Hospital transmission of borderline oxacillin-resistant Staphylococcus aureus evaluated by whole-genome sequencing

doi:10.1099/jmm.0.001384

.2021年7月；70(7):001384.

doi:10.1099/jmm.001384。

临界苯唑西林耐药的医院传播金黄色葡萄球菌通过全基因组测序进行评估

玛丽亚·康斯坦丁诺夫斯基¹, 卡琳·埃伦·维尔德坎普¹, 阿德里安娜·P·M·拉夫里杰森², Thijs Bosch公司^三, 玛格丽特·E·M·克拉克曼¹, 萨姆·努伊¹, 埃里克·C·J·克拉斯¹, Jairo Gooskens公司¹

附属公司

¹荷兰莱顿大学医学中心医学微生物学系。
²荷兰莱顿大学医学中心皮肤科。
^三荷兰德比尔特国家公共卫生与环境研究所传染病研究、诊断和实验室监测。

PMID： 34269673
预防性维修识别码： PMC8493421号
内政部： 10.1099/jmm.001384

临界苯唑西林耐药的医院传播金黄色葡萄球菌通过全基因组测序进行评估

玛丽亚·康斯坦丁诺夫斯基等。医学微生物学杂志. 2021年7月.

.2021年7月；70(7):001384.

doi:10.1099/jmm.001384。

作者

附属公司

¹荷兰莱顿大学医学中心医学微生物学系。
²荷兰莱顿大学医学中心皮肤科。
^三荷兰德比尔特国家公共卫生与环境研究所传染病研究、诊断和实验室监测。

PMID： 34269673
预防性维修识别码： PMC8493421号
内政部： 10.1099/jmm.001384

摘要

导言。 金黄色葡萄球菌是全球医院感染的主要原因。对耐甲氧西林药物的认识金黄色葡萄球菌（耐甲氧西林金黄色葡萄球菌）感染率较高，但对苯唑西林耐药临界值的关注度较高金黄色葡萄球菌（BORSA）是有限的，可能是由于低估了临床相关性、低发病率假设和诊断局限性。差距声明。BORSA监测尚未常规实施，因此在定义和感染控制措施方面缺乏共识。目标。我们的目标是调查医院中BORSA感染的发生率、分子特征和临床表现。方法。在2016年发病率增加后，我们对2014/2016年（我们机构）的BORSA病例进行了更具体的评估。对病历进行审查，以调查流行病学联系、临床特征和结果。通过全基因组测序（WGS）评估抗性和毒力标记。常规方法：扩增片段长度多态性（AFLP）；将多位点序列分型（MLST）和多位点可变数串联重复序列分析（MLVA）与核心基因组MLST（cgMLST）及全基因组单核苷酸多态性（wgSNP）分析进行比较，以确定遗传簇。结果。2009年至2013年，BORSA占所有临床病例的0.1%金黄色葡萄球菌菌株。2016年，发病率是基线水平的六倍。全基因组SNP和cgMLST证实了皮肤病患者中的两个BORSA簇。BORSA患者出现皮肤感染，其中一例发生严重侵袭性感染，导致死亡。感染控制措施成功地阻止了这两个集群中的进一步传播。WGS研究结果表明，BORSA菌株携带多重耐药和毒力基因，致病潜力增加。结论。WGS和cgMLST在临床表现从轻度皮肤感染到危及生命的菌血症的高危患者中有效表征并证实了BORSA簇。因此，有必要提高临床意识并积极监测，以便及时实施感染控制措施，防止BORSA在高危患者中传播。

关键词：BORSA；WGS；抗微生物耐药性；cgMLST；感染控制；医院传播。

PubMed免责声明

利益冲突声明

作者声明不存在利益冲突

数字

**图1。**
最小生成树，使用爆发菌株使用Seqsphere+计算。复杂类型在节点中注明。连接线上注明了等位距离（不按比例）。

**图2。**
BORSA菌株之间SNP差异的概述，用pheatmap可视化。颜色表示菌株之间的SNP距离。

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