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2007年10月6日
DBAli警报!
06/17/08-DBAli数据库不再更新。


DBAli公司。帮助/Glossay。

您可以通过两种主要方式获取DBAli的具体信息:
  • 快速帮助:将鼠标放在像这样的图像上(你会在这里看到更多帮助。。。)获取有关“工具提示”的简要帮助。
  • 扩展帮助:单击类似于此的图像()要获得有关您感兴趣的主题的更多帮助。
  • 一般信息
  • 对齐统计信息
  • 线形计算
  • 更新
  • 已知问题
    • 一般信息
      • DBAli是一个数据库,其中包括对这个PDB公司数据库。DBAli中的所有成对结构比较都有使用哺乳动物小组开发的程序Angel R.Ortiz教授。使用SALIGN命令已获得DBAli中的所有多重结构对齐在里面建模师由Andrej Sali教授团队开发。
        DBAli使用Java小程序JMol公司来自Dan Gezelter及其合作者可视化分子结构。这些是要求以便正确使用JMol小程序。或者,您也可以下载Chimera项目可视化DBAli生成的重叠PDB文件。
    • 路线统计信息
      • 可以获得DBAli的当前统计信息在这里.
    • 路线计算
      • 所有成对对准计算均使用哺乳动物程序。所有的多重对准计算都是使用命令获得的SALIGN在建模师程序。通过该程序获得了蛋白质结构域和片段的定义MODDOM公司使用MCL公司集群程序。
    • 更新
      • DBAli每周自动更新。
    • 已知问题
      • -结果表的排序功能在MacOS Safari浏览器中无法正常工作。
        -一些PDB条目没有很好地解析,将生成对齐而不是三维坐标文件夹。在这些情况下,JMol不会显示重叠,但会显示内部对齐对齐框架。
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