研究交流\(\def\h填{\hskip5em}\def\hfil{\hski p3em}\def\eqno#1{\hfil{#1}}\)

期刊徽标晶体学
通信
国际标准编号:2056-9890

晶体结构碳酸二芳酯:1,3-苯撑双(碳酸苯酯)

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乔治敦大学化学系,37街和O街西北,华盛顿特区,20057,美国
*通信电子邮件:jas2@georgetown.edu

瑞士诺伊沙特尔大学H.Stoeckli Evans编辑(2017年11月10日收到; 2017年11月21日接受; 在线2017年11月28日)

标题化合物的整个分子量C20H(H)14O(运行)6,由镜像对称产生,镜像连接中心苯环。碳酸盐基团采用s-cis-s-cis系统构象,扭角58.7(2) 和116.32(15)°. 这个晶体结构1,3-苯撑双(碳酸苯酯)不含强氢键,尽管C-H…O和抵消作用较弱ππ观察到相互作用,形成平行于交流电平面。

1.化学背景

有机碳酸盐广泛应用于聚合物、表面活性剂、燃料添加剂、复杂工业合成和萃取的溶剂,甚至医药剂、染料和食品(Shukla&Srivastava,2017)【Shukla,K.&Srivastava,V.C.(2017),目录修订版59,1-43。】). 它们通常通过处理合成酒精光气是一种相当有毒的试剂。其他制备方法包括酒精和一氧化碳在催化剂存在下直接冷凝酒精和二氧化碳(乔等。, 2012[Joe,W.、Lee,H.J.、Hong,U.G.、Ahn,Y.S.、Song,C.J.、Kwon,B.J.和Song,I.K.(2012)。《印度工程化学杂志》,第181018-1022页。]; 等。2012【Zhang,C.,Lu,B.,Wang,X.,Zhao,J.&Cai,Q.(2012).加泰罗尼亚科学技术2,305-309.】; 等。, 2009[赵伟、彭伟、王德、赵N.、李J.、肖F.、魏伟和孙寅(2009).目录通讯.10,655-658.]),或醇解尿素(球等。, 1980【Ball,P.,Füllmann,H.&Heitz,W.(1980).Angew.Chem.Int.Ed.Engl.19,718-720.】; 巴纳吉等。, 2003[Bhanage,B.M.,Fujita,S.,Ikushima,Y.&Arai,M.(2003),《绿色化学》,第5期,第429-432页。]; 等。, 2016[张,Z.,张,L.,吴,C.,钱,Q.,朱,Q.&韩,B.(2016).绿色化学.18,798-801.]; Mote&Ranade,2017年【Mote,D.R.&Ranade,V.V.(2017),印度化学技术杂志,24,9-19。】).

本文报告的双碳酸苯结构被确定为1的试图再结晶的意外副产物-(-苯酚)-3-苯基脲。我们推测,这种化合物是通过分子间“自我醇解”反应的组合而形成的,从而形成氨基甲酸酯中间体(Mote&Ranade,2017年【Mote,D.R.&Ranade,V.V.(2017),印度化学技术杂志,24,9-19。】),随后随着时间的推移,生成标题化合物1,3-苯撑双(碳酸苯酯)。与在二芳基脲晶体中常见的一维氢键链基序相比(Solomos等。, 2017【Solomos,M.A.、Watts,T.A.和Swift,J.A.(2017),《晶体生长设计》17,5065-5072。】; 卡帕奇·丹尼尔等。, 2010【Capacci-Daniel,C.、Gaskell,K.J.和Swift,J.(2010),《晶体生长设计》第10期,第952-962页。】, 2015【Capacci-Daniel,C.A.、Mohammadi,C.、Urbelis,J.H.、Heyrana,K.、Khatri,N.M.、Solomos,M.A.和Swift,J.A.(2015),《Cryst.Growth Des.15,2373-2379》。】, 2016【Capacci-Daniel,C.A.,Bertke,J.A.,Dehghan,S.,Hiremath-Darji,R.&Swift,J.A(2016),《水晶学报》第72期,第692-696页。】),二芳基碳酸盐缺乏联想能力通过强大的分子间氢键。对先前报道的数量相对有限的二芳基碳酸盐结构的分析表明,标题化合物具有一些相同的结构特征。

【方案一】

2.结构注释

标题化合物的分子结构如图1所示[链接]. The非对称单元由半个分子组成,因为C9和C11原子位于镜面上。C7=O3键距[1.1878(18)以及C7-O1和C7-O2键距离[1.3446(18)奥和1.3442(18)分别]与其他碳酸盐岩结构的报告值一致(剑桥结构数据库:5.38版,Groom等。, 2016【Groom,C.R.,Bruno,I.J.,Lightfoot,M.P.&Ward,S.C.(2016),《水晶学报》B72,171-179。】). 芳香环都是s-顺式至碳酸盐岩组,C7-O1-C1-C6和C7-O2-C8-C10扭转角为58.7(2) 和116.32(15) °。中心芳香环的1,3-取代赋予分子弯曲或“U”形构象和显著的净偶极矩。

[图1]
图1
标题化合物的分子结构,带有原子标记。位移椭球是在50%的概率水平上绘制的。未标记的原子通过镜像对称(对称操作:x, −+[{1\超过2}],z(z)).

3.超分子特征

1,3-苯撑双(碳酸苯酯)结构中单位-细胞轴的长度有着显著的不同。沿-轴方向由滑动对称性关联,并组装成极性链(图2[链接]). 短分子间C=O……H-C接触(2.59Å; 见表1[链接])沿此轴的分子之间可能有利于它们的组装。相邻链的偶极子ab公司平面采用反平行排列,这导致了非常长的b条轴。非常短的c(c)轴反映偏移ππ通过平移相关的分子之间的叠加(图3[链接]). 细节:Cg公司1⋯Cg公司1i、 ii(ii)= 3.822(1)?,平面间距离=3.438(1)Å,滑动1.669Å [Cg公司1是苯环C1–C6的质心,对称码:(i)x,,z(z) − 1; (ii)x,,z(z) + 1];Cg公司2⋯Cg公司2三、四= 3.822(1)?,平面间距=3.398(1)奥,滑移1.749Å [Cg公司2是中心苯环的质心,对称码:(iii)x, −+[{1\超过2}],z(z) − 1; (iv)x, −+[{1\超过2}],z(z) + 1).

表1
氢键几何形状(λ,°)

D类-H月A类 D类-H(H) H月A类 D类A类 D类-H月A类
C10-H10硫酸 0.95 2.59 3.2105(8) 123
对称代码:(i)[x+{\script{1\over 2}},y,-z+{\sscript{1\ over 2{}].
[图2]
图2
标题化合物的晶体堆积沿c(c)轴,显示相邻分子排的反平行排列,这会产生一个长b条31.548轴(3)Å. C-H?O氢键(见表1[链接])如虚线所示。
[图3]
图3
沿长方向的局部视图b条31.548轴(3)Å的标题化合物的晶体堆积,显示ππ叠加相互作用(虚线)。

4.数据库调查

剑桥结构数据库搜索(CSD,5.38版,2017年5月更新:Groom等。, 2016【Groom,C.R.,Bruno,I.J.,Lightfoot,M.P.&Ward,S.C.(2016),《水晶学报》B72,171-179。】)有机二苯基碳酸盐获得20次点击。值得注意的是,大多数结构物都具有单元-单元参数,至少有一个相当长的轴。用一个b条-轴长31.548(3)嗯,1,3-苯撑双(碳酸苯酯)的结构与这一趋势一致。在20个结构中,C=O键的长度在1.155和1.207之间奥[平均值:1.178(11)奥],C-O键长度在1.310和1.387之间奥[平均值:1.343(9)O]和O-C-O角平均值106(1)°. 然而,C-O-C-C的扭转角阿龙债券的波动性极强。

在这项研究中,只发现了另一种无环双(碳酸苯酯),即4,4′-异丙基二苯基双(碳酸苯基)(DINWOM10;Perez&Scaringe,1987年【Perez,S.&Scaringe,R.P.(1987),《大分子》,20,68-77。】). 键的长度和角度与我们的结构一致,C=O=1.152和1.173Å; C-O=1.326–1.337?和O-C-O=106.6和105.5°。碳酸二苯酯的结构也类似(ZZZPCA02;Hosten&Betz,2014【Hosten,E.&Betz,R.(2014),Z.Kristalogr.《新结晶结构》,第229、327-328页。】),C=O=1.188Å; C-O=1.343和1.337Å; O-C-O=104.85°。碳酸二苯酯的芳香扭转角也与标题化合物类似,C-O-C-C角为59.90和132.36°。

5.合成与结晶

在硝基下将等摩尔量的3-氨基苯酚和苯基异氰酸酯加入苯中,搅拌24小时h.识别为1的白色沉淀物-(-将苯酚)-3-苯基脲过滤、干燥并在各种有机溶剂(乙醇、甲醇、丙酮、乙酸乙酯、苯、甲苯、丙酮:六烯、乙腈)中重结晶。乙醇溶液在1 dram小瓶中缓慢蒸发,盖上穿孔的盖子,得到无色的1,3-苯撑双(碳酸苯酯)大板。在同一小瓶内发现的针状晶体对应于1-(-苯酚)-3-苯基脲。在多次重结晶实验中,1,3-苯撑双(碳酸苯酯)晶体的外观并不一致,这表明可能需要选择杂质和/或有利于非平衡产物的较长延迟蒸发方法来获得这种材料。

6.精炼

晶体数据、数据采集和结构精炼表2总结了详细信息[链接]H原子被包括在C-H=0.95的理想化贡献物中奥和U型国际标准化组织(H) =1.2U型等式(C) ●●●●。

表2
实验细节

水晶数据
化学配方 C类20H(H)14O(运行)6
M(M)第页 350.31
晶体系统,空间组 正交各向异性,P(P)n个
温度(K) 100
,b条,c(c)(Å) 12.9597(12), 31.548(3), 3.8219(4)
V(V)) 1562.6(3)
Z轴 4
辐射类型 K(K)α
μ(毫米−1) 0.11
晶体尺寸(mm) 0.51 × 0.36 × 0.29
 
数据收集
衍射仪 布鲁克D8探索/光子100
吸收校正 多扫描(SADABS公司; 布鲁克,2014[Bruker(2014)。APEX2,SAINT,SADABS,XCIF和XPREP。Bruker AXS,Inc.,美国威斯康星州麦迪逊。])
T型最小值,T型最大值 0.620, 0.746
测量、独立和观察的数量[> 2σ()]反射 16409, 1625, 1409
R(右)整数 0.044
(罪θ/λ)最大值−1) 0.625
 
精炼
R(右)[F类2> 2σ(F类2)],水风险(F类2),S公司 0.040, 0.093, 1.16
反射次数 1625
参数数量 121
氢原子处理 受约束的氢原子参数
Δρ最大值,Δρ最小值(eó)−3) 0.22, −0.28
计算机程序:4月2日,圣人,XCIF公司XPREP公司(布鲁克,2014[Bruker(2014)。APEX2,SAINT,SADABS,XCIF和XPREP。Bruker AXS,Inc.,美国威斯康星州麦迪逊。]),SHELXT2014/4页(谢尔德里克,2015年[Sheldrick,G.M.(2015a).晶体学报A71,3-8.]),2014年6月1日(谢尔德里克,2015年b条[Sheldrick,G.M.(2015b),《结晶学报》,C71,3-8。]),SHELXTL公司(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]),水银(麦克雷等。, 2008【Macrae,C.F.,Bruno,I.J.,Chisholm,J.A.,Edgington,P.R.,McCabe,P.,Pidcock,E.,Rodriguez-Monge,L.,Taylor,R.,van de Streek,J.&Wood,P.A.(2008),J.Appl.Cryst.41,466-470.】)和公共CIF(Westrip,2010年【Westrip,S.P.(2010),《应用结晶杂志》,第43期,第920-925页。】).

支持信息


计算详细信息顶部

数据收集:4月2日(布鲁克,2014);细胞精细化: 圣人(布鲁克,2014);数据缩减:圣人(布鲁克,2014)和XPREP公司(布鲁克,2014);用于求解结构的程序:SHELXT2014/4页(谢尔德里克,2015a);用于优化结构的程序:SHELXL2014/6页(谢尔德里克,2015b);分子图形:SHELXTL公司(Sheldrick,2008)和水银(麦克雷等。, 2008); 用于准备出版材料的软件:XCIF公司(布鲁克,2014)和公共CIF(Westrip,2010)。

(一)顶部
水晶数据 顶部
C类20H(H)14O(运行)6D类x=1.489毫克负极
M(M)第页= 350.31K(K)α辐射,λ= 0.71073 Å
正交各向异性,P(P)n个6581次反射的细胞参数
= 12.9597 (12) Åθ= 2.6–28.1°
b条= 31.548 (3) ŵ=0.11毫米负极1
c(c)= 3.8219 (4) ÅT型=100 K
V(V)= 1562.6 (3) Å棱镜,无色
Z轴= 40.51×0.36×0.29毫米
F类(000) = 728
数据收集 顶部
布鲁克D8任务/光子100
衍射仪
1625次独立反射
辐射源:微焦点密封管1409次反射> 2σ()
多层反射镜单色仪R(右)整数= 0.044
纵断面数据来自φω扫描θ最大值= 26.4°,θ最小值=2.6°
吸收校正:多扫描
(SADABS;布鲁克,2014)
小时=负极1616
T型最小值= 0.620,T型最大值= 0.746k个=负极3939
16409次测量反射=负极44
精炼 顶部
优化于F类2主原子位置定位:结构-变量直接方法
最小二乘矩阵:完整二次原子位置:差分傅里叶映射
R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.040氢站点位置:从邻近站点推断
水风险(F类2) = 0.093受约束的氢原子参数
S公司= 1.16 w个= 1/[σ2(F类o个2) + (0.0297P(P))2+ 1.0258P(P)]
哪里P(P)= (F类o个2+ 2F类c(c)2)/3
1625次反射(Δ/σ)最大值<0.001
121个参数Δρ最大值=0.22埃负极
0个约束Δρ最小值=负极0.28埃负极
特殊细节 顶部

实验。使用APEX2鉴定出一个不同的细胞(Bruker,2014)。使用SAINT(Bruker,2014)对四个框架序列进行整合并过滤统计异常值,然后使用SAINT/SADABS v2014/2(Bruke,2014)通过整合进行吸收校正,以对合并数据进行排序、合并和缩放。未应用衰减校正。

几何图形使用全协方差矩阵估计所有esd(除了两个l.s.平面之间二面角的esd)。在估计距离、角度和扭转角的esd时,单独考虑单元esd;细胞参数中esd之间的相关性仅在由晶体对称性定义时使用。细胞esd的近似(各向同性)处理用于估计涉及l.s.平面的esd。

精炼结构分阶段采用直接方法(Sheldrick,2015)。系统条件暗示了模糊的空间群。F上全矩阵最小二乘求精的成功收敛证实了空间群的选择2。最终的地图没有其他重要特征。对观测到的和计算出的结构因子之间的方差进行的最终分析表明,它们对振幅有一定的依赖性,而对分辨率几乎没有依赖性。

分数原子坐标和各向同性或等效各向同性位移参数2) 顶部
xz(z)U型国际标准化组织*/U型等式
O1公司0.53843 (8)0.37983 (3)0.6378 (3)0.0182 (3)
氧气0.64043(8)0.32686 (3)0.6752 (3)0.0176(3)
臭氧层0.49910 (8)0.32050 (3)0.3282 (3)0.0205 (3)
C1类0.45214 (11)0.40226 (5)0.5132 (4)0.0149(3)
指挥与控制0.47199 (12)0.44105 (5)0.3612 (4)0.0166 (3)
氢气0.54100.45060.33050.020*
C3类0.38982 (12)0.46595 (5)0.2539 (4)0.0185 (3)
H3级0.40220.49280.14940.022毫米*
补体第四成份0.28937 (12)0.45171 (5)0.2990 (4)0.0175 (3)
H4型0.23310.46870.22380.021*
C5级0.27117 (12)0.41276 (5)0.4532 (4)0.0178 (3)
H5型0.20230.40310.48390.021*
C6级0.35262(12)0.38772 (5)0.5632 (4)0.0159 (3)
H6型0.34040.36110.67100.019*
抄送70.55226(11)0.33988 (5)0.5243 (4)0.0144 (3)
抄送80.68026 (11)0.28716 (5)0.5719 (4)0.0141 (3)
C9级0.63026 (16)0.25000.6630 (6)0.0146 (4)
H9型0.56570.25000.78080.018*
C10号机组0.77487 (11)0.28802 (5)0.4077 (4)0.0152 (3)
H10型0.80680.31430.35130.018*
C11号机组0.82269 (16)0.25000.3264 (6)0.0159(5)
H11型0.88820.25000.21490.019*
原子位移参数(2) 顶部
U型11U型22U型33U型12U型13U型23
O1公司0.0145 (5)0.0142 (5)0.0258 (7)0.0025 (4)负极0.0060 (5)负极0.0041 (5)
氧气0.0132(5)0.0147 (5)0.0250 (6)0.0033 (4)负极0.0045 (5)负极0.0041 (5)
臭氧层0.0155 (5)0.0189 (6)0.0272 (6)0.0020 (4)负极0.0062 (5)负极0.0059 (5)
C1类0.0134 (7)0.0153 (7)0.0159 (8)0.0029 (6)负极0.0022 (6)负极0.0035 (6)
指挥与控制0.0142 (7)0.0162 (8)0.0193 (8)负极0.0034 (6)0.0018 (6)负极0.0025 (6)
C3类0.0207 (8)0.0151 (7)0.0198 (8)0.0005(6)0.0015 (7)0.0000 (6)
补体第四成份0.0153(7)0.0180 (8)0.0192 (8)0.0043 (6)负极0.0014 (6)负极0.0011 (7)
C5级0.0131 (7)0.0217 (8)0.0187(8)负极0.0009 (6)0.0020 (6)负极0.0035 (7)
C6级0.0176 (8)0.0141 (7)0.0161 (8)负极0.0014 (6)0.0014 (6)0.0002 (6)
抄送70.0110 (7)0.0149 (7)0.0173 (8)负极0.0002 (5)0.0012 (6)0.0010 (6)
抄送80.0139 (7)0.0133 (8)0.0151 (7)0.0019 (6)负极0.0043 (6)负极0.0019 (6)
C9级0.0091 (10)0.0175 (11)0.0171 (11)0负极0.0008 (8)0
C10号机组0.0144 (7)0.0162(8)0.0151 (7)负极0.0027 (6)负极0.0024(6)0.0010 (6)
C11号机组0.0116 (10)0.0211 (11)0.0150 (11)0负极0.0002 (8)0
几何参数(λ,º) 顶部
O1-C7型1.3446 (18)C4-H4型0.9500
O1-C1型1.4064 (18)C5至C61.384 (2)
氧气-C71.3442 (18)C5-H5型0.9500
氧气-C81.4109 (18)C6-H6型0.9500
臭氧-C71.1878 (18)C8-C10型1.377 (2)
C1-C2类1.379 (2)C8-C9型1.3842 (19)
C1-C6号机组1.382 (2)C9-C81.3841 (19)
C2-C3型1.385 (2)C9-H90.9500
C2-H2型0.9500C10-C11号机组1.3856 (18)
C3-C4型1.388(2)C10-H10型0.9500
C3-H3型0.9500C11-C101.3856 (18)
C4-C5型1.383 (2)C11-H11型0.9500
C7-O1-C1117.93 (12)C1-C6-H6型120.6
C7-O2-C8型117.53 (12)C5-C6-H6120.6
C2-C1-C6型121.79 (14)O3-C7-O2127.33 (14)
C2-C1-O1型116.16 (13)O3-C7-O1型127.50 (14)
C6-C1-O1型121.89 (14)O2-C7-O1型105.16 (12)
C1-C2-C3118.98 (14)C10-C8-C9123.23 (14)
C1-C2-H2120.5C10-C8-O2115.82 (13)
C3-C2-H2120.5C9-C8-O2120.67 (14)
C2-C3-C4型120.04(15)抄送8-C9-C8115.8 (2)
C2-C3-H3型120抄送8-C9-H9122.1
C4-C3-H3型120C8-C9-H9型122.1
C5-C4-C3120.04 (14)C8-C10-C11118.90 (15)
C5-C4-H4120C8-C10-H10型120.5
C3-C4-H4型120C11-C10-H10型120.5
C4-C5-C6120.43 (14)C10-C11-C10119.9 (2)
C4-C5-H5型119.8C10-C11-H11号机组120
C6-C5-H5型119.8C10号机组-C11-H11型120
C1-C6-C5型118.71 (14)
C7-O1-C1-C2负极125.86 (15)C8-O2-C7-O1负极173.24 (12)
C7-O1-C1-C658.7 (2)C1-O1-C7-O3负极0.4 (2)
C6-C1-C2-C3型负极0.4(2)C1-O1-C7-O2178.35 (12)
O1-C1-C2-C3负极175.82 (14)C7-O2-C8-C10116.32 (15)
C1-C2-C3-C4型负极0.2 (2)C7-O2-C8-C9负极69.5 (2)
C2-C3-C4-C5型0.4(2)C10-C8-C9-C8负极1.4 (3)
C3-C4-C5-C6型负极0.1 (2)O2-C8-C9-C8负极175.11 (11)
C2-C1-C6-C5型0.8 (2)C9-C8-C10-C110.5 (3)
O1-C1-C6-C5175.92 (14)氧气-C8-C10-C11174.47 (15)
C4-C5-C6-C1型负极0.5 (2)C8-C10-C11-C100.5 (3)
C8-O2-C7-O35.6 (2)
对称代码:(i)x,负极+1/2,z(z).
氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-H(H)···A类D类-H(H)H(H)···A类D类···A类D类-H(H)···A类
C10-H10···O3ii(ii)0.952.593.2105 (8)123
对称代码:(ii)x+1/2,,负极z(z)+1/2。
 

资金筹措信息

作者感谢国家科学基金会(National Science Foundation)通过授予DMR-1609541和ARCS基金会(ARCS Foundation)博士前奖学金(MAS)提供的资金支持。

工具书类

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