DRaWR:带重启的判别随机漫步

我们提出了DRaWR,一种基于网络的基因或与给定基因集相关的属性。这些相关基因或属性是从大型、异构生物网络的节点中识别信息。我们的方法涉及一个随机遍历,在具有多个节点和边缘类型的初始网络,保留了更多原始的特定属性信息,而不是当前操作的方法在同构网络上。在我们算法的第一阶段,我们发现与给定基因集最相关的属性并提取原始网络的子网络,仅包含相关属性。我们然后根据与给定基因集的相似性,基于第二个在上述子网上执行的随机行走和重新启动。

版本: 1.0.3
取决于: R(≥3.0)
进口: 矩阵,ROCR公司,方法
出版: 2022-03-24
作者: 查尔斯·布拉蒂
维护人员: 查尔斯·布拉蒂(Charles Blatti)
许可证: GPL-2型
需要编译:
材料: 新闻
在视图中: 组学
CRAN检查: DRaWR结果

文件:

参考手册: DRaWR.pdf文件

下载:

包源: DRaWR_1.0.3.tar.gz
Windows二进制文件: r-devel公司:DRaWR_1.0.3.zip文件,r版本:DRaWR_1.0.3.zip文件,r-旧版本:DRaWR_1.0.3.zip文件
macOS二进制文件: r释放(arm64):DRaWR_1.0.3.tgz,r-oldrel(arm64):DRaWR_1.0.3.tgz,r-版本(x86_64):DRaWR_1.0.3.tgz,r-oldrel(x86_64):DRaWR_1.0.3.tgz
旧来源: DRaWR存档

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