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生物
结晶学
第69卷
|
第1部分
国际标准编号:1399-0047
2013年1月发布
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《水晶学报》。
D类
.
社论
《水晶学报》。
(2013).
D类
69
,
1
doi:10.1010/S0907444912051190
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庆祝生物晶体学:
D学报
二十年后
E.N.贝克
和
Z.道特
编辑。
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科学评论
《水晶学报》。
(2013).
D类
69
,
2-4
doi:10.1107/S0907444912044794
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分子在细胞内(而非细胞外)的位置
Z.道特
讨论了以统一、标准的方式呈现大分子结构的重要性。
阅读文章
研究论文
《水晶学报》。
(2013).
D类
69
,
5-15
doi:10.1107/S0907444912039881
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吡咯烷酰-tRNA合成酶的一种新的晶体形式揭示了腺苷酸和氨基酰基部分以及催化位点的天冬酰胺残基的前和后氨基酰基-tRNA合成构象状态
柳泽T
,
苏米达锥虫
,
R.石井
和
横山由纪夫
一种新型吡咯烷酰-tRNA合成酶晶体的X射线结晶学捕获了氨基酰-tRNA合成前和后阶段的结构快照。
PDB参考
:
吡咯烷酰-tRNA合成酶复合物,3vqw
;
3个vqx
;
第三季度
阅读文章
《水晶学报》。
(2013).
D类
69
,
16-23
doi:10.1010/S0907444912041005
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结构和活动
化脓性链球菌
GH1家族6-磷酸-β-葡萄糖苷酶SPy1599
J.步进器
,
J.达宾
,
J.M.埃克洛夫
,
P.通普尔
,
P.孔萨里
,
E.J.泰勒
,
J.P.图尔肯堡
,
H.布鲁默
和
G.J.戴维斯
这个
化脓链球菌
ORF SPy1599属于CAZy家族GH1,通过对芳基糖苷的一系列动力学研究,已显示出6-磷酸-β-葡萄糖苷酶活性。
三维结构已求解为2.5
孪晶和未孪晶晶体的分辨率。
PDB参考
:
SPy1599,4b3k型
;
4b3升
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《水晶学报》。
(2013).
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69
,
24-31
doi:10.1107/S0907444912041169
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中性金属蛋白酶Gentlyase的结构
多粘菌芽孢杆菌
A.鲁夫
,
M.斯蒂尔
,
J.奔驰
,
M.施密特
和
H.索贝克
描述了金属蛋白酶Gentlyase的晶体结构,并与其他相关的嗜热蛋白酶类蛋白酶的结构进行了比较。
PDB参考
:
温和裂解酶,肽复合物,4ger
;
磷酰胺络合物4b52
阅读文章
《水晶学报》。
(2013).
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69
,
32-43
doi:10.1107/S0907444912072
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氨基酚双加氧酶与中间体、产物和抑制剂配合物的结构
D.-F.李
,
J.-Y.张
,
Y.-J.侯
,
L·刘
,
Y.胡
,
S.-J.刘
,
D.-C.王
和
刘伟(W.Liu)
2-氨基苯酚1,6-双加氧酶的晶体结构,这是一种代表少量硬膜外双加氧酶类并催化2-氨基苯酚开环的酶,与内酯中间体(4
Z轴
,6
Z轴
)-3-亚氨基头孢品-2(3
小时
)-本文报道了一种与自杀抑制剂4-硝基邻苯二酚形成的2-氨基粘酮-6-半醛及其配合物。
PDB参考
:
APD、apo、3vsg
;
含铁活性酶,3vsh
;
带有4NC、3vsi的复合体
;
与3-亚氨基氧杂吡啶-2(3)的配合物
小时
)-1和2-氨基粘酮6-半醛,3vsj
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《水晶学报》。
(2013).
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69
,
44胜51负
doi:10.1107/S0907444912042059
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去乙酰化酶结构域的结构
大肠杆菌
PgaB,一种生物膜形成所需的酶:碳水化合物酯酶4家族的循环置换成员
西山T
,
H.野口
,
H.吉田
,
S.-Y.公园
和
J.R.H.塔姆
生物膜是由许多微生物产生的细胞外基质,是临床和技术环境中的一个主要问题。
这里报道的晶体结构有助于阐明生物膜主要成分的合成
鼠疫耶氏菌
和
大肠杆菌
,并可能有助于开发阻止它的代理。
PDB参考
:
PgaB的N端结构域,3vus
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《水晶学报》。
(2013).
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69
,
52-62
doi:10.1107/S0907444912042175
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植物1,3-β-葡聚糖酶与低聚糖水解产物复合物活性位点突变体的结构
A.沃伊特科威克
,
K.威特克
,
J.亨尼
和
雅斯科尔斯基
植物内切-1,3-β-葡聚糖酶的两个晶体结构代表糖苷水解酶家族GH17与层粘连糖水解产物的复合物,首次揭示了五个关键结合亚基的蛋白质-糖相互作用。
在两种结构中,三糖都结合在非还原端(糖基部分)的亚基−3、−2和−1上,在一种结构中额外的四糖结合在还原端(糖苷部分)的子基+1到+4上。
PDB参考
:
马铃薯内切-1,3-β-葡聚糖酶,与层压板糖复合,4gzi
;
含有昆布三糖和昆布三糖的复合体,4gzj
阅读文章
《水晶学报》。
(2013).
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69
,
63-73
doi:10.1107/S0907444912042400
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一种新型葡萄糖醛酸酯酶的结构
嗜热毁丝霉
对其作为潜在生物催化剂的作用有了新的认识
M.-D.查拉夫吉
,
M.迪马罗戈纳
,
E.地形
,
P.克里斯塔科普洛斯
和
E.D.克莱西纳
The crystal structures of an
嗜热分枝杆菌
葡萄糖醛酸酯酶(
标准
GE2)及其S213A突变体的非连锁形式和与甲基4的络合物-
O(运行)
-甲基-β-
D类
-在1.55、1.90和2.35下测定吡喃葡萄糖酸盐
分别给出了?分辨率,揭示了
标准
GE2是一种潜在的生物催化剂。
PDB参考
:
标准
GE2,4g4g
;
S213A突变体,4g4i
;
S213A突变体与4-
O(运行)
-甲基-β-
D类
-4g4j吡喃葡萄糖酸盐
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《水晶学报》。
(2013).
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69
,
74至81
doi:10.1107/S0907444912042503
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偏振分辨二次谐波显微镜作为蛋白质晶体结构域可视化方法
E.L.德沃特
,
V.J.贝格
,
J.A.罗瑙
,
S.Z.沙利文
,
C.达斯
和
G.J.辛普森
偏振分辨二次谐波显微镜被应用于蛋白质晶体样品中多个晶体结构域的识别。
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《水晶学报》。
(2013).
D类
69
,
82-91
doi:10.1107/S0907444912042369
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AidH配合物的高分辨率结构为新的催化机制提供了见解
N个
-酰基高丝氨酸内酯酶
A.高
,
G.梅
,
S.刘
,
P.王
,
Q.唐
,
刘彦(Y.Liu)
,
H.温
,
十、安
,
L.张
,
十、燕
和
D.梁
报道了AHL内酯酶AidH与底物和产物复合物的高分辨率晶体结构,并提出了金属依赖性AHL内酶的催化机理。
PDB参考
:
艾滋病,4g5x
;
含C4-HS、4g9e的络合物
;
S102G突变体,4g8d
;
S102G突变体,与C6-HSL复合,4g8b
;
E219G突变体,4g9g
;
E219G突变体,与C6-HS、4g8c复合
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《水晶学报》。
(2013).
D类
69
,
92-104
doi:10.1107/S0907444912043429
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与S100A10和膜联蛋白A2乙酰化N端肽的1:2:2复合物中C端AHNAK肽的结构
G.奥佐罗斯基
,
S.米尔顿
和
H.勒克
AHNAK的一个20-氨基酸肽的结构不对称地结合到AnxA2–S100A10A异四聚体(1:2:2对称),提供了对支配这种膜修复支架复合物的原子级相互作用的见解。
PDB参考
:
与AnxA2–S100A10异四聚体结合的AHNAK肽,4ftg
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《水晶学报》。
(2013).
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69
,
105-113
doi:10.1010/S0907444912043326
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吸血昆虫载体唾液中生物胺结合蛋白的结构和配体结合特性
克氏锥虫
十、徐
,
B.W.Chang先生
,
B.J.曼斯
,
J.M.C.里贝罗
和
J.F.安徒生
生物胺结合蛋白介导吸血昆虫唾液的抗炎和止血活性。
胺结合蛋白的结构
普罗里克斯乳杆菌
揭示了生物胺配体与蛋白质的相互作用。
PDB参考
:
胺结合蛋白,4get
;
与色胺4ge1的络合物
;
I25M/L134M突变体,4hfo
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《水晶学报》。
(2013).
D类
69
,
114-120
doi:10.1107/S0907444912043880
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的结构特征
菠萝
胰蛋白酶抑制剂III(SOTI-III)
B.格洛茨巴赫
,
S.Schmelz公司
,
M.Reinwarth先生
,
A.克里斯曼
,
D.W.海因茨
和
H.科尔马
SOTI-III与牛胰蛋白酶复合物的晶体结构已解为1.7
奥分辨率。
PDB参考
:
SOTI-III,野生型,与tryspin复合,4a或
;
SOTI-III,F14A突变体,与tryspin复合,4oq
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《水晶学报》。
(2013).
D类
69
,
121-125
doi:10.1107/S090744491204423X
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顺铂和卡铂与组氨酸混合物中蛋白质相对结合的晶体结构分析
重复X射线照射K
J.R.海利维尔
和
S.W.M.坦利
抗癌药物顺铂和卡铂与蛋白质中的游离组氨酸结合。
数据采集温度为100和300时的晶体结构研究
K检查了它们与组氨酸侧链的相对结合亲和力,以及高辐射剂量对后续蛋白质-铂加合物稳定性的影响。
顺铂结合可见,卡铂结合不可见,表明顺铂结合更强。
PDB参考
:
与HEWL结合的顺铂/卡铂混合物,4gcb
;
4个gcc
;
4个月
;
4gce标准
;
4千立方英尺
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《水晶学报》。
(2013).
D类
69
,
126-136
doi:10.1010/S0907444912044800
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腺苷激酶来自
曼氏血吸虫
核苷类似物差异掺入的结构基础
L.罗曼内洛
,
J.F.R.巴切加
,
A.卡萨戈
,
J.Brandáo-Neto公司
,
R.德马尔科
,
R.C.加拉特
和
H.D.佩雷拉
不同核苷类似物掺入的结构基础
曼索尼
并揭示了人腺苷激酶。
PDB参考
:
SmAK–腺苷,3vas
;
3vaq(3伏)
;
SmAK–Ado–AMP,3uq6
;
SmAK–结核杆菌素,3uq9
;
SmAK–2-氟腺苷,4dc3
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《水晶学报》。
(2013).
D类
69
,
137-140
doi:10.1107/S0907444912042229
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血红蛋白晶体中选择性X射线诱导NO光解:来自Raman辅助晶体学研究的证据
A.梅利诺
,
M.R.Fuchs先生
,
A.皮卡
,
A.巴尔萨莫
,
F.S.N.德沃科夫斯基
,
G.蓬皮多
,
L.马扎雷拉
和
A.维加拉
在四聚血红蛋白中检测到NO光解
通过
不同辐射剂量下X射线衍射数据采集期间蛋白质单晶的拉曼显微镜。
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