生物技术

用于MALDI-TOF MS微生物鉴定用文库的微生物


这里介绍NITE提供的MALDI-TOF MS微生物鉴定用文库中使用的微生物。

曲霉属

它是克拉多斯玻色子属的模型照片

克劳德斯波利姆(Cladosporium)属一般被称为霉菌,在土壤和居住环境等广泛的环境中发现。其中很多都是制作空中漂浮的孢子,通过空调机器等向居住环境放出,除了成为食品污染、浴室的墙壁和窗帘等布料的黑色变化的原因之外,作为哮喘等呼吸系统疾病的原因的菌也广为人知。
分类体系非常复杂,需要从多个基因领域进行物种判别,希望有简便的识别方法。
NITE用MALDI-TOF MS分析了市售文库中没有的4种16株,制作并提供了与MALDI Biotyper和SARAMIS对应的文库。

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乳酸菌

乳酸菌的模型照片

乳糖属是酸奶等乳酸发酵食品中大量含有的革兰氏阳性菌,特别是Lactooccus lactis是作为乳酸菌最初被发现了的种。乳杆菌属以前被定位为链球菌属,与口腔、人畜、临床样品等中发现的乳酸菌有很深的关系。
无菌属是产生的乳酸的异构体为D型的杂发酵型乳酸菌。其中Leuconostoc mesenteroides与植物发酵关系密切,存在于农场的青贮、扎瓦克劳特和葡萄酒的制作过程中。另一方面,也有罕见的对人产生机会性感染症的报告例。
乳杆菌属注意是自古以来用于酸奶制造的乳酸菌。另一方面,在日本酒酿造的现场,作为日本酒风味劣化的原因的火落菌也很有名。
NITE用MALDI-TOF MS分析了拉克斯科卡斯属、罗伊科诺斯托克属的18种33株,制作并提供了与MALDI Biotyper和SARAMIS对应的文库。乳杆菌属用MALDI-TOF MS分析了18种57株,制作并提供了与MALDI Biotyper和SARAMIS对应的文库。

注:Zheng,J.et al.(2020)。包括由Int.J.Syst.Evol.Microbiol.702782-2858.重新分类为不同属的物种。

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糖精属

这是一张属于糖衣炮弹的模型照片

狭义的糖衣炮弹(Saccharomycessensu stricto)因含有通过酒精发酵制作面包、葡萄酒、啤酒等的细菌而闻名。
因为含有很多可以用于食品等的有用菌,所以希望简便且精度高的识别、鉴定,另一方面,各个菌种之间非常近缘,用以往的方法识别、鉴定非常困难。
NITE用MALDI-TOF MS分析了10种99株,制作并提供了与MALDI Biotyper和SARAMIS对应的文库。

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黑曲菌的有关菌

黑曲菌的模型照片

黑曲菌是孢子颜色为黑褐色的丝状菌,在土壤、空气中、面包和谷物中发现。就是这些人Aspergillus niger为首的数菌种,产生有致癌性的霉菌毒(秋葵毒素等),作为成为食品污染和住宅灰尘等的呼吸系统的疾病的原因的危害菌被知道。
另一方面Aspergillus awamori黑曲菌的同类中也含有用于酿造酒类和制造酵素的有用菌种。
NITE用MALDI-TOF MS分析黑曲菌中的14种49株,制作并提供了与MALDI Biotyper和SARAMIS对应的文库。

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不动杆菌属

它是一幅属于海涅特巴克特的模型画

不动杆菌属是广泛生活在土壤和河水等自然环境中的革兰氏阴性细菌,约有60种。一方面存在环境污染物质分解菌、原油分解菌等产业上有用菌株A.baumannii,A.haemolyticus等病原菌种的存在,还有一些不动杆菌属种获得了多药耐药性,成为世界性的问题。
NITE用MALDI-TOF MS分析了34种71株,制作并提供了与MALDI Biotyper和SARAMIS对应的文库。

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假单胞菌

它是一幅施德莫纳斯属的模型画

施德莫纳斯(Pseudomonas)属广泛分布于土壤等所有环境的细菌,是富含多种分解能力的革兰氏阴性杆菌。特别是Pseudomonas putida是世界上第一个因其出色的油分解能力而可用于环境净化(生物修复)而被专利注册的物种。P.putida小组只16 S rRNA排列近缘种彼此的识别难,简便鉴定精度高(贵)的方法的开发被期望。

NITE用MALDI-TOF MS分析了11种77株,制作并提供了与MALDI Biotyper和SARAMIS对应的文库。

 

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诺卡迪亚属

它是诺卡迪亚属的模特照片

是放线菌的伙伴,广泛存在于土壤中。诺卡迪亚(Nocardia)属为偏性好氧性,细胞壁中具有抗酸性。一般是长的菌丝状,不久就会分裂成杆状或球状的细胞。另一方面,对于人类和动物,成为诺卡迪亚症(机会性感染症)的原因的种类(N.asteroides单击功能区上,N. brasiliensis单击功能区上,N.farcinica单击功能区上,N.nova单击功能区上,N.otitidiscaviarum单击功能区上,N.transvalensis等已弃用的函数的缺少的支持。此外N.vaccinii是植物N.salmonicida报告了对鱼类的致病性。
NITE用MALDI-TOF MS分析了81种(包括invalid name)96株,制作并提供了与SARAMIS对应的文库。

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黄曲菌的有关菌

这是菊苣霉的模型照片

Aspergillus属广泛分布于世界各地的丝状菌,本属中已知近1000种。其中多数是土壤中的腐生菌和空中浮游菌A.oryzae。要使A.sojae)用于制造以酒为首的发酵食品。另一方面,使食品、产品腐败、劣化,产生微机毒素(A.flavus,A.parasiticus),也存在引起肺部疾病的种类,是有用菌种和有害菌种在近缘难以判别的菌种。
NITE用MALDI-TOF MS分析了10种127株,制作并提供了与MALDI Biotyper和SARAMIS对应的文库。

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