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.2022年1月21日2022:3369858。
doi:10.1155/2022/3369858。 eCollection 2022年。

DTL是一种预后生物标志物,通过调节AKT/mTOR轴促进膀胱癌进展

附属公司

DTL是一种预后生物标志物,通过调节AKT/mTOR轴促进膀胱癌进展

罗永文等。 氧化介质细胞Longev. .

摘要

背景:据报道,无牙E3泛素蛋白连接酶同源物(DTL)是肿瘤发生和发展的重要调节因子。尽管如此,DTL在BCa中的生物学功能和分子机制仍不清楚。

方法:我们基于癌症基因组图谱(TCGA)、ArrayExpress和基因表达综合数据库(GEO)进行了综合生物信息学分析,以探讨DTL的诊断和预后价值。然后,根据临床标本和组织芯片(TMA),利用qRT-PCR和免疫组织化学方法验证DTL表达的临床意义。此外,通过体外和体内实验研究了DTL在BCa中的生物学功能和潜在机制。

结果:综合生物信息学分析表明,DTL是与BCa进展相关的关键基因,DTL表达增加与恶性生物学行为和不良预后相关。临床标本和组织芯片(TMA)的实验进一步证实了我们的发现。生物信息学分析表明,DTL可能与BCa中的细胞周期和DNA复制相关路径有关。DTL的抑制抑制了体内外BCa细胞的增殖、迁移和侵袭。从机制上讲,DTL可能通过AKT/mTOR途径促进BCa的进展。

结论:DTL表达增加与BCa患者的恶性生物学行为和不良预后相关,可能通过AKT/mTOR途径促进BCa进展。我们的研究为BCa提供了潜在的预测因子和治疗靶点。

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数字

图1
图1
加权基因共表达网络分析确定了与BCa进展相关的关键模块。(a) 所有选定基因的树状图基于差异性度量(1-TOM)聚类。(b) 模块特征基因与BCa不同临床信息的相关性热图。(c) 与肿瘤分期和BCa分级相关的模块中平均基因显著性和错误的分布。(d) 气泡图显示基于棕色模块中所有基因的基因本体和KEGG途径富集分析。这个x个-轴表示-log10(第页值),以及-axis代表显著富集的途径。
图2
图2
DTL是BCa的一个关键基因和一个优秀的诊断生物标志物。(a) 棕色模块中所有基因的散点图;位于右上角的圆圈表示这些模块中的关键基因。(b) 蛋白质相互作用网络根据STRING数据库确定了前10个中心基因。(c) GSE13507中选定的前10个枢纽基因的ROC曲线分析。(d) GSE13507中DTL诊断ROC曲线分析。
图3
图3
与邻近正常组织相比,DTL在膀胱癌组织中过度表达。(a) Oncomine数据库中的DTL表达分析。(b) GEPIA数据库中的DTL表达分析。(c) BCa中DTL的改变频率。(d) 15对BCa肿瘤组织及邻近组织的qRT-PCR结果。(e) 膀胱癌组织DTL的IHC染色。图像以×100(上)和×400(下)放大倍率显示。
图4
图4
三个独立数据集中DTL的预测分析。(a) GSE13507数据集。(b) GSE32894数据集。(c) E-MTAB-4321数据集。左面板显示了三个数据集中的Kaplan-Meier生存曲线,DTL高表达患者的生存率明显低于DTL低表达患者。中间面板显示了DTL低表达组和高表达组所有患者的生存状态分布。右侧面板显示了三个数据集中生存预测的时间依赖性ROC曲线。
图5
图5
BCa组织芯片DTL的临床相关性和预后分析。(a) DTL的表达与BCa的肿瘤分期有关。(b) 使用X-tile软件定义最佳截止值。(c) DTL的高表达与预后不良有关。(d) Cox回归分析表明DTL是BCa的独立预后因素。
图6
图6
基于ssGSEA富集途径的DTL表达。(a–d)E-MTAB-4321、GSE13507、GSE32894和TCGA数据集中的ssGSEA富集途径。(e) 四个数据集中激活路径的文氏图。(f) 四个数据集中抑制通路的文氏图。
图7
图7
DTL耗竭抑制BCa细胞增殖并抑制G2细胞周期转换。(a) qRT-PCR分析评估了三种DTL siRNA在UMUC3和T24细胞中的敲除效率,siRNA1代表了最高的敲除率。因此,选择siRNA1用于后续实验。(b) 免疫荧光评估了siRNA1在UMUC3和T24细胞中的敲除效率。(c) 在UMUC3和T24细胞中的MTT分析代表了DTL耗尽后的细胞活力。(d) 克隆形成分析表示DTL耗尽后的细胞增殖活力,(e)对克隆形成细胞计数进行统计分析。(f) 流式细胞术显示了UMUC3和T24细胞中DTL耗尽后细胞周期的改变,并使用双尾分析法评估了统计学意义t吨-测试。(g) Western blotting分析显示细胞周期相关蛋白的改变。第页< 0.01,**第页< 0.001.
图8
图8
DTL耗竭抑制BCa细胞迁移和侵袭,减弱BCa细胞的EMT,并抑制AKT/mTOR通路。(a,b)UMUC3和T24细胞的Transwell迁移和侵袭试验代表DTL耗尽后的细胞迁移和侵袭活性,并对迁移或侵袭细胞计数进行统计分析。(c) Western blotting分析揭示了DTL耗竭后EMT标记和AKT/mTOR通路关键蛋白的表达变化。GAPDH被用作内部控制。(d,e)伤口愈合试验表示DTL耗尽后的细胞迁移活性,并对迁移的细胞计数进行统计分析。使用双尾模型评估统计显著性t吨-测试。
图9
图9
DTL的减少抑制体内BCa的生长。(a) UMUC3稳定细胞的绿色荧光。(b,c)qRT-PCR和western blotting分析验证了UMUC3稳定细胞中DTL的耗竭效率。(d) 皮下注射LV-NC细胞或LV-shDTL细胞建立异种小鼠模型,连续监测5周;然后处死小鼠,解剖肿瘤。(e,f)两组肿瘤体积和重量的统计分析。(g) HE染色评估肿瘤细胞核异型性,IHC染色检测Ki67的表达。(h) 免疫荧光染色检测DTL和Ki67的表达。第页< 0.01,**第页< 0.001.

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