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.2023年1月;131(1):17009.
doi:10.1289/EHP10477。 Epub 2023年1月31日。

BPDE、人类滋养层细胞的迁移和侵袭以及人类流产的发生:一部小说的作用lncRNA-HZ09

附属公司

BPDE、人类滋养层细胞的迁移和侵袭以及人类流产的发生:一部小说的作用lncRNA-HZ09

蒙远戴等。 环境卫生展望. 2023年1月.

摘要

背景:复发性流产影响1%至3%的妊娠。然而,在几乎50%的病例中,病因不明。越来越多的证据表明,苯并(a)芘[B(a)P]是多环芳烃(PAHs)的代表,与流产有关。然而,B(a)P/苯并(a)芘-7,8-二氢二醇-9,10-环氧化合物(BPDE)诱导的滋养层细胞功能障碍和流产的潜在机制仍不清楚。

目标:目的是发现一种新型lncRNA的作用,lnc-HZ09型在调节BPDE抑制滋养层细胞迁移和侵袭以及流产的发生方面。

方法:用0,0.25,0.5,1,1.5μM(M)带或不带相应的BPDElnc-HZ09型沉默或过度表达。利用这些细胞,我们评估了细胞迁移和侵袭、PLD1/RAC1/CDC42通路成员的mRNA和蛋白质水平、lnc-HZ09在PLD1转录和mRNA稳定性中的调节作用,以及lnc-HZ09转录和稳定性。人类绒毛组织采集自RM(n个=15)组及其匹配的健康对照组(HC,n个=15)组。我们评估了BPDE-DNA加合物、lnc-HZ09的水平,以及PLD1/RC1/CD42通路成员的mRNA和蛋白质表达,并将它们的相对表达水平进行了关联。我们进一步构建了0、0.05或0.2毫克/公斤B(a)P诱导小鼠流产模型(每个n个=6),其中测量了Pld1/Rc1/Cdc42通路成员的mRNA和蛋白质表达。

结果:我们发现了一本小说lnc-HZ09型lnc-HZ09型细胞迁移和侵袭较少。此外,复发性流产妇女绒毛组织中这种lncRNA的水平高于健康人。在过度表达的滋养层细胞中,SP1介导的PLD1 mRNA水平较低,HuR介导的PLD1 mRNA稳定性较低lnc-HZ09型然而,经MSX1处理的滋养层细胞的lnc-HZ09型和METTL3介导的m6A甲基化lnc-HZ09型导致更大lnc-HZ09型RNA稳定性。在BPDE处理的人类滋养层细胞和RM绒毛组织中,MSX1介导lnc-HZ09型转录和METTL3介导lnc-HZ09型稳定性都更高。在我们的小鼠流产模型中,B(a)P处理的小鼠Pld1/Rac1/Cdc42通路成员的mRNA和蛋白质水平较低。

讨论:这些结果表明,在人类滋养层细胞中,BPDE暴露上调lnc-HZ09型水平,抑制PLD1/RAC1/CDC42通路,抑制迁移和侵袭,为理解不明原因流产的原因和机制提供了新的见解。https://doi.org/10.1289/EHP10477。

PubMed免责声明

数字

图1A和1B是标题为Swan 71和H T R-8或SVneo的条形图,绘制核糖核酸相对表达,以单位增量绘制0至5,以2为增量绘制12至18,以单位递增绘制0至五,以2(y轴)为增量绘制12-15,穿过苯并(a)芘二醇环氧化物,微摩尔,增量为0.25,范围为0至0.5,Inc-HZ09分别为0.5至1.5,增量为0.5(x轴)。图1C是一组染色组织和条形图。染色问题描述了4′,6-二氨基-2-苯基吲哚,H Z 09,Merge和Zoom的荧光原位杂交分析。柱状图,绘制HZ 09相对表达,范围为0到60,增量为20(y轴),穿过细胞质和细胞核(x轴)。图1D是一组染色组织和一个名为Swan 71的条形图。染色组织显示载体和HZ 09(列)以及迁移和侵入(行)。矢量和HZ 09的柱状图,绘制单元格或视图,范围从0到250,以50(y轴)为增量,跨越迁移和入侵(x轴)。图1E和1G是一组染色组织和一个名为Swan 71和H T R-8或Vneo的条形图。染色组织显示阴性对照,si HZ 09和si2 HZ 09(列)以及迁移和侵袭(行)。针对阴性对照si-HZ 09和si2-HZ 09,在迁移和入侵(x轴)上以100(y轴)为增量从0到200的条形图,绘制单元格或视图。图1F是一组染色组织和一个名为THE-8或SVneo的条形图。染色组织显示载体和HZ 09(列)以及迁移和侵入(行)。矢量和HZ 09的柱状图,绘制单元格或视图,范围从0到100,以50(y轴)为增量,跨越迁移和入侵(x轴)。
图1。
新型lnc-HZ09的表达水平与lnc-HZ09过表达或敲除的人类滋养层细胞的迁移和侵袭。(A–B)RT-qPCR分析(每个n个=3)第页,共页lnc-HZ09型BPDE处理的Swan 71(A)或HTR-8/SVneo(B)细胞中的表达水平。(C) FISH分析(每个n个=3)的分布lnc-HZ09型(红色)在Swan 71细胞的细胞核和细胞质中(比例尺,50μ)以及lnc-HZ09型焦点。(D–G)对过度表达(D和F)或敲除(E和G)的Swan 71(D–E)或HTR-8/SVneo(F–G)细胞迁移和侵袭的Transwell分析lnc-HZ09型(比例尺,200μ). 每个视图的细胞数被量化。这些条形图的汇总数据显示在Excel表S1中。在RT-qPCR分析中,未经处理的细胞中的RNA水平设置为“1”。C–G显示了三个独立实验的代表性数据。(A–G)中的数据显示意思是±标准偏差三个独立实验的结果。双尾学生的t吨-测试(D,F);(A,B,E,G)的单因素方差分析*第页<0.05, **第页<0.01、和***第页<0.001注:方差分析,方差分析;BPDE,苯并(a)芘-7,8-二氢二醇-9,10-环氧;荧光原位杂交;HZ09,过度表达lnc-HZ09型; NC,siRNA阴性对照;ns,无显著性;RT-qPCR,定量逆转录聚合酶链反应;SD,标准偏差;si-HZ09,击倒lnc-HZ09型; 向量,pcDNA3.1的空向量。
图2A是名为苯并(a)芘二醇环氧处理与未处理的维恩图,显示了三个圆圈。顶部的圆圈标有250,左侧的圆圈标明1043,右侧的圆圈注明927。交叉区域标记为9。交叉区域代表胶原蛋白α-1(12)、2型碘甲状腺原氨酸脱碘酶、肌球蛋白重链10、磷脂酶D1、Pleckstrin和Sec7结构域包含3、蛋白酪氨酸磷酸酶非受体13型、单链D N A结合蛋白2和转化生长因子β-2。图2B是磷脂酶D1、Ras-related C3肉毒杆菌毒素底物1和细胞分裂控制蛋白42同源物的字符串分析。图2C是一组两个western blot,显示Vector(100)、HZ 09(31)、阴性对照(100),si1-HZ 09、si2-HZ 09,Swan 71为187,Vector为100,HZ 09为74,HT R-8或SVneo为100,si1-HZ 09(144)、si2-HZ 09(179),以及磷脂酶D1、β-微管蛋白、特异性蛋白1、,和小写的β-微管蛋白(行)。图2D是一个西方螺栓,显示Vector(100)、HZ 09(169)、Negative control(100。图2E、2F、2O、2P、2Q、2R是标题为Swan 71中的染色质免疫沉淀、H T R-8或SVneo中的染色素免疫沉淀、Swan 71的受体相互作用蛋白、Swan 71中的受体相互关系蛋白、H T R-8或SVneo中的受体相互作用蛋白、H T R-8或SVneo中受体相互作用蛋白质的条形图,绘制磷脂酶D1启动子相对折叠富集图,范围从0到6,增量为2;磷脂酶D1启动子相对折叠富集,范围从0到6,增量为2;核糖核酸相对表达,范围从0到6,增量为2;核糖核酸相对表达,单位增量范围为0~4;核糖核酸相对表达,范围从0到6,增量为2;和核糖核酸相对表达,在抗免疫球蛋白G和抗特异性蛋白1中以单位增量(y轴)从0到4不等;抗免疫球蛋白G和抗特异性蛋白1;抗免疫球蛋白G和抗人抗原R;抗免疫球蛋白G和抗人抗原R;抗免疫球蛋白G和抗人抗原R;HZ 09和磷脂酶D1的抗免疫球蛋白G和抗人类抗原R(x轴)。图2H、2I、2S、2T、2U、2V是标题为Swan 71染色质免疫沉淀、Swan 71染色体免疫沉淀、Swan 71受体相互作用蛋白、Swan 71中受体相互作用蛋白质、H T R-8或SVneo中受体相互反应蛋白和H T R-8或SVnoo中受体互作用蛋白的聚集条形图,绘制磷脂酶D1启动子相对折叠富集图,单位增量范围从0到4;磷脂酶D1启动子相对折叠富集,范围从0到8,增量为2;信使核糖核酸相对表达,范围从0到4,增量为2;信使核糖核酸相对表达,范围从0到4,增量为2;信使核糖核酸相对表达,单位增量范围为0至3;和信使核糖核酸的相对表达,范围从0到4,在抗免疫球蛋白G和抗特异性蛋白1之间以2(y轴)为增量;抗免疫球蛋白G和抗特异性蛋白1;抗免疫球蛋白G和抗人抗原R;抗免疫球蛋白G和抗人抗原R;抗免疫球蛋白G和抗人抗原R;载体和HZ 09的抗免疫球蛋白G和抗人类抗原R(x轴);阴性对照和si-HZ09;矢量和HZ 09;赫兹09;阴性对照和si1-HZ09;矢量和HZ 09;阴性对照和si1-HZ09。图2G是一个western blot,显示Vector(100)、HZ 09(34)、阴性对照(100),si1-HZ09(143)、si2-HZ09的(157)柱和特异性蛋白1和小写β-微管蛋白,分别位于swan 71和H T R-8或SVneo(行)下。图2J和2M分别有一组名为Swan 71的两线图,绘制了磷脂酶D1信使核糖核酸的剩余量,范围为0.0到1.0,增量为0.5,增量为0.0至1.0,时间(小时)为0.5(y轴),矢量、HZ 09、si1,2-HZ 09和阴性对照的单位增量(x轴)范围为1到5。图2K和2N分别有一组名为H T R-8或SVneo的两线图,绘制了磷脂酶D1信使核糖核酸的剩余量,范围为0.0至1.0,增量为0.5,增量为0.0到1.0,时间(小时)为0.5(y轴),向量HZ 09、si1,2-HZ 09的单位增量(x轴)范围为1至5,和阴性对照。图2L是一个western blot,显示载体(100)、人类抗原R(147)、阴性对照(100),si1-HZ 09(41)、si2-HX 09(56)柱和磷脂酶D1和小写β-微管蛋白,分别位于swan 71和H T R-8或SVneo(行)下。图2W是一个通过生物素标记的HZ 09或磷脂酶D1信使核糖核酸进行的western blot,名为下拉,在Swan 71和H T E-8或SVneo下显示输入、HZ 09义、HZ 09-反义、输入、磷脂酶D 1义和磷脂酶D1反义(柱)以及人类抗原R。图2X是一个通过生物素标记的磷脂酶D1信使核糖核酸进行的western blot,名为下拉,显示输入、载体(磷脂酶D_1义)、HZ 09(磷脂肪酶D1反义)、输入、阴性对照(磷脂素酶D1义)和si1-HZ 09,根据Swan 71和H T E-8或SVneo。图2Y是一个通过生物素标记的HZ 09进行的名为下拉的western blot,在Swan 71和H T E-8或SVneo下显示输入、载体(HZ 09义)、HZ 09(HZ 09-反义)、输入、阴性对照(HZ-09义)和si1-HZ 09,以及人类抗原R。
图2。
lnc-HZ09调节人滋养层细胞中PLD1/RAC1/CDC42通路成员的表达水平。(A) 经BPDE处理的与未经处理的Swan 71细胞的mRNA测序数据交叉点中显著下调的mRNA,lnc-HZ09型-过度表达与对照Swan 71细胞,RM与HC绒毛组织。(B) PLD1、RAC1和CDC42的字符串分析。(C) Swan 71或HTR-8/SVneo细胞中PLD1、RAC1和CDC42蛋白水平的代表性western blot分析lnc-HZ09型以GAPDH为内部标准。每个波段的相对强度被量化意思是±标准偏差图S3A显示了三个重复的。(D) 以GAPDH为内标,对SP1过度表达或敲除的Swan 71或HTR-8/SVneo细胞中SP1和PLD1蛋白水平进行代表性的western blot分析。每个波段的相对强度被量化意思是±标准偏差图S3G显示了三个重复的。(E–F)SP1 ChIP分析(每个n个=3)SP1在Swan 71(E)或HTR-8/SVneo(F)细胞中PLD1基因启动子区相对富集。(G) Swan 71或HTR-8/SVneo细胞中SP1蛋白水平的代表性蛋白质印迹分析lnc-HZ09型,使用β-微管蛋白作为内部标准。每个波段的相对强度被量化意思是±标准偏差图S3H显示了三个重复的。(H–I)SP1 ChIP分析(每个n个=3)SP1在Swan 71细胞中PLD1基因启动子区相对富集,过度表达(H)或敲除(I)lnc-HZ09型(J–K)PLD1的mRNA稳定性(每个n个=3)在Swan 71(J)或HTR-8/SVneo(K)细胞中过度表达或敲除lnc-HZ09型(L)HuR过度表达或敲低的Swan 71或HTR-8/SVneo细胞中PLD1蛋白水平的代表性western blot分析β-微管蛋白作为内部标准。每个波段的相对强度被量化意思是±标准偏差图S5E显示了三个重复的。(M–N)PLD1的mRNA稳定性(每个n个=3)HuR过度表达或敲低的Swan 71(M)或HTR-8/SVneo(N)细胞。(O–R)RIP分析(每个n个=3)的相对水平lnc-HZ09型在Swan 71(O和P)或HTR-8/SVneo(Q和R)细胞中被HuR蛋白下调的(O和Q)或PLD1 mRNA(P和R)。(S–V)RIP分析(每个n个=3)在过度表达(S和U)或敲低(T和V)的Swan 71(S和T)或HTR-8/SVneo(U和V)细胞中,HuR蛋白降低PLD1 mRNA的相对水平lnc-HZ09型(W)生物素标记的HuR的代表性western blot分析lnc-HZ09型或下拉分析中Swan 71或HTR-8/SVneo细胞中的PLD1 mRNA。(十) 生物素标记的PLD1 mRNA在Swan 71或HTR-8/SVneo细胞中过度表达或敲除的HuR的代表性western blot分析lnc-HZ09型在下拉分析中。(Y) 生物素标记的HuR的代表性western blot分析lnc-HZ09型在下拉分析中PLD1过度表达或敲低的Swan 71或HTR-8/SVneo细胞中。这些条形图和图表的汇总数据显示在Excel表S1中。在所有mRNA稳定性分析中,NC或载体组的表达水平设置为“1”;在所有ChIP和RIP分析中,IgG降低的DNA或RNA水平分别设置为“1”;并且在所有的蛋白质印迹分析中,NC或Vector组的条带强度被设置为“100”。C、 D、G、L、W–Y显示了三个独立实验的代表性数据。(E–F、H–K、M–V)中的数据显示意思是±标准偏差三个独立实验的结果。双尾学生的t吨-测试(E–F、H–I、O–V)*第页<0.05, **第页<0.01注:BPDE,苯并(a)芘-7,8-二氢二醇-9,10-环氧;ChIP,染色质免疫沉淀;甘油醛-3-磷酸脱氢酶;HC,健康对照;HuR,HuR过度表达;HZ09,过度表达lnc-HZ09型; NC,siRNA阴性对照;ns,无显著性;PLD1,磷脂酶D水解物1;RIP、RNA免疫沉淀;RM,反复流产;SD,标准偏差;si-HuR,击倒HuR;si-SP1,击倒SP1;SP1,SP1过度表达;向量,pcDNA3.1的空向量;si-HZ09,击倒lnc-HZ09。
图2A是名为苯并(a)芘二醇环氧处理与未处理的维恩图,显示了三个圆圈。顶部的圆圈标有250,左侧的圆圈标明1043,右侧的圆圈注明927。交叉区域标记为9。交叉区域代表胶原蛋白α-1(12)、2型碘甲状腺原氨酸脱碘酶、肌球蛋白重链10、磷脂酶D1、Pleckstrin和Sec7结构域包含3、蛋白酪氨酸磷酸酶非受体13型、单链D N A结合蛋白2和转化生长因子β-2。图2B是磷脂酶D1、Ras-related C3肉毒杆菌毒素底物1和细胞分裂控制蛋白42同源物的字符串分析。图2C是一组两个western blot,显示Vector(100)、HZ 09(31)、阴性对照(100),si1-HZ 09、si2-HZ 09,Swan 71为187,Vector为100,HZ 09为74,HT R-8或SVneo为100,si1-HZ 09(144)、si2-HZ 09(179),以及磷脂酶D1、β-微管蛋白、特异性蛋白1、,和小写的β-微管蛋白(行)。图2D是一个西方螺栓,显示Vector(100)、HZ 09(169)、Negative control(100。图2E、2F、2O、2P、2Q、2R是标题为Swan 71中的染色质免疫沉淀、H T R-8或SVneo中的染色素免疫沉淀、Swan 71的受体相互作用蛋白、Swan 71中的受体相互关系蛋白、H T R-8或SVneo中的受体相互作用蛋白、H T R-8或SVneo中受体相互作用蛋白质的条形图,绘制磷脂酶D1启动子相对折叠富集图,范围从0到6,增量为2;磷脂酶D1启动子相对折叠富集,范围从0到6,增量为2;核糖核酸相对表达,范围从0到6,增量为2;核糖核酸相对表达,单位增量范围为0~4;核糖核酸相对表达,范围从0到6,增量为2;和核糖核酸相对表达,在抗免疫球蛋白G和抗特异性蛋白1中以单位增量(y轴)从0到4不等;抗免疫球蛋白G和抗特异性蛋白1;抗免疫球蛋白G和抗人抗原R;抗免疫球蛋白G和抗人抗原R;抗免疫球蛋白G和抗人抗原R;HZ 09和磷脂酶D1的抗免疫球蛋白G和抗人类抗原R(x轴)。图2H、2I、2S、2T、2U、2V是标题为Swan 71染色质免疫沉淀、Swan 71染色体免疫沉淀、Swan 71受体相互作用蛋白、Swan 71中受体相互作用蛋白质、H T R-8或SVneo中受体相互反应蛋白和H T R-8或SVnoo中受体互作用蛋白的聚集条形图,绘制磷脂酶D1启动子相对折叠富集图,单位增量范围从0到4;磷脂酶D1启动子相对折叠富集,范围从0到8,增量为2;信使核糖核酸相对表达,范围从0到4,增量为2;信使核糖核酸相对表达,范围从0到4,增量为2;信使核糖核酸相对表达,单位增量范围为0至3;和信使核糖核酸的相对表达,范围从0到4,在抗免疫球蛋白G和抗特异性蛋白1之间以2(y轴)为增量;抗免疫球蛋白G和抗特异性蛋白1;抗免疫球蛋白G和抗人抗原R;抗免疫球蛋白G和抗人抗原R;抗免疫球蛋白G和抗人抗原R;载体和HZ 09的抗免疫球蛋白G和抗人类抗原R(x轴);阴性对照和si-HZ09;矢量和HZ 09;赫兹09;阴性对照和si1-HZ09;矢量和HZ 09;阴性对照和si1-HZ09。图2G是一个western blot,显示Vector(100)、HZ 09(34)、阴性对照(100),si1-HZ09(143)、si2-HZ09的(157)柱和特异性蛋白1和小写β-微管蛋白,分别位于swan 71和H T R-8或SVneo(行)下。图2J和2M分别有一组名为Swan 71的两线图,绘制了磷脂酶D1信使核糖核酸的剩余量,范围为0.0到1.0,增量为0.5,增量为0.0至1.0,时间(小时)为0.5(y轴),矢量、HZ 09、si1,2-HZ 09和阴性对照的单位增量(x轴)范围为1到5。图2K和2N分别有一组名为H T R-8或SVneo的两线图,绘制了磷脂酶D1信使核糖核酸的剩余量,范围为0.0至1.0,增量为0.5,增量为0.0到1.0,时间(小时)为0.5(y轴),向量HZ 09、si1,2-HZ 09的单位增量(x轴)范围为1至5,和阴性对照。图2L是一个western blot,显示载体(100)、人类抗原R(147)、阴性对照(100),si1-HZ 09(41)、si2-HX 09(56)柱和磷脂酶D1和小写β-微管蛋白,分别位于swan 71和H T R-8或SVneo(行)下。图2W是一个通过生物素标记的HZ 09或磷脂酶D1信使核糖核酸进行的western blot,名为下拉,在Swan 71和H T E-8或SVneo下显示输入、HZ 09义、HZ 09-反义、输入、磷脂酶D 1义和磷脂酶D1反义(柱)以及人类抗原R。图2X是一个通过生物素标记的磷脂酶D1信使核糖核酸进行的western blot,名为下拉,显示输入、载体(磷脂酶D_1义)、HZ 09(磷脂肪酶D1反义)、输入、阴性对照(磷脂素酶D1义)和si1-HZ 09,根据Swan 71和H T E-8或SVneo。图2Y是一个通过生物素标记的HZ 09进行的名为下拉的western blot,在Swan 71和H T E-8或SVneo下显示输入、载体(HZ 09义)、HZ 09(HZ 09-反义)、输入、阴性对照(HZ-09义)和si1-HZ 09,以及人类抗原R。
图2。
lnc-HZ09调节人滋养层细胞中PLD1/RAC1/CDC42通路成员的表达水平。(A) 经BPDE处理的与未经处理的Swan 71细胞的mRNA测序数据交叉点中显著下调的mRNA,lnc-HZ09型-过度表达与对照Swan 71细胞,RM与HC绒毛组织。(B) PLD1、RAC1和CDC42的字符串分析。(C) Swan 71或HTR-8/SVneo细胞中PLD1、RAC1和CDC42蛋白水平的代表性western blot分析lnc-HZ09型以GAPDH为内部标准。每个波段的相对强度被量化意思是±标准偏差图S3A显示了三个重复的。(D) 以GAPDH为内标,对SP1过度表达或敲除的Swan 71或HTR-8/SVneo细胞中SP1和PLD1蛋白水平进行代表性的western blot分析。每个波段的相对强度被量化意思是±标准偏差图S3G显示了三个重复的。(E–F)SP1 ChIP分析(每个n个=3)SP1在Swan 71(E)或HTR-8/SVneo(F)细胞中PLD1基因启动子区相对富集。(G) Swan 71或HTR-8/SVneo细胞中SP1蛋白水平的代表性蛋白质印迹分析lnc-HZ09型,使用β-微管蛋白作为内部标准。每个波段的相对强度被量化意思是±标准偏差图S3H显示了三个重复的。(H–I)SP1 ChIP分析(每个n个=3)SP1在Swan 71细胞中PLD1基因启动子区相对富集,过度表达(H)或敲除(I)lnc-HZ09型(J–K)PLD1的mRNA稳定性(每个n个=3)在Swan 71(J)或HTR-8/SVneo(K)细胞中过度表达或敲除lnc-HZ09型(L)HuR过度表达或敲低的Swan 71或HTR-8/SVneo细胞中PLD1蛋白水平的代表性western blot分析β-微管蛋白作为内部标准。每个波段的相对强度被量化意思是±标准偏差图S5E显示了三个重复的。(M–N)PLD1的mRNA稳定性(每个n个=3)HuR过度表达或敲低的Swan 71(M)或HTR-8/SVneo(N)细胞。(O–R)RIP分析(每个n个=3)的相对水平lnc-HZ09型在Swan 71(O和P)或HTR-8/SVneo(Q和R)细胞中被HuR蛋白下调的(O和Q)或PLD1 mRNA(P和R)。(S–V)RIP分析(每个n个=3)在过度表达(S和U)或敲低(T和V)的Swan 71(S和T)或HTR-8/SVneo(U和V)细胞中,HuR蛋白降低PLD1 mRNA的相对水平lnc-HZ09型(W)生物素标记的HuR的代表性western blot分析lnc-HZ09型或下拉分析中Swan 71或HTR-8/SVneo细胞中的PLD1 mRNA。(十) 生物素标记的PLD1 mRNA在Swan 71或HTR-8/SVneo细胞中过度表达或敲除的HuR的代表性western blot分析lnc-HZ09型在下拉分析中。(Y) 生物素标记的HuR的代表性western blot分析lnc-HZ09型在下拉分析中PLD1过度表达或敲低的Swan 71或HTR-8/SVneo细胞中。这些条形图和图表的汇总数据显示在Excel表S1中。在所有mRNA稳定性分析中,NC或载体组的表达水平设置为“1”;在所有ChIP和RIP分析中,IgG降低的DNA或RNA水平分别设置为“1”;并且在所有的蛋白质印迹分析中,NC或Vector组的条带强度被设置为“100”。C、 D、G、L、W–Y显示了三个独立实验的代表性数据。(E–F、H–K、M–V)中的数据显示意思是±标准偏差三个独立实验的结果。双尾学生的t吨-测试(E–F、H–I、O–V)*第页<0.05, **第页<0.01注:BPDE,苯并(a)芘-7,8-二氢二醇-9,10-环氧;ChIP,染色质免疫沉淀;甘油醛-3-磷酸脱氢酶;HC,健康对照;HuR,HuR过度表达;HZ09,过度表达lnc-HZ09型; NC,siRNA阴性对照;ns,无显著性;PLD1,磷脂酶D水解物1;RIP、RNA免疫沉淀;RM,反复流产;SD,标准偏差;si-HuR,击倒HuR;si-SP1,击倒SP1;SP1,SP1过度表达;向量,pcDNA3.1的空向量;si-HZ09,击倒lnc-HZ09。
图3A、3B、3I、3J是标题为Swan 7、H T R-8或SVneo、Swan 71和H T R-8or SVneo的条形图,绘制了核糖核酸相对表达的范围,从0.0到2.0,增量为0.5,0.0到2.00.5,增量为0.0到1.0,增量为0.575到85,增量为5;0.0至1.0,在载体、同源框蛋白M S X-1、阴性对照、si1-同源框蛋白MSX-1和si2-同源框蛋白MS X-1上以0.5和75至90为增量,以5(y轴)为增量;载体、同源盒蛋白M S X-1、阴性对照、si1-同源盒蛋白MSX-1和si2-同源盒蛋白MS X-1;载体,m(6)A甲基转移酶,阴性对照,si1-m(6;Inc-HZ 09的载体、m(6)A甲基转移酶、阴性对照、si1-m(6。图3C和3D是条形图,标题为Swan 71中的染色质免疫沉淀,H T R-8或SVneo中的染色素免疫沉淀,分别绘制了Inc-HZ 09启动子相对折叠富集,范围从0到4,单位增量(y轴)穿过抗免疫球蛋白G和抗同源框蛋白M S X-1(X轴)。图3E和3F是条形图,标题为Swan 71中甲基化RNA免疫沉淀测序和H T R-8或SVneo中甲基化RNA-免疫沉淀测速,绘制了N6-甲基腺苷相对折叠富集,范围从0到6,在Inc-X非活性特异性转录物和Inc-HZ 09(X轴)中以2(y轴)为增量分别用于抗免疫球蛋白G和抗N 6-甲基腺苷。图3G和3H分别是一组两个聚类条形图,标题分别为Swan 71中的甲基化RNA免疫沉淀测序和H T R-8或SVneo中的甲基化RNA免疫沉淀序列,绘制了Inc-HZ 09 m(6)a甲基转移酶相对折叠富集,范围从0到10,增量为5(y轴)载体的抗免疫球蛋白G和抗N-6-甲基腺苷(x轴),m(6)A甲基转移酶,si1-m(6。图3K和3L是标题为Swan 71中甲基化RNA免疫沉淀测序和H T R-8或SVneo中甲基化RNA免疫沉淀测速的聚类图,绘制了Inc-HZ 09 m(6)甲基转移酶相对富集倍数,范围从0到6,增量为2(y轴)抗免疫球蛋白G和抗N-6-甲基腺苷(x轴)分别用于二甲基亚砜和二丙酮醇。图3M和3N是二甲基亚砜、二丙酮醇、载体、甲基化RNA免疫沉淀测序的条形图、Inc-HZ 09核糖核酸相对折叠富集度,范围从0.0到1.0,增量为0.5,单位增量为0到3(y轴),跨越天鹅71和H T R-8或SVneo x轴),和甲基化RNA免疫沉淀测序加二丙酮醇。图3O是一组名为Swan 71的双线图,绘制了Inc-HZ 09核糖核酸剩余量,范围从0.0到1.0,增量为0.5(y轴),跨时间(小时),范围从0到5,增量为单位(x轴),用于甲基化RNA免疫沉淀测序,甲基化RNA免疫沉淀测序加双丙酮醇,载体和载体加二甲基亚砜。图3P是一组两个名为Swan 71的西方印迹。在左侧,western blot显示100、36、183和117(列)和磷脂酶D1、3-磷酸甘油醛脱氢酶、载体、甲基化RNA免疫沉淀测序、二甲基亚砜和二丙酮醇(行)。在右侧,western blot显示阴性对照(100)和硅甲基化RNA免疫沉淀测序(239)(列)以及磷脂酶D1和3-磷酸甘油醛脱氢酶(行)。
图3。
人类滋养层细胞中lnc-HZ09的表达水平受MSX1和m6A RNA甲基化的调节。(A–B)RT-qPCR分析(每个n个=3)的级别lnc-HZ09型在过度表达或敲除MSX1的Swan 71(A)或HTR-8/SVneo(B)细胞中。(C–D)MSX1 ChIP分析(每个n个=3)MSX1在lnc-HZ09型在Swan 71(C)或HTR-8/SVneo(D)细胞中。(E–F)MeRIP分析(每个n个=3)lnc-XIST或lnc-HZ09型在Swan 71(E)或HTR-8/SVneo(F)细胞中。(G–H)MeRIP分析(每个n个=3)m6A RNA甲基化水平lnc-HZ09型METTL3过度表达或敲除的Swan 71(G)或HTR-8/SVneo(H)细胞中。(I–J)RT-qPCR分析(每个n个=3)的级别lnc-HZ09型METTL3过度表达或敲低的Swan 71(I)或HTR-8/SVneo(J)细胞。(K–L)MeRIP分析(每个n个=3)m6A RNA甲基化水平lnc-HZ09型DAA处理的Swan 71(K)或HTR-8/SVneo(L)细胞。(M) RT-qPCR分析(每个n个=3)的级别lnc-HZ09型用DAA处理Swan 71或HTR-8/SVneo细胞。(N) RT-qPCR分析(每个n个=3)的级别lnc-HZ09型在Swan 71或HTR-8/SVneo细胞中,METTL3过表达或METTL3+DAA处理过表达。(O) RNA稳定性(每个n个=3)第页,共页lnc-HZ09型在Swan 71细胞中,METTL3过度表达或被击倒,或METTL3+DAA治疗过度表达。(P) METTL3过表达或敲除,或METTL3+DAA处理的Swan 71细胞中PLD1蛋白水平的代表性western blot分析,以GAPDH为内部标准。每个波段的相对强度被量化意思是±标准偏差图S7F显示了三个重复的。这些条形图和图表的汇总数据显示在Excel表S1中。在所有RT-qPCR和mRNA稳定性检测中,NC或载体组的表达水平均设为“1”;在所有ChIP和MeRIP分析中,IgG降低的DNA或RNA水平设置为“1”;在所有western blot分析中,NC或Vector组的条带强度设置为“100”。(P) 显示了三个独立实验的代表性数据。(A–O)中的数据显示意思是±标准偏差三个独立实验的结果。双尾学生的t吨-测试(A–M);(A,B,I,J,N)的单因素方差分析*第页<0.05, **第页<0.01、和***第页<0.001注:方差分析,方差分析;ChIP,染色质免疫沉淀;DAA,3-去氮腺苷;甘油醛-3-磷酸脱氢酶;IgG、免疫球蛋白G;甲基化RNA免疫沉淀;METTL3,METTL3的过度表达;MSX1,MSX1的过度表达;NC,siRNA阴性对照;ns,无显著性;PLD1,磷脂酶D水解物1;RT-qPCR,定量逆转录聚合酶链反应;SD,标准偏差;si-METTL3,击倒METTL3;si-MSX1,击倒MSX1;向量,pcDNA3.1的空向量。
图3A、3B、3I、3J是标题为Swan 7、H T R-8或SVneo、Swan 71和H T R-8or SVneo的条形图,绘制了核糖核酸相对表达的范围,从0.0到2.0,增量为0.5,0.0到2.00.5,增量为0.0到1.0,增量为0.575到85,增量为5;0.0至1.0,在载体、同源框蛋白M S X-1、阴性对照、si1-同源框蛋白MSX-1和si2-同源框蛋白MS X-1上以0.5和75至90为增量,以5(y轴)为增量;载体、同源盒蛋白M S X-1、阴性对照、si1-同源盒蛋白MSX-1和si2-同源盒蛋白MS X-1;载体,m(6)A甲基转移酶,阴性对照,si1-m(6;Inc-HZ 09的载体、m(6)A甲基转移酶、阴性对照、si1-m(6。图3C和3D是条形图,标题为Swan 71中的染色质免疫沉淀,H T R-8或SVneo中的染色素免疫沉淀,分别绘制了Inc-HZ 09启动子相对折叠富集,范围从0到4,单位增量(y轴)穿过抗免疫球蛋白G和抗同源框蛋白M S X-1(X轴)。图3E和3F是条形图,标题为Swan 71中甲基化RNA免疫沉淀测序和H T R-8或SVneo中甲基化RNA-免疫沉淀测速,绘制了N6-甲基腺苷相对折叠富集,范围从0到6,在Inc-X非活性特异性转录物和Inc-HZ 09(X轴)中以2(y轴)为增量分别用于抗免疫球蛋白G和抗N 6-甲基腺苷。图3G和3H分别是一组两个聚类条形图,标题分别为Swan 71中的甲基化RNA免疫沉淀测序和H T R-8或SVneo中的甲基化RNA免疫沉淀序列,绘制了Inc-HZ 09 m(6)a甲基转移酶相对折叠富集,范围从0到10,增量为5(y轴)载体的抗免疫球蛋白G和抗N-6-甲基腺苷(x轴),m(6)A甲基转移酶,si1-m(6。图3K和3L是标题为Swan 71中甲基化RNA免疫沉淀测序和H T R-8或SVneo中甲基化RNA免疫沉淀测速的聚类图,绘制了Inc-HZ 09 m(6)甲基转移酶相对富集倍数,范围从0到6,增量为2(y轴)抗免疫球蛋白G和抗N-6-甲基腺苷(x轴)分别用于二甲基亚砜和二丙酮醇。图3M和3N是二甲基亚砜、二丙酮醇、载体、甲基化RNA免疫沉淀测序的条形图、Inc-HZ 09核糖核酸相对折叠富集度,范围从0.0到1.0,增量为0.5,单位增量为0到3(y轴),跨越天鹅71和H T R-8或SVneo x轴),和甲基化RNA免疫沉淀测序加二丙酮醇。图3O是一组名为Swan 71的双线图,绘制了Inc-HZ 09核糖核酸剩余量,范围从0.0到1.0,增量为0.5(y轴),跨时间(小时),范围从0到5,增量为单位(x轴),用于甲基化RNA免疫沉淀测序,甲基化RNA免疫沉淀测序加双丙酮醇,载体和载体加二甲基亚砜。图3P是一组两个名为Swan 71的西方印迹。在左侧,western blot显示100、36、183和117(列)和磷脂酶D1、3-磷酸甘油醛脱氢酶、载体、甲基化RNA免疫沉淀测序、二甲基亚砜和二丙酮醇(行)。在右侧,western blot显示阴性对照(100)和硅甲基化RNA免疫沉淀测序(239)(列)以及磷脂酶D1和3-磷酸甘油醛脱氢酶(行)。
图3。
人类滋养层细胞中lnc-HZ09的表达水平受MSX1和m6A RNA甲基化的调节。(A–B)RT-qPCR分析(每个n个=3)的级别lnc-HZ09型在过度表达或敲除MSX1的Swan 71(A)或HTR-8/SVneo(B)细胞中。(C–D)MSX1 ChIP分析(每个n个=3)MSX1在lnc-HZ09型在Swan 71(C)或HTR-8/SVneo(D)细胞中。(E–F)MeRIP分析(每个n个=3)lnc-XIST或lnc-HZ09型在Swan 71(E)或HTR-8/SVneo(F)细胞中。(G–H)MeRIP分析(每个n个=3)m6A RNA甲基化水平lnc-HZ09型METTL3过度表达或敲除的Swan 71(G)或HTR-8/SVneo(H)细胞中。(I–J)RT-qPCR分析(每个n个=3)的级别lnc-HZ09型METTL3过度表达或敲低的Swan 71(I)或HTR-8/SVneo(J)细胞。(K–L)MeRIP分析(每个n个=3)m6A RNA甲基化水平lnc-HZ09型DAA处理的Swan 71(K)或HTR-8/SVneo(L)细胞。(M) RT-qPCR分析(每个n个=3)的级别lnc-HZ09型用DAA处理Swan 71或HTR-8/SVneo细胞。(N) RT-qPCR分析(每个n个=3)的级别lnc-HZ09型在Swan 71或HTR-8/SVneo细胞中,METTL3过表达或METTL3+DAA处理过表达。(O) RNA稳定性(每个n个=3)第页,共页lnc-HZ09型在Swan 71细胞中,METTL3过度表达或被击倒,或METTL3+DAA治疗过度表达。(P) METTL3过表达或敲除,或METTL3+DAA处理的Swan 71细胞中PLD1蛋白水平的代表性western blot分析,以GAPDH为内部标准。每个波段的相对强度被量化意思是±标准偏差图S7F显示了三个重复的。这些条形图和图表的汇总数据显示在Excel表S1中。在所有RT-qPCR和mRNA稳定性检测中,NC或载体组的表达水平均设为“1”;在所有ChIP和MeRIP分析中,IgG降低的DNA或RNA水平设置为“1”;在所有western blot分析中,NC或Vector组的条带强度设置为“100”。(P) 显示了三个独立实验的代表性数据。(A–O)中的数据显示意思是±标准偏差三个独立实验的结果。双尾学生的t吨-测试(A–M);(A,B,I,J,N)的单因素方差分析*第页<0.05, **第页<0.01、和***第页<0.001注:方差分析,方差分析;ChIP,染色质免疫沉淀;DAA,3-去氮腺苷;甘油醛-3-磷酸脱氢酶;IgG、免疫球蛋白G;甲基化RNA免疫沉淀;METTL3,METTL3的过度表达;MSX1,MSX1的过度表达;NC,siRNA阴性对照;ns,无显著性;PLD1,磷脂酶D水解物1;RT-qPCR,定量逆转录聚合酶链反应;SD,标准偏差;si-METTL3,击倒METTL3;si-MSX1,击倒MSX1;向量,pcDNA3.1的空向量。
图4A是一组两个western blot,分别在Swan 71下显示100、85、73、1和17,在H T R-8或SVneo(列)下显示100,80,61,22和11,在磷脂酶D1,Ras-related C3肉毒杆菌毒素底物1,细胞分裂控制蛋白42同源物,3-磷酸甘油醛脱氢酶(行)下显示。苯并(a)芘二醇环氧化合物的摩尔范围为0至1.5,增量为0.5。图4B是名为苯并(a)芘二醇环氧处理的Swan 71的染色组织,显示了载体和HZ 09(列)以及迁移和入侵(行)。图4C是名为苯并(a)芘二醇环氧处理的Swan 71的染色组织,显示阴性对照、si1-HZ 09和si2-HZ 09(列)以及迁移和侵袭(行)。图4D是名为苯并(a)芘二醇环氧处理的H T R-8或SVneo的染色组织,显示载体和HZ 09(柱)以及迁移和侵入(行)。图4E是名为苯并(a)芘二醇环氧处理的H T R-8或SVneo的染色组织,显示阴性对照、si1-HZ 09和si2-HZ 09(列)以及迁移和侵袭(行)。图4F是一组名为苯并(a)芘二醇环氧处理的两个western blot,显示载体(100)、HZ 09(72)、阴性对照(100),si1-HZ 09[187]、si2-HZ 09[219]和载体(100,Ras相关C3肉毒杆菌毒素底物1、细胞分裂控制蛋白42同源物和3-磷酸甘油醛脱氢酶(行)。图4G是一个western blot,显示100、93、86、28和15(列)以及特异性蛋白1和3-磷酸甘油醛脱氢酶,分别位于Swan 71和H T R-8或SVneo(行)下。苯并(a)芘二醇环氧化合物的摩尔范围为0至1.5,增量为0.5。图4H、4I、4J、4K、4Q、4R、4T、4V是簇状条形图,Swan 71中的染色质免疫沉淀,H T R-8或SVneo中的染色素免疫沉淀,苯并(a)芘二醇环氧化物处理的Swan 71的染色质免疫沉淀,苯并芘二醇环氧化物处理的H T R-8或SVnee中的染色蛋白免疫沉淀,苯并(a)芘二醇环氧处理的Swan 71中的受体相互作用蛋白,苯并(b)芘二元醇环氧处理的H T R-8或SVneo中的受体交互作用蛋白,Swan 71的染色质免疫沉淀,Swan 71中的甲基化RNA免疫沉淀测序,绘制磷脂酶D1启动子相对折叠富集图,磷脂酶D1启动子相对折叠富集,单位增量从0到4,磷脂酶D2启动子的相对折叠富集,信使核糖核酸相对表达,以2为增量从0到4不等,信使核糖核酸相对表达量,以2的增量从0至4不等,lnc-HZ09启动子相对折叠富集,以2递增从0到8不等,以及lnc-HZ09信使核素核酸相对折叠富集,范围从0到10,在抗免疫球蛋白G和抗特异性蛋白1、抗免疫球素G和抗特异性蛋白1、抗免疫球蛋白G和抗特异性蛋白1,抗免疫球蛋白质G和抗特殊性蛋白1以及抗免疫球蛋白酶G和抗人类抗原R之间以5(y轴)为增量,分别针对二甲基亚砜、苯并(a)芘二醇环氧化物、载体和HZ 09的抗免疫球蛋白G和抗人类抗原R、抗免疫球素G和抗同源框蛋白MSX-1以及抗免疫球蛋白质G和抗N6-甲基腺苷(x轴)。图4L、4M、4O分别是一组名为苯并(a)芘二醇环氧化处理的天鹅71、苯并(b)芘二元醇环氧化处理H T R-8或SVneo和苯并(c)芘二元醇环氧化膜处理天鹅71的两条线图,绘制了磷脂酶D1信使核糖核酸剩余量,范围从0.0到1.0,时间(小时)增量为0.5(y轴),Vector、HZ 09、Si1,2 HZ 09,阴性对照和人类抗原R的单位增量(x轴)范围分别为0至5。图4N是一个名为苯并(a)芘二醇环氧化物处理的西方印迹,显示载体(100)、HZ 09(134)、阴性对照(100),si1-HZ 09、si2-HZ 09和磷脂酶D1以及小写的β-微管蛋白,分别位于Swan 71和H T R-8或SVneo下(行)。图4P是一个蛋白质印迹,显示100、92、83、45和23(列)以及人类抗原R和3-磷酸甘油醛脱氢酶,分别位于Swan 71和H T R-8或SVneo(行)下。苯并(a)芘二醇环氧化合物的摩尔范围为0至1.5,增量为0.5。图4S是一个western blot,显示100、156、198、216和374(列)以及Homeobox蛋白MSX-1和甘油醛3-磷酸脱氢酶,分别位于Swan 71和H T R-8或SVneo(行)下。苯并(a)芘二醇环氧化合物的摩尔范围为0至1.5,增量为0.5。图4U是一个western blot,显示100、113、187、173和219(柱)和m(6)a甲基转移酶和3-磷酸甘油醛脱氢酶,分别位于Swan 71和H T R-8或SVneo(行)下。苯并(a)芘二醇环氧化合物的摩尔范围为0至1.5,增量为0.5。图4W和4X是标题为Swan 71、Lnc-HZ09信使核糖核酸剩余量的折线图,增量为0.5,范围从0.0到1.0;磷脂酶D1信使核酸剩余量,在时间(小时)内增量为0.5(y轴),范围从0.05到1.0,单位增量为0到5(x轴)。
图4。
lnc-HZ09调控BPDE暴露的人类滋养层细胞中的PLD1/RAC1/CDC42通路。(A) 以GAPDH为内标,对BPDE处理的Swan 71或HTR-8/SVneo细胞中PLD1、RAC1和CDC42的蛋白质水平进行代表性蛋白质印迹分析。每个波段的相对强度被量化意思是±标准偏差图S8A,B(B–E)中显示了三个重复的样本0.5μM(M)BPDE诱导的Swan 71(B和C)或HTR-8/SVneo(D和E)细胞过度表达或敲除lnc-HZ09型(比例尺,200μ). (F) SP1、PLD1、RAC1和CDC42蛋白水平的代表性western blot分析0.5μM(M)BPDE诱导的Swan 71或HTR-8/SVneo细胞过度表达或敲除lnc-HZ09型以GAPDH为内部标准。每个波段的相对强度被量化意思是±标准偏差图S8G–J显示了三个重复中的一个。(G) 以GAPDH为内标物,对BPDE处理的Swan 71或HTR-8/SVneo细胞中SP1蛋白水平进行代表性western blot分析。每个波段的相对强度被量化意思是±标准偏差图S8O显示了三个重复的。(H–I)SP1 ChIP分析(每个n个=3)未经处理或0.5μM(M)BPDE处理的Swan 71(H)或HTR-8/SVneo(I)细胞。(J–K)SP1 ChIP分析(每个n个=3)SP1在PLD1基因启动子区的相对富集0.5μM(M)BPDE诱导的Swan 71(J)或HTR-8/SVneo(K)细胞过度表达lnc-HZ09型(L–M)PLD1的mRNA稳定性(每个n个=3)英寸0.5μM(M)BPDE诱导的Swan 71(L)或HTR-8/SVneo(M)细胞过度表达或敲除lnc-HZ09型(N)PLD1蛋白水平的代表性western blot分析0.5μM(M)BPDE诱导Swan 71或HTR-8/SVneo细胞过度表达或击倒HuRβ-微管蛋白作为内部标准。每个波段的相对强度被量化意思是±标准偏差图S9C显示了三个重复的。(O) PLD1的mRNA稳定性(每个n个=3)英寸0.5μM(M)BPDE诱导Swan 71细胞过度表达或抑制HuR。(P) HuR蛋白水平的代表性western blot分析01.5μM(M)BPDE处理的Swan 71或HTR-8/SVneo细胞,带有β-微管蛋白作为内部标准。每个波段的相对强度被量化意思是±标准偏差图S9H显示了三个重复的。(Q–R)RIP分析(每个n个=3)被HuR蛋白下调的PLD1 mRNA相对水平0.5μM(M)BPDE诱导的Swan 71(Q)或HTR-8/SVneo(R)细胞过度表达lnc-HZ09型(S)MSX1蛋白水平的代表性western blot分析01.5μM(M)BPDE处理的Swan 71或HTR-8/SVneo细胞,以GAPDH作为内部标准。每个波段的相对强度被量化意思是±标准偏差图S9L显示了三个重复的。(T) MSX1 ChIP分析(每个n个=3)MSX1在lnc-HZ09型未经处理或0.5μM(M)BPDE处理的Swan 71细胞。(U) 以GAPDH为内标物,对BPDE处理的Swan 71或HTR-8/SVneo细胞中METTL3蛋白水平进行代表性western blot分析。每个波段的相对强度被量化意思是±标准偏差图S9O显示了三个重复的。(五) MeRIP分析(每个n个=3)m6A RNA甲基化的相对水平lnc-HZ09型未经处理或0.5μM(M)BPDE处理的Swan 71细胞。(W) RNA的稳定性lnc-HZ09型(每个n个=3)未经处理或0.5μM(M)BPDE处理的Swan 71细胞。(十) PLD1的mRNA稳定性(每个n个=3)未经处理或0.5μM(M)BPDE处理的Swan 71细胞。这些条形图和图表的汇总数据显示在Excel表S1中。在所有mRNA稳定性分析中,NC组或载体组的RNA水平均设为“1”;在所有ChIP、RIP和MeRIP分析中,IgG组的DNA或RNA水平设为“1”;在所有western blot分析中,NC或Vector组的条带强度设置为“100”。(A–G,N,P,S,U)显示了三个独立实验的代表性数据。(H–M、O、Q、R、T、V–X)中的数据显示意思是±标准偏差三个独立实验的结果。双尾学生的t吨-测试(H–K、Q–R、T、V)*第页<0.05, **第页<0.01、和***第页<0.001注:BPDE,苯并(a)芘-7,8-二氢二醇-9,10-环氧;ChIP,染色质免疫沉淀;甘油醛-3-磷酸脱氢酶;HuR,HuR过度表达;HZ09,过度表达lnc-HZ09型; IgG、免疫球蛋白G;甲基化RNA免疫沉淀;NC,siRNA阴性对照;ns,无显著性;PLD1,磷脂酶D水解物1;RIP、RNA免疫沉淀;SD,标准偏差;si-HuR,击倒HuR;si-HZ09,击倒lnc-HZ09型; 向量,pcDNA3.1的空向量。
图4A是一组两个western blot,分别在Swan 71下显示100、85、73、1和17,在H T R-8或SVneo(列)下显示100,80,61,22和11,在磷脂酶D1,Ras-related C3肉毒杆菌毒素底物1,细胞分裂控制蛋白42同源物,3-磷酸甘油醛脱氢酶(行)下显示。苯并(a)芘二醇环氧化合物的摩尔范围为0至1.5,增量为0.5。图4B是名为苯并(a)芘二醇环氧处理的Swan 71的染色组织,显示了载体和HZ 09(列)以及迁移和入侵(行)。图4C是名为苯并(a)芘二醇环氧处理的Swan 71的染色组织,显示阴性对照、si1-HZ 09和si2-HZ 09(列)以及迁移和侵袭(行)。图4D是名为苯并(a)芘二醇环氧处理的H T R-8或SVneo的染色组织,显示载体和HZ 09(柱)以及迁移和侵入(行)。图4E是名为苯并(a)芘二醇环氧处理的H T R-8或SVneo的染色组织,显示阴性对照、si1-HZ 09和si2-HZ 09(列)以及迁移和侵袭(行)。图4F是一组名为苯并(a)芘二醇环氧处理的两个western blot,显示载体(100)、HZ 09(72)、阴性对照(100),si1-HZ 09[187]、si2-HZ 09[219]和载体(100,Ras相关C3肉毒杆菌毒素底物1、细胞分裂控制蛋白42同源物和3-磷酸甘油醛脱氢酶(行)。图4G是一个western blot,显示100、93、86、28和15(列)以及特异性蛋白1和3-磷酸甘油醛脱氢酶,分别位于Swan 71和H T R-8或SVneo(行)下。苯并(a)芘二醇环氧化合物的摩尔范围为0至1.5,增量为0.5。图4H、4I、4J、4K、4Q、4R、4T、4V是簇状条形图,Swan 71中的染色质免疫沉淀,H T R-8或SVneo中的染色素免疫沉淀,苯并(a)芘二醇环氧化物处理的Swan 71的染色质免疫沉淀,苯并芘二醇环氧化物处理的H T R-8或SVnee中的染色蛋白免疫沉淀,苯并(a)芘二醇环氧处理的Swan 71中的受体相互作用蛋白,苯并(b)芘二元醇环氧处理的H T R-8或SVneo中的受体交互作用蛋白,Swan 71的染色质免疫沉淀,Swan 71中的甲基化RNA免疫沉淀测序,绘制磷脂酶D1启动子相对折叠富集图,磷脂酶D1启动子相对折叠富集,单位增量从0到4,磷脂酶D2启动子的相对折叠富集,信使核糖核酸相对表达,以2为增量从0到4不等,信使核糖核酸相对表达量,以2的增量从0至4不等,lnc-HZ09启动子相对折叠富集,以2递增从0到8不等,以及lnc-HZ09信使核素核酸相对折叠富集,范围从0到10,在抗免疫球蛋白G和抗特异性蛋白1、抗免疫球素G和抗特异性蛋白1、抗免疫球蛋白G和抗特异性蛋白1,抗免疫球蛋白质G和抗特殊性蛋白1以及抗免疫球蛋白酶G和抗人类抗原R之间以5(y轴)为增量,分别针对二甲基亚砜、苯并(a)芘二醇环氧化物、载体和HZ 09的抗免疫球蛋白G和抗人类抗原R、抗免疫球素G和抗同源框蛋白MSX-1以及抗免疫球蛋白质G和抗N6-甲基腺苷(x轴)。图4L、4M、4O分别是一组名为苯并(a)芘二醇环氧化处理的天鹅71、苯并(b)芘二元醇环氧化处理H T R-8或SVneo和苯并(c)芘二元醇环氧化膜处理天鹅71的两条线图,绘制了磷脂酶D1信使核糖核酸剩余量,范围从0.0到1.0,时间(小时)增量为0.5(y轴),Vector、HZ 09、Si1,2 HZ 09,阴性对照和人类抗原R的单位增量(x轴)范围分别为0至5。图4N是一个名为苯并(a)芘二醇环氧化物处理的西方印迹,显示载体(100)、HZ 09(134)、阴性对照(100),si1-HZ 09、si2-HZ 09和磷脂酶D1以及小写的β-微管蛋白,分别位于Swan 71和H T R-8或SVneo下(行)。图4P是一个蛋白质印迹,显示100、92、83、45和23(列)以及人类抗原R和3-磷酸甘油醛脱氢酶,分别位于Swan 71和H T R-8或SVneo(行)下。苯并(a)芘二醇环氧化合物的摩尔范围为0至1.5,增量为0.5。图4S是一个western blot,显示100、156、198、216和374(列)以及Homeobox蛋白MSX-1和甘油醛3-磷酸脱氢酶,分别位于Swan 71和H T R-8或SVneo(行)下。苯并(a)芘二醇环氧化合物的摩尔范围为0至1.5,增量为0.5。图4U是一个western blot,显示100、113、187、173和219(柱)和m(6)a甲基转移酶和3-磷酸甘油醛脱氢酶,分别位于Swan 71和H T R-8或SVneo(行)下。苯并(a)芘二醇环氧化合物的摩尔范围为0至1.5,增量为0.5。图4W和4X是标题为Swan 71、Lnc-HZ09信使核糖核酸剩余量的折线图,增量为0.5,范围从0.0到1.0;磷脂酶D1信使核酸剩余量,在时间(小时)内增量为0.5(y轴),范围从0.05到1.0,单位增量为0到5(x轴)。
图4。
lnc-HZ09调控BPDE暴露的人类滋养层细胞中的PLD1/RAC1/CDC42通路。(A) 以GAPDH为内标,对BPDE处理的Swan 71或HTR-8/SVneo细胞中PLD1、RAC1和CDC42的蛋白质水平进行代表性蛋白质印迹分析。每个波段的相对强度被量化意思是±标准偏差图S8A,B(B–E)中显示了三个重复的样本0.5μM(M)BPDE诱导的Swan 71(B和C)或HTR-8/SVneo(D和E)细胞过度表达或敲除lnc-HZ09型(比例尺,200μ). (F) SP1、PLD1、RAC1和CDC42蛋白水平的代表性western blot分析0.5μM(M)BPDE诱导的Swan 71或HTR-8/SVneo细胞过度表达或敲除lnc-HZ09型以GAPDH为内部标准。每个波段的相对强度被量化意思是±标准偏差图S8G–J显示了三个重复中的一个。(G) 以GAPDH为内标物,对BPDE处理的Swan 71或HTR-8/SVneo细胞中SP1蛋白水平进行代表性western blot分析。每个波段的相对强度被量化意思是±标准偏差图S8O显示了三个重复的。(H–I)SP1 ChIP分析(每个n个=3)未经处理或0.5μM(M)BPDE处理的Swan 71(H)或HTR-8/SVneo(I)细胞。(J–K)SP1 ChIP分析(每个n个=3)SP1在PLD1基因启动子区的相对富集0.5μM(M)BPDE诱导的Swan 71(J)或HTR-8/SVneo(K)细胞过度表达lnc-HZ09型(L–M)PLD1的mRNA稳定性(每个n个=3)英寸0.5μM(M)BPDE诱导的Swan 71(L)或HTR-8/SVneo(M)细胞过度表达或敲除lnc-HZ09型(N)PLD1蛋白水平的代表性western blot分析0.5μM(M)BPDE诱导Swan 71或HTR-8/SVneo细胞过度表达或击倒HuRβ-微管蛋白作为内部标准。每个波段的相对强度被量化意思是±标准偏差图S9C显示了三个重复的。(O) PLD1的mRNA稳定性(每个n个=3)英寸0.5μM(M)BPDE诱导Swan 71细胞过度表达或抑制HuR。(P) HuR蛋白水平的代表性western blot分析01.5μM(M)BPDE处理的Swan 71或HTR-8/SVneo细胞,带有β-微管蛋白作为内部标准。每个波段的相对强度被量化意思是±标准偏差图S9H显示了三个重复的。(Q–R)RIP分析(每个n个=3)被HuR蛋白下调的PLD1 mRNA相对水平0.5μM(M)BPDE诱导的Swan 71(Q)或HTR-8/SVneo(R)细胞过度表达lnc-HZ09型(S)MSX1蛋白水平的代表性western blot分析01.5μM(M)BPDE处理的Swan 71或HTR-8/SVneo细胞,以GAPDH作为内部标准。每个波段的相对强度被量化意思是±标准偏差图S9L显示了三个重复的。(T) MSX1 ChIP分析(每个n个=3)MSX1在lnc-HZ09型未经处理或0.5μM(M)BPDE处理的Swan 71细胞。(U) 以GAPDH为内标物,对BPDE处理的Swan 71或HTR-8/SVneo细胞中METTL3蛋白水平进行代表性western blot分析。每个波段的相对强度被量化意思是±标准偏差图S9O显示了三个重复的。(五) MeRIP分析(每个n个=3)m6A RNA甲基化的相对水平lnc-HZ09型未经处理或0.5μM(M)BPDE处理的Swan 71细胞。(W) RNA的稳定性lnc-HZ09型(每个n个=3)未经处理或0.5μM(M)BPDE处理的Swan 71细胞。(十) PLD1的mRNA稳定性(每个n个=3)未经处理或0.5μM(M)BPDE处理的Swan 71细胞。这些条形图和图表的汇总数据显示在Excel表S1中。在所有mRNA稳定性分析中,NC组或载体组的RNA水平均设为“1”;在所有ChIP、RIP和MeRIP分析中,IgG组的DNA或RNA水平设为“1”;在所有western blot分析中,NC或Vector组的条带强度设置为“100”。(A–G,N,P,S,U)显示了三个独立实验的代表性数据。(H–M、O、Q、R、T、V–X)中的数据显示意思是±标准偏差三个独立实验的结果。双尾学生的t吨-测试(H–K、Q–R、T、V)*第页<0.05, **第页<0.01、和***第页<0.001注:BPDE,苯并(a)芘-7,8-二氢二醇-9,10-环氧;ChIP,染色质免疫沉淀;甘油醛-3-磷酸脱氢酶;HuR,HuR过度表达;HZ09,过度表达lnc-HZ09型; IgG、免疫球蛋白G;甲基化RNA免疫沉淀;NC,siRNA阴性对照;ns,无显著性;PLD1,磷脂酶D水解物1;RIP、RNA免疫沉淀;SD,标准偏差;si-HuR,击倒HuR;si-HZ09,击倒lnc-HZ09型; 向量,pcDNA3.1的空向量。
图5A、5B、5F、5N是标题为Inc-HZ 09的误差条形图,磷脂酶D1信使核糖核酸,特异性蛋白1,m(6)A甲基转移酶,绘制核糖核酸相对表达,单位增量范围为0至3,核糖核酸相关表达,单位增长范围为0到2,信使核糖核酸相对表达(单位增量为0至2)和信使核糖核酸相对表达(跨H C和R M(x轴)分别为5(y轴)增量为0到10)。图5D、5E、5G、5I、5M是标题为磷脂酶D1信使核糖核酸-Inc-HZ 09、磷脂酶D1蛋白质-Inc-HZ09、磷化酶D1蛋白质-特异性蛋白质1蛋白质、特异性蛋白质1-IncHZ 09、In HZ 09-同源框蛋白MSX-1蛋白质的图,绘制磷脂酶D2信使核核酸相对表达,范围从0.0到2.5,增量为0.5;磷脂酶D1蛋白相对表达,从0到300,增量为100;磷脂酶D_1蛋白相对表示,从0至800,增量为200;特异性蛋白1蛋白相对表达量,增量为0至200;同源框蛋白MSX-1蛋白相对表示,在Inc-HZ 09相对表达式中,范围从0到250,增量为200(y轴),单位增量为0到4;Inc-HZ 09相对表达,范围从0.5到2.5,增量为0.5;特异性蛋白1蛋白相对表达,范围从0到250,增量为50;Inc-HZ 09相对表达,以0.5为增量从0.5到2.5,HZ 09的相对表达,分别以0.5(x轴)为增量从0.0到2.5。图5C是一组两个western blots。在顶部,蛋白质印迹在HC下显示124、147、89、100、163,在RM下显示94、36、21、92、24(列)和特异性蛋白1、磷脂酶D1、Ras相关C3肉毒杆菌毒素底物1、细胞分裂控制蛋白42同源物和甘油醛3-磷酸脱氢酶(行)。在底部,H C下为73、193、96、125、159,P M下为14、19、23、148、100(列),特异性蛋白1、磷脂酶D1、Ras-related C3肉毒杆菌毒素底物1、细胞分裂控制蛋白42同源物和3-磷酸甘油醛脱氢酶(列)。图5H、5L、5O是一个聚集条形图,组织中的染色质免疫沉淀、组织中的染色体免疫沉淀和组织中的甲基化RNA免疫沉淀测序,绘制磷脂酶D1启动子相对折叠富集,范围从0到4,增量为2;Inc-HZ 09启动子相对折叠富集,范围为0至6,增量为2,Inc-HZ09 m(6)A甲基转移酶相对折叠富集范围为0到9,跨抗免疫球蛋白G和抗特异性蛋白1,抗免疫球蛋白质G和同源框蛋白MSX-1,H C和R M分别为抗免疫球蛋白G和抗N6-甲基腺苷(x轴)。图5K是一组两个western blots。在左侧,western blot在H C下显示196、153、108、100、93,在R M(列)下显示21、46、130、31、87,在人类抗原R、同源框蛋白MSX-1、M(6)A甲基转移酶和3-磷酸甘油醛脱氢酶(列)中显示。右侧为92、100、126、131、149(H C下)和74、79、43、25、98(R M下)(列)以及人类抗原R、同源框蛋白MSX-1、M(6)A甲基转移酶和3-磷酸甘油醛脱氢酶(列)。
图5。
lnc-HZ09在人类绒毛组织中的调节作用。(A–B)RT-qPCR分析lnc-HZ09型(A) 或PLD1 mRNA(B)在HC(健康对照,圆形)和RM(反复流产,方形)组织中的表达n个=15). (C) HC和RM组织中SP1、PLD1、RAC1和CDC42蛋白水平的Western blot分析n个=10)以GAPDH为内部标准。每个波段的相对强度被量化,其水平如图S10C所示。(D) PLD1 mRNA水平与lnc-HZ09型HC(圆形)和RM(方形)组织中的水平(每个n个=15). (E) PLD1蛋白水平与lnc-HZ09型HC(圆形)和RM(方形)组(每个组n个=10). (F) RT-qPCR分析(每个n个=3)HC(圆形)和RM(方形)组织中SP1的mRNA水平n个=15). (G) HC(圆形)和RM(方形)组(每个组)中PLD1和SP1蛋白水平的相关性n个=10). (H) SP1 ChIP分析HC和RM组织中PLD1基因启动子区SP1的相对富集度n个=6). (一) SP1蛋白水平与lnc-HZ09型HC(圆形)和RM(方形)组(每个组n个=10). (J) HC和RM组织MSX1 mRNA水平的RT-qPCR分析n个=15). (K) HC和RM组织中HuR、MSX1和METTL3蛋白水平的Western blot分析n个=10)以GAPDH为内部标准。每个谱带的相对强度被量化,其水平如图S10H、J、K所示lnc-HZ09型HC和RM组织(每个n个=6). (M) lnc-HZ09型以及HC(圆形)和RM(方形)组中MSX1的蛋白质水平(每个n个=10). (N) RT-qPCR分析(每个n个=3)HC和RM组织中METTL3的mRNA水平(每个n个=15). (O) MeRIP分析(每个n个=3)m6A RNA甲基化水平lnc-HZ09型HC和RM组织(每个n个=6). 这些条形图和散点图的汇总数据显示在Excel表S1中。在所有ChIP和MeRIP分析中,IgG组的DNA或RNA水平设置为“1”,在所有western blot分析中,中间强度值设置为“100”。(C–E,G,I,K,M)显示了三个独立实验的代表性数据。(H,L,O)中的数据显示意思是±标准偏差六个独立实验的结果。双尾学生的t吨-测试(A–B、F、H、J、L、N–O);皮尔逊分析(D,E,G,I,M)*第页<0.05, **第页<0.01、和***第页<0.001注:ChIP,染色质免疫沉淀;GADPH;甘油醛-3-磷酸脱氢酶;健康对照组;IgG、免疫球蛋白G;甲基化RNA免疫沉淀;n、 生物独立样本的数量;ns,无显著性;PLD1,磷脂酶D水解物1;RM,反复流产组。
图5A、5B、5F、5N是标题为Inc-HZ 09的误差条形图,磷脂酶D1信使核糖核酸,特异性蛋白1,m(6)A甲基转移酶,绘制核糖核酸相对表达,单位增量范围为0至3,核糖核酸相关表达,单位增长范围为0到2,信使核糖核酸相对表达(单位增量为0至2)和信使核糖核酸相对表达(跨H C和R M(x轴)分别为5(y轴)增量为0到10)。图5D、5E、5G、5I、5M是标题为磷脂酶D1信使核糖核酸-Inc-HZ 09、磷脂酶D1蛋白质-Inc-HZ09、磷化酶D1蛋白质-特异性蛋白质1蛋白质、特异性蛋白质1-IncHZ 09、In HZ 09-同源框蛋白MSX-1蛋白质的图,绘制磷脂酶D2信使核核酸相对表达,范围从0.0到2.5,增量为0.5;磷脂酶D1蛋白相对表达,从0到300,增量为100;磷脂酶D_1蛋白相对表示,从0至800,增量为200;特异性蛋白1蛋白相对表达量,增量为0至200;同源框蛋白MSX-1蛋白相对表示,在Inc-HZ 09相对表达式中,范围从0到250,增量为200(y轴),单位增量为0到4;Inc-HZ 09相对表达,范围从0.5到2.5,增量为0.5;特异性蛋白1蛋白相对表达,范围从0到250,增量为50;Inc-HZ 09相对表达,以0.5为增量从0.5到2.5,HZ 09的相对表达,分别以0.5(x轴)为增量从0.0到2.5。图5C是一组两个western blots。在顶部,蛋白质印迹在HC下显示124、147、89、100、163,在RM下显示94、36、21、92、24(列)和特异性蛋白1、磷脂酶D1、Ras相关C3肉毒杆菌毒素底物1、细胞分裂控制蛋白42同源物和甘油醛3-磷酸脱氢酶(行)。在底部,H C下为73、193、96、125、159,P M下为14、19、23、148、100(列),特异性蛋白1、磷脂酶D1、Ras-related C3肉毒杆菌毒素底物1、细胞分裂控制蛋白42同源物和3-磷酸甘油醛脱氢酶(列)。图5H、5L、5O是一个聚集条形图,组织中的染色质免疫沉淀、组织中的染色体免疫沉淀和组织中的甲基化RNA免疫沉淀测序,绘制磷脂酶D1启动子相对折叠富集,范围从0到4,增量为2;Inc-HZ 09启动子相对折叠富集,范围为0至6,增量为2,Inc-HZ09 m(6)A甲基转移酶相对折叠富集范围为0到9,跨抗免疫球蛋白G和抗特异性蛋白1,抗免疫球蛋白质G和同源框蛋白MSX-1,H C和R M分别为抗免疫球蛋白G和抗N6-甲基腺苷(x轴)。图5K是一组两个western blots。在左侧,western blot在H C下显示196、153、108、100、93,在R M(列)下显示21、46、130、31、87,在人类抗原R、同源框蛋白MSX-1、M(6)A甲基转移酶和3-磷酸甘油醛脱氢酶(列)中显示。右侧为92、100、126、131、149(H C下)和74、79、43、25、98(R M下)(列)以及人类抗原R、同源框蛋白MSX-1、M(6)A甲基转移酶和3-磷酸甘油醛脱氢酶(列)。
图5。
lnc-HZ09在人类绒毛组织中的调节作用。(A–B)RT-qPCR分析lnc-HZ09型(A) 或PLD1 mRNA(B)在HC(健康对照,圆形)和RM(反复流产,方形)组织中的表达n个=15). (C) HC和RM组织中SP1、PLD1、RAC1和CDC42蛋白水平的Western blot分析n个=10)以GAPDH为内部标准。每个波段的相对强度被量化,其水平如图S10C所示。(D) PLD1 mRNA水平与lnc-HZ09型HC(圆形)和RM(方形)组织中的水平(每个n个=15). (E) PLD1蛋白水平与lnc-HZ09型HC(圆形)和RM(方形)组(每个组n个=10). (F) RT-qPCR分析(每个n个=3)HC(圆形)和RM(方形)组织中SP1的mRNA水平n个=15). (G) HC(圆形)和RM(方形)组(每个组)中PLD1和SP1蛋白水平的相关性n个=10). (H) SP1 ChIP分析HC和RM组织中PLD1基因启动子区SP1的相对富集度n个=6). (一) SP1蛋白水平与lnc-HZ09型HC(圆形)和RM(方形)组(每个组n个=10). (J) HC和RM组织MSX1 mRNA水平的RT-qPCR分析n个=15). (K) HC和RM组织中HuR、MSX1和METTL3蛋白水平的Western blot分析n个=10)以GAPDH为内部标准。每个谱带的相对强度被量化,其水平如图S10H、J、K所示lnc-HZ09型HC和RM组织(每个n个=6). (M) lnc-HZ09型以及HC(圆形)和RM(方形)组中MSX1的蛋白质水平(每个n个=10). (N) RT-qPCR分析(每个n个=3)HC和RM组织中METTL3的mRNA水平(每个n个=15). (O) MeRIP分析(每个n个=3)m6A RNA甲基化水平lnc-HZ09型HC和RM组织(每个n个=6). 这些条形图和散点图的汇总数据显示在Excel表S1中。在所有ChIP和MeRIP分析中,IgG组的DNA或RNA水平设置为“1”,在所有western blot分析中,中间强度值设置为“100”。(C–E,G,I,K,M)显示了三个独立实验的代表性数据。(H,L,O)中的数据显示意思是±标准偏差六个独立实验的结果。双尾学生的t吨-测试(A–B、F、H、J、L、N–O);皮尔逊分析(D,E,G,I,M)*第页<0.05, **第页<0.01、和***第页<0.001注:ChIP,染色质免疫沉淀;GADPH;甘油醛-3-磷酸脱氢酶;健康对照组;IgG、免疫球蛋白G;甲基化RNA免疫沉淀;n、 生物独立样本的数量;ns,无显著性;PLD1,磷脂酶D水解物1;RM,反复流产组。
图6A至6D为误差条形图,绘制信使核糖核酸相对表达,范围为0.0至1.0,增量为05;0.0至1.0,增量为0.5;磷脂酶D1、Ras-related C3肉毒杆菌毒素底物1、细胞分裂控制蛋白42同源物、,特异性蛋白1。图6E是一组两个western blot,绘制了特异性蛋白1、磷脂酶D1、Ras-related C3肉毒杆菌毒素底物1、细胞分裂控制蛋白42同源物和生物膜相关蛋白的3-磷酸甘油脱氢酶(行)(毫克/千克),范围从0到0.05,增量为0.05;0.05到0.2,增量为0.15(列)。图6F是一个名为组织中染色质免疫沉淀的聚类条形图,绘制磷脂酶D1启动子相对折叠富集,范围从0到6,在0和生物膜相关蛋白的抗免疫球蛋白G和抗特异性蛋白1(x轴)中以2(y轴)为增量。图6H是包含八个步骤的示意流程图。步骤1:生物膜相关蛋白或苯并(a)芘二醇环氧化合物与Msh Homeobox 1相互作用以激活启动子和转录,生物膜相关蛋白质或苯并。甲基转移酶导致Inc-HZ09。步骤2:苯并(a)芘二醇环氧化合物将滋养层细胞暴露于Inc-HZ09(不同程度)导致降解。步骤3:Inc-HZ09和特异性蛋白1的相互作用导致启动子和转录。步骤4:启动子和转录导致磷脂酶D1信使核糖核酸。步骤5:信使核糖核酸导致磷脂酶D1、Ras相关的C3肉毒杆菌毒素底物1或细胞分裂控制蛋白42同源物。步骤6:磷脂酶D1或Ras-related C3肉毒杆菌毒素底物1或细胞分裂控制蛋白42同源物有助于入侵和迁移。第七步:由于入侵和迁徙,流产会发生。步骤8:磷脂酶D1信使核糖核酸(或多或少)导致降解。图6G是一个名为磷脂酶D1蛋白相对表达的图表,在特异性蛋白1蛋白相对表达(x轴)中以50(y轴)为增量从0到150不等。
图6。
BaP诱导流产小鼠胎盘组织中的Pld1/Rac1/Cdc42通路。(A–D)RT-qPCR分析每个B(A)P处理小鼠组(每个组)中Pld1(A)、Rac1(B)、Cdc42(C)和Sp1(D)的mRNA水平n个=8). (E) 每个B(a)P处理的小鼠组中Sp1、Pld1、Rac1和Cdc42的蛋白质水平的蛋白质印迹分析(每个n个=6)以GAPDH为内部标准。每个波段的相对强度被量化,其水平如图S11F所示。(F) 对照组和对照组Pld1基因启动子区Sp1相对富集的Sp1 ChIP分析0.2毫克/公斤B(a)P处理小鼠组(每组n个=6). (G) 对照组(圆形)Pld1和Sp1蛋白水平与0.2毫克/公斤B(a)P处理(方形)组(每个n个=6). (H) 拟议的监管机制lnc-HZ09型.Lnc-HZ09号通过竞争性抑制PLD1 mRNA与HuR(一种可以稳定PLD1 mRNA的蛋白质)的结合,抑制SP1介导的PLD1 mRNA转录,也降低了PLD1 mRNA的稳定性。BPDE暴露促进MSX1介导的lnc-HZ09型转录和增强lnc-HZ09型通过上调m6A甲基化修饰的RNA稳定性。因此,BPDE暴露可能会增加lnc-HZ09型表达水平,抑制PLD1/RAC1/CDC42通路,抑制迁移和侵袭,并可能进一步诱发流产。这些条形图和散点图的汇总数据显示在Excel表S1中。在ChIP试验中,IgG组的DNA水平设置为“1”,在western blot试验中,中间强度值设置为“100”。(A–E,G)显示了三个独立实验的代表性数据。(F)中的数据显示意思是±标准偏差六个独立实验的结果。双尾学生的t吨-测试(F);(A–D)的单因素方差分析,(G)的皮尔逊分析。(H) 由Microsoft Office PowerPoint生成*第页<0.05, **第页<0.01、和***第页<0.001注:B(a)P,苯并(a)芘;BPDE,苯并(a)芘-7,8-二氢二醇-9,10-环氧;ChIP,染色质免疫沉淀;甘油醛-3-磷酸脱氢酶;IgG、免疫球蛋白G;n、 生物独立样本的数量;ns,无显著性;RT-qPCR,定量逆转录聚合酶链反应;SD,标准偏差。
图6A至6D为误差条形图,绘制信使核糖核酸相对表达,范围为0.0至1.0,增量为05;0.0至1.0,增量为0.5;磷脂酶D1、Ras-related C3肉毒杆菌毒素底物1、细胞分裂控制蛋白42同源物、,特异性蛋白1。图6E是一组两个western blot,绘制了特异性蛋白1、磷脂酶D1、Ras-related C3肉毒杆菌毒素底物1、细胞分裂控制蛋白42同源物和生物膜相关蛋白的3-磷酸甘油脱氢酶(行)(毫克/千克),范围从0到0.05,增量为0.05;0.05到0.2,增量为0.15(列)。图6F是一个名为组织中染色质免疫沉淀的聚类条形图,绘制磷脂酶D1启动子相对折叠富集,范围从0到6,在0和生物膜相关蛋白的抗免疫球蛋白G和抗特异性蛋白1(x轴)中以2(y轴)为增量。图6H是包含八个步骤的示意流程图。步骤1:生物膜相关蛋白或苯并(a)芘二醇环氧化合物与Msh Homeobox 1相互作用以激活启动子和转录,生物膜相关蛋白质或苯并。甲基转移酶导致Inc-HZ09。步骤2:苯并(a)芘二醇环氧化合物将滋养层细胞暴露于Inc-HZ09(不同程度)导致降解。步骤3:Inc-HZ09和特异性蛋白1的相互作用导致启动子和转录。步骤4:启动子和转录导致磷脂酶D1信使核糖核酸。步骤5:信使核糖核酸导致磷脂酶D1、Ras相关的C3肉毒杆菌毒素底物1或细胞分裂控制蛋白42同源物。步骤6:磷脂酶D1或Ras-related C3肉毒杆菌毒素底物1或细胞分裂控制蛋白42同源物有助于入侵和迁移。第七步:由于入侵和迁徙,流产会发生。步骤8:磷脂酶D1信使核糖核酸(或多或少)导致降解。图6G是一个名为磷脂酶D1蛋白相对表达的图表,在特异性蛋白1蛋白相对表达(x轴)中以50(y轴)为增量从0到150不等。
图6。
BaP诱导流产小鼠胎盘组织中的Pld1/Rac1/Cdc42通路。(A–D)RT-qPCR分析每个B(A)P处理小鼠组(每个组)中Pld1(A)、Rac1(B)、Cdc42(C)和Sp1(D)的mRNA水平n个=8). (E) 每个B(a)P处理的小鼠组中Sp1、Pld1、Rac1和Cdc42的蛋白质水平的蛋白质印迹分析(每个n个=6)以GAPDH为内部标准。每个波段的相对强度被量化,其水平如图S11F所示。(F) 对照组和对照组Pld1基因启动子区Sp1相对富集的Sp1 ChIP分析0.2毫克/公斤B(a)P处理小鼠组(每组n个=6). (G) 对照组(圆形)Pld1和Sp1蛋白水平与0.2毫克/公斤B(a)P处理(方形)组(每个n个=6). (H) 拟议的监管机制lnc-HZ09型.Lnc-HZ09号通过竞争性抑制PLD1 mRNA与HuR(一种可以稳定PLD1 mRNA的蛋白质)的结合,抑制SP1介导的PLD1 mRNA转录,也降低了PLD1 mRNA的稳定性。BPDE暴露促进MSX1介导的lnc-HZ09型转录和增强lnc-HZ09型通过上调m6A甲基化修饰的RNA稳定性。因此,BPDE暴露可能会增加lnc-HZ09型表达水平,抑制PLD1/RAC1/CDC42通路,抑制迁移和侵袭,并可能进一步诱发流产。这些条形图和散点图的汇总数据显示在Excel表S1中。在ChIP试验中,IgG组的DNA水平设置为“1”,在western blot试验中,中间强度值设置为“100”。(A–E,G)显示了三个独立实验的代表性数据。(F)中的数据显示意思是±标准偏差六个独立实验的结果。双尾学生的t吨-测试(F);(A–D)的单因素方差分析,(G)的皮尔逊分析。(H) 由Microsoft Office PowerPoint生成*第页<0.05, **第页<0.01、和***第页<0.001注:B(a)P,苯并(a)芘;BPDE,苯并(a)芘-7,8-二氢二醇-9,10-环氧;ChIP,染色质免疫沉淀;甘油醛-3-磷酸脱氢酶;IgG、免疫球蛋白G;n、 生物独立样本的数量;ns,无显著性;RT-qPCR,定量逆转录聚合酶链反应;SD,标准偏差。

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