Rediscover简介

我们现在重新发现，相互识别的R包独家基因组事件。它重新实现了以前的R包(发现)其主要贡献是统计分析基于泊松二项分布，考虑到一些样本比其他样本变异更多。重新发现很多比发现实施。

安装

Redicover可以从CRAN存储库中安装：

install.packages（“重新发现”）

介绍

包库有两个主要部分：

• 概率的估计\（第页_{ij}\）那个基因我样本中发生突变j个-假设基因和样本之间存在条件独立性。
• 使用泊松二项分布估计p值，使用之前的概率和样本数，其中两个基因是共同突变的。相应的零假设\（H_0\）是两者的突变状态基因是相互独立的。

第二步是使用这些参数估计p值两个基因共同改变的概率和样本数。重新发现根据需要提供不同的功能研究：

• 获取Mutex如果用户想要评估如果基因是相互排斥的。
• 获取MutexAB如果用户想要评估基因对另一事件是否互斥（放大、删除等……）
• 获取Mutex组将在以下情况下使用用户希望获得某组基因相互排斥。与获取Mutex函数，在此案例用户介绍了一组感兴趣的基因。

重新发现还提供了一个函数来集成其用法具有 黑手党和TCG生物链.具体来说，我们添加了身体互动从黑手党我们的分析基于泊松二项式导致新函数调用的分布发现身体互动.