细胞系培养和癌调节培养基制备
人类永生口腔上皮细胞系(HIOEC)和口腔白斑细胞系(Leuk1)在无血清角质形成细胞培养基中培养[24,25]. OSCC细胞系SCC25和Cal27是从美国型培养物收集中获得的,并在37°C、5%二氧化碳存在下,在补充有10%FBS、青霉素(100 U/ml)和链霉素(100μM/ml)的DMEM中培养[26]. 为了获得各种细胞系的条件培养基(CM),用新鲜的RPMI 1640培养基清洗培养细胞,使其达到80%的融合率,并再培养24小时[19]. 收集无细胞上清液,并在3900 rpm(4°C)下离心15分钟。通过0.45μm和0.22μm过滤单元连续过滤后,最终采集CM。
通过转染THBS1特异性短发夹RNA(5'-TTC TCC GAA CGT GTC ACG T-3′用于Scrambled,5'-GTA GGT TAT GAG TTT AAT-3′用于sh1,5'-GGA CAA CTG TCC ATC CCA TTA-3′用于sh2)慢病毒,并用嘌呤霉素(10μg/mL,Calbiochem,USA)阳性选择,产生稳定的SCC25和Cal25的THBS1敲除细胞。
巨噬细胞分化和极化
THP-1细胞从ATCC中获得,并保存在添加10%FBS、青霉素(100 U/ml)、链霉素(100μM)和2-巯基乙醇(2-ME,50μM,Sigma-Aldrich,USA)的RPMI 1640培养基中。为了获得静息巨噬细胞(M0),THP-1细胞在佛波醇-12-氨基丁酸-13-醋酸盐(PMA,100 ng/ml,Sigma-Aldrich,USA)处理24小时后分化,然后再休息24小时[19,27]. 使用50 ng/ml IFN-γ(美国PeproTech)和1μg/ml LPS(美国Sigma-Aldrich)将M0细胞极化为M1细胞24小时,并使用IL-4和IL13(美国PeproTech,20 ng/ml)极化为M2细胞7天[28,29].
使用Ficoll-Hypaque(GE Healthcare,USA)密度梯度从健康对照组获得外周血单个核细胞(PBMC)[30]. 使用人CD14微珠(MiltenyiBiotec,USA)从PBMC中分离单核细胞,并根据制造商的方案通过磁激活细胞分选(MACS)分离技术进行阳性选择。纯化的单核细胞在添加10%FBS和100 ng/mL M-CSF的RPMI 1640培养基中培养7天,以获得M0[31,32].
外显子的分离和鉴定
收集的CM通过0.10μm过滤装置过滤,然后转移至Amicon®Ultra-15离心过滤装置(100 K,Merck Millipore,USA),并在4°C下以3900 rpm离心浓缩15分钟。然后用PBS仔细清洗外显体,并将其重新悬浮在PBS或RPMI 1640新鲜培养基中,以进行验证或后续实验[33]. 将新分离的外泌体按1:1000稀释,用于纳米颗粒追踪分析(NTA)测量(NanoSight NS500,NTA 3.2 Dev Build 3.2.16)。利用NanoSight-LM10系统(英国威尔特郡NanoSight)分析外显子样品的大小分布和定量。测定检测到的外泌体的大小分布,并用平均值表示 ± 标准偏差[34].
巨噬细胞形态和成像
在倒置显微镜下观察并拍摄处理过的巨噬细胞的形态(蔡司,德国)。为了进行荧光观察,巨噬细胞被固定在多聚甲醛中并预先渗透。细胞骨架用Acti stain™555荧光Phalloidin(Cytoskeley,USA)标记,细胞核用DAPI(YEASEN,China)标记。使用蔡司荧光成像显微镜(德国蔡司)检查荧光标记细胞。
外泌体的荧光标记和巨噬细胞对外泌物的摄取
用Exo-Red标记试剂(美国System Biosciences公司的Exo-Glow Exosome标记试剂盒)在37°C下培养分离的外显体30分钟。使用超滤装置用PBS清洗标记的外泌体,并将其悬浮在新鲜的RPMI 1640培养基中。用Exo-Red染料标记的外显子被添加到THP-1衍生或PBMC衍生的M0细胞中并培养过夜。随后,清洗细胞以去除游离外泌体,然后固定、渗透并用Acti-stain™488-磷灰石和DAPI染色,如上所述。使用尼康A1共焦激光显微镜(日本)检查巨噬细胞对外显子的摄取。
流式细胞术
用CM或外泌体处理24 h后,将巨噬细胞洗涤、胰蛋白酶化并重新悬浮在含有1%FBS的PBS中。然后,用表面标记物(FITC小鼠抗人CD14、Alexa Fluor小鼠抗人CD163、PE小鼠抗人CD 86;用于同位素控制的FITC小鼠IgG2ακ、Alexa Fluor小鼠IgG1κ和PE小鼠IgG1κ;均来自美国BD Biosciences)。为了进行细胞周期分析,收集细胞并将其固定在4°C的70%乙醇中,并用碘化丙啶染色(PI,BD Biosciences,USA)。染色后,用流式细胞仪(Beckman CytolFLEX FCM,美国)对细胞进行分析。
酶联免疫吸附试验
使用Luminex™xMAP技术,使用高灵敏度9-Plex人类ProcartaPlex™面板(美国赛默飞世尔科学公司)进行细胞因子分析。收集、过滤处理过的巨噬细胞培养上清液,并将其储存在 根据制造商提供的协议进行分析之前,温度为80°C。所有样品一式三份。根据制造商的说明(美国eBioscience),使用铂酶联免疫吸附测定法对细胞培养上清液和胞外体悬浮液中的THBS1水平进行定量。
定量实时聚合酶链式反应(qRT-PCR)分析
根据制造商推荐的方案,使用PrimeScript RT试剂盒(日本TaKaRa)提取总RNA并反向转录。使用SYBR Green Premix Kit(日本TaKaRa)对cDNA进行qRT-PCR检测。使用2计算相对表达式-ΔΔCT以下基因的检测方法:TNFα、IL1β、IL6、IL10、CCL18、MRC1、CD80、HLA-DRα、PAI1和THBS1。
细胞内信号通路分析
用外泌体处理24小时后,裂解THP-1衍生的巨噬细胞。根据制造商的协议(Cell Signaling Technology,USA),使用PathScan免疫细胞信号抗体阵列试剂盒对细胞裂解物进行分析。随后,用外泌体处理2 h和6 h后,对THP-1衍生的巨噬细胞进行裂解,并相应地使用PathScan细胞内信号抗体阵列试剂盒(美国细胞信号技术)对细胞裂解产物进行分析。
基于质谱的无标签定量蛋白质组学
北京邦飞生物科技有限公司采集并裂解外显子,用于基于质谱的无标签定量蛋白质组学分析[35]. 在Orbitrap Fusion质谱仪(美国Thermo Scientific)中对每个样品的洗脱肽进行数据采集。MS RAW数据文件通过Proteome Discoverer上传至吉祥物2.1,参考数据库为uniprot-human-160701.fasta。通过UniProtKB数据库分析过滤的蛋白质的功能。
蛋白质印迹
为了进行免疫印迹,使用RIPA裂解缓冲液(含蛋白酶抑制剂混合物)获得细胞提取物或外泌体提取物(Innovation,USA)。将裂解产物进行SDS-PAGE电泳后,通过电印迹将蛋白质转移到聚偏二氟乙烯膜上。然后用一级抗体(来自Thermo Fisher的抗Alix抗体;来自美国System Biosciences的抗CD9和抗CD63抗体;来自BioVision的抗Rab5抗体;抗磷酸-Akt(Ser473)、抗Akt(pan)、抗磷酸-SAPK/JNK(Thr183/Tyr185)、反SAPK/JNK、抗磷酸-p38 MAPK(Thro180/Tyr182)、,和抗p38 MAPK抗体,来自美国Cell Signaling Technology;抗β-微管蛋白抗体,来自BOSTER生物技术,中国)。在Amersham Imager 600(GE,美国)下,使用ECL Plus试剂(Millipore,美国)检测特异性抗体结合蛋白带。
免疫组织化学染色
从石蜡包埋样品中制备5μm切片。在脱蜡、复水和抗原回收后,内源性过氧化物酶活性被抑制。用一抗(美国Santa Cruz的鼠抗人THBS1抗体和鼠抗人CD68抗体;美国Abcam的兔抗人CD80抗体)进行免疫组织化学(IHC)染色。对于THBS1染色,样品用生物素化二级抗体孵育,然后用DAB试剂盒染色(GTVision,中国)。对于CD68和CD80双重染色,根据制造商提供的协议,使用了多重鼠-HRP/兔-AP IHC试剂盒(瑞士Enzo Life Sciences)。CD68的比例+CD80型+使用从美国国立卫生研究院(NIH)网站下载的免费Image J 1.51t版对20例OSCC患者CD68+区域的面积进行了测量(https://imagej.nih.gov/ij/).
生物信息学分析和验证
使用UCSC Xena浏览器根据TCGA HNSCC队列进行生物信息学分析[36,37]. 总计,在RNAseq(polyA+IlluminaHiSeq)下搜索604例患者的基因表达。仅筛选并纳入原发性HNSCC病例,以进一步分析THBS1、TNFα、IL6、IL1B、CD68、CD80和CD86的表达模式。生成定义基因集的表达热图并在线聚类,下载详细数据用于后续统计分析。基于30例原发性口腔鳞状细胞癌病例构建了一个经验证的队列。参与本研究的患者签署了书面知情同意书,研究得到了上海交通大学医学院第九人民医院医学伦理委员会的批准。
细胞迁移分析
Transwell分析用于检测OSCC细胞对外泌体处理的巨噬细胞CM的迁移能力。将癌细胞悬浮在200μl(5 × 104细胞),并用300μl含有10%FBS和300μl CM的培养基(来自底部腔室中经外泌体处理的巨噬细胞)置于Millicell腔室(8μm,Millipore Corporation,USA)中。24小时后,用多聚甲醛固定通过过滤器迁移的细胞,并用10%结晶紫染色。对迁移的细胞进行拍照和计数。
统计分析
本研究中的所有统计分析均使用SPSS16.0软件(SPSS,Inc.,Chicago,IL,USA)进行,数据表示为平均值 ± 两组之间的显著差异由Student’st吨-测试。采用皮尔逊卡方检验评估两个变量之间相关性的统计显著性。A类第页-价值< 0.05被认为具有统计学意义。