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.2017年2月;49(2):269-273.
doi:10.1038/ng.3745。 Epub 2016年12月19日。

原发性硬化性胆管炎的全基因组关联研究确定了新的风险位点并量化了与炎症性肠病的遗传关系

孙国吉 1布莱恩·德朱兰 2索伦·穆查 Trine Folseraas公司 4 5 6卢克·乔斯汀斯 7 8Espen甜瓜 4 5熊坂内彦(Natsuhiko Kumasaka) 1伊丽莎白·J·阿特金森 9埃里克·施利希特 2吉米·Z·刘 1特哈斯·沙阿 1哈维尔·古铁雷斯-阿丘里 1Kirsten M Boberg先生 4 6 10安妮卡·伯奎斯特 11Severine Vermeire公司 12 13伯特斯·埃克斯特恩 14彼得·杜丽 15马尔蒂·法基拉 16托比亚斯·米勒 17克里斯托夫·施拉姆 18马蒂娜·斯特内克 19托拜厄斯·魏斯米勒 20 21 22丹尼尔·哥特哈特(Daniel N Gotthardt) 23大卫·埃林豪斯 费利克斯·布劳恩 24安德烈亚斯·特维尔 25马蒂亚斯·劳德斯 26沃尔夫冈·利伯 27Gunnar Jacobs公司 27乌尔里希·博伊尔斯 28冲洗K Weersma 29Cisca Wijmenga公司 30汉斯·乌尔里希·马尔绍尔 31Piotr Milkiewicz公司 32阿尔伯特·帕尔斯 33Kimmo Kontula公司 34奥利维尔·查佐伊勒(Olivier Chazouillères) 35彼得罗·因弗尼齐 36伊丽莎白·古德 37凯利·斯皮斯 37卡梅尔·摩尔 38 39詹妮弗·桑布鲁克 39 40威廉·H·乌韦汉德 1 38 40 41大卫·J·罗伯茨 38 42 43约翰·达内许 1 38 39Annarosa Floreani公司 44Aliya F Gulamhusein 2约翰·伊顿 2斯特凡·施赖伯  45卡特琳娜·科尔特斯库 46克里斯托弗·鲍尔斯 47Velimir A Luketic公司 48约瑟夫·奥丁 49Kapil B Chopra公司 50克里斯·V·科德利 51纳加·查拉桑尼 52迈克尔·P·曼斯 20 21布里杰什·斯利瓦斯塔瓦 37乔治·梅尔斯 37 53理查德·桑福德 37格雷姆·亚历山大 54丹尼尔·加夫尼 1罗杰·查普曼 55吉迪恩·M·赫希菲尔德 56 57玛丽扎·德·安德拉德 9; UK-PSC财团; 国际IBD遗传学联合会; 国际PSC研究小组; 西蒙·拉什布鲁克 37安德烈·弗兰克 汤姆·H·卡尔森 4 5 6 10Konstantinos N Lazaridis公司 2卡尔·A·安德森 1
附属公司

原发性硬化性胆管炎的全基因组关联研究确定了新的风险位点并量化了与炎症性肠病的遗传关系

孙狗记等。 自然基因. 2017年2月.

摘要

原发性硬化性胆管炎(PSC)是一种罕见的渐进性疾病,可导致胆管破坏;~75%的患者合并炎症性肠病(IBD)。我们对PSC进行了最大的全基因组关联研究(4796例和19955例人群对照),并确定了四个新的全基因组显著位点。一个位点上最相关的SNP影响UBASH3A的剪接和表达,预测保护性等位基因(C)会导致非停止介导的mRNA衰退和UBASH5A的低表达。基于常见变异的进一步分析表明,全基因组遗传相关性(rG公司)PSC和溃疡性结肠炎(UC)之间(rG公司=0.29)显著大于PSC和克罗恩病(CD)(rG公司=0.04)(P=2.55×10-15). UC和CD在基因上更相似(rG公司=0.56)比PSC(P<1.0×10)-15). 我们的研究代表了对PSC遗传学理解的重大进展。

PubMed免责声明

利益冲突声明

竞争性财务利益

作者声明没有竞争性的经济利益。

数字

图1
图1。6个PSC相关SNP中PSC、UC和CD的比值比(及其95%置信区间)表明存在共同的因果变量(最大后验概率>0.8)
PSC OR取自GWAS和复制荟萃分析。UC和CD ORs来自国际IBD遗传学联合会进行的最新关联研究。使用Cochran的Q检验进行优势异质性检验。由于检测异质性的能力因SNP而异,未能检测到显著的概率异质性并不一定表明效应大小相等。
图2
图2。PSC(及其亚表型)、CD和UC之间的全基因组遗传相关性
使用GCTA中实现的线性混合模型的二元扩展计算遗传相关性(及其95%置信区间)(联机方法). PSC与CD和UC的遗传相关性低于这两种炎症性肠病的遗传相关性。PSC与UC的遗传相关性大于与CD的遗传相关性,这在PSC亚表型中是一致的。

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引用人

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