7X5F型

与CsMBE2结合的Nrf2-MafG异二聚体


实验数据快照

  • 方法:X射线衍射
  • 分辨率:2.60 Å
  • R值自由:0.259 
  • R值工作:0.226 
  • 观察到的R值:0.228 

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文学类

CNC家族转录因子Nrf2转录调控的结构基础。

仙谷由纪夫。希纳,M。铃木,K。滨田,K。佐藤,K。内山,A。小林,S。A.奥古尼。H·伊塔亚。Kasahara,K。莫里瓦基,H。C.渡边。T·洪马。冈田,C。S.巴巴。Ohta,T。Motohashi,H。山本,M。Ogata,K。

(2022)核酸研究50: 12543-12557

  • 内政部:https://doi.org/10.1093/nar/gkac1102
  • 相关结构的主要引文:
    7X5E型,7x5英尺,7x5克

  • PubMed摘要:

    一些碱性亮氨酸拉链(bZIP)转录因子在其DNA结合域中具有辅助基序,例如CNC家族的CNC基序或小Maf(sMaf)蛋白的EHR基序。CNC家族蛋白与sMaf蛋白异源二聚体化,以识别CNC-sMaf结合DNA元件(CsMBE),与sMaf-同二聚体竞争,但CNC基序的功能作用仍不明确。在本研究中,我们报道了与MafG和CsMBE复合物中调节抗应激转录反应的CNC家族蛋白Nrf2/NFE2L2的晶体结构。CNC基序限制了碱性区关键Arg残基的构象,这些残基与DNA骨架磷酸盐形成广泛接触。因此,Nrf2-MafG异二聚体对CsMBE的亲和力约为经典bZIP蛋白(如AP-1蛋白)的200倍。CNC-sMaf异二聚体的高DNA亲和力可能使其能够在目标基因上与sMaf同二聚体竞争,而不会受到其他具有类似序列特异性的低亲和力bZIP蛋白的干扰。


  • 组织附属关系

    横滨市立大学医学研究生院生物化学系,横滨236-0004,日本。


大分子

通过以下方法查找类似蛋白质:(通过身份截止)|3D结构
实体ID:1
分子链条序列长度有机体细节图像
转录因子MafG104智人突变: 0 
基因名称:MAFG公司
UniProt&NIH共同基金数据资源
寻找蛋白质O15525号 (智人)
探索O15525号 
转到UniProtKB:O15525号
法老:O15525号
实体组 
序列簇30%身份50%身份70%身份90%身份95%身份100%身份
UniProt集团O15525号
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通过以下方法查找类似蛋白质:(通过身份截止)|3D结构
实体ID:2
分子链条序列长度有机体细节图像
核因子类红细胞2相关因子2113智人突变: 0 
基因名称:NFE2L2型NRF2级
UniProt&NIH共同基金数据资源
寻找蛋白质问题16236 (智人)
探索问题16236 
转到UniProtKB:问题16236
法老:问题16236
实体组 
序列簇30%身份50%身份70%身份90%身份95%身份100%身份
UniProt集团问题16236
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通过序列| 3D结构查找类似核酸

实体ID:3
分子链条长度有机体图像
合成DNA16综合构造
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通过序列| 3D结构查找类似核酸

实体ID:4
分子链条长度有机体图像
合成DNA16综合构造
序列注释
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  • 参考序列
实验数据和验证

实验数据

  • 方法:X射线衍射
  • 分辨率:2.60 Å
  • R值自由:0.259 
  • R值工作:0.226美元
  • 观察到的R值:0.228 
  • 空间组:C 1 2 1
单位单元格以下为:
长度(Å)角度(˚)
a=245.171α = 90
b=54.686β = 99.18
c=85.952γ = 90
软件包:
软件名称目的
菲尼克斯精炼
HKL-2000数据缩减
HKL-2000数据缩放
中枢神经系统阶段划分

结构验证

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筹资组织位置授权编号
日本科学促进会(JSPS)日本--

修订历史记录(完整详细信息和数据文件)

  • 版本1.0:2022-11-09
    类型:首次发布
  • 版本1.1:2022-12-14
    更改:数据库引用
  • 版本1.2:2022-12-28
    更改:数据库引用
  • 版本1.3:2023-11-29
    更改:数据收集、细化描述