研究论文\(\def\h填{\hskip5em}\def\hfil{\hski p3em}\def\eqno#1{\hfil{#1}}\)

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同步加速器
辐射
国际标准编号:1600-5775

北京同步辐射装置束线4B8蛋白质折叠和材料发光的真空紫外光谱研究

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中国科学院高能物理研究所北京同步辐射装置
*通信电子邮件:taoy@ihep.ac.cn

(收到日期:2009年8月26日; 2009年9月14日接受; 在线2009年10月1日)

新的4B8光束线提供360至120波长范围内的UV–VUV光纳米。它独特地支持两种光谱测量:同步辐射圆二色性光谱和VUV激发荧光光谱。前者主要用于蛋白质二级结构的研究,后者用于VUV激发发光材料的研究。实现了对荧光测量的远程访问,用户可以在线收集数据。除了稳态测量外,还使用时域方法建立了荧光寿命测量,而激光诱导温度突变正在开发蛋白质折叠动力学,使用圆二色性作为探针。

1.简介

VUV光谱,波长范围从200到120左右nm(光学窗口的截止波长),由于这一范围内的两种光谱在生物和材料研究中的重要性,引起了人们的特别关注。一个是圆二色性(CD)光谱学,测量生物分子中循环左旋和右旋偏振光之间的吸收差异。CD被广泛用于确定蛋白质的二级结构,肽键的吸收带主要在250到160之间纳米。商用CD光谱仪通常只能测量到200200以下光源强度低,导致波长为nm纳米。然而,大多数结构信息包含在200以下纳米(Miles&Wallace,2006【Miles,A.J.&Wallace,B.A.(2006),《化学社会评论》第35期,第39-51页。】). 同步辐射源可以提供强光,因此可以将高质量数据扩展到200以下纳米。此外,同步辐射圆二色性(SRCD)测量通常在溶液相进行,需要非常少量的样品,并且对大分子尺寸没有限制。因此,SRCD已成为研究蛋白质结构的一种强有力的技术,并已成为结构和功能蛋白质组学中蛋白质结晶学和NMR方法的一个有吸引力的补充。已经建造了多条SRCD梁线,其中一些正在调试或计划中(Dicko等。, 2004[Dicko,C.、Knight,D.、Kenney,J.M.和Vollrath,F.(2004)。生物大分子,5758-767。]; 克拉克和琼斯出版社,2004年[克拉克·D·T·琼斯·G(2004),《同步加速器辐射》第11期,第142-149页。]; 松尾等。, 2005[Matsuo,K.,Fukuyama,T.,Yonehara,R.,Namatame,H.,Taniguchi,M.&Gekko,K.(2005),《电子光谱学杂志》,《相关现象》,144,1023-1025。]; 米罗纳等。, 2005【Mirona,S.、Refregiersa,M.、Gilles,A.和Maurizot,J.(2005)。生物化学。生物物理学报,1724年,第425-431页。】; 萨瑟兰,2002年【Sutherland,J.(2002),《SPIE程序》,4625,126-136。】; 雅吉-沃塔纳贝等。, 2007[Yagi Watanabe,K.、Tanaka,M.、Kaneko,F.和Nakagawa,K.(2007)。科学研究院修订版78123106.]).

VUV的发展(波长<200nm)激发发光材料非常重要,因为这些荧光材料广泛用于无汞灯和面板显示设备(Wegh等。, 1999【Wegh,R.T.、Donker,H.、Oskam,K.D.和Meijerink,A.(1999),《科学》,第283、663-666页。】). 在这些设备中惰性气体(Xe或Xe/Ne)放电在140和190之间采用nm激发荧光粉。此外,宽带半导体也需要低于200的特性纳米(Sedhain等。, 2008【Sedhain,A.,Tahtamouni,T.M.A.,Li,J.,Lin,J.Y.和Jiang,H.X.(2008),《应用物理学报》93,141104。】). 出于同样的原因,同步辐射源在真空紫外激发荧光光谱中起着重要的作用。一些用于荧光光谱的同步加速器VUV光束线目前正在运行(Lee等。, 2008【Lee,T.,Luo,L.,Cheng,B.M.,Diau,E.&Chen,T.M.(2008),《应用物理快报》92,081106。】; 等。, 2007[Lin,H.,Liang,H..,Han,B.,Zhong,J.,Su,Q.,Dorenbos,P.,Birowosuto,M.D.,Zhang,G.,Fu,Y.&W.(2007).《物理评论B》,76,035117.]; 齐默勒,2007年[Zimmerer,G.(2007).辐射测量42,859-864.]).

这两种方法的有趣范围属于相同的VUV区域(200–120纳米)。然而,很少有波束线能满足这两种方法的要求。光束线4B8针对这两种光谱进行了优化,以有效利用此波长范围。为了保持测量的完整性,范围高达360nm被覆盖。描述了4B8开发的这两种方法的仪器,并给出了光束线和仪器的性能测试,证实了这两种实验的高性能。

2.光束线4B8的描述和性能

2.1. 光束线的简要说明

两种光谱学方法都需要较高的通量而CD需要一个小通量密度以防止对生物大分子的辐照损伤。低杂散光水平对CD测量也至关重要,然而,CD测量需要中等的分辨率和波长,通常要低至170左右纳米。荧光测量需要低至较低波长的激发(<140纳米)。

波束线设计在其他地方有详细描述(Tao等。, 2007[陶毅、黄毅、钱毅、严毅、徐坚和郑毅(2007).美国国际药典Conf.Proc.879,555-558.]). 如图1所示[链接]光束线主要由第一环形镜、氟化锂(LiF)窗阀、Seya单色器、第二环形镜、平面镜和光学端窗组成。第一个环形镜以62.5°的入射角使光束向上偏转,并在入口狭缝处垂直聚焦。当车窗阀关闭时,它允许在大气压力下安装该阀后面的部分光束线,光束处于打开状态,为光束线的安装和对准提供了相当大的灵活性。第二个环形镜将光束水平重定向,并将其聚焦在样品位置。通过移动平面镜,光束可以快速切换到不同的分支,用于CD或荧光测量。荧光室和氟化钙(CaF)选择LiF窗口2)CD室窗口,因为LiF窗口达到荧光测量所需的较低截止波长,而CD通常记录到170纳米和CaF2窗户的化学稳定性也更高。

[图1]
图1
梁线4B8的布局。TM1,第一环形镜;WV、LiF窗阀;EN,入口狭缝;FB,固定挡板;G、 光栅;EX,出口狭缝;TM2,第二环形镜;MB,活动挡板;PM,平面镜;LW、LiF窗口;CW、CaF2窗口;F、 焦点。

此外,北京同步辐射装置(BSRF)是一个寄生光源,与北京正负电子对撞机(BEPC)共用储存环。在专用同步加速器模式下,储存环的运行速度为2.5峰值束流为250的GeVmA。在高能模式下,能量为1.89GeV和现在峰值电流是550妈妈。

2.2. 波束线性能评估

这个通量如图2所示[链接]; 震级为~1011光子−1峰值波长位于~180纳米。这个通量根据光电二极管(UVG-100;IRD)的电流估算。通过记录水杨酸钠的荧光得到分布曲线,水杨酸钠盐的荧光发射效率在此范围内保持不变。

[图2]
图2
CD样品位置的光通量。用氮气吹扫CD室。140左右的多个峰值nm来自氮吸收。

使用一系列参考样本(Starna)评估光束线性能。使用特征吸收峰在240至290之间的钬溶液基准实现波长校准nm(图3[链接]). 波长精度的再现性已被证明保持在0.1以内nm用于长期操作。

[图3]
图3
使用0.75带宽的氧化钬参考溶液进行波长校准nm,参考值在括号内。

使用己烷参考溶液中的甲苯,使用两个狭缝宽度测定光谱分辨率(图4[链接]). 使用最大峰值与最小峰值的吸光度比计算分辨率。使用参考盐溶液测定杂散光水平(图5[链接]). 200以下nm,水平为0.06%,足以进行SRCD测量。光束线参数汇总在表1中[链接].

表1
波束线4B8参数汇总

受理 9.8mrad×2.3磁共振成像
波长范围 120–360纳米(10–3.5电子伏)
带宽 >0.55纳米
波长重复性 <0.1纳米
样品的通量 ∼1011光子−1(500毫安)−1
样品的斑点大小 荧光为1mm×1mm;变量从2开始毫米×1.5毫米至8毫米×2CD为mm
杂散光水平 ~0.06%
[图4]
图4
使用己烷溶液中的参考甲苯进行光谱分辨率测定。最大吸光度与最小吸光度的峰值比测量分辨率。
[图5]
图5
通过不同参考盐溶液的传输确定杂散光水平评估。

3.CD光谱学发展

3.1. CD仪器

CD是手性生物分子对左旋和右旋圆偏振光的差分吸收。光弹性调制器(PEM90,CaF2晶体光学头;Hinds Instruments)用于将线偏振光转换为50度左右的圆偏振光千赫。圆极化取决于线性极化,因此在PEM前面安装了Seramont偏振器(B-Halle GmbH),以保持高线性极化。通过设置延迟来校准PEM,使CD信号最大化为192.5参考样品为nm(1)-(+)-10-樟脑磺酸(CSA)(奥克伯格等。, 2000[Oakberg,T.C.,Trunk,J.&Sutherland,J..C.(2000),《SPIE公报》,4133,101-111.]).

CD检测示意图如图6所示[链接]交替变化的圆偏振光穿过样品,到达PMT探测器(R6836遮阳帘光电倍增管;滨松)。信号由带宽为150的前置放大器(A1H;电子管)放大kHz以消除高频噪声。然后通过信号处理单元(SCU100;Hinds Instruments)将放大的信号分离为交流和直流分量。直流分量反馈至国产高压伺服控制器(HT伺服),该控制器通过调整施加在PMT上的高压(HT),在光谱扫描期间保持直流分量恒定。AC部件被输入锁定放大器(7265型;信号恢复)以拾取CD信号。CD、DC、高压和束流信号均被采集。

[图6]
图6
4B8光盘检测仪器框图:PMT高压控制伺服、信号处理和数据采集系统。

在CD扫描期间,可以使用传输信号与记录的高压、PMT增益和束流相结合的既定方法同时记录吸收,以恢复吸收(Sutherland,1996[SSutherland,J.(1996),《生物分子的圆二色性和构象分析》,G.Fasman编辑,第599-634页。纽约,伦敦:Plenum出版社。]).

SRCD样品室不是抽真空,而是用氮气吹扫,以方便测量:液氮蒸发产生的高纯度干燥气体会去除仪器中光路中的氧气。样品温度由珀尔贴温度控制器控制。

为了检测膜蛋白和其他混浊样品,样品必须靠近检测器,以达到较大的接受角度,从而将与光散射从这些样品中(华莱士等。, 2003【Wallace,B.A.,Lee,S.J.G.,Orry,A.J.W.,Lobley,A.&Janes,R.W.(2003),《蛋白质科学》第12期,第875-884页。】). 从样品到探测器表面的距离在光束线4B8处是可变的,可以小到10mm,以达到要求的90°验收。

3.2. CD仪器的性能

CSA通常用作CD光谱仪的校准样品。如图7所示[链接],两个特征峰的比值(θ192.5纳米θ290.5纳米)为1.98±0.01,表明仪器已经过良好校准,杂散光水平得到了良好控制(Miles等。, 2003【Miles,A.J.、Wien,F.、Lees,J.、Rodger,A.、Janes,R.W.和Wallace,B.A.(2003)。光谱学,17,653-661。】). 使用CD工具程序(Lees等。, 2004【Lees,J.G.,Smith,B.R.,Wien,F.,Miles,A.J.&Wallace,B.A.(2004),《生物化学分析》332,285-289。】).

[图7]
图7
CSA的CD光谱,1毫克毫升−1在1中毫米长的电池。192.5 nm和290.5 nm处两个波段的最大值之比纳米为1.98。

Beamline 4B8提供低至172的常规CD测量水溶液为nm,使用0.01毫米长的石英电池(124;Hellma)。当CaF2如果使用电池,则可以在170以下实现更短的波长nm(图8[链接]).

[图8]
图8
伴刀豆球蛋白IV的CD谱;蛋白质浓度~7毫克毫升−1,使用0.01毫米CaF2细胞和D2O作为溶剂。

UV-VUV辐照对生物分子的影响变性已开始关注SRCD测量(Wien等。, 2005【Wien,F.,Miles,A.J.,Lees,J.G.,Vrönning Hoffmann,S.&Wallace,B.A.(2005),J.Synchrotron Rad.12,517-523.】). 发现存在一个阈值通量密度对于变性(英里等。, 2008【Miles,A.J.,Janes,R.W.,Brown,A.,Clarke,D.T.,Sutherland,J.C.,Tao,Y.,Wallace,B.A.&Hoffmann,S.V.(2008),《同步辐射杂志》第15期,第420-422页。】). 人血清白蛋白(HSA)通常用作辐照变性指示灯,因为它容易受到UV–VUV辐射。在束流为~200的专用操作模式下mA,HSA的多次扫描表明,辐照损伤可以忽略不计毫米×1.5mm辐照面积(图9[链接]). 然而,当束流超过400时,寄生模式下的辐照损伤很明显mA。当样品向下游移动以将斑点尺寸扩大至8时,可将不利影响降至最低毫米×2mm,同时减少通量密度。

[图9]
图9
HSA三次连续扫描图;蛋白质浓度~7.5毫克毫升−1, 0.01毫米电池。

样品温度可控制在275至368之间K.肌红蛋白的熔化曲线如图10所示[链接].

[图10]
图10
肌红蛋白的热变性曲线与温度的关系,监测温度为192纳米。插图:马骨骼肌肌红蛋白的CD谱;蛋白质浓度~7毫克毫升−1, 0.01毫米电池。

4.荧光光谱学发展

4.1. 荧光仪器

VUV激发的光学布局光致发光测量示意图如图11所示[链接]。对于荧光测量,移动平面镜,通过LiF光学窗口将光束水平转换95°进入荧光室。然后,LiF分束器反射部分光束,激发水杨酸钠荧光屏,以监测事件的变化通量,而透射光束聚焦在样品上。样品架最多可容纳七个样品。操作器(MB1504;McAllister)上安装了带样品支架的低温恒温器头,用于调整、优化和恢复样品位置。荧光检测部分垂直于激励光束布置。荧光由两个透镜收集和聚焦,并投射到荧光单色仪(SP308;Acton)的入口狭缝上,该单色仪装有三个覆盖190至1700范围的光栅nm,光谱分辨率为0.2纳米。电动滤波器移位器提供八种长通光学滤波器的选择。为了避免各向异性效应,可以在发射路径中安装魔角偏振片。

[图11]
图11
荧光仪器的光学布局。BS:分束器;MPM,移动平面镜;D、 检测器;EM,发射单色仪;FA,过滤器组件;FS,荧光屏;五十、 透镜;S、 样品;W、 LiF窗口。

荧光信号由光子计数头(H6241;哈马松)检测,其输出TTL脉冲被输入计数器模块(974;ORTEC)。从水杨酸钠信号校准样本信号。需要反射率来确定量子效率。将荧光屏插入样品和收集透镜之间,通过检测UV–VUV反射(Justel等。, 2001[Justel,T.,Krupa,J.&Wiechart,D.U.(2001),J.Lumin.93,179-189.]). 面向样品表面安装CCD摄像机,以记录荧光图像。使用涡轮泵(Turbo70;Varian)排空腔室。图12[链接]显示了典型商用红色(YGB)、绿色(ZSM)和蓝色(BAM)荧光粉的一系列VUV激发和发射光谱。

[图12]
图12
红色、绿色和蓝色荧光粉的光致发光。实线:(Y,Gd)BO:欧盟3+(YGB),红灯;虚线,Zn2二氧化硅4:锰2+(ZSM),绿灯;虚线,BaMgAl10O(运行)17:欧盟2+(BAM),蓝光。左:发射波长为594的激发光谱纳米,526nm和452YGB、ZSM和BAM分别为nm。右:发射光谱,均在172激发纳米。插图:YGB带1的发光图像mm比例尺。

已实现荧光测量的远程访问。远程桌面(Radmin;FASCO)在用户的家用计算机上运行,并显示光束线4B8桌面。借助仪器自动化,用户可以通过选择样品、优化样品位置、选择过滤器、控制样品温度(低至14K) 收集数据并最终传输数据。

4.2. 荧光寿命测量

荧光寿命检测对荧光研究至关重要。同步辐射具有脉冲短、重复频率高、波长可调范围宽等优点,是荧光寿命测量的理想激发源。这个脉冲持续时间是150脉冲间隔为800的psBSRF单束团模式下为ns。采用时间相关单光子计数(TCSPC)方法在时域内测量荧光寿命。采用反向启动-停止技术,使来自样本的脉冲信号用于启动时幅转换器(TAC),激励参考脉冲用于停止TAC。

如图13所示[链接]在输入TAC(576;ORTEC)之前,样品脉冲由快速PMT(XP2020Q;Photonis)检测,并由常数分式鉴别器(583;ORTEC)识别。它也可以通过单个光子计数单元(H7421-50;哈马松)检测,其输出TTL信号可以直接输入TAC。探测器安装在发射单色仪的出口狭缝端口。通过检测光束线入口狭缝的可见反射,使用另一个PMT(XP2020)获得激励参考脉冲。然后,信号在输入TAC之前被识别和延迟。将TAC输出输入到多通道分析仪(特朗普MCA卡;ORTEC)中,以恢复衰减曲线。为了避免脉冲堆积计数率保持在重复频率的1%以下。

[图13]
图13
TCSPC设置的框图。Ref,同步辐射参考脉冲;S、 样品;Emi,样品排放量;D、 检测器;恒定分数鉴别器;时间-幅度转换器;MCA,多通道分析仪。

使用已知寿命的化合物测试仪器的性能。强度衰减曲线属于N个-乙酰基-L(左)-色氨酸酰胺(NATA)如图14所示[链接].测量寿命(2.62±0.35ns)与报告值一致(Lakowicz,1983[Lakowicz,J.R.(1983),《荧光光谱学原理》,J.R。Lakowic编辑,第427-485页。纽约:Plenum出版社。]). 仪器响应函数(IRF)是通过检测激励脉冲的散射来测量的。

[图14]
图14
荧光衰减曲线N个-乙酰基-L(左)-水中的色氨酸酰胺(NATA),280nm激发和350nm发射。粗体线条,拟合结果。IRF,仪表响应功能。

5.总结和未来发展

束线4B8处的仪器已开发用于CD和荧光光谱。它已被应用于VUV荧光研究领域,例如新的白色荧光粉(Zhong等。, 2008[钟J.P.、梁H.B.、韩B.、田Z.、苏Q.和陶Y.(2008)。Opt.Express,16,7510-7518。])和量子切割发射研究(田等。, 2008[田,Z.,梁,H.B.,韩,B.,苏,Q.,陶,Y.,张国富,Y.(2008).物理化学学报,11212524-12529.]). 由于用户地理位置分散,大多数荧光研究都是通过远程访问进行的。此外,SRCD已被用于不同的领域,如检测DNA-碳纳米管相互作用中的痕量重金属离子(Gao等。, 2008[高,X.,Xing,G.,Yang,Y.,Shi,X..,Liu,R.,Chu,W.,Jing,L.,Zhao,F.,Ye,C.,Yuan,H.,Fang,X.Wang,C.&Zhao)结合晶体学和SRCD检查疾病相关蛋白的相互作用(Liu等。, 2009[刘,H.,彭,X.,赵,F.,张,G.,陶,Y.,罗,Z.,李,Y..,滕,M.,李,X.&Wei,S.(2009).生物化学与生物物理研究委员会379,1120-1125。])并提供了合成氨基酸手性不对称起源的证据(Burkov等。, 2008【Burkov,V.I.,Goncharova,L.A.,Gusev,G.A.,Kobayashi,K.,Moisenko,E.V.,Poluhina,N.G.,Saito,T.,Tsarev,V.A.,Xu,J.H.&Zhang,G.B.(2008),《原始生命进化生物圈》,38,155-163。】).

下一步,时间分辨方法将成为重点。为了研究蛋白质折叠动力学,正在进行泵-探针仪器设置,以便激光诱导温度突变用于泵送样品,以CD和中红外(MIR)吸收测量值作为探针。后者不仅用于测量温度变化,还用作蛋白质折叠的补充探针(戴尔等。, 1998【Dyer,R.B.,Gai,F.&Woodruff,W.H.(1998),《化学研究》第31期,第709-716页。】). MIR将涵盖纳秒到微秒的动态,而CD将关注毫秒范围。加热将通过Nd:YAG激光器的输出实现,该激光器包含光学参量振荡器装置。

对于荧光寿命测量,将调试混合填充模式,以便将单个束团插入多个束团之间的大间隙中,以使环电流足够高,以进行稳态实验,同时将单个束束用于时间分辨测量。来自BEPC主振荡器的定时信号将用于选择该单束。

远程访问已经得到了很好的使用,但有时它会受到网速低的影响,从而导致远程桌面的操作延迟。当前控制程序是使用Labview公司.利用内部的TCP/IP通信模块Labview公司,控制代码将被重写,并将取代当前的远程桌面方法,以提供更快、更安全的访问。随着高通量CD技术的发展,远程访问CD测量也是可行的。

致谢

我们感谢国家自然科学基金(10635060和20871116)和高能物理研究所创新基金(IHEP)的支持。我们感谢梁洪斌教授(中山大学)提供荧光粉。我们感谢王宝义教授和张志明博士(IHEP)在建立TCSPC仪器方面给予的支持。我们还感谢王卓贤(武汉大学)在分析荧光寿命数据方面提供的大量帮助。

工具书类

第一次引用Burkov,V.I.,Goncharova,L.A.,Gusev,G.A.,Kobayashi,K.,Moisenko,E.V.,Poluhina,N.G.,Saito,T.,Tsarev,V.A.,Xu,J.H.&Zhang,G.B.(2008)。原始生命进化。生物圈38, 155–163. 科学网 交叉参考 中国科学院 谷歌学者
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第一次引用Dicko,C.、Knight,D.、Kenney,J.M.和Vollrath,F.(2004)。生物大分子5,758–767页科学网 交叉参考 公共医学 中国科学院 谷歌学者
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