糖化酶和微生物

在森林里，古树、倒木、落下的树枝等慢慢腐朽。这是由于微生物的活动。木材的主要成分纤维素结晶化，所以难分解性。另外，木材中还含有半纤维素和木质素等，更难分解。具有完全分解木材的一系列酶的生物是有限的，但菌类是具有这种能力的代表性微生物。

使木材腐烂的菌类（木材腐朽菌）传统上根据木质素的分解方法被区分为白色腐朽菌、褐色腐朽菌、软腐朽菌3群。

白色腐朽菌能分解所有木材中的纤维素、半纤维素和木质素。随着腐朽的发展，木材会变成类白色，这是白色腐朽名字的由来。在白色腐朽菌中研究的种子Phanerochaete chrysosporium的下界。其他还有翠竹（Tramets versicolor）、作为食用菌而闻名的羊栖菜（Pleurotus ostreatus）或香菇（Lentinula edodes）等很多蘑菇的同类（担子菌类）是白色腐朽菌。

褐色腐朽菌会分解木材中的纤维素和半纤维素，但木质素的分解是有限的。因此，随着木材的腐朽，残留的木质素的颜色（褐色）也会到达。这就是褐色腐朽名字的由来。褐色腐朽菌类都是蘑菇的伙伴，有名的是大鹌鹑（Fomitopsis palustris）和香菇（Gloeophyllum sepiarium），模板名称将采用不同的格式。使房屋的木材腐烂成为问题的纳米竹（序列lacrymans）也是褐色腐朽菌。

褐色腐朽菌
（金枪鱼肉饼）

引起白色腐朽和褐色腐朽的蘑菇中，不仅有将木材中的纤维素和木质纤维素分解为葡萄糖等单纯的糖，还有进行酒精发酵的种类。白色腐朽菌的白米菌（Tramets suaveolens）和阿拉格卡瓦拉塔克（T.hirsuta）报告了特别显著的乙醇生产能力。另外，半纤维素的主要成分之一木糖也会通过卡瓦拉塔克转化为乙醇。如果这些腐朽菌的研究进行的话，也许不用酵母就能从木质生物质中有效地生产乙醇。

翠竹

软腐朽菌除了分解木材中的纤维素和半纤维素以外，通过分解植物的细胞壁的富含木质素的细胞间层使木材变软。有足够的养分，一般都喜欢湿润的环境。多数软腐朽菌是子囊菌类或子囊菌类的无性生殖世代（不完全菌类），属于三尖菌属（Trichoderma）或天鹅绒属（Caetomium），模板名称将采用不同的格式。酵素在市场上销售，研究也在进行中Trichoderma ressei是代表性的种子。

软腐菌
（天蚕属的1种）

已知寄生在植物上引起疾病的植物病原菌类在侵入植物时会分泌纤维素分解酶。另外，这些酶也与植物组织的腐败症状诱导有关。

在腐朽性的蘑菇中，也有栎属（Armillaria）和松茸属（标题，标题）等，感染活树木引起疾病的种类很多。

纤维素分解酶似乎对这些植物病原菌的感染也起着重要的作用。