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姓名 帮助_脱机 列车自动防护系统 标识符 切比:30616 (贝尔斯坦:3581767) 帮助_脱机 收费 -4 公式 C10H12N5O13P3型 InChIKey公司 帮助_脱机 ZKHQWZAMYRWXGA-KQYNXXCUSA-J公司 微笑 帮助_脱机 Nc1ncnc2n(cnc12)[C@@H]1O[C@H](COP([O-])(=O)OP([O-])(=O)OP 2D坐标 小分子分子分子文件 搜索链接 涉及1267个反应 查找 含有或类似这种结构的分子 在UniProtKB中查找此分子的蛋白质 -
姓名 帮助_脱机 生物素 标识符 切比:57586 (Beilstein:10186323) 帮助_脱机 收费 -1 公式 C10H15N2O3S InChIKey公司 帮助_脱机 YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-M公司 微笑 帮助_脱机 [H] [C@]12CS[C@@H](CCCCC([O-])=O)[C@@]1([H])NC(=O)N2 2D坐标 小分子分子分子文件 搜索链接 涉及14个反应 查找 含有或类似这种结构的分子 在UniProtKB中查找此分子的蛋白质 -
姓名 帮助_脱机 H(H) + 标识符 车比:15378 收费 1 公式 H(H) InChIKey公司 帮助_脱机 GPRLSGONYQIRFK-UHFFFAOYSA-N公司 微笑 帮助_脱机 【H+】 2D坐标 小分子的摩尔文件 搜索链接 涉及9245个反应 查找 含有或类似这种结构的分子 在UniProtKB中查找此分子的蛋白质 -
姓名 帮助_脱机 生物素-5'-AMP 标识符 切比:62414 收费 -1 公式 C20H27N7O9PS InChIKey公司 帮助_脱机 UTQCSTJVMLODHM-RHCAYAJFSA-M公司 微笑 帮助_脱机 [H] [C@]12CS[C@@H](CCCC(=O)OP([O-])(=O)OC[C@H]3O[C@H]([C@H](O)[C@@H]3O)n3cnc4c(N)ncnc34)[C@@]1([H])NC(=O)N2 2D坐标 小分子分子分子文件 搜索链接 涉及2个反应 查找 含有或类似这种结构的分子 在UniProtKB中查找此分子的蛋白质 -
姓名 帮助_脱机 二磷酸盐 标识符 车比:33019 (贝尔斯坦:185088) 帮助_脱机 收费 -3 公式 HO7P2型 InChIKey公司 帮助_脱机 XPPKVPWEQAFLFU-UHFFFAOYSA-K公司 微笑 帮助_脱机 OP([O-])(=O)OP([O-])([O-])=O 2D坐标 小分子分子分子文件 搜索链接 参与1106个反应 查找 含有或类似这种结构的分子 在UniProtKB中查找此分子的蛋白质
交叉引用
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出版物
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霍里克氏热球菌OT3及其复合物生物素蛋白连接酶的晶体结构:生物素活化的结构基础。 巴加季诺夫B。, Kuroishi C。, Sugahara M。, Kunishima N。 生物素蛋白连接酶(EC 6.3.4.15)催化从底物生物素和ATP合成生物素的活性形式生物素-5’-AMP,然后生物素羧基载体蛋白亚基乙酰-CoA羧化酶生物素化。 生物素蛋白连接酶f的三维结构 …>>更多 生物素蛋白连接酶(EC 6.3.4.15)催化从底物生物素和ATP合成生物素的活性形式生物素-5’-AMP,然后生物素羧基载体蛋白亚基乙酰-CoA羧化酶生物素化。 用1.6A分辨率的X射线衍射法测定了霍里氏热球菌OT3生物素蛋白连接酶的三维结构。 该结构揭示了作为功能单元的同二聚体。 每个亚单位包含两个结构域,一个较大的N端催化结构域和一个较小的C端结构域。 通过测定酶与生物素、ADP和反应中间体生物素-5’-AMP的原子分辨配合物的晶体结构,研究了活性中心的结构特征。 这是首次报道生物素蛋白连接酶与核苷酸和生物素-5’-AMP的配体结构。 除了活性中心环在配体结合时的有序性外,未连接形式和配体形式的结构是同构的。 由于生物素和核苷酸的囊袋在催化结构域的缝隙中彼此空间相邻,生物素-5’-AMP结合囊袋模拟底物的结合,因此适当地安排催化结合位点以最小化反应过程中所需的构象变化。 配体和活性位点残基的准确位置使我们能够提出生物素蛋白连接酶进行反应的第一步的一般方案,其中Lys111带正电的ε氨基促进生物素羧基氧原子和 稳定带负电荷的中间体。 <<更少 《分子生物学杂志》353:322-333(2005) [ 公共医学 ] [ 欧洲PMC ] 本出版物由引用 1 其他 条目。 -
大肠杆菌生物素全酶合成酶/生物阻遏物晶体结构描述了生物素和DNA结合域。 威尔逊K.P。, Shewchuk L.M.公司。, 布伦南R.G。, 大冢A.J。, 马修斯·B.W。 大肠杆菌生物素生物合成操纵子阻遏物BirA的三维结构已通过x射线结晶学测定,并在2.3-a分辨率下细化至19.0%的晶体残留。 BirA是一种序列特异性DNA结合蛋白,也催化f …>>更多 大肠杆菌生物素生物合成操纵子阻遏物BirA的三维结构已通过x射线结晶学测定,并在2.3-a分辨率下细化至19.0%的晶体残留。 BirA是一种序列特异性DNA结合蛋白,它还催化生物素和ATP形成生物素-5’-腺苷酸,并将生物素部分转移到其他蛋白质上。 细胞中生物素生物合成酶的水平由生物素-5’-腺苷酸(BirA共抑制剂)的量控制。 该结构提供了同时也是酶的转录因子的示例。 BirA的结构高度不对称,由三个域组成。 N末端结构域主要是α-螺旋结构域,包含螺旋-螺旋DNA结合基序,并与分子的其余部分松散连接。 中心域由一个七个品牌的混合β-表组成,其中一个面上覆盖着字母。 片材的另一面大部分暴露在溶剂中,并含有活性部位。 C末端结构域由六股反平行β-片三明治组成。 生物素结合的位置与影响酶活性的突变一致。 附近的一个环有一个与其他蛋白质中的磷酸结合相关的序列。 据推测,ATP在该区域结合,与生物素相邻。 有人提出,共抑制剂与单体BirA的结合可能通过促进多聚体BirA-共抑制剂-DNA复合物的形成来促进DNA结合。 然而,这个建筑群的结构细节仍然是一个悬而未决的问题。 <<更少 程序。 国家。 阿卡德。 科学。 美国89:9257-9261(1992) [ 公共医学 ] [ 欧洲PMC ] 本出版物由引用 1 其他 条目。 -
大肠杆菌生物素生物合成阻遏物催化生物素-5’-腺苷酸合成的动力学和酶-产物复合物的稳定性。 徐勇。, 贝克特·D·。 大肠杆菌生物素生物合成阻遏物既是生物素连接酶,又是生物素合成操纵子转录起始的阻遏剂。 小分子生物素-5'-腺苷酸(bio-5'-AMP)是生物素连接反应和正变构酶的中间产物 …>>更多 生物素生物合成的大肠杆菌阻遏物既是生物素连接酶,也是生物素生物合成操纵子转录起始的阻遏物。 小分子生物素-5'-腺苷酸(bio-5'-AMP)是生物素连接反应的中间产物,也是BirA结合序列特异性DNA的正变构效应物。 BirA催化底物生物素和ATP合成腺苷酸。 尽管BirA和其他生物素全酶合成酶已成为生物化学研究的主题,但还没有直接测量bio-5'-AMP合成反应的报告。 没有关于腺苷酸合成的机理和动力学参数的信息。 除了缺乏动力学信息外,BirA-bio-5'-AMP复合物的热力学稳定性尚不清楚。 由于BirA-腺苷酸复合物在生物素调节系统中起着关键作用,因此动力学和热力学信息对于定量了解该系统至关重要。 我们开发了一种测量bio-5'-AMP合成时间进程的方法。 这些测量结果表明,时间过程的特征是先有一个初始脉冲,然后是一个缓慢的线性相位。 爆发对应于每摩尔酶1摩尔产物的快速合成,慢线性相的速率受到酶产物释放的限制。 (摘要删减为250字) <<更少 《生物化学》33:7354-7360(1994) [ 公共医学 ] [ 欧洲PMC ] 本出版物由引用 2 其他 条目。