生物技术

为微型双欧姆分析开发测量参考

作为微生物学分析法之一,使用了使用16SrRNA基因的扩增序列和喷枪序列等的元基因组分析。元基因组分析,从基因组的抽出到序列数据的取得的一系列的工序中,由于实验方法和试剂等的不同,各行程产生偏差,其结果,对分析结果产生影响的事被报告文档1,2
因此,NITE正在开发可用于微双态分析的实验协议的优化和验证评价的测量基准。
 

微双欧姆分析中的偏置积累

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微型双欧姆测量参考

NITE开发的测量用参考有菌体鸡尾酒和DNA鸡尾酒两种。菌体鸡尾酒是使用NITE所持有的菌株中革兰氏染色、GC含量、基因组大小不同的多个菌株,分别以细胞数均等混合而成的。DNA鸡尾酒是使用与菌体鸡尾酒制作中使用的相同菌株中提取的基因组DNA,分别用基因数均等混合而成的。
这些测量用参考是以从试样提取DNA方法、用于扩增子序列分析的引物的选定和文库制作试剂等的评价为首的协议的确认可以用于确认作业者之间的手法和新作业者的训练等。
菌体鸡尾酒和DNA鸡尾酒的使用例子的图表

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