MSiP:“质谱”相互作用预测
“MSiP”是一种通过大规模亲和纯化质谱(AP-MS)数据预测蛋白质相互作用的计算方法。该方法包括辐条和矩阵模型,用于在网络环境中解释AP-MS数据。“辐条”模型只考虑了饵-食饵相互作用,而“矩阵”模型则假设在给定的AP-MS实验中,每一种已识别的蛋白质(饵和食饵)都与其他蛋白质相互作用。辐条模型的假阴性率较高,而矩阵模型的假阳性率较高。尽管这两种统计模型都有优点,但结合这两种模型,可以提高机器学习分类器在区分真假阳性交互方面的性能。
版本: |
1.3.7 |
取决于: |
R(≥3.6.0) |
进口: |
数字播放器(≥ 1.0.6),易怒的(≥ 3.1.2),第三年(≥ 1.1.3),马格里特(≥ 2.0.1),普利尔(≥1.8.6),PRROC公司(≥ 1.3.1),插入符号(≥6.0.88),e1071号(≥ 1.7.7),老鼠(≥ 3.13.0),pROC公司(≥1.17.0.1),护林员(≥ 0.12.1) |
建议: |
针织物,降价 |
出版: |
2021-06-17 |
作者: |
马蒂内·拉赫玛巴赫什[aut,cre] |
维护人员: |
马蒂内·拉赫马塔巴赫什(Matineh Rahmatbakhsh)<matinerb.94 at gmail.com> |
许可证: |
GPL-3公司 |
需要编译: |
不 |
CRAN检查: |
MSiP结果 |
文档:
下载内容:
链接:
请使用规范形式https://CRAN.R-project.org/package=MSiP链接到此页面。