phateR:PHATE-基于亲和性的热扩散潜力过渡嵌入

PHATE是一种可视化高维单细胞数据的工具具有自然的前进或轨迹。PHATE使用了一个新的概念框架用于学习和可视化生物系统固有的多样性,其中平滑的转变标志着细胞从一种状态向另一种状态的进展。了解PHATE如何应用于造血系统的单细胞RNA-seq数据集干细胞、人类胚胎干细胞和骨髓样本,请参阅我们在《自然生物技术》上的出版物在<doi:10.1038/s41587-019-0336-3>.

版本: 1.0.7
取决于: R(≥3.3),矩阵(≥ 1.2-0)
进口: 方法、统计、图形、,网状的(≥ 1.8),ggplot2备忘录
建议: 网格图形奶牛场
出版: 2021-02-12
作者: 克里希南·斯里尼瓦桑[aut],斯科特·吉甘特ORCID标识[创建]
维护人员: 斯科特·吉甘特(Scott Gigante)
许可证: GPL-2型|文件许可证
需要编译:
引用: phateR引文信息
材料: 自述文件
在视图中: 组学
CRAN检查: phateR结果

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旧来源: phateR存档

反向依赖关系:

反向进口: 苯丙氨酸脱氢酶

链接:

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