HDStIM:高维刺激免疫映射('HDStIM')

一种在大规模或流式细胞术中识别对实验刺激反应的方法,该方法使用测量参数的高维分析,可以采用端到端的无监督方法执行。在体外刺激试验中,高参数细胞术用于监测细胞内反应标记,使用通过自动聚类或手动门控对一组刺激和非刺激样品进行注释的细胞群体,“HDStIM”将细胞标记为有反应或无反应。该软件包还提供辅助功能,根据细胞内标记对识别反应和生成诊断图的贡献对其进行排序。

版本: 0.1.0
取决于: R(≥3.6.0)
进口: 易怒的,ggplot2,超高速,数字播放器,第三年,扫帚,潮汐选择,ggridges公司,博鲁塔,规模
建议: 针织物,rmarkdown公司,测试那个
出版: 2022-06-24
作者: 罗希特农民ORCID标识[aut,cre],Richard Apps公司ORCID标识[aut],曾俊华(John Tsang)ORCID标识[自动,个人数据记录]
维护人员: 罗希特·法默
错误报告: https://github.com/niaid/HDStIM/issues
许可证: CC0公司|文件许可证
网址: https://github.com/niaid/HDStIM网站,https://niaid.github.io/HDStIM网站/
需要编译:
语言: 英语-美国
材料: 自述文件
CRAN检查: HDStIM结果

文档:

参考手册: HD标准IM.pdf
渐晕图: HDStIM公司

下载内容:

程序包来源: HDStIM_0.1.0.tar.gz硬盘
Windows二进制文件: r-devel公司:HDStIM_0.1.0.邮编,r版本:HDStIM_0.1.0.zip文件,r-oldrel:HDStIM_0.1.0.zip文件
macOS二进制文件: r释放(arm64):HDStIM_0.1.0.tgz硬盘,r-oldrel(arm64):HD标准IM_0.1.0.tgz,r-release(x86_64):HD标准IM_0.1.0.tgz,r-oldrel(x86_64):HD标准IM_0.1.0.tgz

链接:

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