MSiP:“质谱”相互作用预测

“MSiP”是一种通过大规模亲和纯化质谱(AP-MS)数据预测蛋白质相互作用的计算方法。该方法包括辐条和矩阵模型,用于在网络环境中解释AP-MS数据。“辐条”模型只考虑了饵-食饵相互作用,而“矩阵”模型则假设在给定的AP-MS实验中,每一种已识别的蛋白质(饵和食饵)都与其他蛋白质相互作用。辐条模型的假阴性率较高,而矩阵模型的假阳性率较高。尽管这两种统计模型都有优点,但结合这两种模型,可以提高机器学习分类器在区分真假阳性交互方面的性能。

版本: 1.3.7
取决于: R(≥3.6.0)
进口: 数字播放器(≥ 1.0.6),易怒的(≥ 3.1.2),第三年(≥ 1.1.3),马格里特(≥ 2.0.1),普利尔(≥1.8.6),PRROC公司(≥ 1.3.1),插入符号(≥6.0.88),e1071号(≥ 1.7.7),老鼠(≥ 3.13.0),pROC公司(≥1.17.0.1),护林员(≥ 0.12.1)
建议: 针织物,降价
出版: 2021-06-17
作者: 马蒂内·拉赫玛巴赫什[aut,cre]
维护人员: 马蒂内·拉赫马塔巴赫什(Matineh Rahmatbakhsh)<matinerb.94 at gmail.com>
许可证: GPL-3公司
需要编译:
CRAN检查: MSiP结果

文档:

参考手册: 微软信息平台.pdf
渐晕图: MSiP教程

下载内容:

包源: MSiP_1.3.7.目标.gz
Windows二进制文件: r-devel公司:MSiP_1.3.7.zip,r版本:MSiP_1.3.7.zip,r-oldrel:MSiP_1.3.7.zip
macOS二进制文件: r释放(arm64):MSiP_1.3.7.tgz公司,r-oldrel(arm64):MSiP_1.3.7.tgz公司,r-release(x86_64):MSiP_1.3.7.tgz公司,r-oldrel(x86_64):MSiP_1.3.7.tgz公司

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