发行内容

结构
生物学

第75卷| 第10部分

编号：2059-7983

2019年10月发行

封面插图：最近的发展凤凰利用X射线、中子和电子测定大分子结构的软件包[利布施纳等。(2019),《水晶学报》。D类75, 861-877].

专题文章

利用X射线、中子和电子测定大分子结构：最新进展凤凰

最近的发展凤凰软件包描述了使用X射线、中子和电子测定大分子结构的背景。

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科学评论

晶体学和低温电子显微镜中原子模型的推导和精炼：最新进展凤凰促进结构分析的工具

B.P.Klaholz公司

在结构生物学中，从X射线晶体学或低温电子显微镜（cryo-EM）获得的图谱中推导和精炼原子模型对于通过相互作用详细解释结构及其功能含义至关重要，例如氢键，可以分析药物的特异性和相关的分子机制。本评论总结了Phenix软件的最新功能，并强调了低温电子显微镜越来越有助于PDB和EMDB中的数据沉积。

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CCP-EM公司

飞行电子显微镜单粒子图像处理的灵活工作流西皮翁

这个西皮翁该框架允许在电子显微镜设备上生成和使用非常灵活的图像处理工作流，这样可以监视图像采集并检测可能的问题，从而可以动态地做出早期决策。流式工作流可以非常简单或扩展，允许估计数据分辨率和异构性，并根据用户和显微镜操作员的需求进行调整。

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研究论文

质子化、H/D交换和氘化人碳酸酐酶IX的结构比较

科鲁扎，B.拉富马特，M.尼布洛姆，B.P.马洪，W.Knecht公司，R.麦肯纳和S.Z.费希尔

在这项工作中，对四种不同氘标记的人类碳酸酐酶IX表面变体的X射线晶体结构进行了比较和讨论。结果表明，各版本的整体结构和活性中心组织基本相同，为未来中子蛋白质晶体学研究铺平了道路。

PDB参考:人碳酸酐酶IX，蛋白化，6rqn;6个季度;H/D-交换，6rqu;氘化，6rqw

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单体和二聚体状态下逆转录病毒蛋白酶的比较

S.沃希基，M.吉尔斯基，H.扎布兰斯卡，I.皮乔瓦和雅斯科尔斯基

梅森-辉瑞猴病毒蛋白酶以二聚体形式结晶，使用的条件与生成单体形式结晶的条件几乎相同。两种状态结构的比较突出了逆转录酶二聚体过程中的构象变化。

PDB参考:M-PMV蛋白酶的二聚体形式：带有抑制剂的C7A/D26N/C106A突变体，6s1u;带有抑制剂的D26N突变体，6s1v;不含抑制剂的D26N突变体，6s1w

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α-羟基酸氧化酶中的黄素单核苷酸辅因子在控制底物氧化水平中发挥亲电/亲核双重作用

S.-Y.Lyu，K.-H.林，H.-W.Yeh先生，Y.-S.李，C.-M.黄，Y.-L.王，H.-W.Shih先生，N.-S.Hsu公司，C.-J.吴和T.-L.李

的结构和酶学研究第页-羟基己二酸氧化酶及其突变体揭示了黄素单核苷酸辅因子前所未有的亲电/亲核二元性，以及氧化脱羧反应的分子内歧化机制。

PDB参考:第页-羟基扁桃酸氧化酶，5zzp;复杂的(S公司)-扁桃木，5zzr;苯甲酰甲酸盐配合物，6a08;Y128C突变体，与苯甲酰甲酸盐复合物，5zzz;Y128F突变体，6a13;复杂的(S公司)-扁桃酸盐，6a0v;5-deazariboflavin单核苷酸复合物，6a1h;5-deazaribflavin单核苷酸和苯甲酸6a1l络合物;5-去甲氧基黄素单核苷酸和苯甲酰甲酸盐的复合物，6a1m;5-二氮杂核黄素单核苷酸和苯基丙酮酸6a1p复合物;苯丙酮酸和核黄素单核苷酸6a1r络合物;苯甲酰甲酸盐6a19配合物;丙二酰-核黄素单核苷酸复合物，6a21;苯甲酰甲酸和核黄素单核苷酸的配合物，6a23;R163L突变体，与扁桃胺-核黄素单核苷酸复合，6a3t

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硒SAD定相法测定核小体核心粒子的结构

M.Saotome先生，N.Horikoshi先生，K.Urano公司，T.库吉拉伊，H.尤祖里哈拉，H.Kurumizaka先生和W.卡加瓦

人核小体核心粒子的结构通过硒SAD定相得到解决。本研究表明，核小体结构可以通过实验相位确定，并提供了一种在难以通过分子替换获得相位信息的情况下通过X射线结晶学求解核小体构造的方法。

PDB参考:人核小体核心粒子6jr0;6jr1号机组

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用于系列X射线晶体学实验的脂质立方相微晶的井基结晶

R.安德森，C.野生动物园，P.伯斯，R.博斯曼，A.希洛瓦，P.达尔，S.Ghosh公司，A.灌篮，R.Kjeldsen-Jensen先生，J·南，R.L.肖曼，M.Kloos先生，R.B.多克，U.米勒，R.纽茨和G.布雷恩

提出了一种新的方法，用于筛选合适的结晶条件，并在脂质立方相中制备大量膜蛋白微晶，用于系列结晶学实验。

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质子化、H/D交换和氘化人碳酸酐酶IX的结构比较

单体和二聚体状态下逆转录病毒蛋白酶的比较

α-羟基酸氧化酶中的黄素单核苷酸辅因子在控制底物氧化水平中发挥亲电/亲核双重作用

硒SAD定相法测定核小体核心粒子的结构

用于系列X射线晶体学实验的脂质立方相微晶的井基结晶

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