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生物
结晶学
第63卷
|
第10部分
国际标准编号:1399-0047
2007年10月发行
封面插图:
六聚酰胺酶(AmiE)的双轴视图
苍白杆菌
RAPc8是硝化酶超家族的成员。
(
第1048页
).
研究论文
《水晶学报》。
(2007).
D类
63
,
1029-1041
doi:10.1107/S0907444907038164
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使用标量近似的结构因子外推:理论、应用和局限性
英国天才
结构因子外推的标量近似(SASFE)程序用于从自然晶体和部分激活晶体的振幅外推完全“激活”晶体的结构因子振幅。
在此,我们将研究SASFE中固有的近似值是否以及在什么条件下会引入重大误差。
结果表明,SASFE的假设所引入的误差可以忽略不计,而SASFE在大分子晶体学中的有用性主要受到实验不确定性传播的限制。
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《水晶学报》。
(2007).
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63
,
1042-1047
doi:10.1107/S0907444907038292
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克里纳恰翁非歧视性天冬氨酸-tRNA合成酶的结构
tokodaii黄颡鱼
菌株7揭示了两种不同tRNA反密码子的识别机制
Y.佐藤
,
Y.Maeda先生
,
清水县南部
,
M.T.侯赛因
,
S.Ubukata公司
,
K.铃木
,
T.Sekiguchi先生
和
A.塔克纳卡
晶体结构
标准
-AspRS(非歧视型)已确定为2.3
欧决议是克里纳恰非歧视型AspRS的第一个例子。
PDB参考
:
天冬氨酸-tRNA合成酶,1wyds,r1wydsf
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《水晶学报》。
(2007).
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63
,
1048-1058
网址:10.1107/S090744490703836X
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来自
苍白地杆菌
RAPc8型
S.W.基马尼
,
V.B.阿加尔卡
,
D.A.Cowan博士
,
M.F.-R.赛义德
和
B.T.Sewell公司
硝化酶超家族成员的同六聚体结构
D类
3对称。
活性位点构型表明Glu142具有催化作用。
PDB参考
:
脂肪族酰胺酶,2plq,r2plqsf
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《水晶学报》。
(2007).
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63
,
1059-1068年
doi:10.1107/S0907444907040668
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催化Y酶生物合成第二步的古生物TYW1的结构
S.Goto-Ito公司
,
R.石井
,
T.伊藤
,
R.柴田
,
E.镰刀菌
,
S.Sekine公司
,
Y.贝绍
和
横山由纪夫
晶体结构
P.horikoshii先生
描述了TYW1。
PDB参考
:
TYW1、2yx0、r2yx0sf
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《水晶学报》。
(2007).
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63
,
1069-1074
doi:10.1107/S0907444907042230
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结构的确定
O(运行)
-甲基转移酶NovP使用“免费午餐算法”
SHELXE公司
I.乌森
,
C.E.M.史蒂文森
,
D.M.劳森
和
G.M.谢尔德里克
NovP的晶体结构
O(运行)
-甲基转移酶包含262个氨基酸,由SIRAS用1.35求解
Å原生数据和2.45
使用部分链追踪结合的单一汞衍生物的臭氧数据,通过手动绘制初始的高噪声图,然后将数据外推到1.0
Å分辨率。
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《水晶学报》。
(2007).
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63
,
1075-1081
doi:10.1107/S0907444907042229
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细菌翻译延伸因子SelB翼螺旋结构域1和2的构象开关
欧·加尼奇金
和
M.C.Wahl先生
翻译延伸因子SelB结构域IV的前两个翼螺旋基序
嗜热菌
可以经历构象开关,这可以支持SelB的N端和C端部分之间的功能交互。
PDB参考
:
SelB、2v9v、r2v9vsf的WH1和WH2图案
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《水晶学报》。
(2007).
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63
,
1082-1093年
doi:10.1107/S0907444907042461
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纽扣息肉红色和绿色荧光蛋白的精细晶体结构
Zoanthus公司
N.普列特涅娃
,
V.普列特涅夫
,
蒂霍诺娃
,
A.A.帕霍莫夫
,
V.波波夫
,
V.I.马丁诺夫
,
A.瓦洛达尔
,
Z.道特
和
S.普列特涅夫
红荧光蛋白zRFP574的晶体结构
Zoanthus公司
特别是。
1.51时为2
通过对生色团形成三肽Asp-Tyr-Gly内天冬氨酸侧链脱羧反应产生的生色团进行拆分,可以对其进行详细描述。
与新测定的相关绿色荧光蛋白zGFP506的X射线结构的比较
Zoanthus公司
物种及其在过渡‘绿色’和成熟‘红色’形式中的突变体zGFP506_N66D为研究负责获得红色荧光的结构化学提供了新的见解。
PDB参考
:
zRFP574、2icr、r2icrsf
;
zGFP506、2ojk、r2ojksf
;
zGFP506_N66D,“绿色”形式,2pxw,r2pxwsf
;
zGFP506_N66D,“红色”形式,2pxssf,r2pxsff
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(2007).
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1094-1101
doi:10.1107/S0907444907043417
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从中克隆的重组血红素脱卤酶的铁和含铁形式结合位点的X射线晶体结构分析
角闪石
V.de Serrano公司
,
Z.Chen(陈)
,
M.F.戴维斯
和
S.Franzen公司
为了研究圆腹多毛类动物脱苦过氧化物酶的双重功能
角闪石
,该酶在
大肠杆菌
作为野生型重组蛋白和突变蛋白。
野生型和突变蛋白都被结晶,并且它们的结构在100
分辨率为1.62
Å.
PDB参考
:
野生型DHP,2qfk,r2qfksf
;
C73S突变DHP,2qfn,r2qfnsf
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63
,
1102-1108
doi:10.1107/S0907444907043363
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一种新的α-诱导子样蛋白sylvatin的结构
森林腐霉
M.-B.拉斯科姆
,
P.零售
,
M.蓬切特
,
B.工业
,
J.-P.布莱恩
和
T.Prangé
西伐他汀,a 10
卵菌分泌的kDa蛋白
森林腐霉
揭示了一种具有减少内腔的α-诱导素样结构。
PDB参考
:
巴伐他汀,2pos,r2possf
;
2pr0,r2pr0sf
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(2007).
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63
,
1109-1112
doi:10.1107/S09074449074228X
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RuBisCO伴侣RbcX的结构
协同孢子虫
特殊PCC6803
S.田中
,
M.R.Sawaya先生
,
C.A.克尔菲尔德
和
T.O.酵母菌
RbcX的晶体结构
协同孢子虫
据报道,sp.PCC6803揭示了一个异常长的突起C末端螺旋,以及蛋白质底物结合位点中的一个结合聚乙二醇分子。
PDB参考
:
RbcX、2py8、r2py8sf
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《水晶学报》。
(2007).
D类
63
,
1113-1114
doi:10.1107/S0907444907041406
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重新审视立体化学限制:精炼目标的准确性如何,蛋白质结构应允许偏离多少?
作者:Jaskolski、Gilski、Dauter和Wlodawer(2007)
B.Stec公司
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雅斯科尔斯基
等。
[(2007),
《水晶学报》。
D类
63
, 611–620]
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