翻译依赖性和非依赖性mRNA衰变通过核糖体密度定义的互斥途径发生T细胞激活
- 布兰丁·C·梅西耶1,5,
- Emmanuel Labaronne公司2,三,5,
- 大卫·克鲁特2,5,
- 劳拉·吉格塔兹2,
- 尼古拉斯·丰罗多纳2,
- 艾丽西娅·比克内尔1,6,
- 安托万·科尔宾4,
- 梅兰妮·温克4,
- 法比安·奥贝2,
- 劳伦特·莫多洛2,
- 卡琳娜·朱拉夫列娃2,
- 迪迪埃·奥博夫2,
- 梅丽莎·摩尔1,6和
- 埃米利亚诺·里奇2
- 1美国马萨诸塞州伍斯特市马萨诸塞大学医学院RNA治疗研究所，邮编：01605；
- 2里昂大学生物与细胞建模实验室5239，Inserm U1293，69007 Lyon，法国；
- 三ADLIN科学，9100 Evry-Courcoronnes，法国；
- 4里昂大学国际传染病研究中心，Inserm U1111，Claude Bernard Lyon大学1，CNRS，UMR5308，法国里昂ENS，F-69007
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↵5这些作者为这项工作做出了同等贡献。
通讯作者：埃米利亚诺·里奇{网址}ens-lyon.org,梅丽莎·穆尔{地址}umassme.deu
摘要
在mRNA质量控制途径和功能性mRNA的降解。密码子使用、核糖体碰撞和募集导致的共翻译mRNA降解核糖体特异性蛋白的表达是mRNA转换的重要决定因素。然而，翻译依赖性的程度mRNA衰变（TDD）和翻译依赖性mRNA衰亡（TID）通路参与mRNA的降解还没有研究过。在这里，我们描述了对小鼠原发性CD4中基础和信号诱导的TDD和TID的综合分析+T细胞。我们的结果表明，大多数细胞转录物在一定程度上以翻译依赖的方式衰减。我们的分析进一步确定了非翻译区的长度、核糖体密度和GC3含量的重要性TDD大小的决定因素。一直以来，所有在编码范围内发生核糖体密度变化的转录物T细胞激活后的序列显示其TDD水平的相应变化。此外，我们还揭示了一种动态调制GC3含量与T细胞活化时TDD之间的关系，富含GC3和AU3的影响逆转密码子。总之，我们的数据显示，哺乳动物初生代中mRNA翻译和衰变之间存在着强大的动态关联细胞。
- 收到2023年3月7日。
- 已接受2024年3月9日。
