2.方法
2.1. 基于最小二乘拟合的1-RDM重建
对于自旋跟踪(无自旋)纯态N个-电子系统,1-RDM可以通过将N个−1的坐标N个-电子密度矩阵,即
哪里ψ(第页, 第页2, … 第页N个)是纯粹的国家N个-电子波函数。混合状态系统1-RDM只是纯状态1-RDM的凸组合。
这是众所周知的(Löwdin,1955)使用离散的单电子基组可以方便地近似1-RDM{ϕ我}作为
如果基础集保持不变,则一旦人口矩阵确定1-RDMP(P)英寸(2)找到。因此,模型中参数的数量完全取决于总体矩阵的大小,因此也取决于基函数的数量。在这项工作中,基函数是原子轨道,但如果需要,对于强离域电子系统,也可以考虑平面波。
1-RDM通过其对角元素与位置空间中的平均电子密度分布直接相连,
此外,1-RDM通过6D傅立叶-狄拉克变换封装动量空间信息(Weyrich,1996),
具有n个(第页)就是动量密度。这两个相空间轴的双重连接强烈表明,从单一实验技术提供的数据重建高质量1-RDM的希望不大。
由于效率很高精炼方法和模型(Gatti&Macchi,2012)由弹性相干X射线衍射获得的高分辨率X射线SF几乎常用于位置空间电子密度的重建。使用(3),SF和1-RDM之间的关系很简单
另一方面,DCP是通过深度非弹性非相干X射线散射测量的。在脉冲近似下(Phillips&Weiss,1968),它们可以获得动量空间电子密度的投影,即
哪里u个是在动量空间中给出电子密度投影到其上的方向的单位向量。它与康普顿测量的散射矢量共线。
本工作中使用的模型基于表达式(2). 因此,确定给定一组SF和DCP的最佳总体矩阵需要将实验观测值表示为矩阵的函数P(P)使用运算符窗体
具有F类q个和J型q个分别是SF和DCP运营商。为了简洁起见,q个代表(q个, u个)在(8)的康普顿轮廓矩阵元素中). 为了进一步进行,操作员F类q个和J型q个因为矩阵元素需要写在基本集表示中
在这项工作中,特别关注了最终1-RDM重建的可靠性。如果假设数据点上的误差条不相关并遵循正态分布规律,对于无偏模型,最可能的总体矩阵P(P)通过求解最小化问题得到
其中,模型预计会产生以下表示的每个可观测数据的平均值O(运行)我而它的实际实验测量给出了 O(运行)经验我与相关的估计方差在我们的例子中,每个数据点都来自X射线衍射或康普顿散射测量,因此或针对不同的散射矢量。在本工作中,对于给定的高斯收缩Slater型轨道基集,每个矩阵元(9)在之前计算精炼使用数学软件代码(Wolfram Research,2023).
(10)的最小化)是一个凸最小二乘拟合问题。以下部分将解释如何以及必要的N个-在可表示性条件下,重构问题属于一个称为半定规划的凸优化问题(Boyd&Vandenberghe,2004).
3.结果
上述模型非常适合于分子晶体,应针对实际系统进行评估。特别是,对于这种结合不同实验的方法,有必要评估数据质量对1-RDM重建的影响。
尿素晶体[CO(NH2)2](图1)之所以选择它,有两个具体原因:首先,它长期以来被视为电荷密度重建领域的标准测试系统。代表了几种键类型,其中高流动性和离域电子密度有助于非线性光学特性(卡西迪等。, 1979; 西部等。, 2015). 其次,由于多年来吸引了人们的兴趣,高质量的SF(Zavodnik等。, 1999; 比克达尔等。, 2004)和康普顿剖面数据(Shukla等。, 2001)可从文献中获得。因此,尿素是分子化合物上实验1-RDM的第一相空间衍生重建的合理候选物。此外,尿素分子比我们以前的测试系统大得多,可能是康普顿测量报告中最大的分子之一(Shukla等。, 2001). 因此,它可以被视为寻求1-RDM重建的重要一步。本文是根据真实实验数据进行最终重建之前模型校准的最后阶段。
| 图1 (一)单位电池尿素晶体(具有一= 5.66,c(c)= 4.71 Å). (b条)绿色虚线表示计算本文中显示的1-RDM值的路径。路径是通过O–C–N–H原子的一系列片段。 |
我们在这里使用与小型系统相同的模型评估策略,并在之前的论文中进行了描述(De Bruyne&Gillet,2020; Launay&Gillet,2021年):参考1-RDM是从使用B3LYP泛函的周期密度泛函理论(DFT)计算中获得的(Becke,1993)和一个pob-DZVP基组(Peintinger等。, 2013)使用晶体14程序(Dovesi等。, 2014). 原子核的位置是沃瑟姆(1957)给出的)并由中子衍射数据导出。然后基于该DFT衍生的1-RDM生成人工实验数据点。50 K SF计算为1.1 Å−1使用专用选项获得原子位移参数后晶体14(埃尔巴等。, 2013). 康普顿轮廓在如此低的温度下几乎不受热运动的影响,并且在其情况下没有进行特殊处理。这个晶体14SF和DCP值被视为理想平均值,高斯噪声分布集中于每个数据点。因此,在我们的测试重建中也考虑了噪声污染数据。重建的密度矩阵是通过确定一个质量低于人工数据生成质量的总体矩阵来获得的。因此,模型中引入了不可避免的偏差。因此,1-RDM模型的基础集被视为一个简单的6-31G基础集第页氢原子上的轨道。
3.1. 从理想数据重建
当在没有热运动和噪声的情况下获得数据时,期望得到最佳重建结果。无法避免使用人工数据来测试这种最佳情况。观察仅仅使用X射线衍射数据所产生的重建结果是很有说明性的。人工实验装置包括3627平方英尺<1.1 Å−1检查1-RDMΓ(第页, 第页′)在O–C–N–H路径上作为2D函数清楚地表明,仅SF导出的1-RDM缺少大多数非对角区域的重要特征(图2). 这与之前关于更小系统的工作得出的结论是一致的。在这种情况下,推断非对角线区域本质上很困难,因为SF仅与位置空间密度相关,因此与对角线分量相关ρ(第页) =Γ(第页, 第页). 只有模型上的约束才有可能改进非对角描述。这是评估1-RDM重建质量的一个重要标准,因为本质上,非对角线部分取决于键合机制以及不同位置的干扰如何形成波函数。
| 图2 (一)沿O–C–N–H路径的参考1-RDM计算如下晶体14。包含和不包含DCP人工数据的重建1-RDM分别显示在的左上角和右下角(b条). 等高线绘制于Å−3,,其中正(负)轮廓以蓝色(红色)阴影的实线(虚线)显示。 |
第二步是将无噪康普顿数据包含在观测值中。在以下所有情况下,使用八个非等效结晶方向([100]、[110]、[111]、[210]、[211]、[310]、[311]、[321])。对于每个方向,每0.1取一个数据点 原子单位。该值对应于通常的康普顿光谱仪分辨率,并防止了连续点之间的显著相关性。最大动量值设置为10 原子单位。因此,数据集总共包含800个DCP值。很明显,没有噪音精炼案例并不能证明任何加权方案是合理的σ我在目标函数中(10)均取1。
如图2所示(b条),重建的1-RDM现在显示出与参考值的微小偏差。非对角线区域仍存在轻微差异Γ(第页, 第页′ ≠第页). 当沿着两条不同的O–C–N–H路径可视化重建的1-RDM时,观察到差异。一旦施加对称限制,这种差异就会得到纠正。
维里比率−V(V)/2T型是为重建的1-RDM计算的,其中两个电子势能使用2-RDM表达式ansatz进行估计Γ(2)(第页′1, 第页′2;第页1, 第页2) =Γ(1)(第页1,第页′1)Γ(1)(第页′2,第页2) −Γ(1)(第页′1,第页2)Γ(1)(第页′2,第页1). 使用和不使用DCP重建的维里比率分别为0.996和0.934,证实了康普顿数据在获得更具针对性的解决方案方面的作用。这两种重建之间的区别表明了动量空间测量的重要性,即使对于像尿素晶体这样的系统,其中DCP各向异性不超过总电子数的1%(见图5)。请注意,良好的细化后维里比仅仅是重建质量的结果,不需要任何广告 hoc(特别)模型或目标函数中的约束。
在以下段落中,将更详细地讨论重建误差的可能来源,并强调提高模型鲁棒性的技术。
4.结论与讨论
在这项工作中,改进的1-RDM重建方法已经在一个比先前研究的系统大得多的系统上进行了测试(De Bruyne&Gillet,2020; Launay&Gillet,2021年). 证实了来自康普顿散射数据的动量空间信息所起的关键作用。它有助于提高重建质量,即使弱各向异性被统计噪声掩盖。模型中的两个主要附加项,对称性限制和冻结核贡献,可以显著稳定1-RDM重建过程,避免统计噪声和温度影响。同时,在没有附加约束的情况下,结果表明,从建模的1-RDM计算得出的能量非常符合维里定理。因此,发现近似的总能量和维里比是有价值的指标,可以确定埃瓦尔德球体,其平衡了相关信息和噪声污染。
然而,对温度引起的核运动进行适当的反褶积仍然是一个具有挑战性的问题。在当前的方法中,已经确定了两个主要障碍:第一,我们选择限制温度模型和基础集的灵活性,以避免评估中的偏差;其次,保持1-RDM模型线性的必要性。这两种情况都不可避免地导致原子位移参数存在很大差异,但允许对模型的稳定性进行可靠评估。此外,我们有充分的理由相信,在考虑实际实验数据时,使用非线性优化版本,包括两个中心温度系数和更好的基组,将大大提高性能。
当前的1-RDM重建方法本质上是一种统计推断过程。因此,其结果的质量不仅取决于数据分布,还取决于模型的先验分布。在现阶段,使用了统一的先验,这意味着不假设先验知识。未来,人们可以考虑一个更明智的先验,例如,以低水平理论计算为中心的高斯分布。使用额外的先验值将有助于模型的性能,尤其是在数据质量较差的情况下。
最后,我们的结果表明,即使在动量空间信息非常有限的情况下,通过X射线SF和DCP测量,对于中等大小的系统,也可以实现1-RDM重建。在下一步中,这种方法可以很容易地应用于实际的实验数据。
致谢
作者感谢Devinder Sivia、Pietro Cortona和Julie McDonald的深刻评论和讨论。其中一些计算是在巴黎萨克利大学的集群上进行的,对此我们深表感谢。
资金筹措信息
SY感谢中国奖学金委员会(奖学金编号:202106020087)的资助。
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