1.简介
萘普生(NPX,方案1),或(S公司)-2-(6-甲氧基萘-2-基)丙酸是一种非甾体抗炎药,具有镇痛和退热的特性,常用于治疗关节炎、痛经和急性痛风。NPX是一种弱酸(药物数据库,2016年7月查阅;威斯哈特等。, 2006),带有pK(K)一值为4.2,使其在胃肠液中未电离。它被正式归类为低溶解度高渗透性药物(Takagi等。, 2006),但其溶解度高度依赖于周围环境的pH值。分子中的大疏水芳香区不利于与水分子的相互作用,因此不溶于水介质。在pH值较高的环境中,例如在细胞周围的膜中,NPX会随着带电的COO而电离−与水形成更有利的相互作用,促进溶解。为了克服溶解度问题,NPX目前以盐的形式销售,即萘普生钠;然而,改善NPX在所有pH值中的溶解度的替代溶液是可取的。
NPX适合共晶形成,具有氢键结合的可能性通过COOH群,可以形成一系列单、双或三维的强健合成子(Desiraju,1995),附加π-芳香区域的堆积相互作用。到目前为止,已经合成了16种NPX共晶,并使用各种技术进行了表征,包括X射线衍射(XRD)、红外(IR)光谱和差示扫描量热法(DSC)。据报道,含有以下共晶物:烟酰胺(NA)、异烟酰胺(INA)、吡啶酰胺(PA)(Neurohr等。, 2015; 卡斯特罗等。, 2011),反式-1,2-双-(吡啶-4-基)乙烯(TBPE)(Weyna等。, 2009)、度洛西汀(巴斯曼等。, 2009)、曲马多(巴斯曼等。, 2010)、双吡啶(BPY)和哌嗪(PPZ)(Manoj等。, 2014)和几种手性氨基酸,包括丙氨酸(AL)、两性离子脯氨酸(PR)、酪氨酸(TY)、色氨酸(TP)和N个-辛基葡聚糖(O-GL)(Tumanova等。, 2014; 蒂尔博格等。, 2013; 元等。, 2001). 许多共晶体的结构都是用单晶衍射法测定的(见表1的脚注). 相关合成音如图1所示并总结了表1中所有16个报告的共晶体.
| A类 | B类 | C类 | D类 | E类 | F类 | G公司 | H(H) | 我 | S公司-净现值一 | * | | | | | | | | | S公司-2NPX–不适用b条 | | | * | * | * | | | | | S公司-NPX–INA(净现值)b条 | | * | * | * | | | | | | S公司-NPX–待定c(c) | | | | * | | | | | | RS系列-NPX–BPY(净现值)d日 | | | | * | | | | | | S公司-NPX–BPY(净现值)d日 | | | | * | | | | | | RS系列-净现值-PPZd日 | | | | | | * | | | | S公司-净现值-PPZd日 | | | | | | * | | | | S公司-净现值-L(左)-美国铝业公司e(电子) | * | | | | | | * | | | S公司-净现值-D类-美国铝业公司e(电子) | * | | | | | | * | | | S公司-净现值-D类-TY公司e(电子) | * | | | | | | * | | * | S公司-净现值-D类-TP(转移定价)e(电子) | * | | | | | * | * | | | S公司-净现值-L(左)-公关e(电子) | * | | * | | | | | | | S公司-NPX–D类-公关e(电子) | * | | * | | | | | | | RS系列-净现值-L(左)-公关e(电子) | * | | | | | | | | | RS系列-净现值-DL公司-公共关系e(电子) | * | | * | | | | | | | S公司-NPX–O(净现值)-D类-德国劳埃德船级社e(电子) | | | | | | * | | * | * | 参考文献:(一)拉维库马尔等。(1985);(b条)Neurohr公司等。(2015)和卡斯特罗等。(2011);(c(c))韦纳等。(2009);(d日)马诺伊等。(2014);(e(电子))图马诺娃等。(2014),蒂尔堡等。(2013)和元等。(2001). | |
| 图1 文献中先前报道的NPX共晶中存在的合成物。注意synthonB类涉及邻近的INA分子,NPX COOH组参与合成子C类和D类. |
五种共晶的共形物含有一个吡啶环,它很容易与NPX(合成子)上的羧酸基团相互作用D类). 合成子的重要性D类通过观察与同分异构吡啶甲酰胺NA和INA共形物共晶中存在的合成子,进一步强调了这一点(参见方案1)。合成子的形成D类在2NPX中–NA阻止合成子的形成B类(见NPX–INA),由于正确方向上的群体相互作用所需的不利畸变(Ando等。, 2012). 因此,synthonE类而是形成。Synthon公司A类存在于大多数NPX-氨基酸共晶体中,突出了对形成羧氧酸-羧氧基酸二聚体的偏好。卡斯特罗建议在NPX和第三吡啶甲酰胺异构体吡啶甲酰胺(PA,方案1)之间制备共晶等。(2011);然而,由于没有单晶,因此无法确定X射线结构。
固态核磁共振(SS-NMR)对局部结构很敏感,核磁共振晶体学研究已广泛用于表征各种共晶中的氢键(Harris等。, 2009; 史蒂文斯等。, 2014; 沃格特等。, 2009; 戈韦托等。, 2005; Chierotti&Gobetto,2013年; Brown,2012年)包括NPX的共晶体。例如,通过二维(2D)研究2NPX–NA1H–13证实氢键网络的C异核关联(HETCOR)实验是一个相对罕见的例子,单个羧基在同一共晶中产生两个不同的分子间合成子,可能是由于2:1的化学计量比(Ando等。, 2012). 纯NPX及其钠盐也已通过SS-NMR方法进行了研究,2013年对全化学位移分配和环电流效应进行了研究(Carignani等。, 2013),同时23Na SS–NMR实验也用于研究NPX水合物和溶剂化物(伯吉斯等。, 2012). 这个13C和1最近,使用密度泛函理论(DFT)计算的NMR参数,对NPX的H光谱分配进行了批判性分析,其中三个相关性来自Ando的论文等。(2012)被重新分配到拥挤的地区1H–13C HETCOR光谱(捷克,2015). NPX的四水钠盐具有复杂的无序钠和水网络,可以通过堆叠断层或多重断层来预测孪生利用SS-NMR、XRD和计算方法(邦德等。, 2013).
SS–NMR非常适合于研究共晶体中的氢键网络(丸氏等。, 2012; 塔顿等。, 2013; 杜登科等。, 2013; 雷迪等。, 2015)包括在短氢键中定位质子。以下各项的组合1H和15N SS–NMR通常用于确定O-H…O和O-H…N氢键上的质子位置,因为化学位移对当地环境的影响。例如,通过多核SS-NMR(Koike等。, 2014)最近,通过比较,一种速尿-异烟酰胺复合物被证实为共晶体15N SS–NMR和DFT计算的化学位移(克尔等。, 2015). 质子位置研究的另一个方面是短强氢键上可逆质子迁移的表征,这是最重要的,但也可能与某些类型的功能材料有关(福特等。, 2011; 弗兰楚佐夫等。, 2014).
我们在此报告NPX–PA单晶的生长结构测定通过单晶X射线衍射,制备这种共晶体的纯多晶样品并测定其药物相关性质。用核磁共振晶体学方法研究了氢键网络的细节。
2.实验
2.1. 合成和晶体生长
合成了NPX–PA通过机械化学路线。等摩尔(0.5 mmol)数量(S公司)-NPX和PA用研钵和杵一起研磨30分钟 min,逐渐添加总共6滴乙醇。生产出一种白色软粉末。样品重新研磨30次 min,再添加4滴乙醇,以获得作为单一多晶相的共晶。
一小部分(3 mg)的多晶材料在丙酮中回流约353 K代表20 将溶液放在带有穿孔盖子的小瓶中在室温下和冰箱中蒸发。24小时后,两个小瓶中都出现了透明的矩形板状晶体 小时。
2.2。单晶X射线衍射
晶体数据、数据采集和结构精炼表2总结了详细信息.在两种温度下都结晶的晶体(§2.1)已筛选。它们是同一种产品,晶体质量相似。未参与氢键的氢原子被放置在几何形状上,并使用骑乘模型进行处理(库珀等。, 2010). 从不同的傅里叶变换图中定位出可能参与氢键作用的六个氢原子(H31、H201、H202、H291、H292和H361),并自由细化其分数坐标和各向同性原子位移参数。《高射炮》(1983)无法可靠地确定参数。
水晶数据 | 化学配方 | C类14H(H)14O(运行)三·C类6H(H)6N个2O(运行) | M(M)第页 | 352.39 | 晶体系统,空间组 | 单诊所,对21 | 温度 / K(K) | 120 | 一,b条,c(c) / Å | 5.3048 (5), 31.891 (3), 10.508 (1) | β / ° | 98.184 (3) | V(V) / Å三 | 1759.6 (3) | Z轴 | 4 | 辐射类型 | 钼K(K)α | μ / 毫米−1 | 0.09 | 晶体尺寸 / 毫米 | 0.12 × 0.04 × 0.02 | | 数据收集 | 衍射仪 | Bruker Venture公司D8 | 测量、独立和观察的数量[我> 2σ(我)]反射 | 19879, 8939, 5437 | R(右)整数 | 0.045 | (罪θ/λ)最大值/Å−1 | 0.717 | | 精炼 | R(右)[F类2> 2σ(F类2)],水风险(F类2),S公司 | 0.058, 0.082, 0.94 | 反射次数 | 5437 | 参数数量 | 493 | 约束装置数量 | 1 | 氢原子处理 | 用独立和约束精化的混合物处理H原子 | Δρ最大值,Δρ最小值 / 埃奥−3 | 0.39, −0.32 | 计算机程序:4月2日(布鲁克,2012年),92新加坡元(阿尔托马雷等。, 1993)和晶体(贝特里奇等。, 2003). | |
2.3. 粉末X射线衍射
粉末X射线衍射(PXRD)数据在Bruker D8 ADVANCE衍射仪(CuK(K)α1,2辐射)和LynxEye探测器。使用0.014°的步长在4至50°的范围内记录模式。数据分析由Rietveld方法(里特维尔,1969年)使用学术TOPAS软件(科埃略等。, 2011).
2.4. 固体核磁共振(SS-NMR)
13在Varian VNMRS 400光谱仪上使用8 kHz旋转速度,循环延迟为5 s,接触时间5.0 ms.TPPM解耦在收购期间应用1H章动率为74 千赫。通过将金刚烷替代样品的高位移共振设置为38.5 ppm,将光谱参考至纯TMS。
所有其他光谱均记录在Bruker Avance III HD光谱仪上,该光谱仪在1H频率499.6 MHz和a13125.7的C频率 兆赫。这个1H–13C FSLG–HETCOR实验于10时进行 20 kHz MAS s循环延迟和a 1 ms接触时间。64t吨1每次增量采集48个瞬态。13通过设置替换样品的羰基共振来参考C光谱α-甘氨酸至176.5 ppm。这个1H实验是在1.3 旋转速度为60毫米的探针(转子外径) kHz,循环延迟为20 s1通过将金刚烷替代样品的共振设置为1.9 ppm来参考H光谱。这个1HETCOR光谱的H维使用默认的FSLG比例因子重新缩放,然后使用来自1H MAS光谱。
2.6. 热分析
差示扫描量热法(DSC)测量使用配备氮吹扫气体的TA DSC Q1000仪器,使用4-5 mg样品。加热速度为10 K(K) 最小值−1.
2.7条。财产测量
为了比较NPX和NPX–PA共晶的溶解度,进行了内在溶解速率(IDR)和在pH7磷酸盐缓冲介质中的平衡溶解度研究。测定NPX的平衡溶解度(4.32 克 我−1),但无法确定NPX–PA共晶的含量,因为材料与其起始组分分离(如PXRD所观察到的)。IDR实验在美国药典认证的Electrolab TDT-08L II型溶解测试仪(桨式)(印度孟买)上进行 h(Higuchi和Connors,1965年). 在IDR测定之前,通过分光光度法获得NPX和NPX–NA的标准曲线。
3.结果和讨论
3.2. 核磁共振晶体学
比较13纯组分和研磨产物的C光谱证实了共晶的形成(图4). 物理混合物和纯NPX显示出相同的光谱,这与组分之间缺乏相互作用一致。由于纯PA共变换器具有较长的1H(H)T型1 弛豫时间与5的循环延迟相比 s.NPX–PA共晶体的光谱明显不同。首先,NPX产生的一些共振相对于纯NPX光谱发生了偏移,例如C9/C46峰值。NPX COOH现场观察到的去屏蔽,即C2和C37与氢键的形成相一致(Asakawa等。1992年). 其次,由于PA和NPX的紧密结合,现在可以从PA碳位点观察到信号,这缩短了1H(H)T型1 弛豫时间PA谐振的频率。大多数信号的倍增与NPX和PA的两种非等效晶体分子在非对称单元由单晶X射线衍射测定。关键峰值如图5所示,完整的分配如图S5和表S3所示支持信息。光谱分配由13非四元碳峰被抑制的C光谱(图S4支持信息)和2D1H–13C异核相关(HETCOR)实验(图S5和S6支持信息),以及脚轮-计算的屏蔽(图S8和S9支持信息),如下所述。直接励磁13C实验(未显示),短循环延迟为0.5 s表明,唯一明显的动态位点是甲基。
| 图4 13C CP/MAS光谱(一)纯NPX(b条)NPX和PA的物理混合物,以及(c(c))NPX–PA共晶体收购于13C频率100.56 兆赫。标有星点的峰是旋转的边带,蓝色虚线是眼睛的引导,以显示共晶体中新的或偏移的峰。 |
| 图5 (一)1NPX–PA在60时的核磁共振氢谱 千赫兹MAS。原子标记是针对某些位点给出的,因此H原子标记是HX(X)1,其中X(X)是直接键合重原子的标签,例如,O36上的H原子是H361。(b条)的一部分1H–13NPX–PA的C HETCOR光谱,标记了氢键质子峰和NPX羧基碳峰。 |
这个1以60的快速MAS采集的NPX–PA的H谱 kHz(图5一),显示出与安藤提出的2NPX–NA光谱的分辨率相当等。(2012). 由于NPX–PA的边对面人字形结构,一些质子的化学位移可能受到分子间环电流效应的影响,这与纯NPX(Carignani等。, 2013). 同时1H SS–NMR会阻碍SS–NMRs区分同一类型氢键中质子的能力,可能存在许多共晶/盐(Vogt等。, 2009; 戈韦托等。, 2005; 萨尔多等。, 2015; 哈里斯等。, 2010)包括这起NPX–PA案件。不是所有的1可以指定H峰,但合成子中涉及的两个质子的峰E类二聚体,即可以区分H31和H361。可变循环延迟实验表明T型1氢键质子的弛豫明显慢于其他氢原子,因此20 s循环延迟用于获得图6所示的光谱.
| 图6 (一)示意图显示了沿着H原子与其受体原子之间的矢量串联移动的H原子,以形成模型1和模型2。白色圆圈表示X射线衍射结构中H原子的初始位置,箭头表示运动方向。(b条)NPX–PA的能量是H原子位置的函数。分数距离0对应于DFT优化的XRD位置,而距离1对应于H原子位于氢键另一侧的等效位置。负的分数距离对应于向施主原子的移动。 |
由于在用1 ms接触时间(图6b条). 此外,还观察到与合成子二聚体中涉及的PA酰胺C原子C19/C28的弱相关性E类(H31…C28=2.41 ?和H361?C19=2.39 Å). 类似地,a1H–1H双量子/单量子光谱(DQ/SQ)(参见支持信息),也显示了合成子的直接证据E类通过H31/H361和酰胺质子H291/H202之间的相互关系得到二聚体。HETCOR光谱也有助于确认H原子的位置;如果质子在N-H·O氢键中靠近酰胺C原子,C19/C28关联将比C2/C37关联更强烈。因此,观察到的相关强度支持通过单晶XRD确定氢键给体和受体。
通过比较实验核磁共振数据和预测位移值,进一步研究了氢键中H31和H361原子的位置。首先使用DFT对XRD获得的结构进行几何优化。所有原子位置的优化导致优化后的结构与原始结构之间的总重原子RMSD为0.09 Å. 然而,正如预期的那样,从X射线散射中提炼出的H原子的位置显著调整了约0.2 关于优化。这在比较X射线散射和中子散射实验中的氢键距离时观察到的通常范围内(Wells,1984). 如表S1所示(参见支持信息),氢键变得更加对称,两个O-H…O氢键之间的差异基本消失,这与1H31和H361原子的氢位移。
可以提出两种氢键合模型作为XRD的替代方案精细化,参见支持信息在模型1中,只有短O-H…O氢键中的H原子移动,而在模型2中,PA中的酰胺质子也沿着N-H…O氢键移动。具体来说,在二聚体中,H361原子从O36移动到O18,H31原子从O3移动到O27A类和B类分别在模型1中。在模型2中,H202原子也在二聚体中从N20移动到O38,H291原子从N29移动到O1A类和B类分别是。请注意,模型1中存在净质子转移,导致形成盐形式,而模型2是另一种共晶体(参见支持信息). 计算的势能这些模型的氢原子位置函数如图6所示(b条). 这两种情况下都存在一个能量最小值,对应于XRD测定的结构。值得注意的是,DFT计算在描述氢键方面具有一些系统性的弱点,例如如实验所示,在速尿-异烟酰胺共晶体中,短强O-H…N氢键的能量最小值被错误预测15N NMR和XRD数据(克尔等。, 2015). 此外,DFT计算实际上涉及0 K结构,而实验SC–XRD和NMR在120 K和环境温度。然而,图6中的电位曲线(b条)每个都显示出一个陡峭的最小值,因此H原子的替代位置是不可信的,并且氢键上依赖于温度的质子转移是极不可能的。这与之前报道的吡啶-3,5-二羧酸体系形成了对比,在该体系中,核磁共振晶体学研究揭示了质子穿过氢键的量子隧道效应,在氢键中存在浅双峰势能表面(Frantsuzov等。, 2014). 在这种情况下,需要注意的是,只有根据几何优化XRD结构计算的NMR参数与实验数据兼容,如支持信息特别是,实验和计算之间的RMSD13C班次超过下午2点(支持信息)如果H原子移动到氢键的另一侧,根据模型1或模型2,这与分子有机物的有效结构不一致(Bonhomme等。, 2012; 维迪菲尔德等。, 2016).