1T4A公司

枯草芽孢杆菌PurS C2晶型的结构


实验数据快照

  • 方法:X射线衍射
  • 分辨率:2.00 Å
  • R值自由:0.283 
  • R值工作:0.213 
  • 观察到的R值:0.213 

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文学类

枯草芽孢杆菌甲酰甘氨酸核糖核苷酸酰胺转移酶多蛋白复合物模型。

R.阿南德。霍斯金斯,A.A。E.M.贝内特。医学博士辛查克。J·斯塔布。Ealick,S.E.公司。

(2004)生物化学43: 10343-10352

  • 内政部:https://doi.org/10.1021/bi0491292
  • 相关结构的主要引文:
    1个4a,1TWJ公司

  • PubMed摘要:

    在嘌呤生物合成途径的第四步中,甲酰基甘氨酸核糖核苷酸酰胺转移酶(FGAR-AT)催化甲酰基甘氨酸核糖核苷酸(FGAR)、ATP和谷氨酰胺转化为甲酰基甘氨酸核糖核苷酸(FGAM)、ADP、P(i)和谷氨酸。PurL有两种形式:大PurL(lgPurL)是一种约1300个氨基酸的单链多域酶,而小PurL包含约800个氨基酸,但需要两个额外的基因产物PurS和PurQ才能发挥活性。smPurL含有ATP和FGAR结合位点,PurQ是一种谷氨酰胺酶,PurS的功能刚刚被了解。我们分别以2.5和2.0A的分辨率测定了两种不同晶体形式P2(1)和C2中枯草芽孢杆菌PurS的结构。PurS形成一个紧密的二聚体,中央六链β-片两侧有四个螺旋。在P2(1)和C2晶体形式中,PurS的四元结构为四聚体。PurS二聚体的凹面通过C末端区域相互作用,形成带有亲水核心的12个品牌的β-桶。我们将PurS的结构与鼠伤寒沙门氏菌lgPurL的结构结合起来,构建了PurS/smPurL/PurQ复合物的模型。咪唑甘油磷酸合成酶的HisH(谷氨酰胺酶)结构域被用作PurQ的附加模型。该模型显示了使用PurS二聚体的2PurS/smPurL/PurQ或使用PurS-四聚体的4PurS/2mPurL/2PurQ化学计量比。这两个模型都将关键的保守残基置于ATP/FGAR结合位点和结构ADP结合位点。同源模型与重组复合物的生化研究一致。


  • 组织附属关系

    美国纽约州伊萨卡市康奈尔大学化学与化学生物学系,邮编14853。


大分子
通过以下方法查找类似蛋白质:(通过身份截止)|3D结构
实体ID:1
分子链条序列长度有机体细节图像
PurS公司84枯草芽孢杆菌突变: 4 
基因名称:YEXA公司BSU06460型
UniProt公司
寻找蛋白质第12049页 (枯草芽孢杆菌(菌株168))
探索第12049页 
转到UniProtKB:第12049页
实体组 
序列簇30%身份50%身份70%身份90%身份95%身份100%身份
UniProt集团第12049页
序列注释
展开
  • 参考序列
小分子
改性残留物 1独特
身份证件链条类型公式二维示意图起源
MSE公司
MSE查询
A、 B类
L-肽连接C类5H(H)112遇见
实验数据和验证

实验数据

  • 方法:X射线衍射
  • 分辨率:2.00 Å
  • R值自由:0.283 
  • R值工作:0.213 
  • 观察到的R值:0.213 
  • 空间组:C 1 2 1
单位单元格:
长度(Ω)角度(˚)
a=89.128α = 90
b=42.206β = 118.22
c=47.033γ = 90
软件包:
软件名称目的
中枢神经系统精炼
DENZO公司数据缩减
CCP4型数据缩放
中枢神经系统阶段划分

结构验证

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  • 版本1.0:2004-09-14
    类型:首次发布
  • 版本1.1:2008-04-30
    更改:版本格式符合性
  • 版本1.2:2011-07-13
    更改:派生计算,版本格式符合性