鹿西尼亚斯® 分子流行病学分析POT试剂盒(大肠杆菌用)
大肠杆菌E. coli)是在自然环境中广泛存在的日和见感染菌。在医疗环境中,食物中毒和院内感染等集体感染的原因很多,感染管理很重要。
本试剂盒是用于进行大肠杆菌的菌种鉴定、克隆鉴定及菌株识别的基因型试剂盒。在PCR-based ORF Typing(POT)法中,使用多重PCR扩增大肠杆菌所拥有的多个特定基因区域,通过琼脂糖凝胶电泳法对分离出的带型进行数值化,从遗传学上决定克隆鉴定和菌株识别。
特征
- 通过将分析结果数值化(POT值)E.coil菌株识别
- 约4小时以内可以进行分子流行病学分析
- 无需特殊装置
- 特别是在ESBL产生大肠杆菌中,接近PFGE的识别能力
套件配置
|
个别名称 |
容量 |
数量 |
试剂A |
AptaTaq DNA Master(5×Conc.)* |
240 μL |
一根 |
试剂B |
PCR补充剂 |
240 μL |
一根 |
试剂C |
底漆α |
120 μL |
一根 |
试剂D |
引物混合β |
120 μL |
一根 |
试剂E |
正控制 |
240 μL |
一根 |
试剂F |
6个加载缓冲区 |
240 μL |
一根 |
*AptaTaq DNA Master(5×Conc.)是Roche诊断K.K.的商品。
操作步骤
- 分离的菌株纯培养
- 进行DNA提取,制备模板DNA
- 2种多路PCR
- 琼脂糖凝胶电泳
- 读取带模式
- POT值的计算
- 各检体的POT值的比较分析
分析方法
电泳模式
:50bp DNA梯形图
P:积极控制
N:负控制(TE缓冲液)
1-4:大肠杆菌的分离株
检测ORF的种类(目标区域)及其PCR扩增产物尺寸
|
POT No. |
放大尺寸(bp) |
目标区域 |
Reaction mixture 1 |
PCR PC |
652 |
E.coil判定区域 |
POT 1-1 |
511 |
Genomic Islet-1 |
POT 1-2 |
415 |
Genomic Islet-2 |
POT 1-3 |
363 |
Genomic Islet-3 |
POT 1-4 |
307 |
Genomic Islet-4 |
POT 1-5 |
253 |
Genomic Islet-5 |
POT 1-6 |
222 |
Genomic Islet-6 |
POT 2-1 |
178 |
bla CTX-M-2 |
POT 2-2 |
146 |
Genomic Island-1 |
POT 2-3 |
123 |
Genomic Island-2 |
POT 2-4 |
98 |
Genomic Island-3 |
POT 2-5 |
80 |
Genomic Island-4 |
Reaction mixture 2 |
PCR PC |
652 |
E.coil判定区域 |
POT 2-6 |
527 |
Genomic Islet-7 |
POT 2-7 |
436 |
Genomic Island-5 |
POT 2-8 |
361 |
bla CTX-M-1 |
POT 3-1 |
311 |
Genomic Island-6 |
POT 3-2 |
250 |
Genomic Island-7 |
POT 3-3 |
219 |
Genomic Islet-8 |
POT 3-4 |
179 |
Genomic Island-8 |
POT 3-5 |
154 |
Genomic Island-9 |
POT 3-6 |
122 |
Genomic Islet-9 |
POT 3-7 |
102 |
Genomic Island-10 |
POT 3-8 |
79 |
bla CTX-M-9 |
- 从两个多路PCR的电泳结果读取带模式。
- 使用这个电泳的带的有无的结果,用二进制输入POT值解析用Excel表,算出3个范畴的POT值。
- PCR PC阳性时,大肠杆菌(Escherichia coli)。
- 如果POT2值为奇数则为CTX-M-1group,如果为128以上则为CTX-M-2group
如果POT3的值为奇数,则持有CTX-M-9group的各ESBL基因。
- 通过比较检体间POT值E. coli的菌体间的同源性能客观地推测。
- 从集体感染得到的菌体POT1~3的POT值全部变得相同。
分析结果
|
样本编号 |
1 |
2 |
3 |
4 |
POT 1 |
20 |
26 |
49 |
49 |
POT 2 |
1 |
144 |
58 |
101 |
POT 3 |
94 |
4 |
215 |
178 |
产品列表
产品编号 |
产品名称 |
保存温度 |
标准 |
包装 |
详细信息 |
08362-97 |
鹿西尼亚斯分子流行病学分析POT试剂盒(大肠杆菌用) |
冷冻 |
分子生物学用 |
1次(30次) |
|
08178-96 |
鹿西尼亚斯DNA提取试剂 |
冷藏 |
分子生物学用 |
1次(120次) |
|
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小册子
鹿西尼亚斯® 分子流行病学分析试剂盒(大肠杆菌用)
使用说明书
鹿西尼亚斯® 分子流行病学分析POT试剂盒(大肠杆菌用)
计算表(ZIP文件、Excel)
POT(E.coli)计算表(ZIP文件)
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