黑手党

总结、分析和可视化MAF文件

生物导体版本：释放（3.19）

分析并可视化大规模测序研究中的突变注释格式（MAF）文件。该软件包提供各种功能，以执行癌症基因组学中最常用的分析，并以最小的工作量创建功能丰富的可定制可视化。

作者：阿南德·马雅孔达[aut，cre]

维护人员：Anand Mayakonda<Anand_mt at hotmail.com>

引文（从R中输入引文（“maftools”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“maftools”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“maftools”）

生物视图	分类,DNASeq公司,数据表示,驱动程序更改,特征提取,功能基因组学,排序,软件,体细胞突变,生存,变量注释,可视化
版本	2.20.0
在生物导体中	生物柴油3.4（R-3.3）（7.5年）
许可证	MIT+文件许可证
取决于	R（>=3.3）
进口	数据表，gr设备，方法，RColorBrewer，Rhtslib公司，生存，DNA副本
系统要求	GNU品牌
统一资源定位地址	https://github.com/PoisonAlien/maftools网站
错误报告	https://github.com/PoisonAlien/maftools/issues网站

建议	berry函数，生物串,BS基因组,BS基因组。哈皮恩斯。加州大学圣保罗分校hg19,基因组范围,I范围、knitr、mclust、，多重分析实验、NMF、R.utils、，Ragged实验、rmarkdown、，S4载体，雉形图，卷曲
链接到	Rhtslib公司,zlibbico公司
增强功能
取决于我	GNOSIS公司
导入我	CaMutQC（计算机辅助质量控制）,CIMICE公司,卡特探测器,音乐剧,TCGA工作流
建议我	基因组数据共享,多重分析实验,姓氏,TCG生物链
指向我的链接
生成报告	生成报告

跟随安装在您的R会话中使用此软件包的说明。

源程序包	maftools_2.20.0.tar.gz
Windows二进制	maftools_2.20.0.zip格式
macOS二进制（x86_64）	maftools_2.20.0.tgz
macOS二进制（arm64）	maftools_2.20.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/maftools网站
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/maftools
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/maftools网站/
包短Url	https://bioductor.org/packages/maftools（https://bioductor.org/packages/maftools）/
软件包下载报告	下载统计信息