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生物学
第75卷| 第4部分
编号：2059-7983

2019年4月发布

突出显示的插图

封面插图：假酶PDX1.2与维生素B复合物的结构6生物合成蛋白PDX1.3来自拟南芥已由显示统计无序的晶体确定[罗宾逊等。（2019）中，阿克塔·克里斯特。D类75, 400-415]. PDX1.2-PDX1.3十二元络合物的晶体堆积如PDX1.2_PDX1.3络合物结构中所示，从上方和侧面（顶部两幅图像）观察。单十二聚体以绿色表示。下面是PDX1.2-PDX1.3复合物晶体中统计无序的示意图，图中显示了理想的晶体堆积（左侧）和PDX1.2_PDX1.3复合晶体中的晶体堆积，导致了双重统计无序。

专题评论

阿克塔·克里斯特。(2019).D类75,357-367
https://doi.org/10.107/S2059798319003814
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阳离子扩散促进剂家族中锌转运蛋白的结构综述

C.A.科特里姆,R.J.贾罗特,J.L.马丁和D.德鲁
本文总结了过去五年来细菌YiiP的结构研究，概述了锌转运蛋白膜蛋白如何在分子水平上运作。
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研究论文

阿克塔·克里斯特。(2019).D类75,368-380
https://doi.org/10.107/S205979831900175X
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结合中子和X射线晶体学数据，利用量子力学计算改进蛋白质结构

O.卡尔达拉鲁,F.曼佐尼,E.Oksanen公司,D.T.洛根和U.莱德
针对X射线和中子数据，开发了一种将量子力学计算与联合晶体学精细化相结合的方法。半乳糖凝集素3C-乳糖复合物和裂解多糖单加氧酶的结构应用表明，它可以改善氢键的几何形状，尤其是涉及水分子的氢键，并确定关键残基的质子化状态。
阅读文章更正
阿克塔·克里斯特。(2019).D类75,381-391
https://doi.org/10.107/S2059798319001980
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神经元突触后密度蛋白95第三PDZ结构域的构象变化

A.卡马拉·阿蒂加斯,J.Murciano-Calles公司和J.C.马丁内斯
神经元突触后密度蛋白95的第三个PDZ结构域缺乏第三个α-螺旋，D332P和D332G变体的晶体结构显示构象可塑性。
PDB参考:客运专线3302–392，6qjd；客运专线3302–402，6qji个；6个工作日；客运专线3302–402，D332P变型，6qjf；6qjg；客运专线3302–402，D332G变型，6qjk；6qjl个；6个月
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阿克塔·克里斯特。(2019).D类75,392-399
https://doi.org/10.107/S2059798319002304
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古生物翻译起始因子2（aIF2）分子中的第三个结构开关及其在启动GTP水解和从核糖体中去除aIF2中的可能作用

O.尼科诺夫,O.克拉夫琴科,N.内夫斯卡娅,E.斯托尔布什基纳,M.加伯和S.尼科诺夫
在无镁条件下获得的与GTPCP复合物中aIF2（aIF2γ）γ亚基的结构2+测定了结晶溶液中的离子，并获得了有关镁作用的新信息2+提供了具有aIF2γ功能的离子。发现了aIF2γ的一个新的功能区（开关3）。
PDB参考:古生物翻译起始因子2γ亚基与GDPCP复合物，6h6k
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阿克塔·克里斯特。(2019).D类75,400-415
https://doi.org/10.107/S2059798319002912
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假酶PDX1.2与其同源酶PDX1.3复合物的晶体结构：日全食

G.C.罗宾逊,M.考夫曼,C.罗克斯,J.马丁内斯字体,M.霍霍恩,S.Thore公司和T.B.菲茨帕特里克
维生素B6是所有生物体的重要微量营养素。这里，伪酶PDX1.2与维生素B复合物的结构6生物合成蛋白PDX1.3来自拟南芥显示了。
PDB参考:PDX1.2–PDX1.3复合体，6hx3；PDX1.2–PDX1.3中间，6hxg；PDX1.2–PDX1.3-K79A，6个月
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阿克塔·克里斯特。(2019).D类75,416-425
https://doi.org/10.107/S2059798319003875
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蛋白质结构模型中N-聚糖的构建与重建

B.van Beusekom公司,N.韦泽尔,M.L.Hekkelman先生,A.佩拉基斯,P.埃姆斯利和R.P.Joosten先生
碳水化合物的自动生成和重建使用库特在中PDB-重做管道。
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阿克塔·克里斯特。(2019).D类75,426-436
https://doi.org/10.1107/S2059798319003000
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蜗牛糖苷水解酶家族45内切葡聚糖酶EG27II的高分辨率晶体结构十字形壶腹

T.野村,H.我是,N.萨卡,N.高桥,B.米卡米和K.Mizutani公司
蜗牛糖苷水解酶家族45（GH45）亚家族B内切葡聚糖酶EG27II十字形壶腹使用毕赤酵母表达系统和apo形式的晶体结构被确定为1.00 分辨率；这是迄今为止动物内切葡聚糖酶的最高分辨率结构。
PDB参考:EG27II、apo、5xbu；纤维二糖复合物，5xbx；与纤维二糖的复合物，pH 4.0，5xc4；与纤维二糖复合物，pH 5.5，5xc8；与纤维二糖复合物，pH 8.0，5xc9；D137A突变体，与纤维二糖复合物，5xca
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阿克塔·克里斯特。(2019).D类75,437-450
https://doi.org/10.107/S205979831900264X
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亚硝化应力传感牙龈卟啉单胞菌：转录调节剂HcpR的结构和血红素结合

B.R.贝尔文,F.N.穆萨耶夫,J.伯格,J.N.斯卡斯代尔,C.R.Escalante公司和J.P.刘易斯
HcpR需要用于牙龈卟啉单胞菌在亚硝化胁迫下与宿主细胞存活。为了确定其作用的分子机制，确定了该调节剂传感域的晶体结构，使用SAXS检查了全长，重点是DNA-结合域，并定义了调节剂的血红素结合特性。
PDB参考:HcpR的传感器域牙龈卟啉单胞菌,对4122表，5v30；C类2221形式，6np6
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给编辑的信

阿克塔·克里斯特。(2019).D类75,451至454
https://doi.org/10.107/S2059798319004522
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宣布必须向蛋白质数据库（PDB）提交PDBx/mmCIF格式的晶体沉积文件

P.D.亚当斯,P.V.Afonine公司,K.Baskaran公司,H.M.伯曼,J.贝里斯福德,G.布里科内,D.G.布朗,S.K.伯利,陈先生,Z.Feng先生,C.弗伦斯堡,A.古特马纳斯,J.C.霍赫,池川Y,Y.Kengaku先生,E.克里斯内尔,G.库里苏,Y.Liang先生,D.利布施纳,马克,J.L.马克利,N.W.莫里亚蒂,G.N.穆尔舒多夫,M.诺贝尔,E.佩萨赫,一、波斯科娃,B.K.Poon先生,O.V.索博列夫,E.L.乌尔里奇,S.维兰卡,C.冯海因,J.韦斯特布鲁克,M.沃迪尔,M.Yokochi先生和J.Y.杨
这封信宣布PDBx/mmCIF格式文件将成为蛋白质数据库（PDB）晶体沉积的强制性文件。
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