有机化合物\(\def\h填{\hskip5em}\def\hfil{\hski p3em}\def\eqno#1{\hfil{#1}}\)

期刊徽标晶体学
通信
国际标准编号:2056-9890

4-(2-噻吩甲基亚氨基)苯甲酸

聊城大学化学化工学院,山东252059,中华人民共和国b条聊城大学材料科学与工程学院,山东252059,中华人民共和国
*通信电子邮件:taoxuquan@lcu.edu.cn

(收到日期:2009年9月15日; 2009年9月27日接受; 在线2009年10月3日)

在标题分子中,C12H(H)92S、 苯环和噻吩环之间的二面角为41.91(8)°. 晶体填料具有短的分子间O-H…O和C-H…O氢键接触。

相关文献

关于取代噻吩的合成,参见:Koike等。(1999【Koike,K.,Jia,Z.,Nikaib,T.,Liu,Y.&Guo,D.(1999),组织公告1197-198.】). 对于希夫碱,参见:Chakraborty&Patel(1996年【Chakraborty,J.&Patel,R.N.(1996),《印度化学学会杂志》第73期,191-195年。】). 有关相关结构,请参见:Hu等。(2008【胡雪莲,李玉涛,曹丽萍(2008),《结晶学报》E64,o115。】).

【方案一】

实验

水晶数据
  • C类12H(H)92S公司

  • M(M)=231.26

  • 单诊所,21/c(c)

  • = 3.8801 (3) Å

  • b条= 10.0849 (11) Å

  • c(c)= 27.380 (3) Å

  • β= 93.185 (1)°

  • V(V)= 1069.74 (18) Å

  • Z轴= 4

  • K(K)α辐射

  • μ=0.28毫米−1

  • T型=298千

  • 0.43×0.20×0.12毫米

数据收集
  • Bruker SMART APEX CCD面阵探测器衍射仪

  • 吸收校正:多次扫描(SADABS公司; 谢尔德里克,1996年[Sheldrick,G.M.(1996),SADABS,德国哥廷根大学。])T型最小值= 0.888,T型最大值= 0.967

  • 5213次测量反射

  • 1887独立反射

  • 1496次反射> 2σ()

  • R(右)整数= 0.044

精炼
  • R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.054

  • 加权平均值(F类2) = 0.140

  • S公司= 1.09

  • 1887次反射

  • 145个参数

  • 受约束的氢原子参数

  • Δρ最大值=0.35埃−3

  • Δρ最小值=-0.22埃−3

表1
氢键几何形状(λ,°)

D类-H月A类 D类-H(H) H月A类 D类A类 D类-H月A类
O1-H1氧气 0.82 1.83 2.641 (3) 172
C3-H3乙醇O2ii(ii) 0.93 2.52 3.441(4) 169
对称代码:(i)-x个+2, -+2, -z+1; (ii)x个-1,-1,z.

数据收集:智能(西门子,1996年[西门子(1996)。SMART和SAINT。西门子分析X射线仪器公司,美国威斯康星州麦迪逊。]); 细胞精细化: 圣保罗(西门子,1996年[西门子(1996)。SMART和SAINT。西门子分析X射线仪器公司,美国威斯康星州麦迪逊。]); 数据缩减:圣保罗; 用于求解结构的程序:架子97(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 用于优化结构的程序:SHELXL97型(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 分子图形:SHELXTL公司(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 用于准备出版材料的软件:SHELXTL公司.

支持信息


注释顶部

近年来,取代噻吩的合成因其在天然产物中的存在而引起了极大的兴趣(Koike,等。, 1999). 此外,希夫碱从大量羰基化合物胺。研究表明,希夫碱化合物具有较强的抗癌活性(Chakraborty等。, 1996).

这里,我们报告合成和晶体结构一种新型柔性席夫碱化合物4-氨基苯甲酸噻吩-2-甲醛席夫碱,(I)。(I)的分子如图1所示。键的长度和角度与在类似化合物中观察到的值(Hu等。, 2008). C(1)=N(1)键长为1.277(4)Au,符合C=N双键的通常值。分子的每一半显示一个反式C=N双键的构型。

晶体结构,苯环与噻吩环的二面角为41.91(8)°。此外,分子间O-H··O和C-H··O-H键相互作用形成了二维网络结构(图2和表1)。

相关文献顶部

关于取代噻吩的合成,请参见:Koike等。(1999). 对于抗癌活性希夫碱,参见:Chakraborty等。(1996). 有关相关结构,请参见:Hu等。(2008).

实验顶部

在50 ml烧瓶中混合4-氨基苯甲酸(10 mmol)、噻吩-2-甲醛(10 mmov)和20 ml乙醇。在303K下搅拌3小时后,将所得混合物从乙醇中重结晶,得到红色结晶固体的标题化合物。元素分析:按C计算12H(H)9N个2OS:C 62.32,H 3.92,N 6.06%;发现:C 62.38,H 4.14,N 6.17%。

精炼顶部

所有氢原子都被放置在几何理想位置(C-H距离为0.93º,O-H距离为0.82º),并被视为骑在其母原子上U型国际标准化组织(H) =1.2–1.5U型等式(C,O)。

结构描述顶部

近年来,取代噻吩的合成因其在天然产物中的存在而引起了极大的兴趣(Koike,等。, 1999). 此外,希夫碱从大量羰基化合物胺。研究表明,希夫碱化合物具有较强的抗癌活性(Chakraborty等。, 1996).

这里,我们报告合成和晶体结构一种新型柔性席夫碱化合物4-氨基苯甲酸噻吩-2-甲醛席夫碱,(I)。(I)的分子如图1所示。键的长度和角度与在类似化合物中观察到的值(Hu等。, 2008). C(1)=N(1)键长为1.277(4)Au,符合C=N双键的通常值。分子的每一半显示一个反式C=N双键的构型。

晶体结构,苯环与噻吩环的二面角为41.91(8)°。此外,分子间O-H··O和C-H··O-H键相互作用形成了二维网络结构(图2和表1)。

关于取代噻吩的合成,参见:Koike等。(1999). 对于抗癌活性希夫碱,参见:Chakraborty等。(1996). 有关相关结构,请参见:Hu等。(2008).

计算详细信息顶部

数据收集:智能(西门子,1996年);细胞精细化: 圣保罗(西门子,1996年);数据缩减:圣保罗(西门子,1996年);用于求解结构的程序:架子97(Sheldrick,2008);用于优化结构的程序:SHELXL97型(Sheldrick,2008);分子图形:SHELXTL公司(Sheldrick,2008);用于准备出版材料的软件:SHELXTL公司(谢尔德里克,2008)。

数字顶部
[图1] 图1。(I)的分子结构,具有原子编号方案。位移椭球是在30%的概率水平上绘制的。
[图2] 图2。(I)的晶体包装
4-(2-巯基亚甲基氨基)苯甲酸顶部
水晶数据 顶部
C类12H(H)92S公司F类(000) = 480
M(M)= 231.26D类x个=1.436毫克
单诊所,21/c(c)K(K)α辐射,λ= 0.71073 Å
霍尔符号:-P 2ybc1697次反射的单元参数
= 3.8801 (3) Åθ= 3.0–24.6°
b条= 10.0849 (11) ŵ=0.28毫米1
c(c)= 27.380 (3) ÅT型=298千
β= 93.185 (1)°块,红色
V(V)= 1069.74 (18) Å0.43×0.20×0.12毫米
Z轴= 4
数据收集 顶部
Bruker SMART APEX CCD区域探测器
衍射仪
1887个独立反射
辐射源:精细聚焦密封管1496次反射> 2σ()
石墨单色仪R(右)整数= 0.044
φω扫描θ最大值= 25.0°,θ最小值= 1.5°
吸收校正:多扫描
(SADABS公司; 谢尔德里克,1996)
小时=44
T型最小值= 0.888,T型最大值= 0.967k个=129
5213次测量反射=2932
精炼 顶部
优化于F类2主原子位置定位:结构-变量直接方法
最小二乘矩阵:完整二次原子位置:差分傅里叶映射
R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.054氢站点位置:从邻近站点推断
加权平均值(F类2) = 0.140受约束的氢原子参数
S公司= 1.09 w个= 1/[σ2(F类o个2) + (0.0616)2+ 0.4613]
哪里= (F类o个2+ 2F类c(c)2)/3
1887次反射(Δ/σ)最大值< 0.001
145个参数Δρ最大值=0.35埃
0个约束Δρ最小值=0.22埃
水晶数据 顶部
C类12H(H)92S公司V(V)= 1069.74 (18) Å
M(M)= 231.26Z轴= 4
单诊所,21/c(c)K(K)α辐射
= 3.8801 (3) ŵ=0.28毫米1
b条= 10.0849 (11) ÅT型=298千
c(c)= 27.380 (3) Å0.43×0.20×0.12毫米
β= 93.185 (1)°
数据收集 顶部
Bruker SMART APEX CCD区域探测器
衍射仪
1887独立反射
吸收校正:多扫描
(SADABS公司; 谢尔德里克,1996)
1496次反射> 2σ()
T型最小值= 0.888,T型最大值= 0.967R(右)整数= 0.044
5213次测量反射
精炼 顶部
R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.0540个约束
加权平均值(F类2)=0.140受约束的氢原子参数
S公司= 1.09Δρ最大值=0.35埃
1887次反射Δρ最小值=0.22埃
145个参数
特殊细节 顶部

几何图形.所有e.s.d.(除了两个l.s.平面之间二面角中的e.s.d.)均使用全协方差矩阵进行估计。在估计e.s.d.的距离、角度和扭转角时,单独考虑单元e.s.d;只有当由晶体对称性定义时,才使用电解槽参数中e.s.d.之间的相关性。单元e.s.d.的近似(各向同性)处理用于估计涉及l.s.平面的e.s.d。

精炼.改进F类2对抗所有反射。加权R(右)-因子加权平均值和贴合度S公司基于F类2,常规R(右)-因素R(右)基于F类,使用F类负值设置为零F类2。的阈值表达式F类2>σ(F类2)仅用于计算R(右)-因子(gt).与选择反射进行细化无关。R(右)-因素基于F类2在统计上大约是基于F类、和R(右)-基于所有数据的因素将更大。

分数原子坐标和各向同性或等效各向同性位移参数2) 顶部
x个zU型国际标准化组织*/U型等式
N1型0.4137 (7)0.4083 (2)0.34590 (9)0.0410 (6)
O1公司0.9679 (7)0.8245 (2)0.50746 (8)0.0580(7)
上半年1.03830.89430.51970.087*
氧气0.7517 (7)0.9632 (2)0.45013 (7)0.0543 (6)
S1(第一阶段)0.3211 (2)0.18720 (8)0.26947 (3)0.0476 (3)
C1类0.2843 (8)0.3008 (3)0.36133 (11)0.0438 (8)
甲型H1A0.22970.29540.39390.053*
指挥与控制0.2192 (8)0.1869 (3)0.32997 (10)0.0389 (7)
C3类0.0828 (9)0.0673 (3)0.34261 (11)0.0472(8)
H3级0.01140.04830.37370.057*
补体第四成份0.0618 (9)0.0239 (3)0.30361 (12)0.0506 (9)
H4型0.02520.10940.30610.061*
C5级0.1821 (9)0.0267 (3)0.26221 (12)0.0515 (9)
H5型0.18880.02020.23300.062*
C6级0.8065 (8)0.8483 (3)0.46603 (10)0.0397 (7)
C70.6845 (7)0.7322 (3)0.43688 (9)0.0354 (7)
抄送80.7347 (8)0.6033 (3)0.45455 (10)0.0403(7)
H8型0.83200.59020.48600.048美元*
C9级0.6413 (8)0.4952 (3)0.42586 (10)0.0419 (8)
H9型0.67740.40980.43790.050*
C10号机组0.4922 (7)0.5141 (3)0.37856 (10)0.0358 (7)
C11号机组0.4398 (8)0.6428 (3)0.36128 (10)0.0407(7)
H11型0.34130.65610.32990.049*
第12项0.5320 (8)0.7508 (3)0.39001 (10)0.0395 (7)
第12页0.49240.83620.37810.047*
原子位移参数(2) 顶部
U型11U型22U型33U型12U型13U型23
N1型0.0479 (16)0.0341 (14)0.0407 (14)0.0028 (12)0.0002 (11)0.0039(11)
O1公司0.0861 (18)0.0389 (13)0.0463 (13)0.0045 (12)0.0194 (12)0.0047 (10)
氧气0.0839(18)0.0321 (12)0.0455 (12)0.0027 (12)0.0094 (11)0.0006 (10)
S1(第一阶段)0.0579 (6)0.0426 (5)0.0424(5)0.0005 (4)0.0042 (4)0.0011 (3)
C1类0.0488 (19)0.0427 (18)0.0404 (16)0.0005 (15)0.0060 (14)0.0051 (14)
指挥与控制0.0392 (17)0.0358 (16)0.0414 (16)0.0019 (14)0.0008 (13)0.0027(13)
C3类0.055 (2)0.0433 (19)0.0432 (17)0.0036 (16)0.0038 (15)0.0041 (14)
补体第四成份0.055 (2)0.0341 (17)0.062 (2)0.0043 (15)0.0028 (17)0.0020 (15)
C5级0.057 (2)0.0443 (19)0.052(2)0.0033 (17)0.0097 (16)0.0126 (16)
C6级0.0469 (19)0.0373 (17)0.0349 (15)0.0007 (14)0.0025 (13)0.0004(13)
C70.0389(17)0.0316 (15)0.0356 (15)0.0002 (13)0.0011(12)0.0021 (12)
抄送80.0497 (19)0.0375 (16)0.0327 (15)0.0014 (14)0.0056 (13)0.0000 (13)
C9级0.052(2)0.0308(16)0.0426 (17)0.0016 (14)0.0003 (14)0.0016 (13)
C10号机组0.0376 (17)0.0364 (16)0.0335 (15)0.0015 (13)0.0025 (12)0.0049 (12)
C11号机组0.0470 (19)0.0400 (17)0.0341(15)0.0011 (15)0.0058 (13)0.0013 (13)
第12项0.0477(18)0.0302 (15)0.0403 (16)0.0011 (14)0.0005 (13)0.0020 (13)
几何参数(λ,º) 顶部
N1-C1型1.277 (4)C4-H4型0.9300
N1-C10型1.414 (3)C5-H5型0.9300
O1-C6型1.287 (3)C6至C71.480 (4)
O1-H1型0.8200C7-C12号机组1.396 (4)
氧气-C61.252 (3)C7-C8号机组1.397 (4)
S1-C5号机组1.714 (3)C8-C9型1.380 (4)
S1-C2号机组1.724 (3)C8-H8型0.9300
C1-C2类1.448 (4)C9-C10型1.402 (4)
C1-H1A型0.9300C9-H90.9300
C2-C3型1.369 (4)C10-C11号机组1.392 (4)
C3-C4型1.408 (4)C11-C12号机组1.379 (4)
C3至H30.9300C11-H110.9300
C4-C5型1.350 (4)C12-H12型0.9300
C1-N1-C10120.4 (3)O1-C6-C7型116.9 (3)
C6-O1-H1109.5C12-C7-C8型119.2 (3)
C5-S1-C2型91.28 (15)C12-C7-C6119.8(3)
N1-C1-C2型122.4 (3)C8-C7-C6121.0 (2)
N1-C1-H1A型118.8C9-C8-C7120.7 (3)
C2-C1-H1A型118.8C9-C8-H8119.6
C3-C2-C1127.3 (3)C7-C8-H8型119.6
C3-C2-S1型110.9 (2)C8-C9-C10型120.0 (3)
C1-C2-S1型121.8 (2)C8-C9-H9型120
C2-C3-C4型113.0 (3)C10-C9-H9型120
C2-C3-H3型123.5C11-C10-C9119.0 (3)
C4-C3-H3型123.5C11-C10-N1型117.8 (2)
C5-C4-C3112.4 (3)C9-C10-N1123.0 (3)
C5-C4-H4123.8C12-C11-C10120.9 (3)
C3-C4-H4型123.8C12-C11-H11型119.5
C4-C5-S1型112.4 (2)C10-C11-H11号机组119.5
C4-C5-H5型123.8C11-C12-C7型120.1 (3)
S1-C5-H5型123.8C11-C12-H12型120
O2-C6-O1型123.0 (3)C7-C12-H12型120
氧气-C6-C7120.1 (3)
C10-N1-C1-C2176.1 (3)O1-C6-C7-C8型1.8 (4)
N1-C1-C2-C3179.9 (3)C12-C7-C8-C91.2 (5)
N1-C1-C2-S11.4 (4)C6-C7-C8-C9175.6 (3)
C5-S1-C2-C3型0.4 (3)C7-C8-C9-C100.4 (5)
C5-S1-C2-C1178.3 (3)C8-C9-C10-C110.1 (4)
C1-C2-C3-C4型178.4 (3)C8-C9-C10-N1175.2 (3)
S1-C2-C3-C4型0.2 (4)C1-N1-C10-C11143.8(3)
C2-C3-C4-C5型0.2 (4)C1-N1-C10-C940.8 (4)
C3-C4-C5-S1型0.5 (4)C9-C10-C11-C120.1 (5)
C2-S1-C5-C4型0.5 (3)N1-C10-C11-C12175.7 (3)
氧气-C6-C7-C124.9 (4)C10-C11-C12-C70.9 (5)
O1-C6-C7-C12型175.0 (3)C8-C7-C12-C11号机组1.5 (5)
氧气-C6-C7-C8178.2 (3)C6-C7-C12-C11175.4 (3)
氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-H(H)···A类D类-H(H)H(H)···A类D类···A类D类-H(H)···A类
O1-H1··O20.821.832.641 (3)172
C3-H3··O2ii(ii)0.932.523.441 (4)169
对称代码:(i)x个+2,+2,z+1; (ii)x个1,1,z.

实验细节

水晶数据
化学配方C类12H(H)92S公司
M(M)231.26
晶体系统,空间组单诊所,21/c(c)
温度(K)298
b条c(c)(Å)3.8801 (3), 10.0849 (11), 27.380 (3)
β(°)93.185 (1)
V(V))1069.74 (18)
Z轴4
辐射类型K(K)α
µ(毫米1)0.28
晶体尺寸(mm)0.43 × 0.20 × 0.12
数据收集
衍射仪布吕克智能 CCD区域探测器
吸收校正多扫描
(SADABS公司; 谢尔德里克,1996)
T型最小值T型最大值0.888, 0.967
测量、独立和
观察到的[> 2σ()]反射
5213, 1887, 1496
R(右)整数0.044
(罪θ/λ)最大值1)0.595
精炼
R(右)[F类2> 2σ(F类2)],加权平均值(F类2),S公司0.054、0.140、1.09
反射次数1887
参数数量145
氢原子处理受约束的氢原子参数
Δρ最大值,Δρ最小值(eó))0.35,0.22

计算机程序:智能(西门子,1996年),圣保罗(西门子,1996年),架子97(谢尔德里克,2008),SHELXL97型(谢尔德里克,2008),SHELXTL公司(谢尔德里克,2008)。

氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-H(H)···A类D类-H(H)H(H)···A类D类···A类D类-H(H)···A类
O1-H1··O20.821.832.641 (3)172
C3-H3··O2ii(ii)0.932.523.441(4)169.3
对称代码:(i)x个+2,+2,z+1; (ii)x个1,1,z.
 

致谢

作者感谢聊城大学的资助(X20090101)。

工具书类

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