其他信息 |
示例信息
拉紧 | 不适用 |
组织 | 不适用 |
开发阶段 | 不适用 |
性 | F类 |
年龄 | 68 |
细胞类型 | 细胞混合物-组织样本 |
细胞系 | 不适用 |
公司 | 生物链 |
协作 | 不适用 |
信息的外部链接 | [{{{sample_info_link}}}{{示例链接}}] |
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RNA信息
批号 | 不适用 |
目录编号 | 1234283-10兰特 |
采样类型 | 不适用 |
提取协议(详细信息) | 不适用 |
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CAGE接入号码 |
图书馆登录号 |
登录ID Hg19 |
库id | | BAM公司 | | CTSS系统 |
12854元人民币 | | DRZ001055号文件 | | DRZ002440号文件 |
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登录ID Hg38 |
库id | | BAM公司 | | CTSS系统 |
12854元人民币 | | DRZ012405型 | | DRZ013790编号 |
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中位数的相对表达式(log10)
此样本中表达丰富的转录因子显示了该样本中转录因子启动子表达相对于FANTOM5集合中位数表达的排名列表。值已转换为log10。
此样本中表达丰富的共表达簇显示了此样本中协同表达簇表达相对于FANTOM5集合中中值表达的排名列表。值已转换为log10<br>分析师:NA链接到数据集<br>数据
在此示例中使用丰富的表达式重复族<b>摘要:</b>显示了此样本中重复家族表达相对于FANTOM5集合中中值表达的排名列表。值被log10转换<br><b>分析师:</b>NA<br><br>数据集链接<br>数据
TFBS(DNA)基序在该样本中活性启动子近端区域过度表达
JASPAR图案<b>摘要:该样本中JASPAR基序与启动子表达的关联。使用每个启动子的位置权重矩阵估计的TFBS数量与其表达之间的Pearson相关性通过采用基于随机位置权重矩阵的值表示为Z分数,并将对应于Z分数的正态分布的尾部概率作为结果P值。较低的P值表示该基序与启动子表达的关联更多(非随机)。分析员:Michiel de Hoon链接到数据集<br>数据
库编号:CNhs12854
FANTOM5第一阶段新颖独特的图案<b>小结:</b>本样本中FANTOM5第1阶段发现的169个新颖独特的图案的关联。在DMF、HOMER、ChIPMunk和ScanAll发现的去新生基序中,通过与已知基序集的比较,只选择了新基序,它们基于MACRO-APE的聚类产生了169个新颖独特的基序。它们与启动子表达的关联以与上述JASPAR基序相同的方式进行评估。分析师:Michiel de Hoon链接到数据集<br>数据
库编号:CNhs12854
HOMER在该样本中活性启动子中识别的从头基序<b>摘要:</b>显示此示例中HOMER的结果<br><b>分析师:不适用库编号:CNhs12854
FANTOM5(FF)本体
直接上级条款
祖先术语(非发展)<b>摘要:与is_a、part_of或located_in关系相关的本体术语数据
祖先术语(发展)<b>摘要:与develops_from、derives_from或preced_by关系相关的本体术语数据
乌伯龙:0002532(外胚层(通用))
乌伯龙:0006595(推测内胚层)
乌伯龙:0006603(推测中胚层)
UBERON:0010316号(胚层/神经嵴)