C8121.0 (4)
O3-Cu1-N3型79.95 (12)N3-C7-C6116.5(3)
O5-Cu1-N388.47 (13)C8-C7-C6122.6 (4)
O1-Cu1-N1型80.18 (12)编号4-C8-C7122.8 (4)
O3-Cu1-N1氧化物102.86 (13)N4-C8-H8型118.6
O5-Cu1-N1型91.06 (13)C7-C8-H8型118.6
N3-Cu1-N1177.12 (14)N4-C9-C10型122.0 (4)
O1-Cu1-N293.83 (12)N4-C9-H9型119
O3-Cu1-N289.04 (12)C10-C9-H9型119
O5-Cu1-N2176.48 (14)编号3-C10-C9121.0 (4)
N3-Cu1-N291.07 (13)N3-C10-H10型119.5
N1-Cu1-N2型89.57 (12)C9-C10-H10119.5
氧气-C1-O1126.3 (4)C2-N1-C5118.0 (3)
O2-C1-C2型120.2 (4)C2-N1-Cu1型111.3 (3)
O1-C1-C2型113.5 (3)C5-N1-Cu1130.7 (3)
N1-C2-C3型121.0 (3)C3-N2-C4116.8(3)
N1-C2-C1型117.9 (3)C3-N2-Cu1ii(ii)119.8 (3)
C3-C2-C1121.1 (3)C4-N2-Cu1型ii(ii)123.2 (3)
N2-C3-C2气体121.9 (4)C10-N3-C7号机组117.5(3)
N2-C3-H3型119.1C10-N3-铜1130.3 (3)
C2-C3-H3型119.1C7-N3-Cu1型111.8 (3)
N2-C4-C5气体121.6 (4)C9-N4-C8115.7 (4)
N2-C4-H4气体119.2C1-O1-Cu1116.9 (2)
C5-C4-H4119.2C6-O3-Cu1116.5 (3)
N1-C5-C4120.5 (4)铜-O5-H1W119 (5)
N1-C5-H5型119.8铜-O5-H2W121 (5)
C4-C5-H5119.8H1W-O5-H2W小时114 (3)
O2-C1-C2-N1型175.2 (4)C5-C4-N2-Cu1ii(ii)172.6 (3)
O1-C1-C2-N1型5.7 (5)C9-C10-N3-C71.8 (6)
O2-C1-C2-C35.3 (6)C9-C10-N3-Cu1170.6 (3)
O1-C1-C2-C3173.8 (3)C8-C7-N3-C101.5 (6)
N1-C2-C3-N22.1 (6)C6-C7-N3-C10179.4 (4)
C1-C2-C3-N2177.3 (4)C8-C7-N3-Cu1型172.3 (3)
N2-C4-C5-N1型1.0 (6)C6-C7-N3-Cu16.8 (4)
O4-C6-C7-N3型177.6 (4)O1-Cu1-N3-C101.5 (4)
臭氧-C6-C7-N33.8 (5)O3-Cu1-N3-C10178.6 (4)
O4-C6-C7-C8型3.3 (6)O5-Cu1-N3-C1091.0 (4)
臭氧-C6-C7-C8175.3 (4)氮气-铜-N3-C1092.5 (4)
N3-C7-C8-N4号0.1 (7)O1-Cu1-N3-C7171.3(3)
C6-C7-C8-N4型179.0 (4)O3-Cu1-N3-C75.9 (2)
N4-C9-C10-N3号0.6 (7)O5-Cu1-N3-C781.8(3)
C3-C2-N1-C5型1.1 (6)氮气-Cu1-N3-C794.7 (3)
C1-C2-N1-C5179.4 (4)C10-C9-N4-C8号机组1.0 (7)
C3-C2-N1-Cu1型176.9 (3)C7-C8-N4-C91.3 (7)
C1-C2-N1-Cu1型2.6(4)O2-C1-O1-Cu1175.0 (4)
C4-C5-N1-C2型2.6 (6)C2-C1-O1-Cu16.0 (5)
C4-C5-N1-Cu1型175.0 (3)O3-Cu1-O1-C1133.6 (16)
O1-Cu1-N1-C20.4 (2)O5-Cu1-O1-C187.4 (3)
O3-Cu1-N1-C2176.7 (3)N3-Cu1-O1-C1175.8 (3)
O5-Cu1-N1-C289.1 (3)N1-Cu1-O1-C1型3.8 (3)
氮气-铜1-N1-C294.4 (3)氮气-Cu1-O1-C192.7 (3)
O1-Cu1-N1-C5177.3 (4)O4-C6-O3-Cu1177.0 (4)
O3-Cu1-N1-C55.6 (4)C7-C6-O3-Cu11.6(4)
O5-Cu1-N1-C593.2 (4)O1-Cu1-O3-C638.5 (18)
氮气-铜1-N1-C583.3 (4)O5-Cu1-O3-C684.9 (3)
C2-C3-N2-C4型3.7 (6)N3-Cu1-O3-C64.0 (3)
C2-C3-N2-Cu1型ii(ii)171.3 (3)N1-Cu1-O3-C6175.4 (3)
C5-C4-N2-C32.2 (6)氮气-Cu1-O3-C695.3 (3)
对称代码:(i)x个+1,1/2,z+3/2; (ii)x个+1,+1/2,z+3/2.
氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-H(H)···一个D类-H(H)H(H)···一个D类···一个D类-H(H)···一个
O5-H2W公司···臭氧0.82 (5)1.86 (5)2.682 (4)177 (7)
O5-H1型W公司···O1公司0.82 (5)2.01(4)2.757 (4)153 (7)
对称代码:(iii)x个1/2,+3/2,z+1; (iv)x个+1/2,+3/2,z+1.

实验细节

水晶数据
化学配方[铜(C5H(H)N个2O(运行)2)2(H)2O) ]
M(M)327.74
晶体系统,空间组正交各向异性,P(P)212121
温度(K)298
b条c(c)(Å)7.7379 (5), 9.9021 (5), 15.002 (1)
V(V))1149.48 (12)
Z轴4
辐射类型K(K)α
µ(毫米1)1.93
晶体尺寸(mm)0.10 × 0.10 × 0.10
数据收集
衍射仪Bruker APEXII CCD区域探测器
吸收校正
测量、独立和
观察到的[> 2σ()]反射
6840, 2460, 2219
R(右)整数0.032
(罪θ/λ)最大值1)0.639
精炼
R(右)[F类2> 2σ(F类2)],水风险(F类2),S公司0.038, 0.099, 1.01
反射次数2460
参数数量182
约束装置数量
氢原子处理用独立和约束精化的混合物处理H原子
Δρ最大值, Δρ最小值(eó))1.20,0.36
绝对结构Flack(1983),1004对Friedel
绝对结构参数0.49 (2)

计算机程序:智能(Bruker,2001)[或4月2日?],圣普卢斯(布鲁克,2001),圣普卢斯SHELXS97标准(谢尔德里克,1997),SHELXL97型(谢尔德里克,1997),SHELXTL公司(布鲁克,2001),SHELXTL公司.

选定的键长(λ) 顶部
Cu1-O12.015 (3)铜-N32.089 (3)
Cu1-O32.023 (3)Cu1-N1型2.099 (3)
Cu1-O52.073 (3)Cu1-N22.137 (3)
对称代码:(i)x个+1,1/2,z+3/2.
氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-H(H)···一个D类-H(H)H(H)···一个D类···一个D类-H(H)···一个
O5-H2W···O3ii(ii)0.82 (5)1.86 (5)2.682 (4)177 (7)
O5-H1W···O10.82 (5)2.01 (4)2.757 (4)153 (7)
对称代码:(ii)x个1/2,+3/2,z+1; (iii)x个+1/2,+3/2,z+1.
 

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