什么是虚拟筛选

虚拟筛选是制药中使用的计算技术。通过模拟目标和化合物之间的相互作用并计算它们之间的亲和力，可以确定很可能与目标蛋白质结合的化合物。与传统的高通量筛选（HTS）相比，虚拟筛选是一种更合理的制药方法，通过选择大型化合物数据库，帮助您快速、低成本地发现新的活性物质。HTS的一般命中率约为0.01%至0.14%，而虚拟筛选的命中率约为1%至20%。

TargetMol公司在电脑创药支援（CADD:computer-aided drug design）方面具有优势。本公司通过AlphaFold2高精度、高速地预测蛋白质结构，提供对本公司化合物数据库的虚拟筛选服务。根据您的要求，TargetMol经验丰富的团队将为您提供最佳方案，以支持制药研究。

基于坞站的虚拟筛选

对接法（DBVS：docking-based virtual screening）是CADD制药的重要工具。该方法旨在预测低分子化合物对靶点和受体结合位点的结合和亲和力，有助于研究人员了解有关结合过程的物理化学特征。对接法对大规模的化合物库进行虚拟筛选，对热门化合物进行排名，可以建立低分子化合物如何阻碍目标的假说。这在优化引线方面非常重要。

为了确保测试结果的准确性，TargetMol公司通常会进行三次筛选，如下所示。

1. 基于Drug-likeness的筛选
2. 基于坞站的虚拟筛选
3. 创药经验丰富的科学家Manual筛选

经过10年以上的筛选团队进行的Manual筛选，可以获得高精度的结果。

在Manual筛选中，考虑到药物结合部位的立体结构特性（氢键、疏水性、亲水性等），根据分子对接得分选择结合亲和性高的热门化合物。参照现有药的结构活性相关，不仅维持具有同样分子相互作用的热门化合物，还设法列出具有更多新核心结构的化合物。

化合物数据库

顶部数据库
化合物数：1200万种
它是一个收集了1200万种可合成化合物的数据库，可用于多种筛选目的。通过每年进行2次数据的更新，确保信息的正确性和可靠性。另外，几乎所有的化合物都有库存，筛选后可以长期供应。产品的质量在全世界的制药公司，生物技术企业，筛选中心等，200多个研究设施被验证。

顶部排水量数据库
化合物数：160万种
从Topscience database中根据里宾斯基定律筛选出的高质量Drug-like库，是一个包含超过5000种骨骼的多样性数据库。可以进行非常性价比高的筛选，可以减少项目初期调查所需的成本和时间。

Topscience Core database
化合物数：2万种
从Topscience database中收集了已知会引起细胞、组织、个体生物学反应的化合物的数据库。适用于以药物定位、细胞诱导、机制研究、目标鉴定、积极控制等为目的的筛选。

您的数据库TargetMol公司销售的图书馆中所述修改相应参数的值。TargetMol公司可以根据考试的目的提出最合适的数据库，请务必联系表格请与我商量。

与高速筛选（HTS）的比较

TargetMol的优势

• 大量数据库可用
• 10年以上经验丰富的团队
• 稳定提供热门化合物产品
• 通过独特的筛选方法确保可靠的结果
• 使用文献中使用的专业性软件，提供专业规格的图表

订单流程

1. 确认您的要求
   本公司的营业担当或者联系表格中描述的场景，使用下列步骤创建明细表，以便在概念设计中分析体量的周长。
2. 内部评估
   确认申请内容确认TargetMol公司是否可以委托。如果可以委托的话，请允许我提出计划和报价。
3. 虚拟筛选
   交货期标准：化合物数20000种时，交货期2～3周左右
4. 报告的提交·售后服务

虚拟筛选成功示例

1.PLK1-SVCPP1抑制剂虚拟筛选

背景

• 作为有丝分裂激酶的人蛋白质PLK1，在整个细胞周期的各种生物学功能中发挥着重要的作用。该蛋白质由全部603个氨基酸构成在K82、E131、D194上形成ATP结合部位D176中有催化剂部位。
• 研究人员A先生说除了PLK1激酶催化ATP作用之外我们发现它也可以与SHCBP1因子形成复合物。SHCBP1是另一个参与细胞增殖、成⻑、分化的必需成分。
• PLK1-SHCPP1复合体在有丝分裂中发挥作用，与促进癌症的发生有关。

目标

发现抑制PLK1-SHCPP1的蛋白质间相互作用（PPI:Protein-Portein Interaction）的化合物

筛选工序

引用源：Shi，Wengui，et al.“Hyperactivation of HER2-SHCPP1-PLK1axis promotes tumor cell mitosis and impairs trastuzumab sensitivity to gastric cancer。“Nature Communications12.1（2021）：2812。

2.MARK4抑制剂虚拟筛选

背景

• 紫杉醇是用于治疗各种固体肿瘤的有效药剂，但肝细胞癌（HCC）患者对紫杉醇有耐性。
• 实验结果为暗示着MARK4的阻碍有影响紫杉醇耐性的事。

ARK4

筛选工序

（A）MARK4立体结构，（B）虚拟筛选流程，（C）热门化合物，（D）活性实验

引用源：Shen，Xianyan，et al.“Discovery of coumarin as microtubule affinity-regulating kinase4inhibitor that sensitize hepatocellular carcinoma to paclitaxel。“Frontiers in Chemistry7（2019）：366。

3.PRMT5抑制剂虚拟筛选

背景

• 蛋白质精氨酸甲基转移酶5（PRMT5）通过催化组蛋白上精氨酸残基的对称性二甲基化来控制遗传转录，在肿瘤形成中发挥重要作用。
• “EPZ015666”与s-腺苷甲硫氨酸（SAM）结合袋不同的新结合部位是最近报道的PRMT5抑制剂。
• 虚拟筛选鉴定出了一种新的⽊SAM竞争性化合物“#T1551”，可用于开发针对⽊Ø细胞肺癌的PRMT5的低分⼦。

PDB ID:4X61

●SAM

●EPZ015666

筛选工序

命中化合物活性实验

引用源：Wang，Qianqian，et al.“Identification of anover protein arginine methyltransferase5inhibitor in non-small cell lung cancer by structure-based virtual screening。“Frontiers in pharmacology9（2018）：173。