Identifying common genetic variants in blood pressure due to polygenic pleiotropy with associated phenotypes

doi:10.1161/HYPERTENSIONAHA.113.02077

.2014年4月；63(4):819-26.

doi:10.1161/高血压AHA.113.02077。 Epub 2014年1月6日。

识别与相关表型相关的多基因多态性导致的血压常见遗传变异

奥勒·安德烈亚森¹, 琳达·K·麦克沃伊, 卫斯理·K·汤普森, 王云鹏, Sjur Reppe公司, 安德鲁·肖克, 维伦娜·祖伯, 伊丽莎白·巴雷特·康纳, 凯尔·高特维克, 波尔·奥克鲁斯特, 汤姆·H·卡尔森, 斯尔詹·朱罗维奇, Rahul S Desikan公司, 安德斯·M·戴尔; 国际血压全基因组关联研究联合会，骨质疏松症遗传因素联合会

附属公司

附属

¹加利福尼亚大学圣地亚哥分校放射科，8950 Villa La Jolla Dr，Suite C101，La Joella，CA 92037-0841。amdale@ucsd.edu; 和Ole A.Andreassen，挪威，KG捷成精神病研究中心，奥斯陆大学医院，Ullevål，邮政信箱4956 Nydalen，0424奥斯陆，挪威。电子邮件o.a.andreassen@medisin.uio.no。

PMID： 24396023
PMCID公司：第984909页
内政部： 10.1161/高血压AHA.113.02077

识别与相关表型相关的多基因多态性导致的血压常见遗传变异

奥勒·安德烈亚森等。高血压. 2014年4月.

.2014年4月；63(4):819-26.

doi:10.1161/高血压AHA.113.02077。 Epub 2014年1月6日。

作者

附属

¹加利福尼亚大学圣地亚哥分校放射科，8950 Villa La Jolla Dr，Suite C101，La Joella，CA 92037-0841。amdale@ucsd.edu; 和Ole A.Andreassen，NORMENT，KG Jebsen精神病研究中心，奥斯陆大学医院，Ullevál，邮政信箱4956 Nydalen，0424 Oslo，Norway。电子邮件o.a.andreassen@medisin.uio.no。

PMID： 24396023
PMCID公司：项目经理3984909
内政部： 10.1161/高血压AHA.113.02077

摘要

血压是心血管疾病发病率和死亡率的关键决定因素。它受到环境因素的影响，但具有很强的遗传成分。尽管最近进行了大规模全基因组关联研究，但几乎没有发现血压的遗传风险因素。流行病学研究表明，血压与几种疾病和特征之间存在关联，这可能部分源于共同的遗传基础（遗传多效性）。使用全基因组关联研究汇总统计和遗传多效性知情条件错误发现率方法，我们系统地研究了收缩压（SBP）与12种共病特征和疾病之间的遗传重叠。我们发现与SBP相关的单核苷酸多态性显著增加，其与体重指数、低密度脂蛋白、腰臀比、精神分裂症、骨密度、1型糖尿病和腹腔疾病相关。相反，与其他表型（甘油三酯、高密度脂蛋白、2型糖尿病、类风湿性关节炎和身高）相比，共享多基因效应导致的富集程度较小。将条件假发现率方法应用于丰富的表型，我们鉴定出62个与SBP相关的基因座（假发现率<0.01），包括42个新基因座。观察到的SBP和几种相关疾病之间的多基因重叠表明，流行病学关联不仅是通过生活方式因素介导的，还反映了一种需要进一步调查的病因学关系。新基因位点的发现暗示了SBP中与脂质生物学和免疫系统相关的新的遗传机制。

关键词：动脉压；共病；遗传多效性；全基因组关联研究。

PubMed免责声明

数字

**图1。SBP多效性富集的Q-Q图取决于相关表型**
标称与经验−log的条件Q-Q图₁₀收缩压（SBP）的p值（经通货膨胀校正）低于p<5×10的标准GWAS阈值⁻⁸作为与A类)低密度脂蛋白胆固醇（LDL），B类)体重指数（BMI），C类)骨密度（BMD），D类)1型糖尿病（T1D），E类)精神分裂症（SCZ）和F类)−log水平的乳糜泻（CeD）₁₀（p） >0，–log₁₀（p） >1，–log₁₀（p） >2，–log₁₀（p） >3分别对应于p<1、p<0.1、p<0.01、p<0.001。虚线表示空下位。

**图2有条件的罗斯福曼哈顿阴谋**
条件对数的“条件FDR曼哈顿图”₁₀（FDR）单独收缩压（SBP）（黑色）和收缩压的值，给定相关表型低密度脂蛋白胆固醇（LDL；SBP|LDL，红色）、体重指数（BMI；SBP|BMI，橙色）、骨密度（BMD；SBP|BMD，绿色）、1型糖尿病（T1D；SBP|T1D，紫色）、精神分裂症（SCZ；SBP|SCZ；绿绿色）和乳糜泻（CeD）；SBP | CeD，蓝色）。带条件日志的SNP₁₀FDR>2（即FDR<0.01）以大点显示。大点周围的黑色圆圈表示每个LD块中最显著的SNP，该SNP用最接近的基因注释，该基因列在每个位点的符号上方，除了6号染色体上的HLA区域和表S2中（请参见http://hyper.ahajournals.org). 图中显示了16条染色体（1-12、15-17和20）上62个位点的定位。带有–log的位置的详细信息₁₀FDR>2（即FDR<0.01）如表1所示。

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