使用DIAMOND快速而敏感的蛋白质比对
摘要
类似文章
-
PALADIN：蛋白质比对，用于功能分析整个元基因组鸟枪数据。 生物信息学。 2017年5月15日； 33(10):1473-1478. doi:10.1093/bioinformatics/btx021。 生物信息学。 2017 PMID： 28158639 免费PMC文章。 -
从微生物组测序读取的同源基因家族的快速和简单的蛋白对齐引导组装。 微生物组。 2017年1月25日； 5(1):11. doi:10.1186/s40168-017-0233-2。 微生物组。 2017 PMID： 28122610 免费PMC文章。 -
GRASP2：快速、记忆高效的基因中心组装和同源物搜索，用于宏基因组测序数据。 BMC生物信息学。 2019年6月6日； 20（补充11）：276。 doi:10.1186/s12859-019-2818-1。 BMC生物信息学。 2019 PMID： 31167633 免费PMC文章。 -
RAPSearch：一种快速的蛋白质相似性搜索工具，用于简短阅读。 BMC生物信息学。 2011年5月15日； 12:159. doi:10.1186/1471-2105-12-159。 BMC生物信息学。 2011 PMID： 21575167 免费PMC文章。 -
下一代测序序列比对算法综述。 简要生物信息。 2010年9月； 11(5):473-83. doi:10.1093/bib/bbq015。 Epub 2010年5月11日。 简要生物信息。 2010 PMID： 20460430 免费PMC文章。 审查。
引用人
-
鉴定从体外发酵中获得的碳水化合物基因簇作为益生元反应的预测生物标记物。 BMC微生物。 2024年5月25日； 24(1):183. doi:10.1186/s12866-024-03344-y。 BMC微生物。 2024 PMID： 38796418 免费PMC文章。 -
滑行中的分歧 坎迪达斯 胡萝卜品系比较基因组分析证实的紫苑植原体。 微生物。 2024年5月17日； 12(5):1016. doi:10.3390/微生物12051016。 微生物。 2024 PMID： 38792845 免费PMC文章。 -
北京地区肠道微生物宏基因组及耐药性分析 落叶松 和 鸭科 2021年至2023年内蒙古鄂尔多斯红海子湿地的物种。 微生物。 2024年5月13日； 12(5):978. doi:10.3390/微生物12050978。 微生物。 2024 PMID： 38792807 免费PMC文章。 -
从中国盐碱土中分离出的两个新的嗜碱物种： 黄半碱性杆菌 sp.11月，和 乳半碱性杆菌 sp.11月。 微生物。 2024年5月8日； 12(5):950. doi:10.3390/微生物12050950。 微生物。 2024 PMID： 38792780 免费PMC文章。 -
两个 屎肠球菌 分离物对抗生素治疗引起的小鼠肠道微生物群失调具有调节作用。 国际分子科学杂志。 2024年5月15日； 25(10):5405. doi:10.3390/ijms25105405。 国际分子科学杂志。 2024 PMID： 38791443 免费PMC文章。
