新引入的基因组原噬菌体岛是利物浦流行株体内竞争力的关键决定因素属于铜绿假单胞菌

  1. 克雷格·温斯坦利1
  2. 摩根·G.I.兰吉尔2
  3. 乔安娜·福瑟吉尔16
  4. 伊雷娜·库卡维卡·伊布鲁杰6
  5. 凯瑟琳·帕拉迪斯·布鲁6
  6. 弗朗索瓦·桑沙格林6
  7. 尼古拉斯·R·汤姆森4
  8. 杰夫·L·温莎2
  9. 迈克尔·A·鹌鹑4
  10. 尼古拉·伦纳德4
  11. 亚历山德拉·比涅尔4
  12. 路易斯·克拉克4
  13. 凯西·西格4
  14. 大卫·桑德尔斯4
  15. 大卫·哈里斯4
  16. 朱利安·帕克希尔4
  17. 罗伯特·汉考克57
  18. 菲奥娜·布林克曼2、和
  19. 罗杰·列夫斯克
  1. 1英国利物浦L69 3GA利物浦大学医学微生物学和泌尿生殖医学部;
  2. 2加拿大不列颠哥伦比亚省伯纳比西蒙·弗雷泽大学分子生物学和生物化学系,V5A 1S6;
  3. 拉瓦尔大学医学院国际生物和系统研究所保护研究中心,加拿大魁北克省魁北克G1K 7P4;
  4. 4病原体基因组学,Wellcome Trust Sanger Institute,Wellcom Trust Genome Campus,剑桥CB10 1SA,United王国;
  5. 5不列颠哥伦比亚大学微生物疾病和免疫研究中心,温哥华V6T 1Z4,加拿大
  1. 6这些作者对这项工作做出了同样的贡献。

摘要

铜绿假单胞菌分离物具有高度保守的核心基因组,占总基因组序列的90%,并带有附加变量辅助基因,其中许多存在于基因组岛或胰岛中。利物浦流行株的鉴定1996年在儿童囊性纤维化(CF)单元进行的(LES)检测及其在英国多个中心的后续观察对先前广泛存在的CF患者只获得独特菌株的假设提出质疑铜绿假单胞菌从环境出发。为了了解影响这一重要流行株基因组发展的因素对最早存档的LES分离物LESB58进行了测序。序列显示存在许多大的基因组岛,包括五个原噬菌体簇、一个缺陷(pyocin)原噬菌器簇和五个非噬菌体岛。确定角色在这些簇中,进行了一项无偏见的标记突变研究,然后在慢性大鼠中进行选择肺部感染模型。通过测序鉴定了47个突变体,包括已知涉及的几个基因中的突变体在里面假单胞菌属感染。此外,来自四个原噬菌体簇和一个基因组岛的基因被鉴定并处于直接竞争状态与亲本隔离物的研究;在慢性大鼠肺部感染中,有四种药物对竞争力有强烈影响模型。这强烈表明,增强体内竞争力是维持和多样化选择的主要驱动力这些基因组原噬菌体基因。

脚注

  • 7通讯作者。

    7电子邮件鲍勃{位于}cmdr.ubc.ca; 传真:(604)827-5566。

  • [补充材料可在线获取,网址为网址:www.genome.org. The铜绿假单胞菌本研究的LESB58序列数据已提交给EMBL(http://www.ebi.ac.uk/embl/)登录号FM209186。]

  • 文章在印刷前在线发布。文章和发布日期为http://www.genome.org/cgi/doi/10.1101/gr.086082.108

    • 收到日期:2008年9月3日。
    • 2008年10月7日接受。
  • 通过免费在线提供基因组研究打开Access选项。

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  1. 基因组研究。 版权所有©2008,冷泉港实验室出版社

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